表观基因组学研究方法进展与评价

表观遗传学是指基于非基因序列改变所致基因表达水平的变化, 如DNA甲基化和组蛋白修饰等; 表观基因组学则是在基因组水平上对表观遗传学改变的研究。DNA甲基化已经成为表观遗传学和表观基因组学的重要研究内容, 人类表观基因组计划的最终目标是绘制出人类基因组中甲基化可变位点图谱。随着研究的不断深入, 各种研究方法被开发出来以满足不同类型研究的需要。文章主要介绍目前已有的表观基因组学研究方法, 并对其进行简要分析和总结。     

利用抑制差减杂交技术分离三角褐指藻在缺氮条件下上调表达的基因

为了阐明硅藻利用氮源的分子机制, 以三角褐指藻为材料, 利用抑制差减杂交技术, 分离鉴定了16个在缺氮诱导条件下上调表达的基因片段。其中, 与已知功能基因具有较高相似性的有7种, 都是跟氮源的吸收利用相关的。Northern blotting验证其中5个基因, 包括硝酸盐转运蛋白基因、铁氧化还原蛋白亚硝酸还原酶基因、铵盐转运蛋白基因、结合ATP盒的转运蛋白基因和嘌呤透过酶基因, 在缺氮诱导条件下转录水平有明显上调。     

遗传性先天无虹膜患者的PAX6基因新突变(c.1286delC)

摘要: 为了研究遗传性先天无虹膜(Hereditary congenital aniridia)患者发病的分子遗传学机制, 采用PCR扩增PAX6基因编码区的11个外显子(exon 4-13)及外显子和内含子相连接的区域、PCR产物直接测序的方法对1个遗传性先天无虹膜家系的所有成员进行了遗传突变分析。结果表明, 在家系中两个患者的PAX6基因exon 11均存在c. 1286delC新突变。此单个碱基的缺失造成了移码突变, 导致肽链自309位氨基酸开始产生一段含55个氨基酸的异常肽段, 并产生提前终止密码子(Premature termination codon, PTC), 使PAX6蛋白羧基端的59个氨基酸缺失。另外, 通过PCR-RFLP分析的方法对家系中所有正常成员和50名中国汉族健康对照个体基因组DNA进行分析均未检测到该突变。     

土壤氮素循环模型及其模拟研究进展

N既是植物必需的营养元素,又是造成环境污染的重要元素.正确模拟土壤中N循环已经成为科学家共同关注的热点问题.简述了土壤N循环的基本过程,重点介绍了13种土壤N循环模型和6个土壤N循环过程的模拟,并讨论了模拟中存在的参数化问题.     

八种昆虫离体细胞系对灭多威农药的敏感性研究

采用ＭＴＴ法,研究了灭多威农药对八昆虫离体细胞系敏感性的差异。结果显示,同一浓度处理下,不同细胞系细胞病变的程度不同,敏感性差异很大。ＬＣ５０值在１０＾２－１０＾５μｇ／ｍｌ范围内变化,其中,白纹伊蚊细胞系是最敏感的,而小菜蛾细胞系几乎不敏感。     

荧光增白剂对苏云金杆菌毒力的增效作用及其紫外防护功效的研究

以棉铃虫 (Ｈｅｌｉｏｔｈｉｓａｒｍｉｇｅｒａ)初孵幼虫为供试虫测试了三种二苯乙烯类荧光增白剂 (ｆｌｕ ｏｒｅｃｅｎｔｂｒｉｇｈｔｅｎｅｒｓ)ＴｉｎｏｐａｌＬＰＷ ,ＶＢＬ和ＪＤ 3对苏云金杆菌 (ＢａｃｉｌｌｕｓｔｈｕｒｉｎｇｉｅｎｓｅｓＢ .ｔ.)杀虫剂毒力的影响 ,并检测了荧光增白剂ＶＢＬ作为佐剂在Ｂ .ｔ.受紫外线照射时对Ｂ .ｔ.的光保护功效。结果表明 :添加 0 .1 2 5 % ,0 .2 5 % ,0 .5 %及 1 % (ｗ/ｗ)不同浓度荧光增白剂ＴｉｎｏｐａｌＬＰＷ的复混型苏云金杆菌制剂对初孵棉铃虫的ＬＣ5 0 值与单剂Ｂ .ｔ.的ＬＣ5 0 值…     

网络上的生物信息资源

生物信息学是生命科学中最活跃的领域之一。目前,生物信息资源的利用已实现了高度的网络化。算法和软件的进步、数据库的一体化、服务器－客户模式的建立使之成为生物、医药、农业等学科强有力的工具。     

用国产微孔玻璃珠初步纯化人u-PA

用国产微孔玻璃珠从ＣＤ－１工程细胞株培养上清中纯化ｕ－ＰＡ,摸索了微孔玻璃珠结合ｕ－ＰＡ的条件和洗脱方法,比较了硫酸铵线性梯度洗脱或２５％乙二醇洗脱ｕ－ＰＡ活性的结果,最后确定洗脱的条件为０．２５ｍｏｌ／ＬＴｒｉｓ、１～２ｍｏｌ／Ｌ（ＮＨ４）２ＳＯ４、ｐＨ９．３。经此一步纯化,ｕ－ＰＡ比活性达到１５３２９ＩＵ／ｍｇ,回收率７８％,还原条件下ＳＤＳ－ＰＡＧＥ分子量为５２×１０３的单链ｕ－ＰＡ占７４％。     

鼻咽癌的端粒酶活性检测及其临床意义初探

采用Ｋｉｍ 等建立的端粒重复序列扩增法及内标技术对５８ 例患者的鼻咽活检标本进行其端粒酶活性测定． ４３ 例鼻咽癌确诊患者标本的该酶阳性率为９０．７％ ,１５ 例鼻咽部慢性炎症（对照组）标本的该酶阳性率为６．７％ ． ３ 例复发的鼻咽癌标本均呈阳性, ２ 例治愈的鼻咽癌标本则属阴性． 鼻咽癌组织端粒酶活性在不同性别、年龄、病理类型、临床分期的样本之间无显著差异． 由于鼻咽癌组织的端粒酶活化现象普遍存在,其活性检测可望成为鼻咽癌早期诊断、治疗监测及预后的指标．     

北冰洋的珍兽——一角鲸

在那一望无际、“千里冰封,万里雪飘”的北冰洋中,生活着一种神奇的、与众不同的哺乳动物———一角鲸,它的学名为ＭｏｎｏｄｏｎｍｏｎｏｃｅｒｏｓＬｉｎｎａｅｕｓ,英文名Ｎａｒｗｈａｌｅ,法文名和西班牙文名都是Ｎａｒｖａｌ。一角鲸隶属于鲸目（Ｃｅｔａｃｅａ）,齿鲸亚目（Ｏｄｏｎｔｏｃｅｔｉ）,一角鲸科（Ｍｏｎｏｄｏｎｔｉｄａｅ）。一角鲸体型粗壮,头部相对较小,似牛头。成体的胸部鳍肢短而钝,尖端部分稍向上翘;背部略呈弓形,但无背鳍;尾鳍肢的中部凹陷,两端突出,呈“Ｖ”字型,尖端部向上卷曲,老年个体更为明…