高通量测序和DGGE分析土壤微生物群落的技术评价

【目的】比较新一代高通量测序与传统的变性梯度凝胶电泳(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis,DGGE)指纹图谱技术,评价两种技术研究土壤微生物群落结构的优缺点。【方法】针对新西兰典型草地和森林土壤,以16S rRNA基因为标靶,通过高通量测序和DGGE技术分析土壤微生物群落的组成、丰度和多样性,比较两种方法在土壤微生物研究中的适用性。【结果】在不同的微生物分类水平,高通量测序草地土壤检测到22门,54纲,60目,131科,350属;而DGGE仅检测到6门,9纲,8目,10科,10属,表明DGGE显著低估了土壤微生物的群落组成。森林土壤也得到了类似规律,高通量测序的检测灵敏度是DGGE的3.8、6.7、6.4、19.2及39.4倍。进一步分析土壤中主要微生物类群的相对丰度,发现分类水平越低,高通量测序与DGGE的结果差异越大,尤其在科和属的水平上差异最大。以高通量测序结果为标准,DGGE明显高估了土壤中大多数微生物类群的相对丰度,最高可达2000倍。两种方法都表明草地土壤的多样性指数高于森林土壤,但DGGE多样性指数的绝对值远低于高通量测序结果。【结论】高通量测序能够较为全面和准确的反映土壤微生物群落结构,而DGGE仅能够反映有限的优势微生物类群,在很大程度上极可能低估土壤微生物的物种组成并高估其丰度。     

小麦一个新BBI型蛋白酶抑制剂基因TaUES的克隆及初步分析

根据小麦基因表达芯片结果,以山融3号小麦叶片为试验材料,克隆获得在盐胁迫处理24 h时表达显著提高的基因TaUES(up-regulated expression under saline-stress in wheat,ID:KC408382)。序列分析显示,TaUES编码一个富含半胱氨酸的97个氨基酸的多肽,该多肽含有1个BowB结构域和10个保守的半胱氨酸残基;与小麦或其他物种BBI型蛋白酶抑制剂氨基酸序列具有较高的同源性。推测TaUES是小麦中一种新的BBI型蛋白酶抑制剂基因。基因表达分析表明,TaUES基因参与盐和干旱胁迫应答。异源过表达转基因功能初步分析表明,过表达TaUES转基因烟草后代株系耐盐性提高。     

免疫重建荷人膀胱癌 -SCID 鼠模型的建立 *

摘要 目的：探讨建立稳定的荷人膀胱癌 SCID 鼠人化复合型的方法,为在人免疫重建荷人膀胱肿瘤 SCID 鼠型检测重组 BCG 的免疫刺激和免疫保护中打下基础。方法： 经 SCID 鼠腹腔内注射人 PBL、 皮下接种 RT4 膀胱癌细胞, 于接种后 4 周检测 SCID 鼠体内人免疫细咆水平(IgG 和 CD 3+ 、 CD 4+ 、 CD 8+ T 细胞)及脾脏重量, 观察皮下成瘤潜伏期及成瘤率。结果： 型组 100％ 成 瘤,病理类型为移行细胞癌; 检测 SCID 鼠血中人 IgG 均一定水平存在, 与对照组间差异有统计学意义(P<0.01); 人 CD 3+ 、 CD 4+ 、 CD 8+ T 细胞在鼠血及脾中均有表达, 而对照组均未检出(P<0.05); 4 周鼠脾重平均(178.9± 45.2)mg。较对照组(40.6± 14.8)mg 差异 有统计学意义(P<0.01)。结论： 采用腹腔注射人 PBL、 皮下接种 RT4 膀胱癌细胞的方法可以有效地建立人化荷人膀胱癌 SCID 鼠 型, 较好地拟人浸润性膀胱癌体内生物学特性,是膀胱癌免疫基因治疗的较理想型。     

植物基因工程表达载体的改进和优化策略

外源基因在转基因植物中表达效率低一直是令相关研究者困扰的一个问题.转基因植物的生物安全性最近在全球范围内开始引起世人的担忧.本文简要介绍了近年来在植物表达载体构建方面所采用的一些新策略,这些策略有助于增强外源基因的表达水平、提高生物工程体的安全性。 Abstract:The low expression level of foreign genes in transgenic plants is a puzzling question for researchers in plant genetic engineering.The biosafety concern is now causing a growing public wariness of transgenic plants around the world.This article reviews the new strategies currently used in construction of plant expression vector for plant genetic engineering.These strategies are important for obtaining better expression of foreign genes and developing safer transgenic plants.     

转Bt基因水稻对二化螟幼虫取食、生长及其存活的影响(英文)

在实验室中以转cry1Ab基因水稻 克螟稻 1号为材料 ,研究了不同温度下Bt水稻对二化螟Chilosuppressalis (Walker) 3龄和 5龄幼虫取食、生长及其存活的影响。结果表明 ,不同温度下 3龄和 5龄幼虫取食Bt水稻后 ,其取食量、体重增长和存活率均极显著低于对照。温度对 3龄幼虫取食、生长和存活无显著影响 ,但对 5龄幼虫的取食和体重增长则有显著影响。幼虫死亡率与其取食Bt水稻的累积食量间存在着正相关关系。     

普通小麦与簇毛麦对称及不对称体细胞杂交的比较

由长期继代的小麦品种济南177悬浮系制备原生质体为受体,取继代一年的簇毛麦愈伤组织不经照射或经⁶⁰Co-g射线照射,剂量分别为40,60,80Gy(1.3Gy/min),然后分离原生质体为供体,在PEG诱导下分别进行了对称及不对称融合(g融合).经形态学、细胞学、同工酶及5SrDNA间隔序列分析鉴定,对称及不对称融合均高频率地获得了体细胞杂种细胞系,并在对称融合及低剂量g辐照组合得到再生杂种植株.基因组原位杂交的结果证实,对称及不对称融合杂种中异源染色体间不同方式的易位及重组均普遍存在.g辐照存在剂量效应.结果表明:对称及不对称体细胞杂交均可有效地实现核基因的转移与重组,而不对称体细胞杂交还可直接导致染色体小片段易位,显示出此方法在小麦育种上的独特优势.     

转基因植物外源基因逃逸的途径

随着转基因植物商品化进程的加快,对其进行生态风险性评价也日益引起许多学者和科学家的重视。人们对转基因逃逸到其它亲缘物种中能否产生超级杂草、昆虫是否会产生耐受性及转基因植物对生物多样性的影响等问题进行了广泛的研究。本文对转基因植物中外源基因逃逸的几种主要途径作了综述,并对研究方法与手段进行了简要讨论,希望能为有关决策和科研部门提供一些思路。     

Comparative study of symmetric and asymmetric somatic hybridization between common wheat and Haynaldia villosa

Symmetric and asymmetric protoplast fusion between long term cell suspension-derived protoplasts of Triticum aestivum (cv. Jinan 177) and protoplasts of Haynaldia villosa prepared from one-year-old embryogeneric calli was performed by PEG method. In asymmetric fusion, donor calli were treated with gamma ray at a dose of 40, 60, 80 Gy (1.3 Gy/min) respectively and then used to isolate protoplasts. Results of morphological, cytological, biochemical (isozyme) and 5S rDNA spacer sequence analysis revealed that we obtained somatic hybrid lines at high frequency from both symmetric and asymmetric fusion. Hybrid plants were recovered from symmetric and low dose γ-fusion combinations. GISH (genomic in situ hybridization) analysis proved exactly the existence of both parental chromosomes and the common occurrence of several kinds of translocation between them in the hybrid clones regenerated from symmetric and asymmetric fusion. And the elimination of donor DNA in hybrid clones regenerated from asymmetric fusion     

水稻ＣＭＳ—ＷＡ育性恢复基因的定位

在由227个组合组成的珍汕97A×（珍汕97B×密阳46）F