基于高通量测序的精神分裂症患者 肠道菌群多样性

目的探讨精神分裂症患者肠道菌群多样性变化。方法收集16例精神分裂症患者(schizophrenia,Sch)与18例健康者(healthy donor,HD)的粪便样本,提取肠道菌群基因组,扩增16SrRNA基因,运用Illumina平台进行测序。对测序结果进行多样性和物种组成差异分析。结果精神分裂症患者组肠道菌群在门、纲、目、科、属、种、分类操作单元(operational taxonomic units,OTUs)水平的群落种类数目少于健康对照组。Alpha多样性指标中患者组的Ace指数(226.58±31.67)、Chao1指数(222.29±34.45)和Shannon指数(2.66±0.69)明显低于健康对照组(293.63±56.07、302.2±57.99、3.59±0.36),差异均有统计学意义(Ps0.001),而Simpson指数(0.20±0.17)明显高于健康对照组(0.07±0.03),差异有统计学意义(P0.01);Beta多样性分析显示两组研究对象肠道菌群样本可被鉴别区分。精神分裂症患者组与健康对照组样本在门和属水平上肠道菌群组成和含量有差异,其中患者组拟杆菌门和软壁菌门占比明显低于健康组,差异有统计学意义(21.76%vs.27.05%,P=0.008;0.00%vs.0.20%,P=0.033),而放线菌门明显高于健康组(13.52%vs.2.88%,P=0.020),差异有统计学意义;患者组拟杆菌属和柔嫩梭菌属占比明显低于健康组(9.15%vs.20.60%,P=0.031;3.29%vs.9.58%,P=0.005),差异有统计学意义,而双歧杆菌属、普雷沃菌属和巨单胞菌属明显高于健康组(10.89%vs.1.78%,P=0.025;10.88%vs.1.98%,P=0.046;10.78%vs.2.69%,P=0.026),差异有统计学意义。结论基于16SrRNA的高通量测序有助于分析精神分裂症患者肠道菌群多样性变化,为研究肠道菌群与精神分裂症的关系提供新的思路和理论依据。     

氟喹诺酮类药物体外诱导肺炎克雷伯菌耐药后GyrA和ParC的变异

目的了解3种氟喹诺酮类（FQS）体外诱导肺炎克雷伯菌（Klebsiella pneumoniae,Kpn）耐药性的差异,研究肺炎克雷伯菌DNA旋转酶A亚单位（GyrA）和拓扑异构酶ⅣC亚基（ParC）的变异与其耐喹诺酮类药物的关系。方法采用环丙沙星（CW）、左氧氟沙星（LEX）和加替沙星（GAT）对从临床分离8株Kpn进行体外分步诱导,采用琼脂平板二倍稀释法测定CIP、LVF及GAT对Kpn诱导前、后的最低抑菌浓度（MIC）,并对诱导成功的17株Kpn的GyrA的基因（gyrA）和ParC的基因（parC）进行PCR扩增,选取其中8株KpnDNA测序并进行序列分析比较。结果8株耐FQS菌株都存在GyrA变异,同FQS耐药性相关的变异有Ser83（TCC）→Phe（TTC）、Ile（ATC）和Tyr（TAC）,Asp87（GAC）→Ala（GCC）、ma（GCC）和Glu（GAA）,5株Kpn同时存在ParC的变异：丝氨酸Ser80（AGC）→Ile（ATC）。结论本研究体外实验证实了Kpn可在长期低剂量的接触抗菌药物后形成耐药菌株。在高度耐FQS的Kpn中同时存在GyrA和ParC变异。     

抗生素诱导的呼吸道菌群缺失对小鼠RSV感染的影响

目的探究抗生素雾化暴露引起的呼吸道菌群缺失对小鼠呼吸道合胞病毒(RSV)感染的影响,为临床合理使用抗生素提供指导意见。方法32只BALB/c小鼠分为2组:雾化ddH₂O对照组和雾化ABX组合抗生素组,处理6 d后,进行细菌16S rRNA基因PCR检测,构建呼吸道菌群缺失小鼠模型。上述2组组内再随机分为2小组,即PBS对照组(ddH₂O+PBS,ABX+PBS)和RSV感染组(ddH₂O+RSV,ABX+RSV),饲养至第14天。检测和分析各组小鼠支气管肺泡灌洗液(BALF)中的炎症细胞和相关细胞因子(TNF-α、IL-8、IL-10及MCP-1)的数量和水平,观察肺组织病理学状况及检测病毒载量。结果BALF中细菌DNA提取和16S rRNA基因PCR检测显示,雾化ABX组合抗生素处理能够有效地剔除呼吸道菌群。BALF中炎症细胞和相关细胞因子检测显示,ABX+RSV组炎症细胞总数明显增多(P<0.05),分类以巨噬细胞和淋巴细胞为主;且细胞因子TNF-α、IL-8、MCP-1及IL-10水平显著升高(均P<0.05)。肺部HE染色显示,感染RSV后ddH₂O+RSV组和ABX+RSV组小鼠肺部损伤明显加重(均P≤0.01),与ddH₂O+RSV组相比较,ABX+RSV组的病毒载量明显升高(t=2.7160,P=0.0217)。结论雾化ABX组合抗生素不仅能够有效地剔除呼吸道菌群,而且明显增加了小鼠感染RSV的风险,导致呼吸道炎症加重,以及病毒载量升高。     

低聚果糖体内外对肠道菌的影响

目的 :了解低聚果糖 (FOS)体内外对肠道菌双歧杆菌、类杆菌和肠杆菌科菌的增殖作用。方法 :FOS 1g/ (kg· bw· d) ,灌服 (ig)小鼠 ,连续 14 d后 ,取粪便 ,选择性培养基平板菌落计数法测各菌群。体外试验中 ,按 1%的 FOS添加到各人肠道分离菌培养液中 ,培养 2 4h后测其吸光度 A值和 p H值变化。结果 :ig FOS的小鼠肠道双歧杆菌和肠杆菌数量分别是 9.16± 0 .67和 8.3 3± 0 .70 (log10 N CFU/ g) ,高于对照组(P<0 .0 5)。 FOS体外对各肠道分离菌均有增殖作用 ,依大小分别是双歧杆菌、类杆菌和肠杆菌 ,其 A值分别增加了 0 .8～ 1.192、0 .80 2和 0 .198～ 0 .461,其 p H值分别降低了 1.5～ 1.68、1.2和 0 .2～ 0 .58。结论 :FOS体内外有相对选择性增殖双歧杆菌的作用 ,对类杆菌和肠杆菌也有调整作用     

双歧杆菌在抗感染中的作用

双歧杆菌在抗感染中的作用河南省医学科学研究所郑州４５００５２罗予,蔡访勤双歧杆菌是人和很多动物肠道中正常菌群之一,１８９９年Ｔｉｓｓｉｅｒ［１］首次从母乳营养儿大便中发现该菌,在婴儿粪便中该菌占细菌总数的９８％,并指出它对乳儿营养和预防肠道感染具有重...     

异麦芽寡糖促进肠道分离菌生长的体外实验

目的 观察添加１％异麦芽寡糖对从正常人阑尾标本中分离双歧杆菌、乳杆菌和类杆菌的体外促生长作用。方法 分别在培养前和培养１２、２４、３６ｈ和４８ｈ,用７２１分光光度计和ｐＨ计测定培养液ＯＤ值和ｐＨ值变化。结果 接种双歧杆菌的培养液ＯＤ值从０．１２８增加到１．７,ｐＨ值由７．１降到４．２,增殖效果与添加１％葡萄糖相当。接种乳杆菌的培养液ＯＤ值从０．１７增加到０．８５,ｐＨ值由７．０降到４．８,增殖效果低于添加１％葡萄糖。接种类杆菌的培养液ＯＤ值从０．１０５增加到１．６５,ｐＨ值由７．１降到５．１,增殖效果高于添加１％葡萄糖。结论 添加１％民麦芽寡糖具有促进肠道分离菌双歧杆菌、乳杆菌和类杆菌生长的作用。     

河南省举办“微生态学、厌氧菌与临床应用讲习班”

1993年5月24日～31日河南省医学科学研究所及开封公费医疗医院受河南省医科院的委托,在郑州河南省医学科学研究所举办了“微生态学、厌氧菌与临床应用讲习班”。来自河南省各大医院、院校及科研机构的二十余位代表参加了讲习班。会议请育较高理论水平及丰富实践经验的     

大豆低聚糖对肠道双歧杆菌和肠杆菌的促生长作用

目的:观察大豆低聚糖和所含糖对肠道菌群中双歧杆菌、肠杆菌体外促生长作用。方法:按1％大豆低聚糖、0．36％水苏糖、0．52％蔗糖、0．11％棉子糖含量配制培养液,分别接种各试验菌株,在0、12、24小时测定各培养液吸光度A值(分光光度计．550nm)和pH值。结果:经24小时培养,加大豆低聚糖的双歧杆菌标准株和临床分离株培养液A值分别为>1．5和1．307,大于肠杆菌标准株和临床分离株的1．1和1．173,而其pH值小于肠杆菌;加水苏糖的双歧杆菌培养液A值为1．47,大于蔗糖的1．4和棉子糖的0．53。结论:大豆低聚糖促双歧杆菌生长作用大于促肠杆菌生长,水苏糖是促双歧杆菌增殖生长的主要成分。     

16S rRNA PCR鉴定脆弱类杆菌

目的:应用16SrRNA序列设计PCR引物鉴别脆弱类杆菌。方法:通过脆弱类杆菌16SrRNA序列特异性位点设计引物,对4株脆弱类杆菌及大肠杆菌、乳酸杆菌、嗜热链球菌等进行PCR扩增。应用琼脂糖电泳法对PCR扩增产物进行特异性检测。结果:脆弱类杆菌在176bp左右出现特异性条带,而其他细菌均未出现特异性条带。结论:通过16SrRNA序列中特异位点设计引物进行PCR,可特异性鉴定脆弱类杆菌。     

不同来源HBV病毒株基因的同源性分析

目的研究不同来源HBV病毒株的基因同源性。方法在CenBank中调取中国各地递交的HBV病毒株的全基因序列24个,使用ClustalW1．83生物软件,对各HBV病毒株的全基因序列进行同源性比较,并建立基因进化树,分析其特点。结果不同地区的HBV病毒株的全基因序列并不一致,同一地区来源的HBV病毒株的全基因序列亦并不一致,甚至差别很大。结论不同地区间和地区内的HBV病毒株的全基因序列具有很大的异质性。