聚类分析在石首鱼类分类中的应用

以福建近海出现过的13属23种石首鱼（Sciaenidae）作为分类单元（OperationalTaxonomic Units）及其量化数据取值依据,选取39个特征指标,采用系统聚类分析法（HierarchicalCluster）对其进行数值分类,得出了福建近海石首鱼类的聚类分类结果.结果表明：聚类分析法的分类结果与传统的形态分类结果基本吻合,可将福建近海出现过的石首鱼类分成13类（属）.证明了朱元鼎教授等对我国石首鱼类的分类是比较科学、合理的.研究结果支持把鮸状黄姑鱼（Nibea.miichthioides）归到黄鳍牙鱼（鱼或）属（Chrysochir）,这一点与传统的形态分类法观点不同.另外,本研究结果对大头白姑鱼（Argyrosomus macrocephalus）和勒氏短须石首鱼（Umbrina.russelli）的分类存有分歧,并提出了一些具有参考价值和值得重视的观点,有待将来进一步的探讨.     

中国东海二甲基巯基丙酸内盐(DMSP)合成与降解菌的水平和垂直分布

【目的】二甲基巯基丙酸内盐(dimethylsulfoniopropionate,DMSP)及其裂解产物二甲基硫(dimethyl sulfide,DMS)在海洋硫循环中发挥重要作用。目前关于DMSP降解细菌的分布已有部分报道,但其合成细菌的研究才刚刚起步。本文拟研究中国东海水体DMSP合成与降解菌及基因的水平和垂直分布(1000m水深)差异,分析其对环境梯度变化的响应。【方法】利用流式细胞仪计数海水样品中微微型浮游生物的数量,通过荧光定量PCR和高通量测序手段定量测定DMSP合成基因(dsy B和mmt N)及物种、DMSP降解基因(ddd P和dmd A)及物种的丰度,分析其在东海海域水平及垂直方向上的分布差异。【结果】在垂直方向上,聚球藻、原绿球藻、微微型真核生物和异养细菌丰度随着水深的增加而先增后减,最大值位于30–50m附近。表层(4m左右)水体的DMSP合成及降解基因丰度最高,DMSP合成菌(如Alteromonas、Phaeobacter和Pelagibaca等)丰度也最高;随着水深增加,表层以下水体中DMSP合成及降解基因和物种丰度先增加后降低,峰值均出现在100–150 m;100 m以下,DMSP降解基因丰度迅速下降,而合成基因丰度下降程度较低,而且接近底层(500 m)时出现随水深逐渐增加的趋势。水平方向二者变化规律不明显。浅层水体(≤100 m)和深层水体(100 m)细菌群落结构存在显著差异,前者拥有较高比例的黄杆菌纲、放线菌纲和蓝细菌纲细菌,后者α变形菌纲细菌丰度较高。【结论】100m及以浅和100m以深的浮游细菌群落结构存在显著差异。表层水体中DMSP合成和降解细菌的丰度最高,100–150 m水体次之,但100–1022 m介导的DMSP合成和降解细菌丰度的变化趋势有较大差别。     

固定化微生物技术在受污养殖水体和水华水域生物修复中的应用

固定化微生物技术作为一种新型的生物修复技术,具有高效、稳定、生物安全性较高等特点,已经广泛应用于各种污染水体的净化修复之中,也包括受污染日益严峻的近海养殖水体。综述从固定化微生物技术的出现和应用出发,对不同固定方法的优劣及其所擅长降解的污染物类型进行对比,对不同载体的特点进行分析,总结了固定化微生物技术在近海养殖水体污染修复的研究概况,并对当前该技术应用存在的问题进行分析和未来研究的方向进行展望。     

舟山近海水样环境DNA获取方法的建立

以曼氏无针乌贼(Sepiella japonica)为研究对象, 通过绝对定量技术建立和优化了舟山近海高浊度水样环境DNA(Environmental DNA, eDNA)的获取方法。研究结果如下: (1)同体积水样采用乙醇沉淀法获得的eDNA产量是滤膜抽滤法的1.76—2.53 倍, 但在实际应用中由于受到采样体积、处理方式、配套设备的限制, 乙醇沉淀法难以发挥出优势; (2)滤网对泥沙等杂质无过滤作用, 添加滤网并不能过滤掉泥沙及增加抽滤体积; (3)滤膜孔径的大小对少量水样的eDNA产量有很大影响, 但对大体积水样eDNA的产量无影响; (4)水样静置处理有可能会增大eDNA产量, 但也有可能会增大eDNA结果的波动性, 使生物量评估结果误差较大; (5)阳离子表面活性剂对eDNA降解有明显的抑制作用; (6)去膜法效果优于碎膜法, 建议使用去膜法进行eDNA消化, 使用时增加离心时间; (7)酚抽除沙法虽然不能提高eDNA产量, 但能明显提高产物纯度。研究首次建立了舟山近海水样大生物eDNA最适获取方法, 为相似水域的水样采集及eDNA提取提供了借鉴参考。     

陆源人类活动对近海生态系统的影响

随着海岸带快速城市化和经济发展,人类活动对近海生态系统的影响日益增加。通过对国内外大量相关文献的分析和与国际专家的研讨,分别从海洋资源开发、海岸带城市化和环境变化等几个方面概述了陆源人类活动对近海生态系统的影响。目前陆源人类活动导致近海生态系统出现的主要问题有:海洋生物资源过度捕捞、海岸带富营养化、海洋酸化、珊瑚礁退化、海洋垃圾、以及海岸带矿产开采等高强度开发活动引发的重金属和持久性有机污染物污染等。这些问题会直接导致海洋生物群落结构变化、影响水质、降低海洋生物多样性,最终影响海洋生态系统服务功能,威胁海洋生态系统健康。这些问题的根源多来自陆地,必须将海洋和陆地作为一个有机整体,整合海陆系统相互作用的科学计划,推进海洋资源和近海生态系统的可持续管理。     

烟台近海底栖动物调查报告

烟台近海底栖动物调查报告王绪峨,徐宗法,周学家（山东省海洋水产研究所,烟台２６４０００）ＢｅｎｔｈｉｃＡｎｉｍａｌＳｕｒｖｅｙｉｎＹａｎｔａｉＩｎｓｈｏｒｅｓ．￥ＷａｎｇＸｕｅ;ＸｕＺｏｎｇｆａ;ＺｈｏｕＸｕｅｊｉａ（ＭａｒｉｎｅＦｉｓｈ－ｅｒｉｅｓ...     

海南岛东部近海新第三纪孢粉植物群

根据ＢＤ２３－１－１井与孢子花粉共生的海相浮游有孔虫和钙质超微化石,论述了中国海南岛东部近海新第三纪各个时期的孢粉植物群特征。建立了４个孢粉组合,它们是：１．Ｑｕｅｒｃｏｉｄｉｔｅｓ－Ｃｕｐｕｌｉｆｅｒｏｉｐｏｌｅｎｉｔｅｓ－Ｆｌｏｒｓｈｕｅｔｚｉａ－Ｄｉｃｏｌｐｏｐｏｌｉｓ组合（早中新世晚期）;２．Ｄｉｃｏｌｐｏｐｏｌｉｓ－Ｅｘｔｒａ－ｐｕｎｃｔａｔｏｓｐｏｒｉｔｅｓ－Ｔａｘｏｄｉａｃｅａｅｐｏｌｅｎｉｔｅｓ组合（中中新世早期）;３．Ａｂｉｅｔｉｎｅａｅｐｏｌｅｎｉｔｅｓ－Ｐｏｌｙｐｏｄｉ－ａｃｅａｅｓｐｏｒｉｔｅｓ－Ｌｉｑｕｉｄａｍｂａｒｐｏｌｅｎｉｔｅｓ组合（中中新世晚期至晚中新世）;４．Ａｂｉｅｔｉｎｅａｅｐｏｌｅｎｉｔｅｓ－Ｐｅｒｓｉｃａｒｉｏｉｐｏｌｉｓ组合（晚中新世晚期至早上新世）。孢粉植物群反映了海南岛东部近海新第三纪的气候基本上一直比较温暖湿润,并且逐渐降温的历程。     

我国近海赤潮多发区域及其生态学特征

根据有关的研究资料,分析我国近海赤潮多发区分布、主要赤潮生物种类、环境状况及赤潮发生生态学特点.结果表明,我国辽东湾、渤海湾、莱州湾、大连湾、长江口、舟山海域、杭州湾、厦门湾、柘林湾、大鹏湾、珠江口等为赤潮多发区.引发赤潮的因素较多,它与气象、水动力、营养盐及生物环境的变化密切相关,人类活动(如海水养殖、陆源污水排放等)影响加剧近海富营养化是引发赤潮的重要因素;但富营养化并非发生赤潮的唯一条件,低营养海区也可能发生赤潮.目前对诱发赤潮的关键因子及赤潮发生机理,应加强定点长期监测和开展深入研究.     

基于表型参数及SRAP标记的广东茶树种质遗传多样性

采用表型鉴定与SRAP分子标记,对25份广东茶树种质和5份对照品种的遗传多样性进行系统评价和分类;利用Pearson相关和Farthest neighbor方法对其表型性状进行聚类分析.结果表明:茶树各性状的平均变异系数为32.15%,其中茸毛的变异系数最大,为42.41%;芽叶生育期变异系数最小,为18.52%.经基于表型性状的聚类分析,30份样本可分为4组：第1组有17个品种,第2组有10个品种,第3组为云南大叶种和凌云白毛茶2个对照品种,第4组仅海南大叶种1个对照品种.利用21对SRAP引物对茶树基因组DNA进行研究,共扩增出127条带,其中114条为多态性带,占88.67%;平均每个引物组合的谱带数和多态性带数分别为6.05条和5.43条.当遗传距离为0.39 cm时,茶树种质可分成A、B、C 3类,其中A类占83.33%;当遗传距离为0.31 cm时,又可将A群划分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ3个亚群,其中第Ⅰ亚群包括13个品种,第Ⅱ亚群包括2个品种,第Ⅲ亚群包括10个品种.依据SRAP标记的聚类与表型性状的表现并不完全一致.     

山东近海鱼类群落分类多样性

根据相关文献整理了山东近海鱼类名录,并根据1998—2009年山东近海鱼类调查名录,应用平均分类差异指数(Δ+)和分类差异变异指数(Λ+)研究了鱼类分类学多样性特征。结果表明,山东近海鱼类名录包括2纲28目91科169属225种,1998年调查仅2纲11目41科58属62种,2006年调查为1纲13目41科71属78种,2009年调查为1纲9目32科55属62种。1998年—2009年调查鱼类种类远远低于鱼类名录记录的种数,分类阶元包含指数较低,平均每属包含1.1种。根据山东近海鱼类名录计算鱼类平均分类差异指数为66.1,分类差异变异指数为141.7;1998—2009年历次调查鱼类平均分类差异指数在60.9—62.7之间,分类差异变异指数在65.4—92.3之间。将1998—2009年历次调查鱼类群落分类多样性指数计算值叠加到山东近海鱼类总名录的95%置信漏斗曲线图,结果表明大部分调查值在置信漏斗曲线之外,目前山东近海鱼类分类多样性已大幅下降。