车轮虫分类与系统发育研究进展

车轮虫属一大类寄生性纤毛虫原生动物,可不同程度地给宿主造成危害,故对其研究既具有理论意义,又具有经济价值。文中简单回顾了车轮虫的分类研究和系统发育研究的历史。在分类学研究领域方面,全面介绍了目前车轮虫科已发现属的寄生部位和地理分布等;而系统发育研究领域方面,则介绍了车轮虫研究在萌芽期、探索期和发展期这三个时期的进展,包括形态学和分子生物学两方面的研究内容。并对该领域今后应进行的研究提出了建议。     

云南地区水生经济动物外寄生车轮虫的研究

在对云南地区淡水车轮虫的调查研究过程中,在几大重要水生经济动物,即泥鳅、鲫、鲤、鳙、斑点叉尾鮰及牛蛙蝌蚪上获得8种外寄生车轮虫。其中车轮虫属4种,即虱性车轮虫Trichodina pediculus、杜氏车轮虫T.domerguei、拟黑色车轮虫T.paranigra和适度车轮虫T.modesta;拟车轮虫属1种,即圆形拟车轮虫Paratrichodina rotundiformis;小车轮虫属3种,即周丛小车轮虫Trichodinella epizootica、卡普小车轮虫T.carpi和纤细小车轮虫T.subtilis。采用活体观察、甲基绿-派洛宁染色及干银法,并运用国际统一的特定方法及齿体定位描述法对该8种车轮虫进行了详细的形态学研究。     

寄生于罗非鱼的刺纹车轮虫种群分析及其寄主偏好性研究

文章在刺纹车轮虫Trichodina centrostrigata Basson, Van As & Paperna, 1983的重描述基础上, 基于形态学特征、分子特征及系统发育分析, 对其种群多样性及寄主偏好性进行了研究。结果表明, 刺纹车轮虫三个种群: Trichodina centrostrigata (KP295473)、Trichodina centrostrigata (W)和Trichodina centrostrigata (Q)在历经4年的时间里, 未发生明显的种群分化; 其次, 刺纹车轮虫与寄生于海水寄主的车轮虫聚支, 表明二者具有较近的亲缘关系; 再次, 刺纹车轮虫主要寄生于鲈形目的广盐性罗非鱼, 少数寄生于其他淡水鱼类, 具有较强的寄生特异性; 最后, 此研究中的寄主罗非鱼对于刺纹车轮虫具有100%的高感染率, 表明刺纹车轮虫为罗非鱼养殖业中一类潜在病害性微生物。     

基于18S rDNA与ITS-5.8S rDNA对 重庆地区网状车轮虫的种内分化研究

本研究基于形态和分子数据对采自重庆地区5个地理株系的网状车轮虫(Trichodina reticulata)进行了比较研究及重描述。研究结果表明,网状车轮虫不同株系表现出不同的表型分化,含形态略有不同的齿体及有或无中央颗粒,因而具有明显的种内形态多样性。不同地理株系网状车轮虫的18S rDNA序列相似度在99.0%~100%之间,遗传距离为0.000~0.008,并在三大变异区(V4、V5与V7)均具一致的二级结构,表明不同株系的18Sr DNA相似度与遗传距离均属种内水平。综合18SrDNA和ITS-5.8S rDNA的变异位点和系统发育对种内分歧的研究分析显示,来自不同地理分布和宿主的网状车轮虫株系皆因相同的变异位点而聚为一枝,以此推断网状车轮虫的种内分化主要受其基因的影响,地理分布与宿主差异等环境影响在目前的种群分化阶段暂未突显。此外,本研究进一步验证了中央颗粒不能作为网状车轮虫的主要鉴别性特征的观点。     

重庆地区眉溪小车轮虫及其与近缘种的比较

通过活体显微观察和银染法, 文章对采自重庆地区不同宿主的眉溪小车轮虫Trichodinella myakkae (Mueller, 1937) ?rámek-Hu?ek, 1953的3个株系进行了详细的形态学描述, 并与近缘种周丛小车轮虫Trichodinella epizootica (Raabe, 1950) ?rámek-Hu?ek, 1953和纤细小车轮虫Trichodinella subtili (Lom, 1959) Lom & Haldar, 1977进行了比较。结果显示: 眉溪小车轮虫各株系在形态上无明显差异, 但与周丛小车轮虫及纤细小车轮虫有明显差异。基于所获眉溪小车轮虫的分子数据, 详细分析了眉溪小车轮虫的分子特征, 研究了眉溪小车轮虫种内分化, 结果显示: 眉溪小车轮虫各株系的18S rDNA序列相似度为99.2%—100%, 遗传距离为0.000—0.003, T. myakkae (HM)与T. myakkae (AN)的18S rDNA几乎一致, 但T. myakkae (PP)与T. myakkae (HM和AN)的18S rDNA存在7个变异位点, 且在18S rRNA 四个高变区 (V3、V4、V5和V7) 均具有一致的二级结构构型, 表明三株系的18S rDNA相似度和遗传变异属于种内水平, 但T. myakkae (PP)与T. myakkae (HM和AN)则显示出分子分化。系统发育分析显示: 眉溪小车轮虫与周丛小车轮虫相互独立, 眉溪小车轮虫各株系与其宿主鱼一致的系统发育关系显示出两者具有协同进化的趋势。     

广西地区罗非鱼外寄生车轮虫的形态分类学及多样性研究

采用活体观察、吉姆萨与干银法染色等技术,运用国际间统一特定方法及齿体定位描述法对采自广西地区的罗非鱼(单性鱼吉富、奥尼系列)的外寄生车轮虫进行详细的形态分类学与多样性研究,研究结果共计获得车轮虫属2种,拟车轮虫属与三分虫属各1种,分别为:刺纹车轮虫Trichodina centrostrigata Basson et al.,1983、异齿车轮虫Trichodina heterodentata Duncan,1977、非洲拟车轮虫Paratrichodina africana Kazubski&El-Tantawy,1986与直齿三分虫Tripartiella orthodens Basson&Van As,1987。其中,非洲拟车轮虫为中国新纪录,刺纹车轮虫和直齿三分虫为中国广西地区新纪录。非洲拟车轮虫表现出寄主和寄生部位的专一性;进一步应用SPSS统计软件对非洲拟车轮虫进行了种群差异性分析。     

寄生于重庆地区鲢、鳙及草鱼五种外寄生车轮虫的描述

对采自重庆地区寄生于鲢、鳙及草鱼鳃上的5种外寄生车轮虫进行了形态学及分类学研究,其分别隶属于：车轮虫属、小车轮虫属及三分虫属,其中包含1新种和中国2新纪录。即钝圆车轮虫Trichodina obtusiformis sp．nov．,急尖车轮虫T．acuta Lom,1961,显著车轮虫T．nobilis Chen,1963,周丛小车轮虫Trichodinella epizootica（Rabbe,1950）Sramek-Husek,1953和大型三分虫Tripartiella macrosoma Basson ＆ Van As,1987。文中对新种进行了详细的描述并提供了新种及已知种的附着盘银染标本之显微照片及齿体线条图。     

南中国海野生海水鱼类外寄生车轮虫新记录（英文）

研究对采自南中国海的7种海水鱼类进行了调查研究,并分离获得4种隶属于车轮虫属的种类,分别为浦氏车轮虫Trichodina puytoraci Lom,1962;日本车轮虫Trichodina japonica Imai,et al.,1991;直钩车轮虫Trichodina rectuncinata Raabe,1958与鲀车轮虫Trichodina fugu Imai,et al.,1997。研究发现鲀车轮虫Trichodina fugu Imai,et al.,1997为寄主鱼虫纹东方鲀Takifugu vermicularis的病原,且能在野生条件下将其致死。上述4种车轮虫的形态分类学数据均基于干银法标本获得。研究是对我国南中国海车轮虫的首次报道。     

南中国海野生海水鱼类外寄生车轮虫新记录

研究对采自南中国海的7种海水鱼类进行了调查研究, 并分离获得4种隶属于车轮虫属的种类,分别为浦氏车轮虫Trichodina puytoraci Lom, 1962; 日本车轮虫Trichodina japonica Imai, et al., 1991; 直钩车轮虫Trichodina rectuncinata Raabe, 1958 与鲀车轮虫Trichodina fugu Imai, et al., 1997。研究发现鲀车轮虫Trichodina fugu Imai, et al., 1997为寄主鱼虫纹东方鲀Takifugu vermicularis的病原, 且能在野生条件下将其致死。上述4种车轮虫的形态分类学数据均基于干银法标本获得。研究是对我国南中国海车轮虫的首次报道。       

重庆地区鲫外寄生车轮虫形态分类学研究及一新种的描述(英文)

在对重庆地区进行鱼类寄生虫学的调查过程中,从鲫鳃表获得3种隶属于车轮虫属Trichodina Ehrenberg,1830的外寄生车轮虫,其中含一新种,短棘车轮虫Trichodina brevicirra sp.nov,其典型的鉴别性特征为其短细的齿棘。另外两种车轮虫分别为沃玛车轮虫Trichodina ngoma Van As&Basson,1992与网状车轮虫Trichodina reticulata Hirschman&Partsch,1955;沃玛车轮虫为亚洲新记录种。文章对网状车轮虫的3种群进行了详尽的比较讨论研究,尽管该三种群间存在着细微的种群内差异,但网状车轮虫的典型特征则显而易见地存在于三种群间,即为附着盘中央具有8-16个球状或卵圆形的中央颗粒。       

旋唇纲系统发育基因组学分析支持瘦尾虫属归于散毛目

根据传统形态学特征的系统分类学研究,将瘦尾虫属(Uroleptus)归入尾柱目(Urostylida).但是,基于单基因和多基因联合的分子系统发育学分析支持瘦尾虫属与散毛目内部类群的亲缘关系更近.为进一步探讨旋唇纲(Spirotrichea)内部类群的系统发育关系以及瘦尾虫属的系统发育地位,我们对四种旋唇纲纤毛虫(澳大利亚速体虫(Notohymena australis)、瘦尾虫属未定种(Uroleptus sp.)、弹跳虫属未定种(Halteria sp.)和楯纤虫属未定种(Aspidisca sp.))进行单细胞转录组测序,并基于151个直系同源基因的51 596个氨基酸位点对旋唇纲开展更全面的系统发育基因组学分析.分析结果支持旋唇纲中四个亚纲单系:寡毛亚纲与环毛亚纲聚为姐妹枝,腹毛亚纲与这两个亚纲的亲缘关系更近,游仆亚纲位于旋唇纲的基部.尾柱目非单系,瘦尾虫属与散毛目中的尖毛虫科聚为一支,系统发育基因组学分析结果支持瘦尾虫属归于散毛目.     

基于18S rDNA遗传距离与GC含量对游走类纤毛虫的分子系统学研究

为了揭示游走类纤毛虫的系统发生,对寄生于淡水鱼类的车轮虫科中的6种车轮虫进行了18S rDNA的测序并获得了9个序列。采用了最大似然法(ML)与贝叶斯法(BI)对GenBank中所有游走类纤毛虫的18S rDNA序列进行了系统树的构建,并首次将SPSS与18S rDNA遗传距离结合分析了游走类纤毛虫的系统发生。研究结果进一步证实了车轮虫属(Trichodina)的非单系发生与小车轮虫属 (Trichodinella) 的有效性。此外,研究结合18S rDNA 的GC含量与遗传距离分析提出了游走类纤毛虫科属及种间新的鉴定依据: 18S rDNA 的GC含量可用于游走类纤毛虫的科属区分,且与游走类纤毛虫的分化密切相关; 18S rDNA的遗传距离在游走类纤毛虫的不同阶元中具有一定的阈值范围,即通常种内遗传距离阈值范围为0.000-0.005,属种间阈值范围为0.005-0.150,当遗传距离大于0.150时,则达到了科间水平。     

基于18S rDNA遗传距离与GC含量对游走类纤毛虫的分子系统学研究（英文）

为了揭示游走类纤毛虫的系统发生,对寄生于淡水鱼类的车轮虫科中的6种车轮虫进行了18S rDNA的测序并获得了9个序列。采用了最大似然法(ML)与贝叶斯法(BI)对GenBank中所有游走类纤毛虫的18S rDNA序列进行了系统树的构建,并首次将SPSS与18S rDNA遗传距离结合分析了游走类纤毛虫的系统发生。研究结果进一步证实了车轮虫属(Trichodina)的非单系发生与小车轮虫属(Trichodinella)的有效性。此外,研究结合18S rDNA的GC含量与遗传距离分析提出了游走类纤毛虫科属及种间新的鉴定依据:18S rDNA的GC含量可用于游走类纤毛虫的科属区分,且与游走类纤毛虫的分化密切相关;18S rDNA的遗传距离在游走类纤毛虫的不同阶元中具有一定的阈值范围,即通常种内遗传距离阈值范围为0.000—4).005,属种间阈值范围为0.005—0.150,当遗传距离大于0.150时,则达到了科间水平。     

车轮虫干银染色方法的改进

车轮虫（trichodinids）是一大类病害性寄生或共栖生的缘毛类纤毛虫,是鱼类中最为常见的寄生虫之一。虫体大多数分类性状在活体观察或非染色状态下不可直视,因此易于被忽视。干银染色法是目前车轮虫细胞学、遗传学、分类及形态学研究中常用的手段。经典的干银染色法作为车轮虫属间分类和种类鉴别的重要研究手段而沿用至今。国际间较流行的车轮虫种类鉴别的研究方法主要采用Foissner（1991）和Lom and Dykova（1992）对Klein（1958）的干银法修正版。     

重庆地区泥鳅体外寄生车轮虫的形态分类学研究

在重庆地区鱼类寄生虫的调查过程中,从淡水鱼泥鳅的鳃上获得四种外寄生车轮虫,经鉴定隶属车轮虫科（Trichodinidae）、车轮虫属（Trichodina）,含1车轮虫未定种Trichodina．sp．和3已知种,即：适度车轮虫（TrichodinamodestaLom,1970）,斜齿车轮虫（Trichodina lechriodentata Zhao＆Tang,2007）及拟黑色车轮虫（TrichodinaparanigraTangetal,2005）。车轮虫的形态学特征统计采用Lom（1958）倡导的统一特定方法,齿体的定位描述则采用Van As＆Basson（1989）和Tang,Zhao＆Chen（2005）改进的方法进行     

裳卷蛾变形孢虫SSU rRNA核心序列的克隆与系统发育分析

[目的]利用分子生物学手段探索裳卷蛾变形孢虫的遗传发育地位.[方法]微孢子虫的SSUrRNA序列是构建系统发育进化树的重要工具.试验通过T-A克隆法对裳卷蛾变形孢虫(Vairimorphaceraces)SSU rRNA核心序列进行了克隆,并采用近邻法构建了系统发育进化树.[结果]克隆得到了长为1228bp的核苷酸序列(GenBank EU267796).系统发育分析结果表明:裳卷蛾变形孢虫与分离于小菜蛾(Plutella xylostella)的Vairimorpha sp.Germany(GenBank AF124331)和Vairimorphaimperyecta(GenBank AJ131645)相似性最高,它们在系统发育进化树中与寄主为鳞翅目昆虫的Nosema属聚为一类,与纳卡变形孢虫(Vairimorpha necatrix)为代表的Vairimorpha属为相邻集.[结论]结合其生物学特征,裳卷蛾变形孢虫确实为Vairimorph a属的成员,但根据系统发育分析归入Nosematidae科可能更为合适.     

乳白蚁属Coptotermes(Isoptera: Rhinotermitidae)检疫分子鉴定研究进展

白蚁是一类受到世界广泛关注的重要社会性昆虫,对人类生活、经济以及生态环境等有很大的影响,特别是乳白蚁属Coptotermes众多种类危害尤为严重。乳白蚁常随木质包装或原木远距离传播异地建群,其为害隐蔽、潜伏期长,一旦爆发则为害严重且难防治,因其种类多、形态趋同,同一巢群中有龄期不一的虫态和多种生物型,可用分类特征少,造成形态分类困难、人为分类现象普遍。近年来分子生物学技术的日益发展,使得白蚁的分类鉴定更加快速、灵敏和可靠,系统发育分析研究更为深入全面,遗传进化方面取得大量研究成果。本文对基于生物信息学的乳白蚁属检疫分类鉴定和系统发育研究方法进行了介绍和评述,并对DNA技术在乳白蚁属分类和进化研究中的应用进行了讨论。     

石斛属植物光合碳同化途径地理分异研究进展

系统总结了我国石斛属植物光合作用现状,结合石斛属植物光合作用碳同化途径研究,概括了兼性景天酸代谢植物的碳同化路径特征,分析了景天酸代谢表达程度与生态环境的关系,进而归纳出石斛属植物在光合作用碳同化途径方面存在地理分异。最后指出了石斛属植物系统发育研究领域存在的问题,提出从系统发育视角,采用分子系统学技术来研究石斛属植物光合碳同化途径地理分异的生物学机制。     

楔形两极虫(黏体门,双壳目)的形态学重描述及其近缘种的分子系统学研究

两极虫属Myxidium和楚克拉虫属Zschokklella在形态上非常相似,形态鉴定界限模糊。为进一步厘清两者的分类学关系,本研究对采自涪江重庆市潼南县江段的楔形两极虫M.cuneiforme Fujita,1924进行了形态学重描述,并对其分子系统学进行了研究。楔形两极虫孢子壳面观呈长条形,中部稍凹陷或孢子一边突出,壳瓣上有6~8条与缝嵴平行的条纹;缝嵴直,缝面观呈梭形。孢子长12.5μm±0.3μm,宽5.4μm±0.3μm(n=20)。极囊2个,呈梨形,分布于孢子两极端;极囊长4.3μm±0.2μm,宽3.1μm±0.2μm(n=20),极丝细长且明显,盘曲5~6圈。以18S rDNA为分子标记,对楔形两极虫及其近缘种进行了保守区变异、遗传距离、序列相似度和分子系统发育分析,结果表明:两极虫属和楚克拉虫属均非单系发生,两属间物种相互交叉聚支;两极虫属与楚克拉虫属物种间具有很近的亲缘关系。本文基于形态和分子数据的研究结果支持将两极虫属和楚克拉虫属合并为一个属的观点。     

脉翅总目系统发育研究进展

脉翅总目是全变态类昆虫中起源较早的古老类群之一,有关该类群的分类及系统发育研究对阐明全变态类昆虫的起源演化具有重要意义。文章就脉翅总目的系统地位、目级阶元、科级阶元和属种级阶元的系统发育几个方面的研究进行综述,着重介绍近年来国内外取得的研究成果,其中包括基于形态和分子数据所得的最新系统发育假设。最后,对脉翅总目系统发育研究中尚未解决的主要问题进行归纳。