海带(Laminaria japonica)丝状体遗传多样性的比较研究

采用垂直板式聚丙烯酰胺凝胶电泳技术对分别来自中国青岛与日本北海道海带(Laminaria japonica)丝状体的6种酶系统（乙醇脱氢酶、谷氨酸脱氢酶、异柠檬酸脱氢酶、乳酸脱氢酶、山梨醇脱氢酶和超氧化物歧化酶）进行了检测,发现存在22个基因位点,分析了不同来源海带丝状体的遗传多样性与遗传分化程度。结果表明：日本北海道海带丝状体的预期杂合度、每个位点有效等位基因数等遗传参数均大于中国青岛海带丝状体。对日本北海道海带丝状体与中国青岛海带丝状体的遗传相似系数和遗传距离进行了计算分析,显示两者发生了遗传分化。日本北海道海带丝状体的遗传多样性高于中国青岛海带丝状体。研究结果还发现在中国青岛海带丝状体的Idh、Ldh 和Sdh中,以及日本北海道海带丝状体的Adh、Gdh、Idh、Ldh、Sdh和Sod中存在着不同迁移率的不等距双带酶,可能由特殊基因控制,并集中在第3个基因位点上。     

)丝状体遗传多样性的比较研究

采用垂直板式聚丙烯酰胺凝胶电泳技术对分别来自中国青岛与日本北海道海带(Laminaria japonica)丝状体的6种酶系统（乙醇脱氢酶、谷氨酸脱氢酶、异柠檬酸脱氢酶、乳酸脱氢酶、山梨醇脱氢酶和超氧化物歧化酶）进行了检测,发现存在22个基因位点,分析了不同来源海带丝状体的遗传多样性与遗传分化程度。结果表明：日本北海道海带丝状体的预期杂合度、每个位点有效等位基因数等遗传参数均大于中国青岛海带丝状体。对日本北海道海带丝状体与中国青岛海带丝状体的遗传相似系数和遗传距离进行了计算分析,显示两者发生了遗传分化。日本北海道海带丝状体的遗传多样性高于中国青岛海带丝状体。研究结果还发现在中国青岛海带丝状体的Idh、Ldh 和Sdh中,以及日本北海道海带丝状体的Adh、Gdh、Idh、Ldh、Sdh和Sod中存在着不同迁移率的不等距双带酶,可能由特殊基因控制,并集中在第3个基因位点上。     

微生境下羊草两种生态型种群的遗传多样性及遗传分化——等位酶分析

采用水平淀粉凝胶电泳技术,应用等位酶分析方法测定了松嫩平原南部微生境条件下羊草灰绿色和黄绿色两种生态型９个种群的遗传多样性和遗传分化程度。羊草种、种群和生态型水平都维持较高的遗传多样性。两种生态型之间有明显的遗传多样性差异及遗传分化。灰绿型和黄绿型的多态位点百分率分别为６７．３％和５７．１％,等位基因平均数分别是２．２和１．９,期望杂合度分别为０．３４８和０．２９８。两种生态型种群之间平均遗传距离     

蜡梅种质资源遗传多样性的ISSR分析

利用ISSR分子标记技术,对蜡梅种质资源7个野生种群和2个栽培种群的遗传多样性进行了研究。用11条引物,共扩增出124条谱带,其中110条多态带,多态位点占88.70％。用POPEGEN1.31版软件对数据进行分析,结果显示：种群总的Nei’s基因多样性指数为0.272 6,Shannon信息多态性指数为0.411 7,蜡梅总的遗传多样性水平较高。蜡梅不同种群遗传多样性水平差异较大,种群多态位点百分率在52.94％~90.00％之间,Nei’s基因多样性指数为0.143 4~0.378 2,Shannon信息多态性指数为0.232 2~0.546 6。神农架种群（SN）和保康种群（BK）的遗传多样性水平较高。种群间的基因分化系数为0.353 6,种群内的遗传变异大于种群间的遗传变异。用NTSYS2.01版软件对样品进行UPGMA聚类分析,结果9个种群并没有按地理距离进行聚类。种群间的地理距离和遗传距离之间没有显著的相关性(r＝0.437 1,P＝0.921 3)。     

内蒙古小花棘豆遗传多样性的ISSR分析

应用ISSR分子标记对内蒙古西部地区小花棘豆（Oxytropis glabra DC.）6个地理种群进行了遗传多样性研究.结果表明：小花棘豆具有较高的遗传多样性;14个引物共扩增出327个位点,物种水平上Nei＇s基因多样性指数为0.1972,Shannon多样性指数为0.3287;种内总基因多样性为0.1976,种群内基因多样性为0.1653,83.67%的遗传变异存在于种群内,16.33%的遗传变异存在于种群间,种群间的遗传分化系数为0.1633,基因流为2.5613,6个种群间有一定遗传分化,但遗传漂变不会引起遗传分化.UPGMA遗传距离聚类结果表明,生态地理条件相似的种群优先聚集.     

青岛耐冬山茶的多样性（Ⅱ）

采用等位酶电泳技术,检测了青岛近海岛屿———长门岩岛、大管岛和浙江普陀山的天然山茶居群的遗传状况,并与青岛植物园和杭州植物园的栽培山茶居群作了比较。分析结果表明：青岛近海岛屿山茶居群内的遗传多样性水平较高,每个位点的等位基因平均数为２３,多态位点比率为８３３％,平均观察杂合度与期望杂合度分别为０２４５及０３２０,这个结果可以为青岛耐冬山茶的保护提供依据。为了探讨形态分化与等位酶变异之间的关系,对山茶居群内一些形态特殊类型的酶谱作了比较     

木耳栽培菌株酯酶同工酶的酶谱多样性研究

采用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术对木耳（Ａｕｒｉｃｕｌａｒｉａａｕｒｉｃｕｌａ（Ｈｏｏｋ）Ｕｎｄｅｒｗ）１０个栽培菌株酯酶同工酶的酶谱多样性进行了研究。１０个供试菌株的幼龄菌丝（７ｄ）中仅检测到２５条酶带,各个菌株分别具有２～３条酶带,１０个菌株仅有２种酶谱类型;老龄菌丝（７２ｄ）中共检测到４４条酶带,各个菌株分别具有３～６条酶带,１０菌株共有８种酶谱类型。研究表明,木耳双核体菌丝中某些酯酶同工酶基因位点在一定的发育时期才开始表达,老龄菌丝酯酶同工酶酶谱在木耳菌株鉴别和遗传育种研究中具有更大的应用价值。     

岛屿特有种全缘冬青遗传多样性的ISSR分析

全缘冬青(Ilex integra)为岛屿特有植物,主要分布于浙江舟山群岛,被列为浙江省珍稀濒危植物。作者运用ISSR分子标记对舟山群岛的6个全缘冬青种群(5个自然种群和1个栽培种群)共57个个体进行了遗传多样性分析。采用9条随机引物扩增出78条清晰谱带,其中45条为多态性条带,多态位点百分比(PPL)为57.7%。经POPGENE软件分析,全缘冬青种群平均多态位点百分比(PPL)为42.1%,Nei’s基因多样度(HE)为0.153,较其他海岛植物的遗传多样性偏低。5个自然种群遗传分化系数Gst=0.316,AMOVA测度Fst=0.295,Shannon多样性分化系数S=0.304,遗传分化程度较高。全缘冬青种群间地理距离与遗传距离具有正相关性(r=0.649,P<0.05),岛屿间地理隔离对种群间遗传分化产生了较为显著的影响。UPGMA聚类分析显示,朱家尖岛与普陀岛种群亲缘关系较近,而舟山岛栽培种群是由桃花岛自然种群移植而来。针对全缘冬青种群遗传多样性较低及遗传分化程度较高的现状,应加强现有自然种群的就地保护,促进种群自然更新;建立种质资源库,收集不同岛屿的种源进行混合繁殖,促进基因交流。     

亮叶水青冈（Fagus lucida）种群遗传多样性初步研究

本文利用凝胶电泳法研究亮叶水青冈（Ｆａｇｕｓｌｕｃｉｄａ）种内遗传多样性。所测定的酶系统包括：过氧化物酶（ＰＸ１和ＰＸ２）、磷酸葡萄糖脱氢酶（ＰＧＤ）、谷氨酸草酰乙酸转氨酶（ＧＯＴ１和ＧＯＴ２）、异柠檬酸脱氢酶（ＩＤＨ）、甲基荼醌还原酶（ＭＮＲ）、葡萄糖磷酸变位酶（ＰＧＭ１和ＰＧＭ２）,苹果酸脱氨酶（ＭＤＨ２）、酸性磷酸酶（ＡＣＰ）和磷酸果糖升构酶（ＰＧＩ）９种酶系统１１个基因位点。测定和分析了亮叶水青冈２地理种群的等位基因频率,固定指致,基因多祥性和遗传距离,为进一步研究水青冈的遗传变异和种内种间关系提供了科学依据。     

利用AFLP分子标记探讨蜡梅种质资源的遗传多样性

利用AFLP分子标记技术,对中国蜡梅种质资源7个野生种群的遗传多样性进行了研究。利用筛选出的3对引物,共扩增出253条谱带,其中218条多态带,多态位点占86.17% ;种群间的基因分化系数为0.2906,说明蜡梅基因多样性主要存在于种群内;种群总的Nei s基因多样性指数为0.2933,Shannon信息多态性指数为0.4487,蜡梅总的遗传多样性水平较高。蜡梅不同种群遗传多样性水平差异较大,种群多态位点百分率在65.44% ～87.16%之间,Nei s基因多样性指数为0.1653 ～0.4012,Shannon信息多态性指数为0.3132 ～0.5603。神农架种群(SN)和保康种群(BK)的遗传多样性水平较高。用NTSYS2.01版软件对样品进行UPGMA聚类分析,结果7个种群并没有按地理距离进行聚类。最后提出要对各蜡梅野生群体采取相应的迁地和就地保护措施。     

基于线粒体Cyt b基因的龙头鱼群体遗传结构分析

在我国黄海、东海和南海海岸带上, 选取青岛、南通、舟山、三门、宁德、泉州和湛江共7个群体164尾龙头鱼(Harpadon nehereus)为研究对象, 通过PCR扩增共获得长度为1112 bp的线粒体DNA细胞色素b (Cyt b)基因序列, 共检测到32个变异位点, 其中单变异位点27个, 简约信息位点1个。164条序列定义了29个单倍型, 平均单倍型多样性(H_d)和核苷酸多样性(π)分别为0.3026±0.0479和0.000371±0.000379, 其中泉州群体的单倍型多样性和核苷酸多样性均最低。分析比较了不同龙头鱼群体间遗传变异情况, 发现群体间平均遗传距离为0.00035, 遗传分化指数F_ST值均小于0.05, 群体间没有发生明显的遗传分化。AMOVA分析结果显示龙头鱼群体遗传差异主要来源于群体内个体间的变异。中性检验的Tajima’s D和Fu’s F_s统计值均为负值且显著偏离中性, 核苷酸不配对分布图呈现明显的单峰分布, 表明龙头鱼历史上经历了群体扩张事件, 参考已知海洋鱼类Cyt b基因2%每百万年的进化速率, 估算群体扩张发生的时间大约在0.08—0.32百万年前的第四纪更新世中晚期。     

大叶藻居群微卫星遗传多样性研究

采用4对微卫星引物对大叶藻的7个地理居群进行了遗传多样性与遗传结构分析。扩增148株大叶藻得到57个等位基因, 每个位点平均等位基因数为6, 大叶藻居群的平均期望杂合度(He)为0.687, 平均观测杂合度(Ho)为0.417。青岛湾居群的遗传多样性最高(A=7.750, AR=7.043), 俚岛居群最低(A=4.750, AR=4.543)。从F_st值来看, 7个大叶藻居群间属于中度分化。UPGMA系统发育树显示, 中国4个大叶藻居群聚类到一起, 其遗传分化可能是由于历史大海草场的遗留小片段居群产生, 而中国、韩国、日本和爱尔兰居群间的遗传分化则主要是由于地理隔离造成的。自由交配估计结果支持海草的东亚起源说。青岛湾居群遗传多样性较高, 可优先作为大叶藻移植修复的材料和基因库, 并进行重点保护。     

基于线粒体16S rRNA基因的舟山群岛碧蛾蜡蝉种群遗传多样性分析

【目的】揭示岛屿隔离效应对舟山群岛及邻近大陆碧蛾蜡蝉Geisha distinctissima种群遗传多样性的影响。【方法】依据本研究获取的舟山群岛(11个岛屿)及邻近大陆15个种群共247头碧蛾蜡蝉样本的16S rRNA基因序列,对该地区种群进行遗传多样性评估;采用贝叶斯推断法构建系统发育树并绘制单倍型网络图,以解析种群间的遗传结构;通过中性检验、错配分布分析和贝叶斯天空线(Bayesian skyline plot, BSP)分析,探讨该地区碧蛾蜡蝉的种群历史动态。【结果】贝叶斯系统树及单倍型网络图均没有解析出舟山群岛碧蛾蜡蝉种群明显的遗传结构。且分子方差分析发现,遗传变异主要集中在种群内部(种群内变异占68.26%),种群间没有明显的遗传分化,显示了该地区碧蛾蜡蝉种群遗传多样性的均质化。不同种群间的单倍型多态性和核苷酸多态性与大陆-岛屿距离及岛屿隔离时间不相关。中性检验分析检测到Tajima’s D和Fu’s Fs均呈显著的负值,且错配分布分析呈现出典型的单峰,表明该地区碧蛾蜡蝉种群发生了近期的种群扩张事件。BSP分析表明,这种扩张事件发生在大约0.5～3.5千年前。【结论】岛屿隔离效应可能不足以驱使舟山群岛及邻近大陆的碧蛾蜡蝉种群遗传多样性产生明显的差异。     

Genetic diversity of Chinese water deer (Hydropotes inermis inermis): implications for conservation

The Chinese water deer (Hydropotes inermis inermis) is endemic to China. Historically, the species was widely distributed, but now, habitat loss and poaching have reduced its range and number drastically. In order to provide useful information for its conservation, we have investigated the genetic diversity and population structure of the Chinese water deer by analyzing the 403 bp fragment of the mitochondrial DNA (mtDNA) control region (D-loop). Eighteen different haplotypes were detected in 40 samples. Overall, Chinese water deer have a relatively high-genetic diversity compared to other rare cervid species, with a haplotype diversity of 0.923+/-0.025 and nucleotide diversity of 1.318 +/- 0.146%. No obvious phylogenetic structure among haplotypes was found for samples of different origin. An analysis of molecular variance (AMOVA) showed significant differentiation between the Zhoushan and the mainland population (F(ST)= 0.088, P < 0.001; Phi( ST ) = 0.075, P = 0.043), which suggests that exchanges of individuals between Zhoushan and the mainland should be avoided. We also recommend that a breeding center be set up for the mainland population.     

青岛耐冬山茶的多样性 (Ⅱ)——居群的遗传多样性分析

采用等位酶电泳技术,检测了青岛近海岛屿--长门岩岛、大管岛和浙江普陀山的天然山茶居群的遗传状况,并与青岛植物园和杭州植物园的栽培山茶居群作了比较。分析结果表明：青岛近海岛屿山茶居群内的遗传多样性水平较高,每个位点的等位基因平均数为2.3,多态位点比率为83.3%,平均观察杂合度与期望杂合度分别为0.245及0.320,这个结果可以为青岛耐冬山茶的保护提供依据。为了探讨形态分化与等位酶变异之间的关系,对山茶居群内一些形态特殊类型的酶谱作了比较。     

Application of SSR and AFLP to the analysis of genetic diversity in <Emphasis Type="Italic">Gracilariopsis lemaneiformis</Emphasis> (Rhodophyta)

The agarophyte Gracilariopsis lemaneiformis is both important for biological research and of significant economic value. However, the genetic diversity of wild populations of the alga has not been studied. We used amplified fragment length polymorphism (AFLP) PCR and simple sequence repeat (SSR) analysis to investigate diversity in four field populations, three from the coast of Qingdao and one from Weihai, China. Forty G. lemaneiformis isolates collected from the four different geographical groups were analyzed using 16 pairs of SSR primers for PCR amplification. However, no polymorphisms were detected, indicative of a degree of genetic homogeneity. A total of 347 reproducible bands were then amplified using eight AFLP primer pairs, and genetic indices of diversity within and between populations were calculated. This analysis revealed only low levels of genetic diversity both within and between the four geographical groups of G. lemaneiformis. The Weihai population showed a higher within-population genetic diversity than any of the Qingdao populations. The data suggest that there is only limited gene flow between populations. An UPGMA dendrogram revealed two main clusters, and one of these included all the Qingdao isolates. The order of clustering was in accordance with their geographical distribution. These results suggest that the wild G. lemaneiformis populations are closely related and that there is little genetic diversity within wild germplasm in the regions sampled.     

舟山小黄鱼线粒体DNA D-loop区序列变异的遗传多样性分析

小黄鱼(Pseudosciaena polyactis)为我国重要海产经济鱼类之一,过度捕捞和环境污染等因素造成其资源日益衰退。研究小黄鱼种群遗传结构对其资源的保护及其可持续利用有十分重要的意义。该研究采用聚合酶链式反应(PCR)技术对浙江舟山附近海域小黄鱼种群53个个体的mtDNA D-loop区全序列进行扩增,序列长度在795~801bp之间,长度差异不大。采用ClustalX1.83、MEGA3.1、DnaSP4.0等生物信息学软件进行遗传多样性分析,结果显示:53条小黄鱼线粒体DNA D-loop区的T、C、A和G碱基平均含量分别为30.3%、23.1%、32.3%和14.3%,排除13处核苷酸的插入或缺失后,共检测到93处转换和颠换位点,约占分析序列总长度的11.6%,其中包括53个单一多态位点和40个简约信息位点,共确定了52种单倍型,单倍型多样性(hd)为0.9993,单倍型间的平均遗传距离为0.012,转换/颠换平均值为4.305,平均核苷酸差异数(k)为9.73875,核苷酸多样性(π)为0.01233,表明舟山小黄鱼遗传多样性处于中等水平。     

Genetic Diversity of Chinese Water Deer (Hydropotes inermis inermis): Implications for Conservation

The Chinese water deer (Hydropotes inermis inermis) is endemic to China. Historically, the species was widely distributed, but now, habitat loss and poaching have reduced its range and number drastically. In order to provide useful information for its conservation, we have investigated the genetic diversity and population structure of the Chinese water deer by analyzing the 403 bp fragment of the mitochondrial DNA (mtDNA) control region (D-loop). Eighteen different haplotypes were detected in 40 samples. Overall, Chinese water deer have a relatively high-genetic diversity compared to other rare cervid species, with a haplotype diversity of 0.923±0.025 and nucleotide diversity of 1.318 ± 0.146%. No obvious phylogenetic structure among haplotypes was found for samples of different origin. An analysis of molecular variance (AMOVA) showed significant differentiation between the Zhoushan and the mainland population (F_ST= 0.088, P < 0.001; Φ _ST = 0.075, P = 0.043), which suggests that exchanges of individuals between Zhoushan and the mainland should be avoided. We also recommend that a breeding center be set up for the mainland population.