人Elongator复合物Elp3亚基基因可显著补偿酵母elp3缺失菌株的生长缺陷

从HeLa细胞中分离的人的Elongator复合物在组成及与RNAPⅡ的作用方式上与酵母的Elongator复合物十分相似．但对其功能研究极少。为了研究人的Elongator复合物催化亚基Elp3的功能,将人elp3等基因转入酵母elp3基因缺失的突变菌株（elp3△菌株）,并对转化菌株进行功能互补实验和ssa和pho5基因表达分析,结果表明人elp3基因可显著恢复突变菌株对高温和Caffeine的敏感性．在低磷条件下显著补偿了突变株ph05基因表达延迟的缺陷．并可在热激条件下提高ssa3基因的表达。含酵母elp3非HAT区和人elp3 HAT区的融合yhelp3对上述缺陷有着更强的补偿能力。而HAT区催化结构域缺失的yhelp3HAT-没有任何补偿能力．表明人Elp3亚基可能与酵母的该亚基功能相似．人Elp3的HAT活性也为其行使功能所必需。     

人Elongator复合物Elp3亚基基因可显著补偿酵母elp3缺失菌株的生长缺陷

从HeLa细胞中分离的人的Elongator复合物在组成及与RNAPⅡ的作用方式上与酵母的E- longator复合物十分相似,但对其功能研究极少。为了研究人的Elongator复合物催化亚基Elp3的功能,将人elp3等基因转入酵母elp3基因缺失的突变菌株(elp3Δ菌株),并对转化菌株进行功能互补实验和ssa3和pho5基因表达分析,结果表明人elp3基因可显著恢复突变菌株对高温和Caffeine的敏感性,在低磷条件下显著补偿了突变株pho5基因表达延迟的缺陷,并可在热激条件下提高ssa3基因的表达。含酵母elp3非HAT区和人elp3 HAT区的融合yhelp3对上述缺陷有着更强的补偿能力。而HAT区催化结构域缺失的yhelp3HAT没有任何补偿能力,表明人Elp3亚基可能与酵母的该亚基功能相似,人Elp3的HAT活性也为其行使功能所必需。     

人Elongator复合物Elp4亚基基因可部分补偿酵母ELP4缺失菌株的生长缺陷

为研究人Elongator复合物EIp4亚基的功能,将人ELP4基因转入酵母ELP4基因缺失的突变菌株(elp4△菌株)中,并对转化菌株进行功能互补实验和SSA3和PHO5基因表达分析,结果表明人的ELP4基因不能恢复突变菌株对高盐的敏感性,但可以在一定程度上缓解突变菌株对高温、咖啡因(Caffeine)和6-氮尿嘧啶(6-AU)的敏感性,部分恢复低磷条件下PHO5基因表达延迟的缺陷,并可在热激条件下提高SSA3基因的表达,因此人的ELP4基因可以部分补偿酵母ELP4基因缺失所引起的生长缺陷,提示人的EIp4亚基可能与酵母的该亚基功能相似。     

一种温敏复制缺陷T载体的构建及在鸡白痢沙门氏菌基因敲除中的应用

基因敲除是基因功能研究的重要手段,载体是基因敲除的工具和核心。为获得有效的基因敲除载体以快速构建基因突变株及鉴定相应基因的必需性,在已有温敏复制缺陷pIDM1质粒的基础上,于EcoRⅠ和PstⅠ位点间插入串联的XcmⅠ酶切位点接头,构建了pIDM-T质粒;该质粒经XcmⅠ酶切可获得末端突出T的线性化pIDM-T载体。在验证了pIDM-T质粒复制的温敏特性基础上,应用构建的T载体克隆鸡白痢沙门氏菌CVCC527菌株的eno和ybdr两个基因,鉴定获得pIDM-T_eno和pIDM-T_ybdr两个重组质粒;将重组质粒转化527菌株,经IPC(Integration rate per cell)值计算,鉴定eno为必需基因,ybdr为非必需基因。挑取非必需ybdr基因527菌株重组菌(SalΔybdr),经PCR和测序,确认突变菌株重组位点的正确性。pIDM-T载体可快速克隆PCR产物,用于沙门氏菌的基因敲除及必需性鉴定,为沙门氏菌基因功能研究提供了一种有效快速的手段。     

两种新型HBsAg基因的毕赤酵母表达载体构建及其表达

目的：从乙肝患者血清中发现2个有突变的乙型肝炎病毒株,从中扩增出HBsAg(乙肝表面抗原)基因,构建酵母表达载体,并在巴斯德毕赤酵母中表达,以鉴定这2个基因表达产物的活性。方法：利用PCR技术从乙肝患者血清中扩增出乙肝表面抗原基因．并将其连接到pPIC3．5K中,转化毕赤酵母,通过甲醇诱导,利用SDS-PAGE和ELISA检测表达的蛋白。结果：通过序列测定结果表明成功地构建了毕赤酵母表达载体,聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS—PAGE)和ELISA证明这2个基因在毕赤酵母中能有效表达。且表达产物均具有生物活性。结论：从实验结果发现乙肝表面抗原决定簇以外的少数氨基酸变化不影响其活性。因此可以利用这2个基因对乙肝表面抗原进行表达。     

产甘油假丝酵母胞浆3-磷酸甘油脱氢酶基因（CgGPD）功能分析

【目的】从高产甘油生产菌株产甘油假丝酵母（Candida glycerinogenes）基因组中克隆了NAD+依赖3-磷酸甘油脱氢酶编码基因（CgGPD）,但是该基因及其上游调控序列具体的功能还是未知的。本文研究了CgGPD基因及其上游调控序列的功能。【方法】本文以酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）及其渗透压敏感型突变株为宿主,构建3种不同的酵母表达载体导入酵母细胞,研究了不同酵母转化子在渗透压胁迫条件下CgGPD基因表达对细胞的耐高渗透压胁迫应答及其细胞的甘油合成能力的影响。【结果】实验结果表明无论是以来源于S. cerevisiae 的TPI启动子还是来源于CgGPD基因的启动子,过量表达CgGPD基因的转化子均能够显著加速葡萄糖消耗速度和提高甘油合成能力,在gpd1/gpd2突变株中表达CgGPD基因能够消除细胞对外界高渗透压的敏感性,同时转化子胞内甘油大量积累。【结论】CgGPD基因在野生型酵母S. cerevisiae W303-1A表达显著提高细胞的甘油合成能力,在gpd/1gpd2突变株中能够互补GPD1基因的功能,CgGPD基因表达受渗透压诱导 调控。     

分枝杆菌glpX基因的功能

【目的】构建耻垢分枝杆菌(Mycobacterium smegmatis)glpX基因敲除株,研究其在生理代谢中的功能。【方法】利用分枝杆菌噬菌体Che9c重组系统构建耻垢分枝杆菌glpX基因敲除株;比较野生株及突变株在不同碳源培养条件下的生长差异;通过荧光实时定量PCR,比较野生株在以葡萄糖或油酸为唯一碳源培养下,glpX基因的表达水平。【结果】glpX突变株在以甘油或油酸为唯一碳源的培养基中无法生长;野生株在以油酸为唯一碳源培养下,glpX基因表达上调。【结论】glpX基因编码了分枝杆菌糖异生途径必需的和非冗余的果糖1,6-二磷酸酶(fructose 1,6-bisphosphatase,FBPase)。     

拟南芥抗旱转录因子CBF4基因区域的核苷酸多样性及其分子进化分析

以生长于不同气候条件下的17个拟南芥核心生态型为材料,分析了它们的抗旱转录因子CBF4基因区域的序列多态性。结果表明：拟南芥CBF4基因区域具有高密度的单核苷酸多态性(SNP)和插入缺失(Indel),多态性频率为每35．8bp一个SNP,每143bp一个Indel,基因非编码区的多态性是编码区的4倍;在编码区,SNP的频率为每96．4bp一个SNP,其中发现25av、203av和244av 3个生态型CBF4基因区域1034位(以Gen—Bank登录号AB015478序列第19696位的核苷酸为1)碱基变化：G←→T,引起第205位氨基酸变化：gly←→val。核苷酸多样性统计分析显示,该基因内部大范围内存在连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD),5’端非编码区有一个重组。与拟南芥等的研究结果类似,选择压力对不同的区域作用不同。3’端非编码区核苷酸多样性程度最高,是平衡性选择的结果,编码区核苷酸变化符合中性突变假说,而5’端非编码区是自然选择作用的靶位点。     

酿酒酵母GAL基因的表达调控

酵母菌一直是人们进行遗传分析的理想材料,对许多酵母基因的表达调节途径人们也已有了较深人的了解。酵母中研究最多的基因表达调节途径是GAL基因表达调节过程,它不仅为比较研究原核和真核生物的协同表达调节机制提供了可能性,而且由于酵母GAL基因表达可以被生长条件所控制,所以GAL基因区域对外源基因在酵母中的克隆表达也具有潜在的应用价值I‘,‘］。现在就酵母GAL基因的表达调节做一概述。IGAL基因组成及转录调节模型半乳糖是通过转化为6一磷酸葡萄糖后进人糖解途径而被酵母利用的。其中至少有五种基因产物参与从半乳糖的运…     

腈水解酶基因bxn的结构与功能研究

前期研究发现腈水解酶基因bxnRD127表达产物无功能,测序证明该基因结构中存在4处突变。本文对4处突变逐点进行结构与功能回复突变研究,发现其中2处突变能使基因表达产物丧失功能,1处使基因表达产物活性降低,1处对基因表达产物活性基本无影响。进一步将完全回复突变的bxn基因转化烟草,获得的转基因烟草具有抗溴苯腈除草剂特性,结果证明结构中的3处突变与活性中心功能有关。     

The Set2 methyltransferase associates with Ssn6 yet Tup1-Ssn6 repression is independent of histone methylation

The Tup1-Ssn6 corepressor regulates the expression of diverse classes of genes in Saccharomyces cerevisiae. Chromatin is an important component of Tup1-Ssn6-mediated repression. Tup1 binds to underacetylated tails of histones H3 and H4, and requires multiple histone deacetylases for the repression. Here we examine if histone methylation, in addition to histone deacetylation, plays a role in Tup1-Ssn6 repression. We found that like other genes, Tup1-Ssn6 target genes exhibit increased levels of histone H3 lysine 4 trimethylation upon activation. However, deletion of individual or multiple histone methyltransferases and other SET-domain containing genes has no apparent effect on Tup1-Ssn6-mediated repression of a number of well-defined targets. Interestingly, we discovered that Ssn6 interacts with Set2. Although deletion of SET2 does not affect Tup1-Ssn6 repression of a number of target genes, Ssn6 may utilize Set2 in specific contexts to regulate gene repression.     

Genetics of gene expression responses to temperature stress in a sea urchin gene network

Stress responses play an important role in shaping species distributions and robustness to climate change. We investigated how stress responses alter the contribution of additive genetic variation to gene expression during development of the purple sea urchin, Strongylocentrotus purpuratus, under increased temperatures that model realistic climate change scenarios. We first measured gene expression responses in the embryos by RNA‐seq to characterize molecular signatures of mild, chronic temperature stress in an unbiased manner. We found that an increase from 12 to 18 °C caused widespread alterations in gene expression including in genes involved in protein folding, RNA processing and development. To understand the quantitative genetic architecture of this response, we then focused on a well‐characterized gene network involved in endomesoderm and ectoderm specification. Using a breeding design with wild‐caught individuals, we measured genetic and gene–environment interaction effects on 72 genes within this network. We found genetic or maternal effects in 33 of these genes and that the genetic effects were correlated in the network. Fourteen network genes also responded to higher temperatures, but we found no significant genotype–environment interactions in any of the genes. This absence may be owing to an effective buffering of the temperature perturbations within the network. In support of this hypothesis, perturbations to regulatory genes did not affect the expression of the genes that they regulate. Together, these results provide novel insights into the relationship between environmental change and developmental evolution and suggest that climate change may not expose large amounts of cryptic genetic variation to selection in this species.