RAPD数据分析软件RAPDDIST V1.0的使用

介绍了RAPDDISTV1 0软件包中的 7个程序 ,并以已发表论文中的数据分析为例介绍了该软件程序的使用 ,目的是为使用此软件的同行提供一些帮助     

不同地理飞蝗种群的遗传多样性

用GenBank中飞蝗Locusta migratoriaL.的序列来设计微卫星引物,并对这些引物的有效性进行验证。结果表明,在所设计的3对引物中,只有1对为有效引物,可扩增出微卫星位点。序列分析表明本位点是一个不连续的重复微卫星位点。该多态微卫星位点含有14个等位基因,不同飞蝗地理种群的等位基因数目、大小和频率都存在较大的差异。对该位点各等位基因型进行χ2检验,基因型频率的观察和期望杂合度分别为0.4578和0.8836,该位点不属于Hardy-Weinberg平衡位点(χ2=733.12,P=0.0000)。该微卫星位点表现出高度的多态性说明是分析飞蝗种群遗传多样性的优良分子遗传标记。     

基于RAPD改进的分子标记技术

随机扩增多态DNA(RAPD)由于经济、快速简便、不需预知模板DNA信息、对模板DNA要求较低,因此被大量应用于昆虫学的研究中,如昆虫的鉴定分类、构建连锁图谱、系统发育分析等。但RAPD也有许多缺点,主要是一种显性标记而不能区分杂合体和纯合体,结果的重复性易受多因素的影响等。针对这些缺点,人们通过将RAPD与其它检测技术如聚丙烯酰胺凝胶电泳、单链构象多态(SSCP)、变性梯度凝胶电泳(DGGE)等相结合,提高了其分析的灵敏度和稳定性;再者,还将RAPD标记发展成为其它更稳定的或共显性的标记,如SCAR、微卫星等,为RAPD进一步的应用开阔了前景。文章对这些检测和转化的改进技术进行综述。     

nrDNA ITS和cpDNA rpl16基因测序法对六种鼠尾草的检测

为从鼠尾草属植物中鉴别丹参品种,采用基因测序方法,用核糖体核酸内转录间隔区基因(nrDNA ITS),编码核蛋白体大亚基多肽L16的基因(rpl16)及叶绿体DNA上包含trnL以及trnL和trnF间隔区的区域基因(trnL-trnF)的序列,检测六种鼠尾草属新鲜植物.由于nrDNA ITS和rpl16突变率较高,可以做为6种鼠尾草的基源鉴定标记,依此设计了两对特异引物,从6种鼠尾草中鉴定出丹参(Salvia miltiorrhiza)和云南鼠尾草(S.yunnanensis).但trnL-trnF突变率太低,未能用于鉴别.商品干燥中药材因加工和储藏的方式致使DNA降解严重,基因测序法难于应用.     

白色念珠菌和热带念珠菌对人肺上皮细胞的粘附作用及其差异性比较

目的探讨白色念珠菌和热带念珠菌对人肺上皮细胞的粘附作用及其差异性.方法将白色念珠菌和热带念珠菌临床分离株在体外与人肺上皮细胞共同作用,经革兰染色后,在倒置显微镜下观察念珠菌对肺上皮细胞的粘附数.结果念珠菌粘附的肺上皮细胞与浓度和时间有依赖关系.菌液浓度在5×103CFU/ml至5×107CFU/ml范围内,念珠菌对肺上皮细胞的粘附作用随念珠菌浓度的增加而增强.白色念珠菌对肺上皮细胞的粘附数比热带念珠菌的粘附数要高.来自痰、尿标本的同一种念珠菌对人肺上皮细胞的粘附数无明显差异.结论念珠菌对人肺上皮细胞的粘附是一种特异性的粘附,临床标本来源的白色念珠菌粘附宿主细胞的能力比热带念珠菌强.     

离子辐照玉米花粉诱发DNA损伤的RAPD分析

利用 30Ｋｅｖ和 8种剂量的Ｎ+ 辐照玉米不同品种的花粉 ,通过ＲＡＰＤ(ＲａｎｄｏｍＡｍｐｌｉｆｉｅｄｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍＤＮＡ)技术利用 10 4个 10碱基随机引物分析了花粉基因组ＤＮＡ的损伤效应 ,结果表明 :经Ｎ+ 辐照的花粉ＤＮＡ在 10 4个引物的扩增下 ,共产生了 4 70条带 ,表明了明显的多态性变化。在供试剂量下共发现 51条多态性带 ,其中 3× 10 15Ｎ+ ｃｍ2 、6× 10 15Ｎ+ ｃｍ2 、9× 10 15Ｎ+ ｃｍ2 、12× 10 15Ｎ+ ｃｍ2 、15× 10 15Ｎ+ ｃｍ2 和 18× 10 15Ｎ+ ｃｍ2 ＤＮＡ多态性的频率分别为 4 .3%、8.5%、1…     

飞蝗总DNA的抽提及其RAPD分析条件的摸索

通过试验寻求得到一种快速、简便抽提飞蝗（Ｌocusta sp.)总DNA方法,使每头雄性和雌性成虫分别可以得以５０和１００μg的总ＤＮＡ。所得到的总ＤＮＡ ＯＤ２６０／ＯＤ２８０为１．５－２．２,分子量４５kb。为了获得高分子量的ＤＮＡ产品,使ＲＰＡＤ结果具重复性,酚氯仿抽提后的ＤＮＡ沉淀用灭菌Ｔip头挑出,而不用离心收集。对各种分析条件如摸板、Ｔaq酶、dNTP及引物的浓度、不同的ＰＣＲ仪、反应管进行了比较试验,发现在一定的范围内,它们对ＲＡＰＤ结果影响。用优化的试验条件对我国３个飞蝗亚种５个地理种群进行ＲＡＰＤ分析。结果在３个亚种ＵＰＧＭＡ聚类图中,东亚飞蝗和西藏飞蝗珠２个种群以１００％Ｂootstrap分别聚类在一起,亚洲飞蝗与东亚飞蝗的２个种群以６６％的Ｂootstrap聚类在一起,在３个亚种所有个体的ＵＰＧＭＡ聚类图中,亚种内的所有个体都聚类在一起,各自形成独立分支,说明３个飞蝗亚种有明显的区别。西藏飞蝗的２个种群之间,群居型与散居型东亚飞蝗之间在聚类图中混合聚类,说明它们之间存在基因交流。     

热预处理菠菜叶绿体的能量转换特征

经热预处理（湿度为２５－４５℃,部分实验为２０－３６℃,时间为５－１０min)的菠菜（Ｓpinacia oleracea L.)叶绿体。严重影响其能量转换的各步反应。（１）循环光合磷酸化速率随处理温度而下降。（２）类囊体膜上腺三磷酶失活。（３）光照诱导叶绿体的质子吸收减小;叶绿体的９－氨基吖啶（９－ＡＡ）荧光猝灭减弱,但加二环己基磷二亚胺（ＤＣ－ＣＤ）可以部分恢复９－ＡＡ荧光猝死。（４）叶绿体的延迟发光和△Ａ５１５nm电色效应均出现明显变化。（５）免疫印迹反应结果表明,经４５℃预处理叶绿体的膜上腺三磷酶出现解离,其α亚单位的蛋白量明显减少。（６）预处理温度超过３３℃,叶绿体光系统Ⅰ介导的氧吸收速率也下降,在反应介质中加芥子碱可以部分恢复其氧吸收能力,就这些结果与膜透性变化、耦联因子复合物解离和自由基积累的关系进行了讨论。     

显示AgNOR的改良染色效应在实验动物肿瘤中的应用

本文报道的ＡｇＮＯＲ组化反应，是我们经过反复实验，得新建立的染色逍度，染色时间和温度的系列程序，其结果表明不所显示ＡｇＮＯＲ成分的对比清晰度较强，而适用于实验动物肿瘤组织的形态学观察，图象分析系统的定量研究和诊断的价值。