喉癌相关基因的研究进展

喉癌是头颈部常见恶性肿瘤之一,以喉鳞状细胞癌为多。喉癌的发生和发展是一个多基因参与、多阶段、多层面的复杂过程。目前研究发现,喉癌与EGFR、COX-2、Survivin、VEGF、STAT3、p16、p53和Cyclin D1等基因相关。通过对这些基因的深入研究,基因治疗将为喉癌的临床治疗和预防提供新途径,对人类战胜喉癌有着极其重要的意义。     

喉癌中p15、p16基因纯合缺失与EGFR基因扩增相关性研究

研究p15、p16基因缺失和EGFR基因扩增的相关性及其与喉癌发生、发展的关系。提取喉癌新鲜组织中基因组DNA,采用聚合酶链反应技术,分别对30例喉癌进行p15基因第2外显子(p15E2)和p16基因第2外显子(p16E2)进行纯合缺失研究;应用FISH方法进行喉癌实体瘤EGFR基因扩增研究。p15E2纯合缺失率为13．3％(4／30),p16E2纯合缺失率为16．7％(5／30),p15E2、p16E2共同缺失率为6．7％(2／30)。在30例喉癌实体瘤EGFR基因扩增频率为30％(9／30),扩增2～8倍。p15E2和p16E2纯合缺失以及二者共同缺失与EGFR基因扩增相关,可能引起细胞周期失控而导致细胞增殖紊乱,在喉癌的发生及恶性进展中发挥一定作用。     

重组腺病毒介导人野生型p53和B7-1基因诱导喉癌细胞凋亡并增强其免疫原性

为开展喉癌的复合基因治疗,观察共表达人野生型p53和B7-1基因的重组腺病毒Ad-p53/B7-1对喉癌细胞增殖及免疫原性的影响,检测到Ad-p53/B7-1介导的人野生型p53基因可抑制喉癌细胞增殖并诱导其凋亡,同时B7-1基因的导入可增强喉癌细胞的免疫原性基因修饰的癌细胞可刺激自体肿瘤浸润淋巴细胞增殖,并诱导外周血淋巴细胞形成对肿瘤具有特异杀伤性的细胞毒性T淋巴细胞。     

喉癌的比较基因组杂交研究

寻找与喉癌发生进展的相关基因,应用比较基因组杂交技术分析了18例喉癌患者。结果显示,每例喉癌细胞染色体均有不同程度的变化,包括染色体全部或部分的扩增或丢失。平均每例有12．9处异常区域,丢失多于扩增,分别为每例7．2处和5．7处。主要为3q(78％,)、5p(61％)、11q(56％)、1q(50％,)、8p(44％)、8q(39％)和15q(39％)的扩增;3p(70％)、5q(78％)、90(67%)、13q(50％)、1p(44％)和14q(39％)的丢失。有多条染色体区带上出现特异的扩增或丢失,特别是1p13-21(8／18)、3p21-23(14／18)、5p21-22(14／18)、9p12-pter(10／18)和13q21-31(8／18)的拷贝数增加明显,而1q11-2l(11／18)、3q15-21(12／18)、8p22-24(6／18)、11q12-13(8／18)、15q21-23(7／18)和18p11(8／18)区域的丢失为喉癌的特征性变化,说明这些区域中存在与喉癌发生发展密切相关的癌基因、抑癌基因或其他相关基因。     

《生物技术通讯》2002年分类索引

研究报告重组腺病毒介导人野生型p５３和B７－１基因…………诱导喉癌细胞凋亡并增强其免疫原性邱兆华,潘鲁浙,劳妙芬,等（１）重组腺病毒介导人野生型p５３和B７－１基因在喉癌………细胞中的高效转移和高水平表达邱兆华,王艳飞,潘鲁浙,等（６）新型噬菌……………………………………………………………………体表面呈现载体的构建刘志刚,俞炜源,林建波（１１）二硫键稳定的抗肝癌人源化Fv－突变体人TNFα融合基因的…………………构建与表达孙志伟,俞炜源,吕国华,等（１４）转化的大鼠胚胎成纤维细胞系与p５３val１３５功能…     

PCDH20在喉鳞癌中的表达及与预后的关系

检测前钙粘蛋白20(procadherin20,PCDH20)在喉磷状细胞癌(laryngeal squamous cell carcinoma,LSCC)中的表达与喉癌病理特征及预后的关系。荧光定量PCR(quantitative real-time polymerase chain reaction,q RT-PCR)及Western blotting检测PCDH20在喉癌组织及癌旁组织中的mRNA及蛋白表达,免疫组化(immunohistochemistry,IHC)检测PCDH20在喉癌中的表达,同时分析PCDH20蛋白表达水平与喉癌临床特征及预后的关系。qRT-PCR、Western blotting以及IHC结果显示PCDH20在喉癌组织中的表达率明显低于癌旁组织(p0.05)。进一步分析IHC结果显示PCDH20在喉癌组织中的表达水平与吸烟及淋巴转移有关,而与年龄、性别、T分期、临床分期、分化程度无相关性,单因素Cox回归分析显示病理分级、T分期、PCDH20表达与喉癌患者五年生存率明显相关(p0.05)。同时结果显示PCDH20基因的低表达患者的生存率更低(p0.05)。PCDH20可能提示喉癌发生的恶性进程,其低表达可能与喉癌患者的预后不良相关,可能成为新的预后的标志物。     

p53对胃癌发生的影响

胃癌的发生是多步骤、多基因参与的过程.抑瘤基因p53变异在胃癌的发生发展过程中发挥了重要的作用.对p53基因及其蛋白质的结构、生物学功能和p53基因多态性及基因突变对胃癌发生、发展的影响进行了综述.     

Id-1在喉癌组织中的表达

目的:证实Id-1基因在喉癌组织和喉癌细胞系中的表达.方法:通过反转录PCR(RT-PCR)和蛋白质印迹杂交法(Westernblot法)对30例喉癌组织,10例癌旁正常组织和一个喉癌细胞株在基因和蛋白水平上对ID-1的表达进行检测.结果:喉癌组织和喉癌细胞株中Id-1基因高表达,而正常喉组织中没有Id-1的表达;Id-1蛋白的表达与喉癌组织的、临床分期、分化程度具有相关性(均P<0.05).结论:ID-1蛋白的表达与喉癌的发生、发展及临床分期有关.     

食管癌遗传易感基因的研究进展

食管癌的发生发展是多个基因参与改变的过程,本文对近年来研究热点的遗传易感基因p53基因、FHIT基因、p16基因、错配修复基因、PLCE1基因在食管癌发生发展过程中的作用作了简要阐述,以期为食管癌的早期诊断、预后评估及基因治疗寻找一条可行的途径。     

人喉癌干细胞的培养鉴定及其增殖的抑制研究

喉癌发病率逐年上升,常规化疗药物如顺铂(cisplatin, DDP)和盐酸阿霉素(doxorubicin hydrochloride, DOX)在杀伤喉癌细胞、减少远处转移和提高患者生存率方面至关重要,但对肿瘤干细胞的杀伤效果欠佳。靶向性或选择性杀伤肿瘤干细胞,有望提高化放疗敏感性,减少癌症转移及复发。该文主要通过体外悬浮培养人喉癌干细胞(Hep2 sphere),运用qRT-PCR、Western blot等实验方法检测Hep2 sphere相关因子的表达、细胞周期和耐药性等数据。结果显示,其在一定程度上具备肿瘤干细胞样特征。克隆形成实验和细胞计数法检测得到的人喉癌干细胞增殖能力弱,多处于静息状态G0/G1期。q RT-PCR结果显示,在Hep2 sphere中CD44、ALDH、p-AKT、bcl2和p21表达显著上调, bax和AKT表达下调。Western blot也证实,在Hep2 sphere中bax和AKT蛋白表达下调, bcl2、p21蛋白表达显著上调。MTT实验检测表明,在不同化疗药物处理下, Hep2 sphere的细胞存活率明显高于Hep2;在腺病毒ZD55-Trail处理下, Hep2的细胞存活率则明显高于Hep2 sphere。研究证明,悬浮培养的人喉癌干细胞具有喉癌干细胞特性;腺病毒ZD55-Trail对人喉癌干细胞具有较强杀伤效果,对分化的喉癌细胞影响较弱, DDP、Dox和5-Fu则相反。     

喉癌差异表达cDNA序列的分离与初步鉴定

分离和克隆人喉癌中新的相关基因将有助于提示喉癌的易感性与癌变机制。运用ｍＲＮＡ差异显示法对２例成人喉癌组织及配对癌旁正常组织的基因表达进行研究,分离到３５个差异显示片段;用反向Ｎｏｒｔｈｅｒｎ点杂交筛选到６个差异片段,经克隆、测序和匹配分析,得１２条不同ｃＤＮＡ序列,其中４条为新基因序列,另外８条与已知基因高度同源。将１２条ｃＤＮＡ序列固定在膜上,用来自喉癌和配对正常组织的总ｃＤＮＡ探针与其杂交和     

P53家族基因的三周期性及其分步聚类分析

P53家族基因(p53、p63和p73)与肿瘤密切相关。为研究其相关性质,首先用Voss映射将p53家族基因的蛋白质编码序列(coding sequence,CDS)映射为数值序列;继而对数值序列进行离散傅立叶变换,并计算其功率谱;接着基于功率谱研究p53家族基因的最大功率谱、信噪比、位移偏度和三周期性强度等性质;最后利用p53家族基因的三周期性分析结果,构造其特征向量并进行分布聚类分析。结果显示,p63基因和其他两类基因的性质较为接近,而p53和p73基因的性质差异相对较大。另外,通过实例说明和比较分析的方式证明分步聚类分析对p53家族基因具有较高的有效性。     

喉癌相关基因LCRG1的克隆和表达分析

喉癌是严重危害人类健康的一类恶性肿瘤。选用在mRNA差异显示研究中获得的在喉癌组织中表达显著下调且代表新基因的EST之一（AF10056）,设计引物进行cDNA文库筛选,得到一全长为3448bp的cDNA序列,其开放读码框编码288个氨基酸,与已知蛋白质无明显同源性,属一新发现的基因,GenBank接受号为AF268387。与GenBank数据库匹配分析,发现该基因包含6个外子,基因组RT－PCR显示有40％（12／30）的喉癌组织表达下调,RT－PCR显示有54．5％（6／11）其他肿瘤细胞系表达缺失。把该基因命名为喉癌相关基因（laryngeal carcinoma related gene1,LCRG1)。这提示LCRG1可能与喉癌的发生发展相关。     

喉癌中差异表达的蛋白激酶及其抑制剂的生物信息学筛选

目的：筛选喉癌中差异表达的激酶基因以及调控这些差异表达激酶的激酶抑制剂,为喉癌的分子治疗提供新的靶点。方法： 利用PubMed 数据库和SAM 软件筛选喉癌中差异表达的激酶基因。体外培养人喉癌Hep-2和FaDu 细胞。实时定量聚合酶链反 应（Real-time PCR）检测目的激酶在喉癌细胞系中的表达,以验证全基因表达谱结果的准确性。利用KEGG数据库获得激酶调控 的通路。文献挖掘和人工筛选获得差异表达激酶的激酶抑制剂。结果：①在喉癌基因组表达谱中,共筛选出差异表达基因207个, P<0.05,其中激酶基因4 个,分别为CDC42、CDK7、SLK 和TXK。②Real-time PCR 结果显示在人喉癌Hep-2 和FaDu 细胞中这四 个差异基因也出现差异表达,P<0.05,证明全基因组的结果准确。③通路分析的结果显示4 个差异激酶共调控25 个通路。④文献 挖掘和人工筛选的结果显示共有10 个激酶抑制剂调控CDC42,7 个激酶抑制剂调控CDK7,1 个激酶抑制剂调控SLK,2 个激酶 抑制剂调控TXK。并且再次文献挖掘的结果显示在这20 个激酶抑制剂中,有9 个在癌症方面的研究较少,文献<10 篇。结论： 喉癌中共有四个激酶CDC42、CDK7、SLK 和TXK发生差异表达,并发挥促癌作用。它们的激酶抑制剂可能有潜在的抗癌作用, 为喉癌的分子治疗提供新的切入点。     

非编码RNA在喉癌发生中的作用及其临床意义

喉癌是头颈部最常见的恶性肿瘤之一,喉癌患者吞咽、呼吸及发音功能均可受到严重影响,患者经受“有苦难言”的折磨,生活质量极差。因此,揭示喉癌发病的分子机制,以期提高喉癌早期诊断水平和防治效果一直是该研究领域的热点之一。近年来,随着基因测序技术、转录组学技术和生物信息学技术等分子生物学技术的应用,越来越多的与喉癌发生相关的非编码RNA先后被发现。实验证明,一些短链非编码RNA（如：上调的miR-16、miR-21、miR．106b和miR-1297,下调的let．7a、miR．1、miR．24、miR．34a／c、miR-137、miR-203和miR-206）以及长链非编码RNAf如：H19、HOTAIR和MALAT-1）均被发现参与了喉癌的发生、发展过程,它们发挥着促癌或者抑癌作用,影响细胞的增殖、浸润、转移和凋亡。这些非编码RNA将有可能为喉癌诊断和治疗分别提供新的标志物和治疗靶点。     

棉铃虫核多角体病毒p10基因的序列及转录分析

为了利用棉铃虫核多角体病毒（HaSNPV）p10基因的启动子构建重组病毒杀虫剂及表达系统,应用末端测序法和引物步移法测定了p10基因的序列,并应用Northern杂交和引物延伸实验对该基因进行了深入的转录特性分析,HaSNPV p10基因被定位于基因组DNA的115.4kb-115.6kb处,转录方向与多角体基因相反,在其上下游分别发现了p26和p74基因。转录分析结果确定了p10基因是个极晚期基因,其转录从杆状病毒晚期转录保守序列GTAAG的第二个A开始,转录产物大小约为430nt。HaSNPV p10基因最早可检测到的转录是在病毒感染后的20h,随后其转录产物量迅速放大,到感染后72h达到非常高的水平。围康时相分析同时还检测到一个大小为1300nt的产物,推测该产物为p26和p10通读的转录产物。对HaSNPV P10蛋白序列的分析表明,该蛋白第6－44位及第51－65位氨基酸序列处含多个典型的卷曲螺旋七聚体重复结构,两片段间相隔6个氨基酸残基,在该蛋白序列的第20－34位与第51－65位存在L－X（2）－L－X（10）－L的亮氨酸重复。Helical net分析表明,HaSNPV P10的疏水氨式酸分布为两个集簇区,两者互为180度转角。     

2型糖尿病易感基因的连锁和关联研究

2型糖尿病（T2DM）是由于胰岛素抵抗和β细胞分泌缺陷导致高血糖的一种复杂多基因疾病。遗传因素在T2DM的发生发展中起着重要的作用,其遗传率估计为70％～80％。鉴定2型糖尿病基因将有助于阐明其发病机制,发展更好的诊断、预防和治疗策略。2型糖尿病易感基因的鉴定方法主要有候选基因关联研究和全基因组连锁分析。有3种类型的候选基因：功能候选基因、图位候选基因和表达候选基因。虽然许多候选基因与T2DM的关联分析已经进行,但多数都没有得到一致的重复,过氧化物酶体增殖物激活受-γ,体和β-细胞ATP敏感性钾通道基因是目前最好重复的基因。迄今为止,T2DM的全基因组扫描已在20多个不同的群体中进行,包括欧洲人、美国白人、墨西哥裔美国人、美国本地印度人、非洲裔美国人和亚洲人,这些研究鉴定了一些与T2DM相关的QTLs区域。与T2DM显著和证实连锁的区域包括1q25、2q37．3q28、3p24、6q22、8p23、10q26、12q24、18p11、20q13等,与T2DM提示连锁的区域有1q42、2p21、2q24、4q34、5q13、5q31、7q32、9p24、9q21、10p14、11p13、11q13、12q15、14q23、20p12、Xq23等。鉴定这些区域的T2DMQTLs基因及其作用机制是未来的主要挑战。把DNA微阵列和蛋白质组学技术结合起来应用于传统的连锁分析和关联研究,研究基因-基因间、基因-环境间的互作和多个基因对T2DM的加性效应和综合作用,进一步加强国际协作,T2DM的遗传机制可望在不远的将来得到阐明。本文总结了2型糖尿病基因鉴定的现状,重点在一些得到重复的区域和未来的展望。     

Hsa-miR-10a-5p靶基因预测及生物信息学分析

利用生物信息学对miR-10a-5p的靶基因进行预测及相关分析,为miR-10a-5p靶基因的实验验证及其调控机制提供理论基础。通过miRBase获取并分析人、大鼠,小鼠等物种的miR-10a-5p的碱基序列特征;使用在线数据库Targetscan7.1,miRDB,mirDIP和DIANA TOOLS等预测miR-10a-5p的靶基因,并用Venny 2.1绘制韦恩图取交集。用在线工具DAVID对交集靶基因进行GO功能注释和KEGG pathway分析。结果表明miR-10a-5p成熟序列在各物种间高度保守。获得的79个靶基因在分子功能上主要涉及染色质结合,转录活性激活等,并显著富集于肝脏发育,脂肪组织发育等生物学过程,涉及cAMP信号通路,TNF信号通路及AMPK信号通路。miR-10a-5p通过调控靶基因参与了生命活动和疾病过程中多个方面,尤其生长发育和癌症过程,为进一步研究提供了生物学基础。     

miR-24-3p对宫颈癌细胞增殖与迁移的作用及机制研究

该文探讨了miR-24-3p对宫颈癌细胞增殖和迁移的促进作用及其机制。采用miR-24-3p抑制剂下调宫颈癌细胞中miR-24-3p的表达后,通过MTT、Transwell实验和Western blot检测细胞增殖、迁移和PCNA蛋白水平;采用生物信息学方法预测miR-24-3p的靶基因并进行功能注释和筛选;双荧光素酶报告实验和Western blot验证靶基因类血管动蛋白-2(angiomotin-like 2,AMOTL2),并通过siRNA抑制AMOTL2检测其对宫颈癌细胞迁移的影响。结果显示,下调miR-24-3p能抑制宫颈癌细胞的增殖和迁移能力并减少PCNA蛋白表达;其靶基因主要存在细胞与细胞连接组分中,显著富集于蛋白激酶活性分子功能、蛋白质自身磷酸化生物学过程和癌症中microRNA信号通路;miR-24-3p能靶向负调控最佳靶基因AMOTL2,下调AMOTL2可促进宫颈癌细胞CaSki的迁移。总之,miR-24-3p可调控多靶基因参与多个生物学过程和多条信号通路,在宫颈癌中可促进细胞增殖且通过靶向AMOTL2促进迁移。     

p16INK4A在黑素瘤中的研究进展

黑素瘤是人类恶性皮肤肿瘤之一,对药物治疗不敏感且死亡率高.近年来随着分子生物学的发展,人们对黑素瘤的研究在基因水平取得了很大进步.p16INK4A作为一种多肿瘤抑制基因,与黑素瘤的发生、发展有关.P16 INK4A在黑素瘤中的失活形式主要是缺失、突变和甲基化,进一步明确p16INK4A基因的失活机制及其与黑素瘤的相关性,可能为黑素瘤的临床诊断、治疗和判断预后等方面提供一种新路径.