茶树α-tubulin基因实时荧光定量RT-PCR方法的建立

目的:建立茶树α-tubulin基因实时荧光定量RT-PCR方法。方法:根据GenBank中茶树α-tubulin基因保守区域设计一对特异性引物,将PCR扩增得到的α-tubulin基因克隆到pTG19-T载体上,构建的重组质粒标准品经1/10梯度稀释后,用SYBR GreenⅠ染料法绘制标准曲线,并进行融解曲线分析。结果:标准曲线Ct值检测范围为14.56~27.09,相关系数为0.991,溶解曲线分析显示产物为特异的单峰,其Tm值为81±0.3℃。结论:建立了茶树α-tu bulin基因实时荧光定量RT-PCR法,为以α-tubulin作为茶树内参基因进行功能基因表达差异研究奠定了基础。     

实时荧光PCR结合融解曲线分析快速鉴定临床常见曲霉菌

目的 采用实时荧光PCR结合融解曲线分析的方法快速将临床常见曲霉菌鉴定到种的水平.方法 ①普通PCR扩增真菌ITS区后进行序列比对,准确鉴定菌种并设计种特异性引物和探针.②采用实时荧光PCR的方法及融解曲线分析,根据不同的解链温度将5种临床常见曲霉菌鉴定到种的水平.③特异性、敏感性、重复性试验.结果 ①解链曲线分析显示,不同种曲霉菌的种特异性探针有特异的Tm值,根据Tm值的不同可以将5种曲霉菌区分开来:烟曲霉Tm =61.4℃,黄曲霉Tm=57.4℃,黑曲霉Tm=67.7℃,土曲霉Tm=55.2℃和64.5℃,构巢曲霉Tm=65.8℃.其中小孢根霉和疣状瓶霉与烟曲霉探针发生交叉反应,阴性对照不出现特异性的解链曲线.②该方法对5种曲霉菌的检测下限分别为:烟曲霉56.8 fg,黄曲霉1 110fg,黑曲霉13.7 fg,土曲霉123 fg,构巢曲霉780 fg.③重复性试验结果显示,同一种曲霉菌的Tm值波动范围不超过0.5℃.结论 采用实时荧光PCR结合融解曲线分析的方法可以快速准确地将临床常见曲霉菌鉴定到种的水平,具有良好的敏感性、特异性和可重复性,有助于临床侵袭性曲霉感染的诊断和指导抗真菌药物使用.     

肝细胞癌患者外周血HSF1 基因表达的检测及应用价值

目的:建立检测HSF1 mRNA的real-time PCR的方法,了解肝细胞癌患者外周血中HSF1的表达水平及其与各临床病理特征之间的关系。方法:利用real-time PCR的方法检测20例肝细胞癌患者及20例正常人群外周血中HSF1 mRNA的表达量。结果:肝细胞癌患者外周血中的HSF1 mRNA表达量显著高于正常人群(P<0.05);肝细胞癌患者外周血中HSF1 mRNA的表达水平在不同性别、肿瘤大小、门静脉侵犯情况、HbsAg水平及AFP水平的患者中的差异无统计学意义(P>0.05);在不同病理分化程度、TNM分期的患者中的差异有统计学意义(P<0.05)。结论:real-time PCR技术可以成功检测外周血中HSF1 mRNA的表达量,HSF1可能与肝细胞癌的发生发展密切相关。     

TEM1mRNA 在非小细胞肺癌中的表达及临床意义*

目的:揭示TEM1其与非小细胞肺癌侵袭和转移的可能关系,为靶向治疗提供理想的药物作用靶点。方法:实时荧光定量PCR方法检测56例非小细胞肺癌肿瘤组织及癌旁组织中TEM1 mRNA表达水平,分析其在不同组中的表达差异。结果:TEM1在56例非小细胞肺癌组织中都有表达。TEM1表达水平在肿瘤组织中比癌旁组织表达高,并且其表达水平与淋巴结转移及肿瘤分期密切相关(P<0.05),但与患者的病理类型,年龄及性别无关(P>0.05)。结论:TEM1表达水平与非小细胞肺癌分期密切相关,表明其可能是一个参与非小细胞肺癌侵袭及转移有价值的分子标记物。TEM1可能成为潜在的基因治疗靶点。     

卵巢上皮癌中CCN1的表达及临床意义

目的:探讨人卵巢上皮癌组织和卵巢良性肿瘤中CCN1表达水平的差异及临床意义.方法:收集我院21例卵巢上皮癌病理组织,以卵巢良性肿瘤为对照,经Real-time PCR和免疫组织化学等方法从mRNA水平和蛋白水平检测CCN1的表达水平.分析其表达水平与卵巢上皮肿瘤恶性程度的关系.结果:Real-time PCR和免疫组织化学结果均提示CCN1在卵巢上皮癌组织中的表达水平高于良性肿瘤(P＜0.01).结论:CCN1可能与卵巢上皮癌的恶性潜能密切相关.     

粪肠球菌生物被膜形成早期相关基因的表达研究

目的:以粪肠球菌为研究对象,探讨粪肠球菌基因srtA(转肽酶A编码基因)、esp(肠球菌表面蛋白)与粪肠球菌生物被膜形成早期的相关性。方法:用逆转录PCR与实时荧光定量PCR方法对生物被膜和浮游菌组细菌srtA、esp两种与生物被膜形成早期相关的基因其表达进行检测,并进行统计学分析。结果:srtA、esp基因与粪肠球生物被膜菌早期形成密切相关。生物被膜菌组srtA、esp表达量分别是浮游菌组的7.9与13.5倍。结论:srtA、esp基因与粪肠球生物被膜菌形成早期密切相关,可能是生物被膜早期形成的上调因子。     

卫氏并殖吸虫PCR和实时荧光PCR快速检测方法的建立

目的建立快速、灵敏、特异的分子生物学检测卫氏并殖吸虫的方法。方法根据卫氏并殖吸虫的特异性基因序列,设计适合于PCR检测的特异性引物及实时荧光PCR特异性引物和探针,并进行灵敏性和特异性试验。结果设计的引物和探针特异性强,所建立的检测方法灵敏度高。应用实时荧光PCR方法的检测灵敏度可达到0.1 pg/μL,比PCR方法的灵敏度高三个数量级。结论本研究所建立的PCR和实时荧光PCR技术检测卫氏并殖吸虫方法的特异性强,灵敏度高,为卫氏并殖吸虫感染的诊治提供了快速的检测技术手段。     

血管紧张素酶2在黄疸大鼠心脏中的表达

目的:研究阻塞性黄疸大鼠心组织中血管紧张素转化酶2(ACE2)的 mRNA 和蛋白质水平,探讨阻塞性黄疸大鼠心功能损害与 ACE2 的关系.方法:36 只 SD 大鼠随机分为假手术(SO)组(n=18)和胆总管结扎(BDL)组(n=18),于术后3d、7d、10d分别随机取 2 组大鼠的心组织(n=6),采用实时定量 PCR 方法和免疫组化方法检测心组织内 ACE2 的 mRNA 和蛋白质的表达水平.结果:(1)BDL组的总胆红素(TBIL)和肝功能指标(ALT)较 SO 组显著升高(P＜0.01),BDL 组中 7d 组 TBIL 为最高(158.65±10.80mmol/L)(P＜0.05),3d 组 ALT 为最高(236.07±12.49U/L)(P＜0.05);(2)BDL组心组织 ACE2 的 mRNA 水平较假手术组均呈一定程度的下降,其中 7d 组下降最显著(P＜0.01);(3)黄疸大鼠心肌纤维中 ACE2 的阳性率明显减少,且强度减弱,其中 7d 组减少最明显.结论:阻塞性黄疸大鼠心脏中的 ACE2 mRNA 和蛋白质水平均下调,可能是引起阻塞性黄疽后心功能损害的因素之一.     

KLF4在内毒素血症小鼠中的表达模式及其意义

目的探讨Kruppel样因子4（Kruppel-like factor 4,KLF4）在内毒素血症小鼠中的表达模式及意义。方法运用实时荧光PCR技术和Western blot技术,分别从mRNA水平和蛋白水平探讨内毒素血症小鼠肝脏和肺脏中KLF4的表达;运用生物信息学技术,对启动子区含有KLF4的结合位点的炎症介质基因进行了预测;运用RT-PCR技术,从mRNA水平探讨内毒素血症小鼠肝脏和肺脏中IL1β的表达模式。结果内毒素血症小鼠肝脏和肺脏中KLF4 mRNA的表达下凋,KLF4蛋白的表达先下凋后升高;IL-18、IL-15、IL-12、IL-18、IL-10等炎症介质基因的启动子区均含有KLF4的结合元件,这些炎症基因的表达可能直接受到KLF4的调控;内毒素血症小鼠肝脏和肺脏中IL-IB的表达模式与KLF4的表达模式呈相反趋势。结论内毒素血症小鼠肝脏和肺脏中KLF4表达下调,KLF4在炎症介质基因表达调控中可能具有重要作用。     

实时荧光PCR技术定量检测转Bt基因水稻的研究

以转Bt基因的"克螟稻"为研究材料,通过使用特异的引物和荧光标记探针,以已知转基因成份含量的水稻样品为模板建立标准曲线,对转基因水稻的NOS和Bt外源基因进行了荧光定量检测分析.初步建立了转基因水稻定量检测的技术方法.