circ_0000218通过靶向吸附miR-1182对宫颈癌HeLa细胞增殖、迁移和侵袭的影响

目的探讨环状RNA 0000218(circ_0000218)是否通过靶向吸附miR-1182从而影响宫颈癌HeLa细胞增殖、迁移和侵袭。方法采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术分析43例宫颈癌患者癌组织、癌旁组织中circ_0000218和miR-1182的表达水平。根据转染序列不同分为si-NC组、si-circ_0000218组、miR-NC组、miR-1182组、pcDNA组、pcDNAcirc_0000218组、si-circ_0000218+anti-miR-NC组、si-circ_0000218+anti-miR-1182组。运用细胞计数试剂盒(CCK-8)法、Transwell实验分析circ_0000218和miR-1182表达对HeLa细胞增殖、迁移和侵袭的影响。蛋白质印迹法检测Ki-67、基质金属蛋白酶2(MMP-2)和MMP9蛋白表达。双荧光素酶报告实验和RT-qPCR分析circ_0000218和miR-1182的靶向关系。癌旁组织与宫颈癌组织比较采用配对t检验,两组间比较采用独立样本t检验进行统计学分析。结果宫颈癌组织中circ_0000218表达量高于癌旁组织(4.17±0.32比1.00±0.05),而miR-1182表达量低于癌旁组织(0.33±0.03比1.00±0.05),差异具有统计学意义(P均<0.001)。与si-NC组比较,si-circ_0000218组HeLa细胞增殖活力(0.86±0.04比0.37±0.03)、迁移数量[(86.73±7.13)个比(38.52±3.19)个]和侵袭数量[(66.80±4.95)个比(26.58±2.55)个]以及Ki-67(0.57±0.05比0.18±0.02)、MMP-2(0.74±0.07比0.28±0.03)和MMP-9蛋白表达量(0.64±0.04比0.22±0.02)降低,差异有统计学意义(P均<0.001).与miR-NC组比较,miR-1182组HeLa细胞增殖活力(0.88±0.04比0.46±0.04)、迁移数量[(89.74±5.53)个比(46.63±3.79)个]和侵袭数量[(68.03±4.34)个比(34.63±3.37)个]以及Ki-67(0.59±0.04比0.24±0.02)、MMP-2(0.76±0.05比0.33±0.03)和MMP-9蛋白表达量(0.66±0.04比0.29±0.03)降低,差异有统计学意义(P均<0.001)。circ_0000218靶向负调控miR-1182表达。与si-circ_0000218+anti-miR-NC组比较,si-circ_0000218+anti-miR-1182组HeLa细胞增殖活力(0.35±0.03比0.76±0.04)、迁移数量[(35.58±3.11)个比(77.04±4.08)个]和侵袭数量[(25.44±2.29)个比(57.61±3.47)个]以及Ki-67(0.16±0.02比0.46±0.04)、MMP-2(0.26±0.02比0.65±0.04)和MMP-9蛋白表达量(0.20±0.02比0.57±0.04)升高,差异有统计学意义(P均<0.001)。结论circ_0000218通过靶向吸附miR-1182可促进宫颈癌HeLa细胞增殖、迁移和侵袭。     

乙型肝炎病毒核心蛋白变构调节剂的研究进展

由于乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)的共价闭合环状DNA的持续存在和病毒介导的宿主免疫反应钝化,导致慢性乙型肝炎病毒感染很难治愈。现有的核苷(酸)类似物或聚乙二醇干扰素疗法难以实现高比率的HBV表面抗原清除。目前正在研发的核心蛋白变构调节剂有望大幅度降低血清表面抗原。本文就HBV核心蛋白的结构、功能以及核心蛋白变构调节剂的分类、应用前景等方面进行综述。     

Circ-CL5A1受TDP-43调控并抑制肝细胞癌转移的研究

目的:探索Circ-COL5A1的生物学功能、调控机制和作用机制,进而为HCC转移的干预提供候选分子并进一步了解HCC转移。方法:通过前期工作基础选定目标分子Circ-COL5A1。通过慢病毒转染在HCC细胞系中过表达Circ-COL5A1,进而通过划痕愈合实验、transwell实验观察Circ-COL5A1的生物学功能。通过生物信息学分析、表达干扰实验和RNA免疫共沉淀(RIP)实验探究目标分子的调控机制。通过western blot技术、实时定量PCR(qRT-PCR)技术对目标分子的下游作用机制进行初步探索。结果:Circ-COL5A1在肝癌干细胞中表达下调,而且Circ-COL5A1过表达的HCC细胞系侵袭和迁移能力减弱。在Circ-COL5A1生物学合成过程中,RNA结合蛋白TDP-43可以富集其线性前体,并在环化结构形成后解离。Circ-COL5A1还可以降低其亲本基因V型胶原蛋白α1链(COL5A1)的蛋白质表达水平,这可能会影响多个信号通路进而干预HCC的转移过程。结论:内源性的Circ-COL5A1可以抑制HCC的转移能力,可以为阻断HCC转移提供候选分子。TDP-43的促进环状RNA形成提示RNA结合蛋白是环状RNA生物学合成过程中的重要调控因子。Circ-COL5A1可以通过转录后调控抑制其亲本基因COL5A1的表达。     

中华蜜蜂6日龄幼虫响应蜜蜂球囊菌胁迫的环状RNA应答

【目的】蜜蜂球囊菌(Ascosphaera apis,简称球囊菌)专性侵染蜜蜂幼虫而导致白垩病,危害蜜蜂健康和养蜂生产。本研究旨在探究中华蜜蜂(Apis cerana cerana,简称中蜂) 6日龄幼虫响应球囊菌胁迫的环状RNA(circular RNA,circRNA)差异表达谱及差异表达circRNA (differentially expressed circRNA,DEcircRNA)在宿主胁迫应答中的潜在功能。【方法】利用去除线性RNA的circRNA-seq技术对正常和球囊菌侵染的中蜂6日龄幼虫肠道(AcCK和AcT)进行测序。利用find_circ软件鉴定circRNA,统计circRNA的长度和环化类型。根据|log_2(Fold change)|≥1和P≤0.05的标准筛选DEcircRNA。将DEcircRNA的来源基因比对Gene ontology (GO)数据库和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG)数据库,从而获得功能及通路(pathway)注释。随机挑选3个DEcircRNA进行RT-qPCR验证。【结果】AcCK和AcT的circRNA-seq分别得到76342570和68269362条原始读段(raw reads),经严格质控得到74524108和66974392条有效读段(clean reads),Q30分别为92.75%和94%,GC含量分别为54.31%和54.90%。比对上东方蜜蜂(Apis cerana)参考基因组的短序列读段(anchor reads)共计23648400条。AcCK和AcT中分别鉴定到805和702个circRNA,长度均介于201–1000 nt,数量最多的环化类型均为已注释外显子circRNA,但分布在不同长度、不同环化类型的circRNA数量存在差异。AcCK vs AcT比较组共有494个DEcircRNA,包括257个上调circRNA和237个下调circRNA;上调和下调幅度最大的circRNA分别为novel_circ_000123和novel_circ_000726。上述DEcircRNA的来源基因可注释到11条生物学进程相关条目,9条分子功能相关条目,9条细胞组分相关条目,以及73条通路。进一步分析发现,部分DEcircRNA的来源基因注释到7条细胞免疫通路和3条体液免疫通路。【结论】中蜂6日龄幼虫响应球囊菌胁迫的过程中可能通过改变分布在不同长度和环化类型的circRNA数量,以及特异性表达一些circRNA和调节部分circRNA的表达量对病原产生应答;novel_circ_000027、novel_circ_000127、novel_circ_000312等DEcircRNA在宿主的胁迫应答过程中可能通过调控氧化磷酸化、细胞和体液免疫等通路发挥特殊作用。研究结果为深入理解中蜂幼虫对球囊菌的胁迫应答机制及二者的相互作用机制提供了新见解。     

MSI2通过下调circRNA_001214促进急性髓系白血病细胞HL60生长

Musashi-2（MSI2）是一种RNA结合蛋白质,对维持造血干细胞功能具有重要作用。研究表明,MSI2高表达能促进急性髓系白血病（acute myelocytic leukemia, AML）进展,但其作用机制尚不明确。本研究稳定沉默HL60细胞MSI2后,第1、2、3、4 d对照组的相对细胞生长率分别为1.931 ± 0.027、3.070 ± 0.073、4.017 ± 0.092和4.215 ± 0.246;敲减组分别为1.927 ± 0.035、2.564 ± 0.090、2.825 ± 0.097和3.223 ± 0.182,两组相比具有统计学差异,P<0.001;细胞凋亡明显增加(7.967% ± 0.698% vs 3.400% ± 0.322%., P<0.01);G₀/G₁期细胞比例明显增高（67.430% ± 4.390% vs. 50.360% ± 2.160%, P<0.01）;NUMB蛋白明显上调,LEF1明显下降。环状RNA（circular RNA, circRNA）芯片筛选和荧光定量PCR验证显示,MSI2沉默组circRNA_001214表达水平是对照组3.48倍。这一结果也在NALM6细胞得到证实。进一步用生物信息学分析,显示circRNA_001214最可能与miR-1273a、miR-1273e和miR 5095结合,进而影响参与细胞凋亡相关基因（CYCS、AKT1、BAX、TNFRSF10A、TNFRSF10D）、Wnt信号基因（WNT4、WNT2B、WNT7B、 DKK2、SFRP1、CSNKE1和LEF1）以及参与细胞代谢相关基因（RPE, PGAM4, PGAM1, TAT, CBS、RPE、SUCLG2、PGAM4、PGAM1和 IDNK）。总而言之,MSI2可能通过干扰circRNA_001214生成,减少靶miRNA对凋亡、Wnt信号及细胞代谢相关基因表达的影响,促进细胞生长。     

PITX2 R62H突变导致角膜环状皮样瘤的分子基础

角膜环状皮样瘤(RDC)是一种呈常染色体显性遗传的角膜良性肿瘤,前期研究证明,PITX2基因的G185A突变(R62H)是导致RDC发生的原因.为了进一步探讨R62H导致RDC的分子基础,将PITX2构建至原核表达载体,诱导表达后纯化融合蛋白进行EMSA实验,显示R62H与DNA的结合能力并未明显下降.筛选稳定表达PITX2 WT和R62H的HeLa细胞克隆,用流式细胞仪分析细胞周期,并用Quantitative Real-time PCR来检测细胞克隆的β-catenin和Cyclin D1的表达水平,结果发现稳定表达PITX2 R62H的HeLa细胞的增殖活性低于PITX2 WT,且β-catenin和CyclinDl的mRNA水平均比PITX2WT明显下降.由此推测,R62H突变使Wnt/β-catcnin→PITX2信号途径发生改变,促使基因表达异常,导致细胞异常增生和角膜环状皮样瘤的形成.     

环状RNA参与鼻咽癌发生发展

环状RNA(circular RNA,circRNA)是一种具有共价闭环结构的非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA),因其具有高稳定性、进化保守性和组织表达特异性的特点,越来越受到人们的关注。现有研究表明,circRNA参与恶性肿瘤等多种疾病的发生发展过程。鼻咽癌是一种起源于鼻咽上皮的恶性肿瘤,在中国华南和东南亚地区高发,发病与EB病毒（Epstein-Barr virus,EBV）感染密切相关。目前放疗和化疗是鼻咽癌治疗的主要手段,复发和远处转移是鼻咽癌患者死亡的主要原因。近年研究表明,circRNA作为基因表达调节因子,在鼻咽癌发生发展过程中发挥着重要的作用,影响着鼻咽癌的进展。本文主要综述了鼻咽癌中表达异常的circRNA,包括EB病毒编码的circRNA,在鼻咽癌发生发展中的研究现状,探讨了circRNA作为鼻咽癌患者治疗的潜在靶点以及诊断和预后标志物的可能性。     

肉桂环状剥皮与新皮的再生

对５年生肉桂树（ＣｉｎｎａｍｏｍｕｍｃａｓｉａＰｒｅｓｌ）采用茎干大面积环剥（剥皮长度１０～１５ｍ,占主干长度８０％以上）、药剂处理（喷洒“桂皮再生剂”）和透明塑料薄膜包裹方法,８０％以上植株剥皮后能在原位再生新皮并产生与原皮相似的结构。再生皮表面较粗糙,皮孔外突,比原皮明显增厚。横切面上可见再生皮有两条较宽的木栓带和一条连续成带状的中柱鞘石细胞群。３年生再生皮韧皮部油细胞分布较多,桂油和桂皮醛含量（分别为０９％和００７８％）均超过６年生原皮。３年生再生皮在形态上和生理上已经成熟,可再次环剥和再生。由于剥皮不砍树,随着树体长粗和增高,可实现桂皮增产,有利于肉桂植物资源的持续利用和经济效益的提高。     

环状芽孢杆菌C—2几丁酶基因在大肠杆菌中的表达

对已克隆的环状芽孢杆菌Ｃ－２的几丁酶基因片段所作的亚克隆分析表明,该几丁酶基因位于１．７ｋｂ Ｐｓｔ Ｉ－Ｓｔｙ Ｉ片段 。ＣｈｉＩ基因在大肠杆菌ＪＭ１０７,ＤＨ５α,ＸＬ１－ｂｌｕｅ,ＴＧ－１等菌株中均能表达,但表达水平不同,其中ＪＭ１０７的表达活性最高,其胞外几丁酶活性与供体菌Ｃ－２菌株的胞外酶活性几乎相当。     

柑桔树中的一种小分子RNA

从柑桔裂皮病疫区采集的柑桔植株叶片中提取核酸,经双方向聚丙烯酰胺凝胶电泳分析,发现两种小分子环状RNA,采用分子杂交鉴定,此两种小分子RNA均与大多数类病毒中心保守区段有明显的序列同源性,其中一种分子量较柑桔裂皮病类病毒(CEV)小,与马铃薯纺锤体块茎类病毒(PSTV)大小相近。将含CEV和小分子RNA的柑桔叶汁接种于爪哇三七,经一定时间后,从爪哇三七中提取核酸,通过电泳和分子杂交方法分析,获得与柑桔植株相同的结果。对此种小分子RNA的性质本文进行了初步分析。