中心法则对生物学的影响及其面临的挑战

ＦｒａｎｃｉｓＣｒｉｃｋ 1 95 7年在实验动物学会年会上作了题为“关于蛋白质合成”的报告 ,该文发表于 1 95 8年。在这篇论文中 ,Ｃｒｉｃｋ首次列出了 2 0个氨基酸残基的标准位点 ,并提出了核酸碱基序列可以独特的表达一段核酸的特异性 ,该序列编码某一特定蛋白质的氨基酸序列 ;还提出了蛋白质三维空间的形成是由它的氨基酸序列所决定的论据 ;并指出蛋白质合成一定是连续的 ,阐明了在核糖体上合成蛋白质由“中间体 (ａｄａｐｔｏｒ)”分子介导的假说。最重要的是Ｃｒｉｃｋ提出了“中心法则”。中心法则在过去和现在一直在影响着分子生…     

生物传感芯片质谱及其在蛋白质组研究中的应用

目前蛋白质组研究技术在已有的研究基础上取得了长足进展 ,包括固相 ｐＨ梯度双向凝胶电泳、生物质谱技术、蛋白质双向电泳图谱的数字化和各种分析技术、蛋白质间相互作用分析的方法如酵母双杂交系统、噬菌体展示、表面等离子共振等。但均各有其利弊。目前质谱是进行蛋白质组成分鉴定的支撑技术 ,但是它在蛋白质间相互作用分析及结构与功能的关系分析方面显得无能为力 ,而生物分子相互作用分析技术 (Ｂｉｏｍｏｌｅｃｕｌａｒｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎａｎａｌｙｓｉｓ ,ＢＩＡ)是进行蛋白质相互作用分析的较好技术 ,将两者结合起来在蛋白质组…     

内蛋白子及其功能

内蛋白子及其功能白玉明,袁静明（山西大学生命科学系,太原０３０００６）关键词内蛋白子,蛋白质剪接,内蛋白子归巢１．内蛋白子内蛋白子（ｉｎｔｅｉｎ）是由Ｐｅｒｌｅｒ等［１］于１９９４年正式提出的与蛋白质剪接（ｐｒｏｔｅｉｎｓｐｌｉｃｉｎｇ）有关的一个专...     

酵母双杂合系统的改进和发展

酵母双杂合系统是在１９８９年由ＳｔａｎｌｅｙＦｉｅｌｄｓ和Ｏｋ－ｋｙｕＳｏｎｇ等提出并初步建立的［１］,该系统是在酿酒酵母（Ｓａｃｈａｒｏｍｙｃｅｓｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）中研究蛋白质间相互作用的一种非常有效的分子生物学方法。近几年来随着人们对该系统的广泛应用,这一系统得到了不断的完善及改进,同时也衍生出单杂合系统,三杂合系统等一系列相关的技术。这些技术在不同研究领域中的广泛应用有力地推动了蛋白质与ＤＮＡ,蛋白质与ＲＮＡ,以及多种蛋白质分子间相互作用的研究。     

酵母以杂合系统的改进和发展

酵母双杂合系统是在１９８９年由ＳｔａｎｌｅｙＦｉｅｌｄｓ和Ｏｋ－ｋｙｕ Ｓｏｎｇ等提出并初步建立的＾［１］,该系统是在酿酒酵母（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）中研究蛋白质间相互作用的一种非常有效的分子生物学方法。近几年来随着人们对该系统的广泛应用,这一系统得到了不断常有的效的分子生物方法。近几年业随着人们对该系统的广泛应用,这一系统得到了不断的完善及改进,同时也衍生出单杂合系统     

逆向酵母双杂交系统的应用

198 9年Ｆｉｅｌｄｓ等提出了酵母双杂交系统来研究真核细胞的蛋白质之间的相互作用。这一崭新手段迅速发展成为一种常规的分子生物学技术 ,并得到了广泛的应用。近来 ,国外学者为拓宽传统的双杂交系统的应用范围 ,在原有的酵母双杂交的基础上发展了大量衍生系统 ,包括用于研究蛋白质与ＤＮＡ之间相互作用的单杂交系统 (ｏｎｅ ｈｙｂｒｉｄｓｙｓ ｔｅｍ) [1] ;研究两个蛋白质与第三个成分间相互作用的三杂交系统 (ｔｈｒｅｅ ｈｙｂｒｉｄｓｙｓｔｅｍ) [2 ] ,第三个成分可以是蛋白质、ＲＮＡ或小分子药物等[3 ] 。另外 ,在通过双杂交体系…     

第三届国际人类蛋白质组大会即将于2004年10月在北京召开

随着人类基因组计划的完成,蛋白质组研究已成为21世纪生命科学发展的先导,成为生命科学乃至自然科学最活跃的学科领域之一。由国际人类蛋白质组组织(HUPO)发起的国际人类蛋白质组大会是蛋白质组领域规模最大、影响最广、水平最高的国际性会议,每年举办一次。2004年10月25日至27日,第二届国际人类蛋白质组大会将在北京召开。这将是亚太地区主办的第一次大型国际蛋白质组学大会。     

串联质谱数据从头解析与蛋白质的数据库搜索鉴定

蛋白质的鉴定是蛋白质组学研究中必不可少的一步。用串联质谱（ｔａｎｄｅｍ ｍａｓｓ ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ,ＭＳ／ＭＳ）可以进行多肽的从头测序（ｄｅ ｎｏｖｏ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ）,并搜索数据库以鉴定蛋白质。用图论以及真实谱－理论谱联配（ａｌｉｎｇｍｅｎｔ）的方法对串联质谱得到的多肽图谱进行从头解析,得到了可靠的多肽序列,并应用到数据库搜索中鉴定了相应的蛋白质。同时,还用统计的方法对ＳｗｉｓｓＰ     

菜豆富含脯氨酸蛋白质基因在生物和非生物胁迫下的表达

植物细胞壁是细胞的机械支持物和保护壳,在植物的生长和发育、细胞内的通讯和代谢交换过程中起重要作用。细胞壁主要由多糖和蛋白质组成,根据蛋白质的氨基酸组成和糖的含量特点可把细胞壁结构蛋白分为５类：富含羟脯氨酸的糖蛋白（ｂｙ一ｄｒｏｘｙｐｒｏｌｉｎｇ－ｒｉｃｈ　ｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎｓ,ＨＲＧＰｓ）、富含脯氨酸蛋白质（ｐｒｏｌｉｎｅ－ｒｉｃｈｐｒｏｒｅｉｎｓ,ＰＲＰｓ）、富含甘氨酸蛋白质（ｇｌｙｃｉｎｅ－ｒｉｃｈｐｒｏｔｅｉｎｓ,ＧＲＰｓ）、茄科凝集素（ｓｏｌａｎａｃｅｏｕｓｌｅｃｔｉｎｓ）和阿拉伯…     

肿瘤: 一种蛋白质组病

恶性肿瘤的发生是一个涉及多因素、多基因的多阶段病理过程. 以往的研究主要集中在基因组和转录组分析. 随着人类基因组计划的完成, 肿瘤研究开始进入“后基因组时代”, 肿瘤蛋白质组学应运而生. 蛋白质作为基因功能的主要执行者, 一方面在肿瘤发生发展过程中扮演重要角色, 另一方面在很大程度上决定正常细胞和肿瘤细胞之间的差异(如异型性、恶性特征等). 本文提出, 肿瘤是一种蛋白质组病, 并根据肿瘤比较蛋白质组、表达蛋白质组、功能蛋白质组和结构蛋白质组研究进展, 从肿瘤发生发展过程中蛋白质(组)表达水平及状态、蛋白质翻译后修饰、蛋白质相互作用及网络调控等三个方面进行阐述. 该观点的提出, 将为肿瘤发病机制的研究开辟新的领域, 为肿瘤的诊断(如生物标志物筛选)和筛选(如药物新靶标)提供新的思路, 具有重要的科学意义和临床应用价值.     

在网络上作蛋白质序列分析

因特网上的Ｗｅｂ服务器是生物学家的主要网络资源[1] ,就目前的数学和计算机科学能力而言 ,不同的基因组序列项目产生的大量序列 ,仍是生物计算领域的主要挑战之一。如何从生物数据的海量中获取蛋白质序列最有价值的信息 ?首要条件是访问由几个生物计算中心如ＮＣＢＩ、ＥＢＩ、ＥＭＢＬ、ＳＩＢ和ＩＮ ＦＯＢＩＯＧＥＮ研究开发的最新序列和结构数据库 (例 :ＥＭＢＬ、ＧｅｎＢａｎｋ、Ｓｗｉｓｓ Ｐｒｏｔ、ＰｒｏｔｅｉｎＤａｔａＢａｎｋ)。网络蛋白质序列分析 (ＮｅｔｗｏｒｋＰｒｏｔｅｉｎＳｅｑｕｅｎｃｅＡｎａｌｙｓｉｓ,ＮＰＳ …     

蛋白质芯片技术

以前对蛋白质的研究集中在一次研究一种蛋白质 ,通常费时费力 ;而蛋白质芯片技术是研究蛋白质组的新技术 ,是高通量、微型化和自动化的蛋白质分析技术。它可以用来研究蛋白质的亚细胞定位和蛋白质与蛋白质之间的相互作用 ,以及对蛋白质的功能进行生物化学分析 ,将对蛋白质组研究及医学生物学的发展有很大的推动作用。较系统地介绍了蛋白质芯片的概念、制作及检测方法 ;同时也讨论了蛋白质芯片的两种功能形式、存在问题和应用前景。     

双向蛋白质组分析程序

《双向蛋白质组分析程序》(2 ＤＰｒｏｔｅｏｍｅＡｎａｌｙｓｉｓＰｒｏｔｏｃｏｌｓ)由ＡｎｄｒｅｗＪ.Ｌｉｎｋ编著 ,1999年ＨｕｍａｎａＰｒｅｓｓＩｎｃ .出版 ,6 0 1页。本书系“分子生物学方法”(ＭｅｔｈｏｄｓｉｎＭｏｌｅｃｕｌａｒＢｉｏｌｏｇｙ)丛书的第 112卷 ,是用蛋白质组解答生物学问题的一册指南。不管是球面蛋白质分析问题 ,还是评估细胞对内部或外部的刺激反应 ,本书描述的先进方法将对研究者更好地理解细胞如何活动以及对药物探索都提供了新的可能性。特点 :(1)证实了蛋白质总体表达的特殊性和同一性程序。(2 )药物探…     

蛋白质组阵列技术的现状与展望

蛋白质组就是展示一个细胞或组织或机体的全部蛋白质。目前双向凝胶电泳特别是固相pH梯度等电聚焦的双向聚丙烯酰胺凝胶电泳,是分离阵列蛋白质组成分的核心技术,但仍存在诸多不足,通过改善蛋白溶解、阵列策略和蛋白斑点的探测技术,使蛋白质组阵列技术取得了进展。     

蛋白质间相互作用技术的研究近况

蛋白质间相互作用技术的研究近况黄翠芬叶棋浓（军事医学科学院生物工程研究所,北京１００８５０关键词：蛋白质,相互作用,技术ＲｅｃｅｎｔＡｄｖａｎｃｅｓｉｎｔｈｅＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓｏｆＰｒｏｔｅｉｎ┐ＰｒｏｔｅｉｎＩｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓＨｕａｎｇＣｕ...     

蛋白质的自剪接

1990年,Ｈｉｒａｔａ等在酵母液泡膜Ｈ -ＡＴＰａｓｅ的α亚基(ＶＭＡ1)中首次发现了蛋白质自剪接(ｐｒｏｔｅｉｎｓｅｌｆｓｐｌｉｃｉｎｇ)现象。此后,蛋白质剪接现象陆续在古细菌、真细菌及真核细胞中被发现。1994年Ｐｅｌｅｒ等对蛋白质自剪接进行了规范化定义和命名:(1)将按正确阅读框架插入到前体蛋白氨基酸序列中,但在蛋白剪接成熟过程中被切除的序列称为蛋白内含肽(ｉｎｔｅｉｎ)。处于ｉｎｔｅｉｎ两侧,相互首尾相连以产生成熟蛋白产物的蛋白序列称为蛋白外显肽(ｅｘｔｅｉｎ)。(2)蛋白质剪接是在蛋白质水平上,而不是在ＲＮＡ水平…     

胁迫处理对林生山黧豆蛋白质多肽及其含量的影响

应用二维电泳技术,分析了经水分胁迫（ＰＥＧ）、盐分胁迫（ＮａＣｌ）和热激（４０℃）处理后林生山黧豆（ＬａｔｈｙｒｕｓｓｙｌｖｅｓｔｒｉｓＬ．）体内蛋白质多肽及其含量的变化。有些蛋白质经ＰＥＧ、ＮａＣｌ和热激处理后可以产生相同的变化。两种不同的胁迫因子对某些蛋白质的影响有一定的共同性。特定的胁迫条件可以造成特定的影响。不同胁迫因子对同一蛋白质多肽可以造成不同的影响。胁迫下蛋白质的变化可能与林生山黧豆抵抗和适应胁迫条件的能力以及体内非蛋白质氨基酸的代谢有关     

甲醇酵母表达系统

甲醇酵母基因表达系统是一种最近发展迅速的外源蛋白质生产系统。甲醇酵母是可利用甲醇作为唯一碳源的酵母 ,主要有Ｈ .Ｐｏｌｙｍｏｒｐｈａ、ＣａｎｄｉｄａＢｏｄｉｎｉｉ、ＰｉｃｈｉａＰａｓ ｔｏｒｉｓ三种 ,其中ＰｉｃｈｉａＰａｓｔｏｒｉｓ作为基因表达系统使用得最多、最广泛[1] 。与以往的基因表达系统相比 ,它具有无可匹敌的高表达特性 ,已被认为是最具有发展前景的生产蛋白质的工具之一。1 .外源蛋白质的基因在甲醇酵母中的高效表达目前已有多种蛋白质的基因在该表达系统中克隆成功 ,包括蛋白酶、酶抑制剂、受体、单链抗体等 (…     

双向凝胶电泳技术进展

双向聚丙烯酰胺凝胶电泳按等电点和分子量对蛋白质进行分离,具有很高的分辨率,已经成为蛋白质组研究中的核心技术之一。目前的方法还难以满足真核生物蛋白质组研究的要求。自1975年O'Farrell提出该方法以来,针对应用中常见的一些问题,如样品的增溶及加载,样品的预分级分离,阴极漂移和凝胶上蛋白质的回收等,对这种技术进行了不断的改进。     

HMG蛋白质与人ε—珠蛋白基因5‘旁侧调控元件DNA相 …

ＨＭＧ蛋白质是一类在染色质内含量极为丰富的非组蛋白质,它们在染色质的结构与功能中起着重要的作用。本文运用凝胶电泳阻抑法和ＤＮａｓｅＩ足迹法分析了ＨＭＧ蛋白质与人ε－珠蛋白基因５＇旁侧调控元件ＤＮＡ之间相互作用的情况。结果表明ＨＭＧ蛋白质（１／２）既能与两个正调控元件（－５３５￣－４５３ｂｐ和－４４６￣－４１９ｂｐ）ＤＮＡ相结合,也能与启动子（－１７７￣＋１ｂｐ）ＤＮＡ相结合;而ＨＭＧ蛋白质（１４／