某些植物病毒核糖核酸3′末端tRNA样结构

按照Peattie(1979)直接化学定序法测定了某些植物病毒RAs(KYMV,CYVV,APLV和EMV)3’末端区域的核苷酸顺序。基于核苷酸顺序资料参照TYMV-RNA模型(Rietveld等,1982)提出它们3’末端的可能二级结构,即tRNA-样结构。KYMV、CYVV、OYMV、APLV和EMV-RNA3’末端的tRNA-样结构完全一致。此种对缬氨酸具有特异性的tRNA-样结构与真核生物缬氨酸tRNA也极为相似。缬氨酸反密码子(CAC)位于tRNA-样结构的适当部位。这些植物病毒RNA的核苷酸由于硷基配对在氨基酸接受臂内能产生12个硷基对的共轴堆砌。3’末端区域具有……(CC)A_(OH)末端。本实验结果支持Rietveld等1982年提出的TYMV-RNA3’末端二级结构模型。最后简要地讨论了tRNA-样结构的可能作用。     

假结结构

某些植物病毒RNA的3’末端具有氨酰化作用的tRNA-样结构。氨基酸接受臂由三个短的双螺旋片段在空间呈准连续堆砌的双螺旋组成的假结结构。假结结构也见于RNA的其它部位,它可能是复杂RNA分子的一种结构成分。     

新型冠状病毒3C样蛋白酶结构和功能特征分析

采用生物信息学方法分析新型冠状病毒(Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2)3C样蛋白酶(3-chymotrypsin-like protease, 3CL^pro)的理化性质、结构与功能,为抗SARS-CoV-2药物研发提供参考。通过ProtParam、ProtScale、Bioedit服务器对3CL^pro进行一级结构如氨基酸理化性质、疏水性的预测分析;COILS Server、SignalP、TMPred、TargetP Server、NetPhos Server、NetNGlyc Server服务器对3CL^pro结构进行如卷曲螺旋区、信号肽、跨膜结构域、亚细胞定位、磷酸化位点、糖基化位点的预测分析;SOPMA、SWISS MODEL服务器对3CL^pro进行二级结构、三级结构的预测分析;IEBD对3CL^pro进行B细胞表位的预测分析。3CL^pro由306个氨基酸组成,其中亮氨酸占比最高,分子质量为33 796.64,理论等电点值为5.95,半衰期为1.9 h,脂肪系数为82.12;亲水性较高,不具有卷曲螺旋区与信号肽特点,含一个跨膜区;具有4个磷酸化位点,2个糖基化修饰点;二级结构中无规则卷曲占据主导地位,三级结构能与已知的6y2g.1（SMTL ID）模型同源建模;存在4个潜在的B细胞表位,位于92~101位的氨基酸区域应答频率最高。利用生物信息学技术分析3CL^pro的结构和功能特征,可为新型冠状肺炎药物的研发提供参考。     

居住区植物绿量与其气温调控效应的关系

选取了深圳市3个居住小区,在对各小区植被分布调查的基础上,各选取20m×20m样区25个,统计了每个样区内植物的绿化三维量作为绿地量化指标。在实地气象观测的基础上,对温度与样区绿化三维量值进行了非线性回归,结果表明20m×20m样区内绿化三维量与植物的降温能力之间具有很高的拟合精度(Adj. R²=0.88),据此提出深圳市居住小区20m×20m范围内绿化三维量的合理指标。同时,通过对样区内不同结构植物绿化三维量与温度的相关性分析,得出乔木的遮阳作用是植物降温效应的主要影响因子。因此,若要有效发挥植物降温效应,城市居住区绿化应以乔木为主,同时在特定范围内(如20m×20m)满足植物绿量的要求。     

利用荧光共振能量转移技术研究活细胞TLR4与MD-2作用结构域

脂多糖(LPS)的识别和信号转导是宿主发生防御反应的关键,Toll样受体4(TLR4)与髓样分化蛋白-2(MD-2)形成复合物在LPS的识别及其信号转导中发挥了重要作用．研究TLR4与MD-2结合的功能结构域,对于深入了解LPS信号转导机制及其内毒素休克的防治具有重要意义．运用基于强度的三通道荧光共振能量转移技术(FRET)及基因突变和转染技术,研究了活细胞TLR4与MD-2作用的结构域．结果表明：N端Glu²⁴～Met⁴¹缺失使TLR4与MD-2结合能力明显下降;LPS刺激后TLR4聚合迅速增加,而缺失Glu²⁴～Met⁴¹的TLR4不能聚合．上述结果提示,TLR4的Glu²⁴～Met⁴¹不仅是结合MD-2的区域,并且还参与了LPS刺激后TLR4的聚合作用．     

口服维生素D对实验性脑疟小鼠树突状细胞的影响

维生素D（VD）为固醇类衍生物,除发挥抗佝偻病作用,还具有一定的免疫调节功能。主要研究VD对实验性脑疟小鼠树突状细胞的影响。结果显示,与对照组相比,在伯氏疟原虫（P.bANKA）感染前给予VD,可降低C57BL/6小鼠发生脑型疟疾的风险,存活时间明显延长。VD预处理后,脾脏中髓样树突状细胞（CD11c⁺CD11b⁺）和浆样树突状细胞（CD11c⁺B220⁺）百分率明显降低,CD11c⁺MHCII⁺细胞、CD11c⁺TLR4⁺细胞和CD11c⁺TLR9⁺细胞的百分含量也显著减少。由此提示,预防性口服VD可抑制感染小鼠树突状细胞的数量和功能,对脑型疟疾的发生具有一定预防作用,为新型抗疟药物的研发提供参考。     

影响红曲霉葡萄糖淀粉酶活力的因子

本文报道了某些化学试剂对红曲霉葡萄糖淀粉酶两个分子型E3和E4活力的影响。在试验的十六种金属离子中,Fe²⁺、Co¹⁺、Ca²⁺、Mg²⁺ 稍有激活作用(+20％),重金属离子Hg²⁺、Pb²⁺、Cu²⁺ 和 Fe³⁺ 有不同程度的抑制作用(一20一40％),Ag+ 则是一个强烈的抑制剂(一80％)。     

拟草果总黄酮制备纯化及抗炎活性研究

该文在前期研究的基础上,以拟草果的甲醇粗提液为原料,研究了拟草果总黄酮成分的纯化方法以及考察拟草果总黄酮的抗炎活性。结果表明:采用静态吸附-洗脱试验筛选HP-20为纯化拟草果总黄酮的最佳大孔吸附树脂; 以吸附率、解吸率等参数为指标,考察上样液和洗脱液的质量浓度、体积、流速等因素对纯化工艺的影响,确定最佳工艺条件:上样液质量浓度为0.5 mg·mL^-1、上样体积流量为4 mL·min^-1、上样体积为15 BV、洗脱剂乙醇浓度为70%、洗脱流速为2 mL·min^-1、洗脱剂用量为10 BV,在此条件下纯化的总黄酮保留率为65.48%; 通过检测获得的拟草果总黄酮对脂多糖刺激的小胶质BV2细胞中白介素(IL)-6水平的影响发现,其可显著下调炎症因子IL-6的表达,具有一定的抗炎活性。     

蛋白质溶液NMR结构测定的一些新进展

新的标记技术的进展和采用稀释的液晶作为溶剂以提供额外的结构信息,提高了核磁共振技术测定蛋白质溶液三维结构的精度,扩大了分子质量测定范围.目前已经利用多维 ¹⁵N,¹³C,²H标记NMR测定了许多分子质量为30 ku左右的蛋白质溶液结构,这一上限可能还会被进一步提高.     

固相闪烁晶体用于液闪测量的评价

本文介绍两种固相闪烁晶体制样及测量方法并与乳化剂闪烁液相比较。 ³H, ¹⁴C, ¹²⁵I及 ³⁵S其计数效率(E％)分别达34.1％,89.9％,60.3％及77.4％。液相及两种固相闪烁体间的变异系数(CV％)范围为5.1％—10.3％,同系列样品对不同厂家型号的液闪谱仪,测量效率趋一致。其测量效率、精确度、平行度等近于或优于液相测量。对数波谱分析表明无需淬灭校正并可用于双标记测量。用固相闪烁体制样不需闪烁液,故无毒、无污染、污物体积小且使用方便,克服了液体闪烁测量的不足。因此是较理想的可推广的新型样品制备与测量技术。     

L7811鼠腹水肿瘤细胞 31P核磁共振的研究

用 ³¹P核磁共振技术(³¹P-NMR)研究了L₇₈₁₁鼠腹水肿瘤细胞和615系鼠胸腺细胞(正常对照细胞)。结果发现在肿瘤晚期阶段,L₇₈₁₁腹水肿瘤细胞的含磷化合物未进入完全不活跃状态。此外,腹水肿瘤细胞的磷脂组成与含量亦有明显改变。因此, ³¹P-NMR谱可做为观察肿瘤细胞内能量生成和某些磷脂合成宏观动态过程的一项参考指标。     

白内障与晶状体的离子转运

本文介绍了晶状体的结构与功能,并着重介绍了与白内障有密切关系的离子转运的研究概况。大多数学者认为,白内障晶状体的离子泵Na⁺,K⁺-ATPase和Ca²⁺-ATPase活力下降,也有人认为Na⁺,K⁺-ATPase的活力没有变化。     

黄河三角洲横向水文结构连结空间尺度变异性分析

水文连通是影响滨海湿地生态和水文过程的基础要素之一。引入无标度网络模型改进已有横向静态水文连通参数化方法,将其应用于较大尺度（100 hm²）量化黄河三角洲滨海湿地的水文连通,并结合已有研究结果分析3个尺度（1 m²,100 m²和100 hm²）水文连通的空间变异性。研究结果显示,潮间区和生态补水区的水文连通较强,3个尺度的空间变异性主要来自于水文连通指数较高的样点;盐沼区和河滨区相对较弱,空间变异性主要来自于水文连通指数较小的样点,且大尺度水文连通空间变异性相对中尺度和小尺度更高。小尺度和中尺度方法描述了一个样地与周边较小范围的空间区域土壤水分连通状况,在大的潮汐或补水条件下不同区域各个样地倾向于保持一致;而大尺度方法则侧重于描述区域内的水文过程,这是导致尺度差异的根本原因。     

甲基鸟嘌呤甲基转移酶表达调节在肿瘤发生和治疗中的作用

甲基鸟嘌呤甲基转移酶（O⁶-methylguanine-DNA methyltransferase,MGMT）是从细菌到哺乳类机体中存在的一种独特的DNA修复蛋白,其作用是在DNA损伤的修复过程,催化DNA分子鸟嘌呤O⁶位上的烷基从鸟嘌呤碱基转移至MGMT蛋白的半胱氨酸残基上,而使DNA分子鸟嘌呤复原.因此,机体中MGMT适当的表达有利于修复由烷化剂诱导而形成的O⁶烷基鸟嘌呤DNA加合物.MGMT蛋白的含量和活性不但在基因水平受到各种因素的调控,并且与某些药物的直接作用有关.调节MGMT在细胞内的活性,对于防御肿瘤的发生及某些肿瘤的治疗过程中克服肿瘤耐药性和克服骨髓毒性具有重要的意义.     

二价金属离子转运蛋白1——一个新发现的重要铁转运蛋白

二价金属离子转运蛋白1(divalent metal transporter 1,DMT1)的发现是近年铁代谢研究领域最重大的一项突破.DMT1是哺乳类跨膜铁转运蛋白.这种蛋白质广泛分布于人体各组织.DMT1 mRNA有两种形式,一种含有IRE(iron response element),而另一种则不含此结构.DMT1的功能主要是介导小肠上皮细胞的铁吸收以及参与铁从内吞小体移位到胞浆的过程.DMT1介导的铁转运是一个主动的和H⁺依赖的过程.DMT1也参与其他二价金属如Zn²⁺、Mn²⁺、Co²⁺、Cd²⁺、Cn²⁺、Ni²⁺和Pb²⁺的转运.小肠DMT1的表达受饮食或组织铁控制.第四跨膜区是DMT1的重要功能区.此区基因发生点突变（G185R）是导致不可逆性缺铁性贫血的原因.在帕金森氏病人的黑质发现DMT1表达异常增加,因而DMT1可能也与某些神经退行性疾病的形成有关.     

吉林蛟河42 hm2针阔混交林样地植物种-面积关系

 种-面积关系是生态学中的基本问题, 其构建方式对种-面积关系的影响以及最优种-面积模型的选择仍然存在争议。该文利用吉林蛟河42 hm²针阔混交林样地数据, 分别采用巢式样方法和随机样方法建立对数模型、幂函数模型和逻辑斯蒂克模型, 并通过赤池信息量准则(AIC)检验种-面积模型优度。结果表明, 种-面积关系受到取样方法的影响, 随机样方法的拟合效果优于巢式样方法。采用随机样方法构建的幂指数模型(AIC = 89.11)和逻辑斯蒂克模型(AIC = 71.21)优于对数模型(AIC = 113.81)。根据AIC值可知, 随机样方法构建的逻辑斯蒂克模型是拟合42 hm²针阔混交林样地种-面积关系的最优模型。该研究表明: 在分析种-面积关系时不仅应考虑尺度效应, 还需注意生境变化及群落演替的影响。     

牛肝TrnaIle的序列分析和二级结构

用随机降解法和Donis-Keller酶分析法,测定了牛肝tRNA^Ile序列.牛肝tRNA^Ile长77个碱基;G5·G69不配对为其显著特征.依据tRNA螺旋区和环区自由能大小及Holley模型,确定了tRNA^Ile的二级结构.     

Gc、Pi蛋白亚型的快速微量电泳分析

用快速微量等电聚焦技术对190名北京地区汉族健康人血清Gc蛋白亚型、Pi蛋白亚型进行分型鉴定和基因频率调查.上样量为1.5μl,电泳和染色各0.5h.Gc^1F=0.4891,Gc^1S=0.2432,Gc²=0.2678.观察值与期望值吻合良好.(∑X²=1.404,0.7<P<0.8).Pi^M₁=0.7542,Pi^M₂=0.1808,Pi^M₃=0.0650,观察值与期望值吻合也良好,(∑X²=1.1233,0.7<P<0.8).     

拟南芥中PAP特异磷酸酶(AtAHL)的折叠识别与结构预测

通过现有的序列同源性比较、二级结构预测、三维结构预测和模拟方法,得到了拟南芥中PAP特异磷酸酶的三维结构.这是一种与酵母中的Hal2p蛋白质类似,并且N端为α＋β,C端为α/β结构域的多结构域蛋白质.分析预测所得结构,发现了Mg²⁺等金属离子的结合位点,推测了对Na⁺敏感的结构基础.这些结合位点与其生化功能相关.而且,通过结构与功能分析,讨论了蛋白质数据库(PDB)中同一个酶已有理论结构的不合理性.     

p16INK4a基因的功能及其调控

p16^INK4a蛋白能抑制CDK4和CDK6的活性,使pRb处于非磷酸化或低磷酸化状态而能与转录因子E2Fs结合,从而抑制DNA 的合成,阻止细胞由G1期进入S期.p16^INK4a的表达受Ets1和Ets2的正调控,受Bmi-1的负调控.p16^INK4a基因缺失、突变、甲基化、RNA剪接加工错误可导致细胞周期失控和癌变.应用p16^INK4a对某些肿瘤进行基因治疗的研究正在进行中.