猪肾果糖1,6-二磷酸酯酶N-端60肽的溶液构象

猪肾果糖1,6-二磷酸酯酶N-端60个氨基酸是结合AMP的别构部位的重要组成部分.这一段肽在天然酶中具有2段α-螺旋,不含β-折叠,螺旋含量占这段肽的60%左右.经枯草杆菌蛋白酶对果糖1,6-二磷酸酯酶限制性酶解可以专一地作用在这一位点.得到S-肽和S-蛋白,虽然S-肽与S-蛋白的肽键已经分开,但是它们依然缔合在酶的4个亚基之中.在9%的甲酸溶液中,用SephadexG-75柱(1.3×195cm)可以把S-肽与S-蛋白分开.除去甲酸后,用CD测定二级结构表明,S-肽有30%的α-螺旋和38.5%的转角或类似转角的二级结构,没有β-折叠.蛋白质的生物合成是从N-端开始向C-端延伸,新生肽在生物合成的过程中,它的构象由一级结构决定它自发形成某种结构的趋势,但是,其它部分的相互作用可以在较大程度上改变它的结构,使它最后形成天然状态的空间构象.用6mol/L盐酸胍破坏S-肽链的溶液构象,然后逐步透析去掉盐酸胍,重新测定CD的数值,所得结果与胍变性前的二级结构含量相同,用加入乙醇,环己烷,少量十二烷基磺酸钠等扰动方法都不能增加α-螺旋的含量.相反,随着加入量的增加,有序结构减少,说明当S-肽从酶上被分离下来后,在水溶液中只能形成其在该天然酶蛋白中的一半的螺旋,而另一半却变成转角或类似转角的有序结构的结果并不是由于分离过程产生的假象.     

人心肌缺血/再灌注期间红细胞膜分子流动性改变的机理研究

对开心手术病人心肌缺血／再灌注过程中冠状静脉窦血中的红细胞流变性变化和红细胞膜分子结构的改变进行了研究。结果表明,再灌注即刻心脏产生大量自由基,并持续到再灌注第２０分钟时才大幅度回落;于再灌注后的２０分钟的自由基产生时相期间,除红细胞膜蛋白分子和脂质分子的τｐ、τｌ均明显延长外,还伴有血浆ＭＤＡ水平的明显增加和ＳＯＤ活性的显著降低,及红细胞内ＧＳＨ－Ｐｘ活性升高;与此同时其红细胞膜蛋白分子的α螺旋先减少后渐回复和β折叠渐增加并伴有羧基（ＣＯＯＨ）和氨基（ＮＨ３）的减少,而其红细胞膜脂质分子的磷氧双键（Ｐ＝Ｏ）、羰基（Ｃ＝Ｏ）和多不饱和键（Ｃ＝Ｃ）则增加;说明（１）再灌注期间氧自由基分别引起了红细胞膜蛋白分子碳端和氮端的改变及膜磷脂分子亲水区和疏水区化学结构的变化,（２）蛋白分子碳、氮端的变化造成了膜蛋白分子构象的改变,（３）蛋白分子和磷脂分子化学结构及构象的改变是红细胞膜这些分子流动性明显恶化的根本原因。     

付里埃变换红外测定有不同阴离子结合和通过时膜带Ⅲ蛋白的构…

用付里埃变换红外（ＦＴＩＲ）技术研究了不同阴离子结合和通过时,脂蛋白体膜带Ⅲ蛋白有结构的变化,发现：有Ｃｌ、ＮＯ３、ＳＯ４＾２－结合和通过时,膜带Ⅲ蛋白α螺旋均为升高趋势,其中Ｃｌ结合和通过时,带Ⅲ蛋白α螺旋增加较少：ＮＯ３、ＳＯ４＾２－结合和通过时,带Ⅲ蛋白α螺旋增加较多,阴离子的结合和通过时,带Ⅲ蛋白α螺旋的增国可能与带Ⅲ所形成的阴离子通道扩张有闫,扩张程度的大小主要取决于阴离子的体积,基本不     

蛋白质组学中新蛋白质鉴定的研究方法和策略

当前,基于生物质谱进行蛋白质鉴定的技术已经成为蛋白质组学研究的支撑技术之一.产生的数据主要使用数据库搜索的方法进行处理,这种方法的一大缺陷是不能鉴定数据库中未包含的蛋白质,因此如何充分利用质谱数据对蛋白质组研究的意义很大,而新蛋白质鉴定更是其中一个重要的内容.新蛋白质鉴定是蛋白质鉴定的一个方面,新蛋白质的定义按照序列和功能的已知程度分为3个层次;以蛋白质鉴定的方法为基础,目前新蛋白质鉴定的方法可分为denovo测序和相似序列搜索结合的方法以及搜索EST、基因组等核酸数据库的方法2大类;两者各有利弊.存在各自的问题和相应处理的策略.不同的研究者可以根据具体目的应用和发展不同的鉴定方法,同时新蛋白质的鉴定也将随着蛋白质组学研究的发展而更加完善.     

基于空间生态集合覆盖模型的自学习禁忌搜索算法在保护区空间选址中的应用——以戴云山为例

自然保护区规划是保护生物多样性的有效方式.传统保护区规划方法只能识别物种保护的重点区域,无法科学确定保护区的适宜面积.地块选择方法基于数学模型,从规划区域中选择部分地块组成自然保护区,保护特定物种或生态系统,是缓解生态保护与开发利用矛盾的重要手段.现有地块选择法未考虑各单元生态差异,且最优化算法存在计算效率的瓶颈.本文首先构建适用于森林生态系统的生态值赋分评价体系,据此计算戴云山生态值并绘制其分布图;然后,结合生态值建立生态集合覆盖模型(ESCP),并基于ESCP嵌入空间紧凑性提出空间生态集合覆盖模型(SSCP);最后,利用寻优性能良好的自学习禁忌搜索算法(STS)搜索各保护目标下的近似最优选址方案,给出福建省戴云山现有建成区优化方案.结果表明: 戴云山生态值计算结果在空间分布上存在明显差异;ESCP比原集合覆盖模型(SCP)能产生生态值更高的选址方案;SSCP在ESCP基础上对生态值较高区域有聚集作用,且周长权重越大,聚集效果越明显;建议现保护区可向外拓展136 km²,并将西北向分布长苞铁杉的地块纳入保护区范围.研究结果为实现戴云山保护区可持续发展及土地资源优化配置提供了优化方案,也可为我国森林生态系统类型的自然保护区设计提供新思路.     

乙二醇对木瓜蛋白酶催化活性的影响

对不同浓度乙二醇水溶液影响木瓜蛋白酶水解酪蛋白的催化活性及构象的改变进行研究。结果表明,木瓜蛋白酶在乙二醇水溶液中水解酪蛋白的活性显著下降。动力学测定表明,木瓜蛋白酶在乙二醇水溶液中最大反应速度明显下降;差示光谱显示,在乙二醇水溶液中木瓜蛋白酶的二级结构发生了变化;荧光发射光谱显示,木瓜蛋白酶在乙二醇水溶液中发射峰位几乎没移动,但发射强度明显增高。     

中国人胃癌染色体17q21区域基因遗传不稳定性研究

To investigate microsatellite instability (MSI) and loss of heterozygosity (LOH) of locus D17S396, D17S579 and D17S855, and their effect on the expression of nm23H1 and BRCA1 of gastric cancer, which would provide experimental basis for clinical treatment and prognosis analysis of gastric cancer. DNA was extracted from paraffin-embedded materials. Polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism (PCR-SSCP) was used to analyze MSI and LOH. Expression of nm23H, and BRCA1 was detected by Envision immuno-histochemistry and Leica-Qwin computer imaging techniques. In the forty cases of gastric cancer, the frequency of MSI, LOH and nm23H1 protein were 20.00%, 17.50% and 55.00% respectively at locus D17S396, while at locus D17S579, the frequency of MSI, LOH and BRCA1 protein were 22.50%, 15.00% and 37.50% respectively; at locus D17S855, the frequency of MSI, LOH and BRCA1 of thirty-seven cases were 18.92%, 18.92%, 37.84% respectively. In tumor node metastasis (TNM) staging, at locus D17S396, D17S579 and D17S855, MSI in stages I + II appeared more frequently than that in stages III + IV, while LOH appeared the contrary tendency. In the group of metastasis of gastric cancer, MSI had a less frequency (5.00%) than that with no metastasis (35.00%, P < 0.05) at locus D17S396, but LOH appeared more frequently (30.00%) than that with no metastasis (5.00%, P < 0.05). At locus D17S579, MSI had an increasing tendency with the degree of tumor differentiation (50.00% in high differentiation cases, 20.00% in middle differentiation cases, and 0% in low differentiation cases, P < 0.05). The frequency of nm23H1 and BRCA1 protein in stages TNM I + II was higher than that in stages TNM III + IV; and that in higher differentiation cases was higher than in poor differentiation cases. The frequency of nm23H1 protein in the group of metastasis (30.00%) was less than that with no metastasis significantly (80.00%, P<0.01). The frequency of nm23H1 protein in the group positive to MSI (87.50%) was higher than that in the group negative to MSI (46.88%, P < 0.05). However, nm23H1 protein in group positive to LOH (14.29%) was lower than that in the group negative to LOH (63.64%, P < 0.05). The frequency of BRCA1 protein in the group positive to MSI (66.67%) was more than that in the group negative to MSI (29.03%, P < 0.05). The results of experiments indicate that MSI and LOH may separately control the development of sporadic colon cancer with different pathways. MSI may be an early period molecule marker for sporadic colon cancer, enhanced expression of nm23H1 protein can effectively inhibit colon cancer metastasis and improve prognosis of sporadic colon cancer patients. By comparison, LOH mostly arises in the late period of sporadic colon cancer and endows a high aggressive and poor prognostic phenotype. nm23H1 protein could effectively restrain gastric cancer metastasis and development; and BRCA1 protein could restain tumor from becoming lower differentiation.     

血清白蛋白在多聚阳离子－壳聚糖共混材料表面的构象变化及其与细胞生长的关系

用L-多聚赖氨酸、聚乙烯亚胺及L-多聚鸟氨酸三种多聚阳离子对壳聚糖进行共混修饰,制备了三种共混材料.在这些材料表面吸附了血清白蛋白,并利用圆二色(CD)光谱研究了白蛋白吸附到材料表面后的构象变化.结果显示,与天然状态相比,白蛋白吸附到共混材料表面后,其α-螺旋、β-折叠及无规则卷曲的含量均发生了明显改变.通过研究MC3T3-E1细胞在这些材料表面的生长情况,发现细胞的增殖与血清白蛋白的构象变化有一定关系,在吸附的白蛋白构象与天然构象最接近的共混材料表面,MC3T3-E1细胞增殖水平最高.     

人参EST资源的SSR信息分析

从7055条人参EST序列中搜索出791个SSR,其出现频率为11．21％,平均长度为21．37bp,平均分布频率为1／5．7kb。二核苷酸重复是主要的重复类型,占全部EST-SSR的56．89％,其次是三核苷酸重复的占全部SSR的21．11％。AT、GAA是二核苷酸和三核苷酸中出现次数最多的重复基元类型,分别占28．89％和10．18％。     

桑天牛长尾啮小蜂的寄主搜索行为

桑天牛长尾啮小蜂(Aprostocetus.fkutai Miwa etSonan)对桑枝条的气味反应敏感,受桑天牛危害的桑枝条比未受害的桑枝条对长尾啮小蜂有更强烈的引诱作用;刻槽的形状对长尾啮小蜂对寄主卵的搜索行为也有一定的引诱作用,而卵对长尾啮小蜂的引诱作用不明显.