基于TaqMan探针多重实时荧光PCR的肠道特殊菌群绝对定量方法的建立

本研究旨在建立对肠道主要共生菌的快速定量方法。根据细菌16S rRNA基因的保守序列并参考相关研究,设计针对总肠道菌群的通用引物和探针,以及针对双歧杆菌属、肠球菌属和肠杆菌科的特异性引物和探针,采用引物设计工具(Primer-BLAST) 以及聚合酶链式反应(polymerase chain reaction, PCR)扩增以验证引物和探针的特异性。通过分子克隆技术,构建各目标菌属目的基因的重组质粒作为qPCR检测的标准模板,选择标准模板进行重复性实验,并计算组内和组间重复变异系数。用所建立的方法对不同年龄段的临床粪便标本进行3类细菌的检测,并初步分析这些菌群与增龄的关系。结果显示,引物和探针具有较高的特异性;各目的细菌标准曲线在一定范围内线性关系良好,总菌群或各目标菌属的线性范围分别为：总菌群2.9×10³～2.9×10¹²copies/μL、双歧杆菌3.1×10²～3.1×10⁹ copies/μL、肠球菌5.9×10²～5.9×10⁹ copies/μL、肠杆菌6.3×10²～6.3×10⁹ copies/μL,决定系数R²≥ 0.995;检测的最低拷贝数为总菌群7.5×10² copies/μL、双歧杆菌 46 copies/μL、肠球菌 37 copies/μL、肠杆菌 51 copies/μL;重复性实验变异系数在1.32%以下,具有良好的可重复性。对不同年龄段临床粪便标本检测的结果显示,肠球菌和肠杆菌含量随增龄呈增长趋势,且老年组含量显著高于青年组,但在高龄老年人中未发现肠球菌数量增加。双歧杆菌含量随增龄减少,且各组间差异显著,在高龄老年人中也未观察到双歧杆菌显著减少。结果提示,本研究建立了一种可供临床推广的菌群绝对定量方法,能够同时检测3类细菌和菌群总量,对于菌群定量研究具有实际意义。     

耐碳青霉烯类肠杆菌的流行病学特点与治疗现状

耐碳青霉烯类肠杆菌(carbapenem-resistant Enterobacteriaceae,CRE)是近年来检出率不断升高的一种临床常见耐药菌,是导致患者死亡的独立危险因素。CRE的出现主要是由于细菌产碳青霉烯酶,包括肺炎克雷伯菌产生的碳青霉烯酶(Klebsiella pneumoniae carbapenemase,KPC)、金属β-内酰胺酶(metallo-β-lactamase,MBL)和 苯唑西林酶(oxacillinase,OXA),少数是由于细菌外膜蛋白改变以及外排泵高表达。临床上最常见的CRE是肺炎克雷伯菌,最常暴发CRE感染的科室是重症监护室(intensive care unit,ICU),感染高危因素包括接触医疗机构、各种侵入性操作以及抗菌药物使用史。由于缺乏前瞻性临床试验数据,目前在治疗CRE感染的高危患者时多采用多药联合的经验性治疗措施,一些经典药物如多黏菌素、替加环素、磷霉素等起到了意想不到的效果,一些新药如头孢他啶-阿维巴坦也投入使用并发挥了一定作用。本文就近年来CRE感染的流行病学特点以及目前临床上主要使用的药物进行综述。     

大豆低聚糖对肠道双歧杆菌和肠杆菌的促生长作用

目的:观察大豆低聚糖和所含糖对肠道菌群中双歧杆菌、肠杆菌体外促生长作用。方法:按1％大豆低聚糖、0．36％水苏糖、0．52％蔗糖、0．11％棉子糖含量配制培养液,分别接种各试验菌株,在0、12、24小时测定各培养液吸光度A值(分光光度计．550nm)和pH值。结果:经24小时培养,加大豆低聚糖的双歧杆菌标准株和临床分离株培养液A值分别为>1．5和1．307,大于肠杆菌标准株和临床分离株的1．1和1．173,而其pH值小于肠杆菌;加水苏糖的双歧杆菌培养液A值为1．47,大于蔗糖的1．4和棉子糖的0．53。结论:大豆低聚糖促双歧杆菌生长作用大于促肠杆菌生长,水苏糖是促双歧杆菌增殖生长的主要成分。     

溶解肠杆菌的交流电电解刺激过程

以葡萄糖为惟一碳源,研究了溶解肠杆菌(Enterobacter dissolvens)在外加电场交流电的刺激下细胞的生长和代谢的过程.研究表明,在低电流10 mA刺激下,交流电刺激下的细菌没有明显的刺激效应;当采用100 mA的电流通电24 h,交流电刺激下的细菌出现了明显的刺激效应,当通电12 h后,菌液葡萄糖的降解率和脱氢酶活性分别为对照参比的1.4倍和2.17倍,细胞浓度呈现明显的增长.分析原因可能是由于电极产物中没有过氧化氢的产生.     

608份胆汁标本中分离细菌菌谱及其药敏结果分析

了解胆系感染常见的病原菌及其药敏情况,为抗菌治疗提供依据。采用法国生物梅里埃公司的VITEK-2及API系统进行细菌鉴定,药敏试验采用K—B纸片法,应用WHONET5．4对药敏结果进行分析。608份胆汁标本中共分离细菌和真菌431株,其中革兰阴性杆菌320株（占74．2％）、革兰阳性球菌91株（占21．1％）、真菌20株（占4．6％）;排在前3位的菌株分别是大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌和铜绿假单胞菌。胆系感染以革兰阴性杆菌为主,尤以肠杆菌科细菌为主,上述细菌对碳青霉烯类、酶抑制剂类以及三代头孢菌素的敏感率均较高。     

肠杆菌诱导型AmpC酶对第三代和第四代头孢菌素的影响

目的探讨诱导型AmpC酶对三代、四代头孢菌素的影响及其治疗策略。方法采用药敏纸片扩散法,用FOX药敏纸片作为诱导剂,以CAZ、CTX和FEP作为指示剂,检测肠杆菌的诱导AmpC酶的产生。结果待测的196株菌株中有101株为产诱导型AmpC酶阳性（51．5％）,其中阴沟肠杆菌58株（67．4％）,产气肠杆菌18株（52．9％）,沙雷菌属共8株（40％）,费劳地枸椽酸杆菌6株（42．8％）,聚团肠杆菌6株（33．3％）,奇异变形杆菌5株（20．8％）,其余95株产诱导型AmpC酶为阴性。产诱导型AmpC酶阳性菌株中无一株对FEP纸片的抑菌圈直径有影响,诱导型AmpC酶试验均为阴性。结论对于鉴定确认为诱导型AmpC酶阳性菌株的感染,即使实验报告三代头孢菌素为敏感,也应慎用或避免使用第三代头孢菌素的治疗,以第四代头孢菌素如头孢吡肟为首选药。     

改良环介导等温扩增技术快速检测婴儿配方奶粉中的阪崎肠杆菌

[目的]采用改良环介导等温扩增(LAMP)技术,快速检测婴儿配方奶粉中的阪崎肠杆菌.[方法]以阪崎肠杆菌(ATCC29544)的16S-23S rRNA间区序列作为靶序列,设计内、外引物和环引物,通过肉眼观察白色沉淀,判断检测结果.[结果]LAMP检测阪崎肠杆菌的灵敏度为0.101 CFU/mL,人工污染阪崎肠杆菌的婴儿配方奶粉的检出限为1.1 CFU/g.采用试剂盒提取DNA,从样品处理到报告结果,耗时1 h.而对照,PCR检测阪崎肠杆菌的灵敏度为101 CFU/mL,人工污染阪崎肠杆菌的婴儿配方奶粉的检出限为1100 CFU/g.采用同样方法提取DNA,从样品处理到报告结果,耗时3 h.[结论]因此,LAMP检测婴儿配方奶粉中的阪崎肠杆菌灵敏度高,耗时短,方法简便.     

CTX-M型阴沟肠杆菌插入序列的检测

目的研究插入序列ISEcp1B及超广谱β-内酰胺酶(extended spectrum beta-lactamase,ESBLs)、AmpC酶基因在CTX-M型阴沟肠杆菌(Enterobacter cloacae,ECL)中的分布,并分析其与耐药的关系。方法用MIC法分析2株含CTX-M基因的阴沟肠杆菌的耐药性;用多重聚合酶链反应(PCR)技术扩增ESBLs、AmpC、ISEcp1B基因及I类整合子,对PCR产物进行DNA测序。结果 2株阴沟肠杆菌对青霉素类、四代头孢菌素、喹诺酮类和呋喃类抗生素耐药,对氨基糖苷类和碳青霉烯类表现为敏感。在ECL15同时检出TEM、CTX-M-G1、ACT-1、I类整合子及ISEcp1B基因;在ECL45同时检出SHV、CTX-M-G1及ISEcp1B基因。ECL45(400 bp)ISEcp1B的右端均连接一个反向重复序列,有-35及-10两个启动子,与CTX-M型ESBLs编码起始距离不相同,与ECL15序列一致,GenBank登录号:EF437434;ECL45(500 bp)无反向重复序列,只有一个-35启动子,与CTX-M型ESBLs编码起始距离不相同,与ECL15序列不相同,GenBank登录号:EF441350。结论在CTX-M型阴沟肠杆菌中检出2种新的插入序列ISEcp1B,其对CTX-M的高水平表达和传播可能起重要的调控作用。     

20项肠杆菌酶学指标的筛选

肠杆菌科酶法快速分类系统的研制工作中,初选了20项酶学指标,利用SAS软件的主成分分析和变量聚类分析法,结合变异系数法及相关系数法,按照专业知识的特点,对271株肠杆菌的实验数据结果,筛选出了主要的10项指标。此研究为提取主要指标,并对指标加权作进一步处理提供了科学依据。     

浅析肠杆菌科食源性感染常见致病菌的快速检测方法

目的:浅析肠杆菌科食源性感染常见致病菌的快速检测方法。方法:采用带有正电荷的尼龙膜作为寡核苷酸芯片的载体,利用寡核苷酸芯片的技术进行肠杆菌刻食源性感染常见致病菌的检验方法进行检测。结果:在同样的条件下,可以检测到多种细菌的的基因突显。结论:寡核苷酸芯片技术可以作为快速检测肠杆菌常见致病菌的有效方法之一,可以快速诊断并预防食源性感染病菌。