中国兽类分类与系统演化研究进展

中国兽类（即哺乳动物）种类繁多,对维持生态平衡发挥着重要的作用。自John R.Reeves于1829—1834年在我国广东开展兽类调查以来,近200年我国兽类分类及系统学研究取得了令世人瞩目的进步和发展。目前中国已知的兽类物种数已达686种,约占全世界兽类种数的10%,是世界上兽类物种多样性最丰富的国家之一。随着我国对生态环境保护的重视,生态环境日益改善,但全球气候变化、生境破碎化、人类活动增加及人兽共患重大疫情涌现等问题仍十分突出,兽类多样性调查及分类学研究的必要性越发明显。同时,兽类分类学这门古老而传统的学科也在不断引入各种新方法与技术,如整合分类学、标本数字化、模式标本测序、便携式测序技术及基于深度学习技术的物种识别鉴定等,分类学研究的成果及应用在近年得到了飞速发展。动物分类学作为传统的基础学科,是遗传学、生理学、生态学、医学、药学等现代生物学的基石。然而,由于学科特征和差异等原因,该学科近年来没有得到足够的重视,导致出现了学科萎缩和分类学人才后继无人的危机。因此,从国家层面对分类学、形态学等基础学科的人才培养、课题设置和资金投入等,予以特殊的政策支持,十分必要,也亟待解决。     

二十年来我国兽类学研究的进展与展望：Ⅱ．形态分类、动物地理、古兽类学

1　分类、区系研究进展2 0年来 ,我国兽类分类和区系研究取得了较大的发展 ,主要表现在以下几个方面 :1 1　生物多样性保护已成为国家必须履行的国际义务 ,生物多样性保护的第一个层次就是物种多样性 ,而物种多样性是建立在分类区系研究的基础上。这要求加强有关兽类分类和区系的研究工作。1 2　国家科技部、基金委和中科院一贯重视并支持《三志》 (即《中国动物志》、《中国植物志》和《中国孢子植物志》)的编撰工作。 2 0多年来投入数千万元的编撰、出版费 ,组织全国 80 0余位分类学家参加编撰工作。除了国家拨专款支持外 ,1 999年中国…     

赣江鱼类物种更新名录

赣江是长江的主要支流之一, 淡水鱼类多样性极其丰富, 但是目前对于该河流的鱼类多样性还未有充分的了解。本研究于2016年9月至2017年8月对赣江鱼类进行了实地调查, 结合历史文献资料并参考最新的分类学成果, 更新了赣江淡水鱼类名录。结果表明, 赣江共有淡水鱼类180种, 隶属于12目31科93属。其中, 土著鱼类174种, 外来鱼类6种。赣江鱼类以鲤形目为主; 鲤科种类最多, 其次是鲿科。更新的物种名录中, 包含23个新记录土著种, 其中有5个未被描述的新种; 有36个历史资料记载的种类被剔除出物种名录; 25个物种发生了分类地位的变更。此外, 本次调查有28种鱼类未采集到, 说明这些鱼类的种群数量正在急剧下降, 而这些鱼类分别属于洄游性、流水性和产漂流性卵等独特生态类型, 说明赣江鱼类多样性受到了严重的人为干扰。本研究所给出的赣江鱼类的更新物种名录, 可为今后的赣江鱼类多样性保护提供理论基础。     

贵州省翼手类名录修订

参考翼手目动物分类学和分子系统学的最新研究成果, 在《贵州兽类志》的基础上, 结合近年来有关翼手类研究的资料, 对贵州省翼手类名录进行整理, 并列出了贵州省翼手类的分布地点。截止到2015年10月31日, 贵州省共有蝙蝠7科17属51种, 占中国现有蝙蝠种类(134种)的38.1%。其中, 我国特有种8种(贵州特有种2种)。与《贵州兽类志》中记载的翼手类相比, 增加了14种, 3个物种未被列入, 更改了10个物种的名称。按照中国动物地理区划, 贵州省蝙蝠以东洋界种类占绝对优势, 共有42种, 古北界种类仅2种, 广布种7种。列入IUCN红色名录各濒危等级的有44种, 列入《中国脊椎动物红色名录》的有48种。     

中国兽类多样性监测网的建设规划与进展

兽类类群和物种多样,分布范围广,适应于多种生境类型,对栖息地变化特别敏感,是生物多样性保护管理与评价的关键指示类群。中国兽类多样性监测网是由中国科学院近年来推动建立的中国生物多样性监测与研究网络的专项网之一,重点对分布于我国境内的陆生兽类物种多样性及资源进行监测与研究。针对当前我国兽类监测研究面临的三大根本任务(兽类物种有什么?在哪里?有多少?),当务之急是应尽快建立和完善我国兽类各类群的监测技术规范,制定常态监测计划,全面建设全国性的兽类多样性监测网络技术体系和监测数据公共信息平台。本文在总结国内外兽类监测研究的基础上,提出了我国陆生兽类多样性监测网的建设规划,重点介绍该监测网的科学目标、布局、监测技术和监测数据产品等。本文也总结了近年来我国陆生兽类多样性监测网建设所取得的重要进展及存在的问题,为全面推动我国兽类多样性联网监测明确发展方向。     

《世界哺乳动物种名录》简介

长久以来,国际上没有一本完整的全世界兽类的分类名录。这对兽类专业工作者或与之有关的各方面人员,往往感到十分不便,虽然,有些专类可以通过专著查考,如啮齿目;有些地区可以通过地区性的分类名录查考。如古北界、北美;但毕竟不如有一本综合全世界兽类的分类名录查考方便。英国自然历史博物馆的分类学家Corbet和Hill合作编篡的这一本世界兽类名录的问世,基本上可以满足各方面一般查考兽类分类及分布之需。     

山西油松林分类学多样性

基于物种分类系统关系的分类学多样性不仅能反映群落内物种分类学之间的差异,而且可以间接反映生态系统或群落是否处于退化阶段。与传统的物种多样性指数相比,分类学多样性指数对不同的取样方法和大小具有较强的稳健性。以山西油松林为研究对象,在山西省范围内选取113个样地进行植被调查,并结合历史资料和相关文献整理了植物名录,野外共记录植物357种,隶属于3门4纲36目71科227属。植物科内属、种的组成差异较大,其中含属、种最多的科是菊科,分别为31属和50种,含种最多的属为蒿属(Artemisia 11种)。选取平均分类学差异指数(Δ~+)和分类学差异变异指数(Λ~+)作为度量群落分类学多样性的指标,同时分析了分类学多样性指数与环境因子的关系,研究结果表明:113个样地的Δ~+值大都位于Δ~+理论平均值上方(89.5%);Λ~+值都位于Λ~+理论平均值上方,这表明山西油松林物种组成的亲缘关系较远,分属不同的分类单元;群落内物种分类单元的均匀度较差,即物种主要集中在几个大的分类单元内,如菊科、蔷薇科、豆科和禾本科等。对分类学多样性指数影响最大的是群落结构因子(胸径、乔木密度和群落物种数),其次是微地形因子(坡向和坡位)。土壤全氮和有机碳与Δ~+呈极显著正相关(P0.01)。宏观地形因子(纬度和海拔)与Δ~+和Λ~+相关性不显著(P0.05)。通过对山西油松林物种的Δ~+和Λ~+研究表明,山西油松林大多处于平稳的成长阶段,物种组成相对稳定,存在一定的物种分类学差异,但主要集中几个大的分类单元。     

山西平陆黄河湿地植物分类学多样性

传统的物种多样性通常使用物种数量指标α和β等多样性指数进行测度,由于其对取样和样本大小有依赖关系且极其敏感,因此取样方法的不同会对多样性的结果产生显著影响。分类学多样性方法基于分类学系统关系测量物种多样性,弥补了传统方法的不足,同时面对各种变量和不受控制的取样具有稳健性,同时也考虑了集合的分类学均匀度。不仅能反映植物群落多样性,还能间接反映环境与扰动间的关系,用于识别生态系统或生境是否处于退化阶段。为了探究平陆黄河湿地的物种多样性,检验分类学多样性方法在植物生态学方面的应用,选取了16个样地进行植物调查,并结合历史资料整理了种子植物名录,结果表明平陆黄河湿地共有植物368种,隶属于36目67科213属。含种最多的科为菊科和禾本科,分别为54种和45种。应用平均分类学差异指数(Δ+)和分类学差异变异指数(Λ+)研究了各样地的植物物种多样性:Δ+和Λ+的理论平均值分别为74.24和480;位于三门峡大坝上游和下游的样地和不同群落类型的分类学多样性均没有显著差异(P0.05)。受人类干扰较大的车村和鳖干平均分类学差异指数值显著较低,Δ+分别为62.28和67.41,位于95%的置信漏斗外;而水分条件较好且人为干扰较少的南沟渡口和三湾湖平均分类学差异指数值最高为分别81.30和79.94。车村的分类差异变异指数值最高为814.44,其物种在不同分类阶元分布最不均一,涧北的分类差异变异指数值最低为423.31,其物种分布相对较均一。传统的多样性方法难以全面的反映某个区域的物种组成、分布和多样性,此外分类学多样性的高低与物种数量的多少没有一定的相关关系,Δ+与S、Λ+与S的相关关系分别为-0.257和-0.187(P0.05)。耕作、生态旅游、日常活动等人为干扰因素可能是造成平陆黄河湿地分类学多样性降低及物种在不同分类等级间分布不均匀的主要原因。     

中国高等植物多样性编目进展

中国高等植物多样性编目是“中国生物物种名录”项目中的重要组成部分, 旨在后植物志时代对中国高等植物的物种名录进行修订和年度更新。自2017年深圳国际植物学大会以来, 中国高等植物物种名录已进行了5次年度更新。名录参考最新的植物分类学研究进展, 对各大类群全面采用有分子证据的新分类系统, 收录5年来发表的中国植物新类群和新记录, 补充往年遗漏的部分类群, 并依据新的专科专属的修订结果对发生属间分类变动的类群进行了更新。目前的中国高等植物物种名录包含角苔类4科9属27种, 苔类62科170属1,081种94个种下等级, 藓类94科453属2,006种154个种下等级, 石松类3科12属165种4个种下等级, 蕨类38科177属2,215种228个种下等级, 裸子植物10科45属291种118个种下等级, 被子植物272科3,409属32,708种6,909个种下等级, 共计483科4,275属38,493种7,507个种下等级, 较5年前增加了19科270属2,334种。     

中国兽类资源数据库管理信息系统的建立与应用

本文阐明了建立兽类资源管理系统的意义,然后详细介绍系统的设计目标、数据结构及系统软件的设计。介绍了标本、物种分布名录及文献库管理的功能,并对本系统创建及应用的物种、地名代码体系作了介绍。最后介绍了已经用此系统建立的昆明动物研究所兽类标本及中国兽类分布名录等基础数据库的概况。     

Determination of mitochondrial genetic diversity in mammals

Mitochondrial DNA (mtDNA) is one of the most popular population genetic markers. Its relevance as an indicator of population size and history has recently been questioned by several large-scale studies in animals reporting evidence for recurrent adaptive evolution, at least in invertebrates. Here we focus on mammals, a more restricted taxonomic group for which the issue of mtDNA near neutrality is crucial. By analyzing the distribution of mtDNA diversity across species and relating it to allozyme diversity, life-history traits, and taxonomy, we show that (i) mtDNA in mammals does not reject the nearly neutral model; (ii) mtDNA diversity, however, is unrelated to any of the 14 life-history and ecological variables that we analyzed, including body mass, geographic range, and The World Conservation Union (IUCN) categorization; (iii) mtDNA diversity is highly variable between mammalian orders and families; (iv) this taxonomic effect is most likely explained by variations of mutation rate between lineages. These results are indicative of a strong stochasticity of effective population size in mammalian species. They suggest that, even in the absence of selection, mtDNA genetic diversity is essentially unpredictable, knowing species biology, and probably uncorrelated to species abundance.     

中国灵芝属真菌的多样性与资源

灵芝属是大型真菌的一个重要类群,具有重要的经济价值、生态价值和文化价值。尽管国内外对灵芝属真菌的研究较多,但灵芝属真菌的分类一直存在诸多问题,我国过去报道的灵芝属真菌有114个分类单元,但其中很多的分类地位存在争议。本文基于凭证标本,确认我国目前发现的灵芝种类有40种,其中具有ITS分子序列的种类有39种,其他74个分类单元或为同物异名或为待定种。本文提供的中国39种灵芝的ITS序列可为今后准确鉴定灵芝的野生和栽培种类提供依据。     

Species of Turbellaria Acoela in the Swedish Museum of Natural History, with Remarks on Their Anatomy, Taxonomy and Distribution

The Turbellaria Acoela in the collection of slides in the Swedish Museum of Natural History have been subject to reexamination considering new taxonomic principles. In a list of 101 species contributions are given to the anatomy, taxonomy, distribution and habitats of the species. The list is at the same time a catalogue of the types in the collection. The main part of the species have been described in several papers by Einar Westblad and Ernst Marcus.     

Thuja sutchuenensis: a rediscovered species of the Cupressaceae

After more than a century, the only conifer species listed as being extinct in the wild (EW) by IUCN-SSC has been rediscovered in the Dabashan Mountains of central China. The history, taxonomy, ecology and conservation of Thuja sutchuenensis are described, and illustrations, based on both the earliest and latest collection of botanical material of this tree, are provided. The taxonomic context of this rare species is discussed.  © 2002 The Linnean Society of London , Botanical Journal of the Linnean Society , 2002, 139 , 305–310.     

中国苔藓植物多样性研究进展

苔藓植物是生物多样性的重要组成部分, 包括角苔植物、苔类植物和藓类植物三大类群, 其物种数量仅次于被子植物, 是高等植物的第二大类群。我国是世界苔藓植物多样性最丰富的国家。自2017年以来, 我国苔藓学者在世界范围发现了10个新属, 40个新种, 建立了新的地钱纲分类系统; 更新了我国苔藓植物物种名录, 完成了数本分类学专著, 并在苔藓系统发育基因组、苔藓植物多样性与环境关系、苔藓植物多样性保护等领域取得了可喜的进展。对未来的研究, 我们提出5点建议: (1)加强对重要生态系统、国家公园和关键类群的物种多样性调查; (2)加快基于基因组的苔藓植物多样性研究; (3)加强苔藓植物保护研究; (4)加强西北地区苔藓植物多样性研究人才的培养; (5)进一步加强国际合作, 努力构建“一带一路”国家苔藓植物多样性平台。     

Against the naming of fungi

The use of molecular bar-coding and consensus on nomenclatural practices has encouraged optimism about the future of fungal taxonomy and systematics. There are, however, profound deficiencies in our understanding of fungal diversity and broader problems with the taxonomic enterprise that deserve greater attention. For 250 years mycologists have tried to reconcile fungal diversity with the Linnean fantasy of a divine order throughout nature that included unambiguous species. This effort has failed and today's taxonomy rests on an unstable philosophical foundation. Rather than persisting with the present endeavour, it may be more fruitful to abandon the notion of fungal species pending further basic research. In the meantime, mycologists should consider tagging collections with digital codes and assigning these operational taxonomic units to higher taxonomic ranks whose objective reality is corroborated by strong phylogenetic evidence.     

中国泡状微孢衣及相关种类的初步研究

采用传统分类学及分子生物学技术,鉴定并报道了采自中国甘肃、新疆、西藏的微孢衣属中国新记录种——泡状微孢衣(Acarospora bullata Anzi),并对该属部分种类[节微孢衣(A. nodulosa (Dufour) Hue)、垫微孢衣(A. pulvinata H. Magn.)]进行了分类及系统发育学研究,提供了这3个物种的详细描述、形态结构图以及ITS序列。本研究可为《中国地衣志——微孢衣科》的编写提供科学数据。     

Classical and non-classical taxonomy: where does the boundary pass?

Rise of non-classical science during XX century had certain influence upon development of biological taxonomy. Scientific pluralism (especially normative naturalism of Laudan), contrary to positivist and early post-positivist treatments, made taxonomy acknowledged scientific discipline of its own right. The present state of some schools of taxonomy makes it possible to consider them as a part of non-classical science and constituting the non-classical taxonomy. The latter is characterized by the following most important features. Ontological substantiation of both classificatory approaches and particular classifications is requested which invalidates such formal approaches as nominalistic and phenetic (numerical) schools. This substantiation takes a form of content-wise background preferably causal models which include certain axioms and presumptions about taxonomic diversity being studied, together with its causes, and thus define initial conditions of classificatory procedures. From this viewoint, phylogenetic classificatory approach is the most developed part of non-classical taxonomy. The entire taxonomic diversity is structured into several aspects of different levels of generality, each being outlined by a particular consideration aspect. The latter makes personal knowledge constituting an irremovable part of any scientific statement about taxonomic diversity, thus opposition of "objectively" and "subjectively" elaborated classifications becomes vague. Interrelation of various species concepts corresponding to its different consideration aspects is described by uncertainty relation principle. Classificatory algorithms are to be compatible with the conditions of a background model to ensure particular classifications obtained by their means are interpretable within the same model: this is provided by the correspondence principle. Classification is considered as a taxonomic hypothesis, i.e. a conjectural judgement about structure of particular fragment of taxonomic diversity considered within given consideration aspect; wich is to be forwarded and tested according to certain rules. Recognition of different aspects of taxonomic diversity makes it "legal" to elaborate several classifications of equal status, each reflecting a particular aspect of a fixed fragment of that diversity. This viewpoint makes classical ideas of the "ultimate" Natural (whatever might be its definition) or the best reference systems futile. In general, any pretension of an approach to be "the best" in reflecting taxonomic divesrity is contr-productive. Instead, elaboration of particular spectra of complementary classifications becomes the main task of non-classical taxonomy which describes in sum the entire taxonomic diversity. So, not opposition but correct mutual interpretation of such classifications and uniting them into the comprehensive picture of taxonomic diversity become focal points of non-classical taxonomy.