基于RNA-Seq高通量测序技术的牦牛卵巢转录组研究:进一步完善牦牛基因结构及挖掘与繁殖相关新基因

RNA-Seq作为近年来新发展起来的高通量转录组测序技术,为大规模转录组学研究提供了一种全新的且更为有效的方法.目前该技术已广泛应用于转录组学中多方面的研究,尤其近年来,该技术在进一步完善基因结构信息及挖掘新转录本及新基因方面的功能也逐渐受到关注.本研究以牦牛卵巢组织作为研究对象,应用RNA-Seq技术对其进行高通量转录组测序分析,经测序后得到了一个包含26826516条过滤后测序读数,4828772880 bp的卵巢测序文库,比对分析显示,有16992条牦牛基因发生表达,其中3734条基因存在不同类型的可变剪接.功能分析表明,这些表达基因涉及多种GO分类及KEGG通路.进一步分析转录组数据发现,共有7340个基因的5′或3′端在原有基因组的位置基础上发生了延伸,同时还发现了6321个新转录本,定位回基因组预测显示,外显子数量为1~84个,其中2267个新转录本预测具有编码蛋白的能力.比对分析显示,共有1200~4993条新转录本分别与Nt数据库、Nr数据库及SwissProt数据库中的基因比对上,其中与牛相似性基因最多(41.4%),其次为野牦牛(33.0%)、绵羊(6.3%)、人类(2.8%)及小鼠(1.6%)等其他物种.进一步对新转录本进行GO分类注释,结果显示,与繁殖发育相关的GO分类占有较大比例,其中繁殖类别(reproduction)所涉及的新转录本最多.本研究结果为描绘牦牛卵巢正常转录组图谱及进一步探析牦牛繁殖性能提供了基础,同时证实RNA-Seq高通量转录组技术在完善基因结构及挖掘新转录本及新基因方面的具有强大的优势,为进一步完善牦牛基因组结构信息及挖掘潜在的新基因提供了丰富数据.     

华西雨屏区苦竹林土壤酶活性对模拟氮沉降的响应

2007年11月-2009年5月,对华西雨屏区苦竹人工林进行了模拟氮沉降试验,氮沉降水平分别为：对照(0 g N·m^-2·a^-1)、低氮(5 g N·m^-2·a^-1)、中氮(15 g N·m^-2·a^-1)和高氮(30 g N·m^-2·a^-1).在氮沉降进行半年后,每月采集各样方0～20 cm土壤样品,测定其土壤酶活性,连续测定1年.结果表明：苦竹人工林样地中6种土壤酶活性的季节变化较明显,蔗糖酶、纤维素酶和酸性磷酸酶活性的高峰期出现在春季,脲酶活性高峰期出现在秋季,而过氧化物酶和多酚氧化酶活性高峰期出现在冬季;氮沉降增加了苦竹林土壤中木质素分解酶和碳、氮、磷分解相关酶（多酚氧化酶、蔗糖酶、酸性磷酸酶和脲酶）的活性,抑制了纤维素酶活性,而对过氧化物酶的影响不显著;苦竹林生态系统处于一种氮限制状态,氮沉降刺激了微生物-酶系统对土壤有机质的分解.     

鹤山马占相思人工林的生物量和净初级生产力

通过对鹤山马占相思（Ａｃａｃｉａ ｍａｎｇｉｕｍ）人工林的群落结构,生物量、净初级生产力的研究表明,１５龄的马占相思人工林乔木层总生物量为１９６．９４ｔ．ｈｍ＾－２,其中树干为８０．７５ｔ．ｈｍ＾－２,树枝为５５．１４ｔ．ｈｍ＾－２,树叶为１９．６９ｔ．ｈｍ＾－２,根为４１．３６ｔ．ｈｍ＾－２,该人工林１－７龄生物量增长迅速,而７－１１龄的生物量增则相对较慢,１１龄后生物量趋。１１龄马占相思林的净     

PCR反应混合液的冻干处理及其应用

本研究将除模板DNA以外的PCR反应混合液,经过真空浓缩冻成干粉状后,分别置于室温和4℃贮存,经过一定的贮藏时间后进行PCR反应,发现经冻干处理的样品能在较长的贮存时间内保持扩增活性,这将给实际工作带来很大的便利。 Abstract:In this paper we introduce a new storage method of PCR ingredient.PCR mixture except DNA template has been frozen to dry powder by the DNA-Plus system.This kind of powder was stored at room temperature or 4℃.PCR has been run in different period of storage.It was discovered that the samples of lyophilization could keep activity for a long time.     

荷兰芹胚性愈伤组织诱导及胚状体发生与内源IAA和ABA关系的初步研究

分析了荷兰芹胚性愈伤组织发生的条件, 对Co²⁺作用下胚状体形成与培养物内源IAA和ABA 的关系做了研究。结果表明, 荷兰芹下胚轴胚性发生能力随其相对位置而异, 自下而上逐渐提高。提高2, 4-D 浓度有利于胚性愈伤组织的诱导, 水解酪蛋白对胚性能力的表达没有显著影响。在胚状体发生过程中, 添加Co²⁺显著降低培养物内源IAA 和ABA 水平, 并提高胚状体诱导率。其中对照组IAA 有一个峰值, ABA 有两个峰值;实验组ABA 变化趋势与对照组相似, 而IAA 则始终没有峰值出现。Co²⁺对IAA 和ABA 的抑制机制可能有所不同。     

薇甘菊的生物防治及其天敌在中国的新发现

薇甘菊(Mikania mixeantha H.B.K.)为原产中南美洲的菊科假泽兰属攀缘草本植物,现在广泛分布于东南亚地区并对我国南方部分地区的农林业生产造成严重危害。由于施用化学除草剂会对环境造成污染,所以生物防治更为可靠。大量工作表明,一些真菌和昆虫有望被用来进行薇甘菊的生物控制。本文中报道的薇甘菊天敌小蓑蛾(Acanthopsyche sp.)为国内首次发现,为薇甘菊的生物防治提供了新的线索和启示。     

病毒命名与分类系统研究进展

病毒的命名过去不够统一,有些病毒是以宿主、病理特点、致病症状、病毒颗粒形态进行命名,有些病毒是以地名和人名进行命名,还有些病毒是以字母和数字命名。病毒的分类系统也不一致,动物病毒分类等级设立科、属、种;而植物病毒分为组、亚组、种。为了力求分类和命名的统一,１９９２年Ｍａｒｔｅｌｌｉ首先提出了植物病毒的科、属、种分类原则,１９９３年８月在英国格拉斯哥召开的第９届国际病毒大会上,国际病毒分类委员会（ＩＣＴＶ）采纳了这一分类原则,并且新设立了一些植物病毒的科、属［１］,１９９５年在ＩＣＴＶ所公布的病毒…