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一个生物体基因组测序工作的完成 ,是进行基因组学和功能基因组学研究的基础 ,只是巨量工作的开始。本文通过运用GeneMark以及softberryfgenesV等软件在铜绿假单胞菌噬菌体PaP2基因组上共发现了 5 8个推定基因的编码区 ,为了解这些基因的功能 ,进行了两个方面的研究。一方面是将纯化噬菌体颗粒进行SDS PAGE分析 ,发现噬菌体PaP2至少含有 10个衣壳蛋白质 ,再转印到PVDF膜上 ,分别剪下各条带进行蛋白质N 末端氨基酸测序。根据蛋白质实测分子量 ,从 5 8个ORFs中找出编码相近分子量产物的ORFs ,再根据N 端氨基酸序列确定衣壳蛋白质的… 相似文献
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在噬菌体全基因组测序工作中 ,基因组结构性质和末端鉴定是一个重要内容 ,只有在明确了末端的性质与结构之后 ,对一个生物体的测序工作才告结束。噬菌体PaP2是我室新近分离的 1株溶原性铜绿假单胞菌噬菌体 ,以噬菌体PaP2基因组为模板 ,经过鸟枪法随机测序和重叠群组装拼接之后得到的是一个全长为 4 3783bp的表观为“环状”的dsDNA基因组 ,基因组在自然状态下的固有形状需要用实验证实。用在基因组上仅有一个切点的限制性内切酶AatⅡ和只有 2个切点的限制性内切酶ScaI进行酶切反应 ,之后将噬菌体基因组的物理图谱和电子酶切图谱进行比较 … 相似文献
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铜绿假单胞菌(绿脓杆菌)外毒素A(PEA)为该菌最主要的致病物质,由toxA基因编码.本文综述PEA的调控基因,包括正调控基因regA、regB、lasR、ptxR、vfr和负调控基因fur、ptxS.regA是影响toxA转录的最主要基因.除lasR外,其余其因均在转录水平上通过regA调控PEA的产量. 相似文献
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肽抗生素研究进展及其应用前景 总被引:2,自引:0,他引:2
传统的抗生素大多为霉菌、放线菌的代谢产物。但近些年来的研究已经表明 ,一些植物、昆虫、两栖类、鸟和多种哺乳动物甚至人类等生物也能产生抗生素类物质。目前已经发现的这类物质已达 30 0多种以上。它们在生物界的广泛存在表明其是有机体防御系统进化的古老机制。早期将此类物质称为“防役素”(defencin) ,也有称为“抗菌肽”(antibacterialpeptides)的。近年来国际文献中趋向于使用“肽抗生素”( peptideantibiotics)一词 ,这是最贴切的 ,它既反应了肽抗生素的化学本质是一种“多肽” ,也反应了它是一种“抗生素” ,最容易为大众理解与… 相似文献
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越来越多的实验证据表明,tRNA基因与噬菌体及原核生物的整合位点密切相关。tRNA基因与tmRNA基因自身的独特结构使得其可被频繁的利用作为遗传元件的整合位点。本文对tRNA基因的结构特征、整合位点在tRNA基因中的亚定位情况、整合酶的系统进化与attB在tRNA基因中亚定位的关系、新整合位点使用的进化、tRNA基因整合位点的选择及识别的类属性假设等做了简要介绍。 相似文献
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在感染过程中,病原体会表达一系列基因产物以适应体内环境.因此,病原体只在宿主体内表达或高表达的基因可能与致病机制密切相关.本研究用体内诱导抗原技术(in vivo induced antigen technology,IVIAT)来筛选伤寒沙门菌感染过程中体内诱导表达的抗原,共筛选到7个体内诱导(in vivo induced,IVI)抗原,分别是BcfD(菌毛结构亚单位)、GrxC(谷氧还蛋白3)、SapB(ABC转运系统)、T3663(ABC未知转运系统)、T3816(可能的有关硫氰酸酶的硫转移酶)、T1497(可能的TonB依赖受体)和T3689(功能未知),其中BcfD,GrxC,SapB,T3663和T3689这5个抗原与吸附处理后的健康志愿者的血清无交叉免疫反应.这些筛选到的体内诱导抗原是新药和疫苗开发的潜在靶标,同时也有利于新诊断方法的研究. 相似文献