黄颡鱼PGRP-L基因克隆及其对爱德华氏菌的反应

为了研究肽聚糖识别蛋白家族(Peptidoglycan recognition proteins, PGRPs)在黄颡鱼(Pelteobagrusfulvidraco)先天免疫应答中发挥的作用, 根据NCBI中斑马鱼(Danio rerio) 和虹鳟(Oncorhynchus mykiss) PGRP-L的基因信息, 采用简并引物和RACE方法从黄颡鱼肝脏中克隆得到了一个长型PGRP (PfPGRP-L)基因. PfPGRP-L基因的全长cDNA序列大小为1617 bp, 其中5'和3'非翻译区的长度分别为135和72 bp, 开放阅读框为1410 bp, 编码469个氨基酸. 同源性和系统进化分析表明, 黄颡鱼PGRP-L与虹鳟的同源性为60%, 与脊椎动物的PGLYRP2 或PGRP-L聚在一起. 半定量RT-PCR分析发现PfPGRP-L基因在黄颡鱼鳃、胸腺、肝脏、脾脏、肠道、肾脏、头肾、心脏、血液和肌肉组织中均有分布, 但在肠道和脾脏中的表达量较为丰富, 而在肌肉和血液中表达则很少. 用爱德华氏菌刺激后, PfPGRP-L在肝脏、脾脏、肠道及头肾中的表达明显上调. 结果表明, PfPGRP-L在黄颡鱼抵抗病原菌中具有重要作用.     

降水稳定同位素研究的历史与现状——基于文献计量学及网络分析方法

降水稳定同位素可以揭示降水的不同水汽来源和水汽的季节转换。通过建立降水稳定同位素与不同气象要素的关系,可为区域水资源管理甚至可为生态修复中的植被恢复状态的研究提供重要的背景数据。为揭示降水稳定同位素研究的发展现状,基于文献计量学以及网络分析方法运用Citespace软件对1990—2017年Web of Science核心数据库中降水稳定同位素的相关文献进行可视化统计分析。发现降水稳定同位素相关的文献数量在呈逐年上升趋势,主要分布在地质、气象与大气科学、海洋学、湖泊沼泽学、古生物学等相关学科,美国、中国、德国、加拿大等国家以及中国科学院、美国地质调查局等研究机构文章数量较多,表现出较强的科研实力。利用Citespace软件绘制了降水稳定同位素研究相关文献的共被引、研究作者的共被引等知识图谱,对该研究领域知识基础及核心作者的影响力进行了探讨。图谱显示,2007年以来,Yao T、Risi C、Tian L等对降水稳定同位素的研究的推进起到了重要的推动作用。最后对该研究领域的关键词与词频等进行分析,绘制出降水稳定同位素研究领域的研究热点演进脉络,并确定leaf water、Tibetan Plateau、cellulose、environmental change、tree ring、atmospheric circulation、groundwater recharge、hydrograph separation等即将成为研究的新热点。近几年来,虽然研究的文章数量在逐年增加,但是核心作者及代表作品较少,与社会的实际生产应用结合度不足。在未来研究中在注重方法的更新的同时可考虑与社会生产实际相结合。     

塔克拉玛干沙漠南缘防护林和自然群落中多枝柽柳的光合特征及水分利用效率

干旱区植物的生长和生存主要受水分限制,采用滴灌方式对防护林植物进行水分补给是维持人工生态屏障稳定性的重要手段.本研究通过测定塔克拉玛干沙漠南缘防护林和自然群落多枝柽柳的气体交换参数和稳定性碳同位素值,研究不同水分来源多枝柽柳的光合特征和水分利用效率.结果表明: 滴灌群落多枝柽柳受灌溉和土壤盐分的影响水势普遍较低;自然群落多枝柽柳清晨和正午水势较其他植物低,表明其遭受到严重的水分胁迫;滴灌群落多枝柽柳叶片净光合速率(P_n)、气孔导度(g_s)、胞间CO₂浓度(C_i)和最大光合速率(P_{n max})均明显低于自然群落多枝柽柳,表明滴灌群落多枝柽柳光合能力弱于自然群落多枝柽柳;灌溉造成的盐分胁迫导致滴灌群落多枝柽柳比自然群落拥有较高的长期水分利用效率.总之,现行的灌溉模式虽能提供防护林植物生长所需水分,但技术的缺陷和土壤盐分的积累可能会影响防护林体系的长期稳定性.     

花椒挥发油对离体豚鼠气管平滑肌作用的实验研究

目的研究花椒挥发油对组胺(Histamine,His)、乙酰胆碱(Acetylcholine,Ach)诱发的豚鼠离体气管条收缩作用的影响,以及作用的量效关系,为研发平喘类中药奠定基础。方法采用Medlab生物信号采集处理系统利用定量药理分析方法分别测定:(1)His的量效曲线;(2)Ach的量效曲线;(3)不同浓度的花椒挥发油对His诱发的豚鼠离体气管条收缩的影响;(4)不同浓度花椒挥发油对Ach诱发的豚鼠离体气管条收缩的影响。结果His、Ach在体外引起了豚鼠离体气管条的浓度依赖性的收缩,其中His与Ach在10-2mol/L时均可以使气管条收缩达到最大值,花椒挥发油对His、Ach诱发的支气管收缩均有抑制作用,在花椒挥发油浓度达0.48 g/L时抑制率为49%;但对Ach诱发的支气管收缩在剂量为0.48 g/L时抑制率仅达到26%,抑制作用明显弱于His;结论花椒挥发油在体外浓度为0.08~0.48 g/L时均能有效地抑制His、Ach诱发的支气管收缩,对His诱导的豚鼠气管平滑肌收缩的抑制作用强于Ach,提示花椒挥发油对过敏性刺激诱发的哮喘有较好的抑制作用,将为开发抗过敏性哮喘疾病的中药研发奠定基础。     

超声波对感染根管消毒作用的实验研究

目的:通过与氢氧化钙药尖消毒作用的比较,验证超声波对感染根管的消毒作用并判断其消毒作用的临床应用价值。方法:10只3月龄的小型健康实验家兔随机分成二组后,制备成感染根管动物模型。对模型进行术前细菌培养后,分别做超声根管内消毒和氢氧化钙药尖消毒,术后细菌培养。结果:超声波和氢氧化钙对需氧菌和厌氧菌的杀灭作用无菌种之间的差别;但杀菌效果存在显著差异。实验发现超声波消毒的特点是:第一,无抗菌谱的差异。第二,无热效应,根管壁表面升温不明显。第三,作用无方向性,对任何角度方向上的有机物均能使其失活。第四,越是细小根管作用越强。这些正是根管消毒所要求的特殊条件。结论:1)超声波对感染根管的消毒作用明显优于氢氧化钙药尖。2)超声波对感染根管的消毒作用无抗菌谱的差异。3)超声波对感染根管具有较可靠的消毒作用,作为一种根管消毒手段值得进一步研究。     

埃博拉病毒基因组中微卫星序列的分布分析

微卫星或简单重复序列(simple sequence repeat, SSR)在真核和原核生物以及病毒基因组中普遍存在,并被广泛用于遗传与进化研究。本研究从NCBI中下载埃博拉病毒属的四个不同种的埃博拉病毒全基因组序列,筛选36条作为实验材料,利用IMEx在线提取软件提取SSRs,用Python编程统计数据,从而分析SSRs在埃博拉病毒全基因组序列中的分布情况。分析得出,埃博拉病毒基因组序列中二型SSRs含量最为丰富,其次是一型SSRs,三型SSRs有少量,四型SSRs则更少,没有发现五型和六型SSRs。在更深入的分析中得出在埃博拉病毒属四个种中,含A/T碱基的SSRs含量远远大于含C/G碱基的SSRs。分析得出一型SSRs中(A)n/(T)n远多于(G)n/(C)n,二型SSRs中不存在(GC/CG)n,三型中也不存在(GGC/CGG/GCG/CCG/CGC/GCC) n。上述发现可能跟埃博拉病毒的致病机理有密切联系。通过对埃博拉病毒基因组序列中SSRs的分析,为研究埃博拉病毒的变异情况及致病机制提供更多参考。     

结合蛋白质相互作用数据进行基因表达数据聚类

提出了一种蛋白质相互作用的相似性度量,将其与基因表达数据的相似性度量相结合,定义了一种融合的距离度量,并且将这种融合的距离度量用于改进现有的K—means聚类方法。经过实际数据的检验,改进后的K—means方法比常用的其它几种聚类方法具有更好的效果,说明结合蛋白质相互作用数据可以使得基因表达聚类的结果更有生物意义。     

酿酒酵母表面展示鲑鱼降钙素多肽的研究

目的:实现酿酒酵母表面展示鲑鱼降钙素.方法:人工合成鲑鱼降钙素(Salmon cacitonin,sCT)编码基因,克隆到表面展示载体M-pYD1上.用NocⅠ酶切重组质粒M-pYD1-sCT和空白质粒M-pYD1,回收sCT和V5表达框片段后分别以LiAC法转化酿酒酵母EBY100菌株,分别得到重组酵母yAGA2-sCT和yAGA2-V5.两种重组酵母分别经半乳糖诱导表达后,采用FITC荧光标记酵母表面展示的sCT和V5多肽,分别用荧光显微镜和流式细胞仪进行定性和定量分析.结果:诱导12h后,荧光显微镜下清晰观测到了工程菌表面有重组sCT,流式细胞分析结果表明10000个细胞中65.2%的yAGA2-sCT菌株表达了外源sCT,52.4%的yAGA2-V5菌株表达V5.结论:利用酿酒酵母表面展示鲑鱼降钙素多肽获得了成功,为口服型鲑鱼降钙素的研发奠定了基础.     

辽宁义县金家沟义县组砖城子层孢粉组合

辽宁义县金家沟义县组砖城子层的孢粉组合是以无肋双囊类花粉为主(占组合的70%左右),伴以少量Cicatricosisporites,Jugella,Ephedripites,Jiaohepollis等为特征,其基本面貌与北票黄半吉沟义县组尖山沟层的孢粉组合类似,时代同属早白垩世贝利亚斯期,反映温暖湿润的气候环境。     

测定心脏收缩时间间期在房间隔缺损中的应用

我们曾测量分析了房缺、室缺和动脉导管未闭患者中的心脏收缩时间间期(STI),发现心内分流和心外分流的心功变化有其不同的特点,其中房缺患者在STI上的变化是以PEP、ICT和Q-S_1延长,LVET缩短,PEP/LVET和ICT/LVET比值增大为特征的。本文在此基础上进一步分析了房缺患者中分流量、肺动脉压、年龄等与STI异常的关系,并比较手术前