错配修复蛋白MutS的新功能位点

MutS蛋白是DNA错配修复系统的关键成份,其突变会使细胞失去正常的错配修复功能,导致基因组不稳定和细胞异常.本研究利用易错PCR随机突变和利福平筛选,建立了研究MutS蛋白的新方法,发现影响MutS错配修复功能的新位点,并利用表面等离子共振、分子筛、farwestern等方法对错配修复功能缺陷的突变体进行了活性测定和分析;通过揭示MutS与错配修复功能相关的新信息,为MutS同源物多态性的研究及人源MutS同源物突变与癌症相关的研究提供新的线索.     

A new combination of mutated loxPs in a vector for construction of phage antibody libraries

In the construction of large antibody libraries by in vivo recombination, two non-homogeneous loxP sites are required for the exchange of Vgenes between phagemids to create many new VH-VL combinations.The mutated loxP511 was designed not to recombine with the wild-type loxP (loxPwt) in early studies and a combination of the two has been used to construct antibody libraries. But recent reports have shown that recombination occurs between loxPwt and loxP511. This suggests that the combinational use of loxP511 and loxPwt might lead to the loss of the V gene diversity of antibody libraries. Therefore, it is necessary to find a new combination of loxPs to avoid the excision recombination in the antibody library. In this study,we found that the excision recombination between loxP511 and loxP2272, another mutated loxP sequence,was undetectable within one phagemid, while the excision recombination between loxP511 and loxPwt occurred at a frequency of 40%, higher than that reported previously. Furthermore, the in vivo recombination of different phagemids with loxP511 and loxP2272 showed that the V gene exchange was efficiently mediated to produce new VH-VL combinations. It was concluded that the loxP511 and loxP2272 combination was more favorable for reducing the excision recombination and constructing large phage antibody libraries with high diversity.     

Critical Role of Cys168 in Noggin Protein＇s Biological Function

Previous studies have indicated that noggin exerts its neural inducing effect by binding and antagonizing bone morphogenetic protein 4 (BMP4). In order to further clarify the relationship between the structure and the function of noggin, and elucidate the possible mechanism responsible for noggin-BMP4 interaction, we generated three noggin mutants, C168S, C174S and C197S, by using a site-directed mutagenesis method. Ectopic expression of wild-type (WT) noggin, C174S or C197S, in Xenopus animal caps (ACs) by mRNA injection converted the explants (prospective ectoderm) into neural tissue, as indicated by the neural-like morphology and expression of the neural cell adhesion molecule (NCAM) in the ACs. In contrast, ACs expressing C168S suffered an epidermal fate similar to the control caps. Similarly, among the three mutants, only C168S lost the dorsalizing function. These studies highlight the critical role played by Cys168 in noggin‘s biological activities. It probably participates in the formation of an intermolecular disulfide bridge.     

假单胞菌M18调控因子GacA与RsmA的相关性及对抗生物质合成代谢调控机制的分析

假单胞菌M18是一株可同时合成并分泌吩嗪-1-羧酸(Phenazine-1-carboxylic acid,PCA)和藤黄绿脓菌素(Pyoluteorin,Plt)两种抗生物质的生防菌株。为了进一步研究假单胞菌M18抗生物质合成代谢的调控方式与机制,在分别构建gacAr、smA等单基因突变株基础上,又构建了gacArsmA双基因突变株M18GR以及gacA′-l′acZ和rsmA′-′lacZ等翻译融合表达载体(pMEGA和pMERA)。通过在PPM和KMB两种培养基中发酵培养和两种抗生物质PCA和Plt的HPLC定量测定显示,双突变株M18GR的PCA和Plt的合成量不论在PPM还是在KMB培养基中都介于单突变株M18G和M18R之间。由实验结果分析推测,两种调控因子对抗生物质合成的调控作用不是发生在转录水平,很可能发生在转录后水平。由β-半乳糖苷酶的定量分析表明,在假单胞菌M18中,两种调控因子不存在自诱导机制;虽然GacA未调控RsmA的合成,但RsmA可能部分正向调控GacA的表达。     

大肠杆菌O23 O-抗原基因簇序列的破译及UDP-N-乙酰葡萄糖-C4异构酶的鉴定

采用鸟枪法破译大肠杆菌O23标准株的O-抗原基因簇序列,并用生物信息学的方法进行了基因注释和分析;采用基因缺失和互补的方法鉴定了O23的UDP-GlcNAc C4异构酶(Gne);用同源建模的方法构建了O23 Gne的高级结构并对其活性位点进行了分析;分析了不同血清型大肠杆菌O-抗原基因簇中gne基因的多样性;根据O23O-抗原基因簇中的特异基因筛选出了可用于大肠杆菌O23快速检测的特异DNA序列。     

pCMV-BD-ZNF424和pCMV-Tag2-ZNF424缺失突变重组质粒的构建

锌指蛋白基因家族是人类最大的基因家族之一,目前已知的很多锌指蛋白成员都是转录调控因子.KRAB/C2H2型锌指蛋白是一类重要的转录因子,ZNF424是该亚家族的一个新成员.已经初步证明ZNF424具有转录激活作用,为了进一步研究ZNF424各结构域激活程度和在信号途径中的作用,设计出引物,以pCMVB-D-ZNF424重组质粒作为模板,PCR扩增出含ZNF424基因的KRAB、LINK和ZNF的3个含不同结构域的区域,克隆到pMD18T-载体,然后内切酶切下各目的片段,再构建出pCMVB-DK-RAB、pCMVB-DL-INK、pCMVB-D-ZNF、pCMVT-ag2BK-RAB、pCMVT-ag2BL-INK和pCMVT-ag2CZ-NF共6个缺失突变重组质粒,为进一步研究ZNF424基因功能奠定基础.     

DNAJC10基因在鼻咽癌中的表达及表达下调机制的研究

运用RT-PCR检测候选抑瘤基因DNAJC10在鼻咽癌组织中的表达,运用甲基化特异性PCR(MSPCR)技术、LOH和测序等技术分别检测DNAJC10基因在鼻咽癌组织中的甲基化状况、LOH和启动子突变情况.结果表明,DNAJC10基因在肿瘤组织中较对照慢性鼻咽炎组织表达明显下调(P<0.05).DNAJC10在鼻咽癌中不表现高甲基化,其LOH的缺失率为6.25%,突变率为66.7%.因此,DNAJC10基因的表达下调主要是其遗传改变(LOH和突变)所致.     

禽流感病毒H5N1亚型HA基因表达及其产物的应用

根据GenBank公布的禽流感病毒H5N1亚型血凝素基因 (HA) (GenBank DQ023145) 序列设计一对引物P1、P2,以重组质粒pUC-HA为模板扩增去除信号肽的HA成熟蛋白. PCR 产物克隆入pMD18-T载体,经测序发现在967位A突变为T,形成一个终止密码子TAA. 在突变位点附近设计两条有21个碱基配对的突变引物P3、P4,采用重叠延伸剪切法 (SOE) 用A定点替换T碱基,然后将正确的基因片段定向插入到表达载体pET-32a (+) 中,诱导表达获得正确的表达产物.Western-blot分析表明,表达的重组蛋白能与经BL21(DE3)大肠杆菌菌体裂解液处理的H5亚型禽流感病毒阳性抗血清发生特异性反应.利用纯化的重组HA蛋白初步建立了检测H5亚型禽流感病毒抗体的间接ELISA方法,该方法可以代替传统的血凝与血凝抑制方法用于区分禽流感病毒的血清亚型.本研究为禽流感病毒亚单位疫苗及新型诊断试剂盒的研究奠定了基础.     

小克银汉霉γ-亚麻酸高产菌株的快速筛选和发酵条件研究

以小克银汉霉C0为出发菌株,经过5-氟尿嘧啶和紫外线复合诱变,采用抗失水苹果酰肼与抗低温(15℃)相结合的筛选方法,获得一株生产性能比出发菌株显著提高的突变株C23。采用5L全自动发酵罐对小克银汉霉C23发酵生产γ-亚麻酸的pH值控制和补料工艺进行研究,发现将发酵液pH值维持在5.5,当发酵进行到60h、84h、108h时,分别补糖15g/L,发酵192h后收获,结果生物量、油脂产量和γ-亚麻酸产量分别达到49.88g/L、21.93g/L、2.69g/L。     

大肠杆菌中高效表达rhBMP-4的探讨及初步活性测定

目的 在大肠杆菌中表达具有生物活性的rhBMP-4。方法 在不改变氨基酸序列的前提下,以全基因合成的方式对人BMP-4成熟肽基因全长进行定点突变,将之重组入pET-3c表达载体并转化至大肠杆菌BL21(DE)plysS。IPTG诱导和包涵体复性后,利用C2C12细胞横向成骨细胞分化实验以及小鼠肌袋异位骨形成实验检测其活性。 结果 获得0.348 kb的BMP-4 DNA序列,表达的目的蛋白主要以包涵体的形式存在。经纯化及复性后,体内与体外的活性检测表明rhBMP-4有良好的诱骨生成活性。结论 该方案能够实现rhBMP-4在大肠杆菌中的高效表达。