Nmi及其变异体在大肠杆菌中表达、抗体制备及其细胞分布

 为了检测细胞内源性Nmi和变异体Nmi s的表达、亚细胞分布以及可能形成的信号转导蛋白复合物 ,成功构建并表达了异源Nmi和Nmi s 获得纯化异源蛋白 ,用以制备兔源抗Nmi(Nmi s)多克隆抗体 .Western印迹在多种细胞株HL 60 ,K562 ,2 93T细胞中检测到Nmi(Nmi s)高表达 .在不同的细胞系中 ,Nmi表现为不同的蛋白复合物迁移带 ;Nmi(Nmi s)在胞浆和胞核均存在 ,而核内荧光更强 .Nmi(Nmi s)通过与多种蛋白相互作用行使其生物学功能 ,在不同细胞中可能与不同的蛋白相互作用 ,发挥不同的功能 .     

凋亡蛋白和Nmi的相互作用及作用位点的筛选鉴定

为研究来源于鸡贫血病毒的小分子蛋白质———凋亡蛋白 (apoptin)诱导肿瘤细胞凋亡的分子机制 ,利用酵母双杂交系统从人白细胞cDNA文库筛选凋亡蛋白相互作用蛋白质 ,核苷酸序列分析及同源性检索表明 ,其中一个约为 1.2kb的克隆与Nmi(N Mycinteractionprotein)高度同源。细胞免疫共沉淀实验结果显示 ,在哺乳动物细胞水平仍能够检测到凋亡蛋白与全长Nmi的特异相互作用。利用构建好的分别缺失C端 11个氨基酸、中间 33～46位氨基酸和二者均缺失的 3个凋亡蛋白突变体进行相互作用位点研究 ,结果表明凋亡蛋白的 33～ 46位氨基酸(核外运信号 )对于凋亡蛋白与Nmi的相互作用是必需的 ,而C端核定位信号 /DNA结合序列对于凋亡蛋白与Nmi的相互作用不是充分必要的     

酿酒酵母GPCR蛋白Ste2亚细胞定位信号探索

G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptor,GPCR)家族蛋白在细胞感受各种胞外信号过程中发挥重要作用。Ste2是酵母细胞中GPCR蛋白之一。大量文献报道了Ste2蛋白突变体对其功能和表达的影响,但关于Ste2亚细胞定位的研究相对较少。这项工作的目的在于确定Ste2亚细胞定位,探究Ste2不同跨膜域、胞内外环状结构域和N端、C端对其亚细胞定位的影响。构建了一系列结构域删除或替换突变体,通过荧光显微镜观察判断不同结构区域对Ste2亚细胞定位的影响,并通过与已知的细胞器标记蛋白共定位观察验证亚细胞定位判读结果。结果显示:野生型Ste2荧光信号出现在质膜和液泡内腔; C端缺失突变体荧光信号出现在质膜和内质网。在N端、C端、各环状结构域序列采用动物GPCR蛋白ORI7、OR17-40相应结构域替换的突变体中,C端替换导致液泡内腔信号消失,质膜信号强于野生型; N端和部分环状结构域替换不同程度减弱或消除了质膜定位,液泡腔内信号类似于野生型;部分突变体在胞内出现点状分布的荧光信号。由此推断:Ste2 N端,第一、第二胞外环状结构域和第三胞内环状结构域可能具有影响Ste2运输定位到质膜的功能;而C端则可能在Ste2离开细胞膜进入液泡的过程中发挥作用。初步确定了Ste2的不同结构区域对其定位的影响,为深入研究GPCR蛋白的亚细胞定位机制奠定基础。     

家蚕二分浓核病毒NS1蛋白的表达及定位

[目的]在Bm N细胞中表达家蚕二分浓核病毒(Bombyx mori bidensovirus,Bm BDV)非结构蛋白NS1,并分析其亚细胞定位。[方法]在病毒非结构蛋白NS1基因5'端加上kozak序列、3'端融合Flag标签序列;将重组序列克隆至昆虫细胞表达载体pIBV5/His上,转染BmN细胞,通过Western blot和免疫荧光检测NS1蛋白的表达和亚细胞定位。[结果]PCR和酶切鉴定显示重组表达载体构建正确;Western blot检测到一条大小约37 kDa的特异条带,免疫荧光分析显示表达的蛋白主要定位于细胞核中。[结论]构建的真核表达质粒能在BmN细胞中稳定表达NS1蛋白,该蛋白主要定位在细胞核中。     

叶花相关蛋白结构域对其转录辅激活及细胞核定位的影响

染色质相关蛋白在真核生物DNA复制、基因转录调控等过程中起着非常重要的作用．前期报道拟南芥叶花相关蛋白(leaf and flower related,LFR)蛋白定位于细胞核中, 其缺失突变体在叶、花发育及育性等方面存在着许多表型,但LFR蛋白的自身特征尚有待进一步探究．酵母单杂交实验表明,酵母转录因子GAL4 的DNA结合域与全长LFR的融合蛋白(GBD-LFR)具有转录辅激活活性,LFR的C端至少有2个犰狳蛋白(ARM)重复结构域及完整N端对于其转录辅激活活性是必需的．但在野生型拟南芥原生质体中,与典型的转录激活因子相比,GBD-LFR的转录辅激活活性并不明显．缺失或突变LFR与黄色荧光蛋白(YFP)的原生质体亚细胞定位的荧光显微观察表明,N端的1～25位氨基酸,特别是其中第22位的赖氨酸和第4、23以及25位精氨酸影响其核定位．利用激光共聚焦显微镜观察共表达黄色或青色荧光(CFP)融合蛋白的细胞核内分布,结果表明LFR与染色质结构蛋白组蛋白H4及染色质结合蛋白HMGA有一定的核内共定位．这些结果表明LFR可能作为一个染色质相关的蛋白质,在拟南芥的生长发育中发挥重要作用．     

干扰素在肝癌细胞Huh7.0中诱导SAMHD1抑制HBV复制

目的:研究干扰素调节宿主限制性因子SAMHD1的表达而抑制HBV复制的分子机制。方法:首先不同剂量的干扰素α、β和γ处理Huh7. 0细胞,通过荧光定量PCR和Western blot检测SAMHD1在转录和翻译后的表达水平;进一步通过siRNA干扰内源性的SAMHD1,再评价干扰素α、β对病毒的抑制效应;最后通过免疫荧光检测了干扰素α诱导内源性SAMHD1的细胞定位及Southern blot检测了SAMHD1细胞定位对病毒复制的影响。结果:在Huh7. 0细胞中,SAMHD1的RNA水平和蛋白表达明显受干扰素α和β的诱导升高;干扰SAMHD1后干扰素α和β对HBV复制的抑制作用消失; SAMHD1定位在细胞核内,干扰素α诱导SAMHD1同样定位在细胞核内,缺失核定位信号后SAMHD1丧失了其抑制病毒复制的作用。结论:在Huh7细胞中,干扰素α、β能诱导SAMHD1表达上调来抑制HBV的复制,SAMDH1的抗病毒作用依赖于其细胞定位。     

伪狂犬病毒VP22蛋白C-端系列缺失突变体的构建及亚细胞定位分析

以绿荧光蛋白(GFP)为标记,构建了一系列伪狂犬病毒VP22蛋白的C-端缺失突变体与GFP融合表达的真核表达质粒,脂质体介导转染Hela细胞,通过荧光显微镜观察分析各个缺失突变体的亚细胞定位,发现伪狂犬病毒VP22蛋白与核定位有关的结构域在第60个到第90个氨基酸残基之间,第111个到第159个氨基酸残基有可能与形成细胞核内的颗粒有关,与微管蛋白结合有关的结构域可能在第187到第241个氨基酸残基之间.上述研究结果为进一步深入研究伪狂犬病毒VP22蛋白的结构与功能奠定了基础.     

杜氏盐藻核基质结合区结合蛋白的细胞定位

为研究核基质结合区结合蛋白的功能及调控机制,PCR扩增杜氏盐藻MBP的cDNA全长序列及N端和C端序列,与绿色荧光蛋白基因融合构建真核表达载体,脂质体转染CHO细胞,Western blotting和荧光显微镜检测基因表达情况和细胞定位。结果显示:MBP及N端和C端融合蛋白成功在CHO细胞表达,MBP和C端部分定位于细胞核且聚集于核仁,N端部分分布整个细胞,说明MBP定位于细胞核且细胞定位信号位于C端,MBP可能与rRNA前体结合发挥作用。     

A型流感病毒NS1蛋白羧基端PL结构域影响NS1在细胞核内的定位

A型流感病毒NS1蛋白羧基端4个氨基酸可以与PDZ结构域(the domain of PSD95,Dig and ZO-1)相结合,称为PL结构域(PDZ ligand domain)．对不同亚型或毒株的流感病毒而言,其NS1蛋白PL结构域的组成存在比较大的差异．有研究发现这种差异能够影响NS1与宿主细胞蛋白的相互作用进而影响病毒的致病力．为进一步探讨PL结构域对NS1蛋白生物学特性的影响,首先构建出4种不同亚型流感病毒(H1N1、H3N2、H5N1、H9N2)来源的NS1绿色荧光蛋白表达质粒．在此基础上,对野生型H3N2病毒NS1表达质粒进行人工改造,将其PL结构域缺失或者替换为其他亚型流感病毒的PL结构域,制备出4种重组NS1蛋白表达质粒．通过比较上述不同NS1蛋白在HeLa细胞中的定位情况发现,只有野生型H3N2病毒的NS1蛋白可以定位于核仁当中,而野生型H1N1、H5N1、H9N2病毒的NS1蛋白以及PL结构域缺失或替代的H3N2病毒NS1蛋白都不能定位于核仁．而通过比较上述NS1蛋白在流感病毒易感的MDCK细胞中的定位,进一步发现所有这些蛋白均不定位于核仁．上述结果表明：PL结构域的不同可以明显影响NS1蛋白在HeLa细胞核内的定位和分布,这有可能造成其生物学功能的差异．同时,NS1蛋白在细胞核内的定位还与宿主细胞的来源有着密切关系．     

蜕皮激素对家蚕脂肪体中BmATG8蛋白亚细胞定位与细胞核皱缩的调控

【目的】昆虫脂肪体是物质合成代谢、先天免疫的重要器官。ATG8蛋白的亚细胞定位是细胞自噬的主要指标之一,细胞核皱缩是细胞凋亡的形态标记之一,目前家蚕 Bombyx mori 中尚未在蜕皮和变态发育进程中对BmATG8蛋白的细胞生物学变化进行观察。本研究旨在同时检测家蚕脂肪体细胞中BmATG8蛋白亚细胞定位和细胞核皱缩的时空变化,研究蜕皮激素(20E)信号对两者的调控作用。【方法】利用免疫荧光和Hoechst染色方法,分别在家蚕幼虫4龄第2天至预蛹第2天、5龄第2天幼虫注射20E (10 μg/头)后以及对游走期幼虫脂肪体中20E受体基因 usp 进行RNAi后,检测家蚕脂肪体中BmATG8蛋白定位和细胞核形态变化。【结果】在家蚕幼虫蜕皮和幼虫-蛹变态发育时期,BmATG8蛋白高水平存在于脂肪体细胞中,同时细胞核发生皱缩。在正常摄食时期,20E处理(10 μg/头)能够诱导细胞中大量出现BmATG8蛋白且存在于细胞质中并诱导细胞核皱缩。对 usp 基因进行RNAi后,脂肪体细胞内的BmATG8蛋白显著减少,同时细胞核皱缩减弱。【结论】家蚕BmATG8蛋白不仅在幼虫-蛹变态时期细胞质中大量存在,而且在幼虫蜕皮时期也大量表达,与细胞核的皱缩同时出现,BmATG8蛋白在细胞质中的定位与细胞核皱缩两者均受到 20E信号通路的调控。本研究为BmATG8蛋白功能及其调控机制的深入研究提供了重要的科学依据。     

Interferon-inducible Myc/STAT-interacting protein Nmi associates with IFP 35 into a high molecular mass complex and inhibits proteasome-mediated degradation of IFP 35

Nmi is an interferon (IFN)-inducible protein homologous to IFN-inducible protein IFP 35. The homology consists of a novel Nmi/IFP 35 domain (NID) of 90-92 amino acids that is repeated in tandem in each protein and mediates Nmi-Nmi protein interactions and subcellular localization. In a yeast two-hybrid screen with a fragment of Nmi protein containing both NIDs, we identified an interaction between Nmi and IFP 35. Deletion derivatives of the proteins indicate that both NIDs are required for the interaction between Nmi and IFP 35. In mammalian cells, Nmi and IFP 35 co-immunoprecipitate and co-localize in large cytoplasmic speckles. Nmi and IFP 35 proteins associate into a high molecular mass complex of 300-400 kDa as determined by native gel electrophoresis and gel filtration. The association of Nmi and IFP 35 into a complex can be demonstrated in multiple cell lines and is not dependent on treatment with IFN. Short term and long term cultures of transfected HEK293 cells suggest that Nmi and IFP 35 proteins stabilize each other through complex formation. IFP 35 appears to be more labile because Nmi was stable in the absence of IFP 35, whereas IFP 35 was degraded in the absence of Nmi. A deletion analysis revealed that Nmi must interact with IFP 35 to prevent its degradation and that the amino terminus of Nmi is required, but not sufficient, for this function. Inhibition of the proteasome, but not other proteases, led to increased levels of IFP 35. Thus, we have shown that Nmi and IFP 35 associate into a protein complex, that IFP 35 is degraded in a proteasome-mediated process, and that a novel function of Nmi is to prevent IFP 35 degradation. The stabilization of IFP 35 by Nmi may serve to amplify the physiologic effects of IFNs.     

大鼠脊神经节感觉神经特异蛋白35kD(SSP-35)的纯化及鉴定(英文)

 以大鼠脊髓背根神经节及背根纤维组织为材料 ,通过离子交换层析 ,FPLC凝胶过滤等技术分离纯化了脊感觉神经特异蛋白 35kD(SSP 35) .经SDS PAGE分析 ,该蛋白特异地存在于脊感觉神经而不存在于脊运动神经 .非还原电泳结果表明 ,该蛋白分子内含有巯基 ,有二聚体存在 .根据HPLC测定 ,蛋白纯度达 90 %以上 .将此蛋白给予培养的PC 1 2细胞 ,观察到它具有神经营养作用 .     

UDP-galactose (SLC35A2) and UDP-N-acetylglucosamine (SLC35A3) Transporters Form Glycosylation-related Complexes with Mannoside Acetylglucosaminyltransferases (Mgats)

UDP-galactose transporter (UGT; SLC35A2) and UDP-N-acetylglucosamine transporter (NGT; SLC35A3) form heterologous complexes in the Golgi membrane. NGT occurs in close proximity to mannosyl (α-1,6-)-glycoprotein β-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase (Mgat5). In this study we analyzed whether NGT and both splice variants of UGT (UGT1 and UGT2) are able to interact with four different mannoside acetylglucosaminyltransferases (Mgat1, Mgat2, Mgat4B, and Mgat5). Using an in situ proximity ligation assay, we found that all examined glycosyltransferases are in the vicinity of these UDP-sugar transporters both at the endogenous level and upon overexpression. This observation was confirmed via the FLIM-FRET approach for both NGT and UGT1 complexes with Mgats. This study reports for the first time close proximity between endogenous nucleotide sugar transporters and glycosyltransferases. We also observed that among all analyzed Mgats, only Mgat4B occurs in close proximity to UGT2, whereas the other three Mgats are more distant from UGT2, and it was only possible to visualize their vicinity using proximity ligation assay. This strongly suggests that the distance between these protein pairs is longer than 10 nm but at the same time shorter than 40 nm. This study adds to the understanding of glycosylation, one of the most important post-translational modifications, which affects the majority of macromolecules. Our research shows that complex formation between nucleotide sugar transporters and glycosyltransferases might be a more common phenomenon than previously thought.     

The PH domain containing protein CKIP-1 binds to IFP35 and Nmi and is involved in cytokine signaling

The pleckstrin homology domain-containing protein CKIP-1 is implicated in regulation of cell differentiation, apoptosis, cytoskeleton as well as recruitment of CK2 and ATM kinases to plasma membrane. Protein-protein interactions of CKIP-1 were required for these functions. Here we identify the IFN-induced protein IFP35 and its homologue Nmi as two novel CKIP-1 interacting partners. The NID domains of IFP35 and Nmi are required for the interactions. Similar to IFP35 and Nmi, CKIP-1 can be up-regulated dramatically by IFN-gamma and IL-2 and form homodimer and homotrimer in vivo. Nmi stabilizes IFP35, whereas CKIP-1 destabilizes IFP35 via inhibiting IFP35-Nmi interaction. The ratio of Nmi to CKIP-1 determines the stability of IFP35 and control cytokine signaling in a novel mechanism. Importantly, similar to Nmi and contrast to IFP35, CKIP-1 inhibits tumor cell growth and Akt-mediated cell survival. Thus, our results provide a novel role of CKIP-1 in cytokine signaling response and the biochemical mechanism, by which two previously identified modulators IFP35 and Nmi are involved via interactions.     

Developmental and Regional Changes of mRNA for a Cerebellar Protein (Spot 35) in the Rat Brain

Spot 35 protein is a cerebellar Ca-binding protein. Because Southern blot analysis showed evidence for the nucleotide sequence of spot 35 protein cDNA in the rat genome, we applied cDNA to quantitate the mRNA of rat spot 35 protein. The size of this mRNA was about 1,900 nucleotides in length, and that of mRNA from bovine cerebellum was larger. We also examined the developmental changes and regional distribution of spot 35 protein mRNA in rat brains by dot-blot analysis using cDNA as a probe. During postnatal days 1-20, a rapid increase of mRNA levels was observed. Further, the level of mRNA for spot 35 protein was found in the cerebellum and was negligible in the cerebral cortex, striatum, and hippocampus.     

人Nmi mRNA编码区存在变异形式

Ｎｍｉ基因编码一种可与Ｍｙｃ相互作用的蛋白质．在人红白血病细胞系ＴＦ－１细胞去细胞因子ＧＭ－ＣＳＦ后８ｈ,发现ＮｍｉＲＮＡ表达水平升高．利用ＰＣＲ方法从中扩增ＮｍｉｃＤＮＡ编码区,发现除正常大小的扩增片段外,还有一比公布核酸序列小约１００～２００ｂｐ的扩增片段．序列分析表明该片段为编码区第３３７～５０９位的碱基缺失,由ＧＴＴＣＣＡＴＴＧＣＧ１１个碱基取代,形成一个开放读码框架,编码２５４个氨基酸,比野生型Ｎｍｉ编码的３０７个氨基酸少５３个氨基酸．