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相似文献
 共查询到18条相似文献,搜索用时 281 毫秒
1.
张悦  赵鑫  侯峥  王艳敏  王玉成  王超 《植物研究》2019,39(1):113-122
通过对刚毛柽柳转录组分析,克隆获得了一条与S-腺苷甲硫氨酸合成酶(SAMS)基因同源性高的基因,命名为ThSAMS。序列分析结果表明:ThSASM基因全长cDNA为1185bp,编码394个氨基酸,编码蛋白相对分子质量为97.85kDa,理论等电点为5.02。通过生物信息学分析表明,ThSASM基因编码的氨基酸与其他物种SAMS基因编码的氨基酸具有很高的同源性,其中与枣的同源性最高,达95%。实时荧光定量PCR(quantitativereal-timePCR,qRT-PCR)分析表明,ThSASM表达受NaCl、聚乙二醇(PEG)和ABA处理做出应答,暗示ThSASM可能参与了刚毛柽柳对盐和干旱的胁迫应答,为进一步研究SAMS基因在植物胁迫应答中的功能及作用机制提供了参考依据。  相似文献   

2.
红树植物杯萼海桑是最耐盐的红树植物之一。S-腺苷甲硫氨酸合成酶(S-adenosylmethionine synthetase,SAMS)是S-腺苷甲硫氨酸(S-adenosylmethionine,SAM)生物合成途径的关键酶。SAMS作为一个逆境胁迫响应蛋白在植物的耐盐调控中发挥着极其重要的作用。本文结合杯萼海桑根的转录组注释,根据编码区序列设计引物,通过PCR克隆杯萼海桑SAMS基因的编码区cDNA,并对其进行生物信息分析,为研究杯萼海桑适应逆境的机制奠定理论基础。结果显示PCR扩增了一个长1 182 bp的基因片段,该片段编码由393个氨基酸组成的S-腺苷甲硫氨酸合成酶。同源性比对及进化树分析显示杯萼海桑的SAMS氨基酸序列进化上相对保守。本研究首次从红树林植物杯萼海桑中克隆S-腺苷甲硫氨酸合成酶基因,并获得其编码区序列,为进一步研究杯萼海桑应对逆境胁迫的分子生物学机制与胁迫相关基因调控网络奠定基础。  相似文献   

3.
以小麦品种‘晋麦47’为材料,利用半定量RT-PCR方法,对S-腺苷甲硫氨酸代谢途径中的S-腺苷甲硫氨酸合成酶(SAMS)基因、S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶(SAMDC)基因和γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶(-γECS)基因在正常供水、PEG-6000模拟水分胁迫和复水过程中小麦叶片的表达模式进行了分析。结果表明,3个基因在正常生长情况下有一定量的表达,SAMS和SAMDC基因在水分胁迫早期(PEG-6000胁迫6、12、244、8 h)上调表达,水分胁迫后期(PEG-6000胁迫75 h)表达量下降;复水后3~6 h上调表达,复水9 h后表达量下调至对照水平。-γECS基因在水分胁迫阶段呈上调表达,复水后表达量下调至对照水平。可见,小麦SAMS、SAMDC和-γECS基因的表达都受水分胁迫诱导,同时,SAMS与SAMDC基因还参与水分胁迫后的复水调节,说明S-腺苷甲硫氨酸代谢途径在小麦抗旱节水中具有重要作用。  相似文献   

4.
干旱、高盐和低温是限制植物生长和农作物产量的主要逆境因子。S-腺苷甲硫氨酸合成酶(S-adenosylmethionine synthetase,SAMS)与植物抗逆境密切相关,而且超表达SAMS的转基因植物具有更高的抗干旱、高盐和低温能力。进行条斑紫菜(Porphyra yezoensis)S-腺苷甲硫氨酸合成酶基因(PySAMS)cDNA的克隆及序列特征分析。首先利用电子克隆技术得到基因相关的contig,预测全长并设计引物,最后利用RT-PCR技术成功克隆了PySAMS的cDNA序列(GenBank accession:FJ404748)。该cDNA序列含有长1155nt的完整ORF,编码蛋白(PySAMS)分子量41.8kDa,长384AA。PySAMS与盘基网柄菌(Dictyostelium discoideum)、莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)和水稻(Oryza sativa)等多种生物的SAMS具有较高的序列一致性,含有与SAMS酶活性密切相关的氨基酸残基和保守序列,与人(Homo sapiens)和大肠杆菌(Escherichia coli)的SAMS具有高度相似的三维结构。所以PySAMS与其它生物的SAMS一样,在条斑紫菜的抗逆过程中发挥重要作用。研究PySAMS有助于阐明条斑紫菜耐受非生物胁迫的作用机理,有助于获得高抗逆转基因植物。  相似文献   

5.
从二色补血草cDNA文库中分离出1个硫氧还蛋白基因全长cDNA序列。基因全长1138bp,其中,5’非翻译(UTR)区128bp,3'非翻译区212bp,开放阅读框(ORF)全长798bp,编码265个氨基酸,编码蛋白的分子量为28.58kDa,理论等电点(pI)为9.68。BlastP分析表明二色补血草Trx与拟南芥Trx序列同源性为52%,与葡萄7h序列同源性为76%,从11个物种的氨基酸多序列比对可以看出Trx氨基酸序列保守性较高。实时定量RT-PCR方法检测低温、NaCl和PEG胁迫不同时间后的基因在二色补血草中表达模式的结果表明,NaCl能诱导Trx基因在二色补血草叶中表达,胁迫24h后达到高峰,而聚乙二醇和低温处理则抑制Trx在二色补血草根和叶的表达。  相似文献   

6.
小麦胁迫相关基因W1的克隆及表达模式分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
应用噬菌体原位杂交技术从干旱胁迫诱导的小麦cDNA文库中克隆到一个胁迫诱导的基因片段别。删全长cDNA为901bp,其中,编码区长498bp,编码166个氨基酸。Southern杂交表明,W1是一个低拷贝基因。RT—PCR结果表明,W1受干旱、低温的诱导,但不受高盐的诱导。氨基酸序列分析发现W1有一个USP保守区(pfam00582)。同源性分析发现W1与一个水稻胁迫诱导蛋白(NM_001061239)的同源性为83%,但该类蛋白的功能尚无报道。肼是小麦第1个被克隆的胁迫相关蛋白基因,该基因的克隆有助于阐明小麦的抗逆机制,并为今后培育抗逆性小麦品种提供候选基因。  相似文献   

7.
甘蓝型油菜SAMDC3基因及其启动子的克隆与分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶(SAMDC)是植物体内亚精胺和精胺前体物质形成的关键酶。本研究克隆了甘蓝型油菜(Brassica napus)BnSAMDC3基因家族2个成员的全长cDNA和启动子序列,并对其诱导表达特性进行了鉴定。BnSAMDC3-1(GenBank accession No.HM013966)和BnSAMDC3-2(GenBank ac-cession No.HM013967)的全长cDNA分别为1746bp和1754bp,开放阅读框(ORF)长度分别为1101bp和1104bp,在大ORF上游132bp处均包含一个171bp的小ORF。BnSAMDC3基因在叶片中表达量较高,受高温和干旱抑制。6-BA、GA3和SA抑制BnSAMDC3-1的表达,而GA3和甘露醇诱导BnSAMDC3-2表达上调。BnSAMDC3基因启动子具有多个与胁迫和激素诱导相关的顺势调控元件,表明BnSAMDC3可能通过ABA、6-BA和SA信号途径介导植物对非生物胁迫的响应。本研究将有助于进一步探讨甘蓝型油菜抗逆的分子机理,为甘蓝型油菜的栽培和品质改良奠定基础。  相似文献   

8.
硫腺苷甲硫氨酸作为甲基供体在转甲基反应中起到重要作用。为了解硫腺苷甲硫氨酸在盐地碱蓬(Suaeda salsa (L.) Pall)耐盐中的作用,我们对可能编码硫腺苷甲硫氨酸合成酶的基因(SsSAMS2)进行了分析.该基因在经400mmol/L NaCl处理的盐地碱蓬地上部分的λ-Zap cDNA文库中克隆到,其播入片段全长1531bp,包含一个395个氨基酸的开放阅读框架,该基因推断的分子量约为43kD.SsSAMS2与长春花(Catharanthus roseus)的SAMS2在氨基酸水平上的一致性为93%.Southern杂交显示,SsSAMS2在盐地碱蓬基因组中可能是两个拷贝.Northern分析显示硫腺苷甲硫氨酸合成酶基因受NaCl等胁迫的正调控.酶活性检测表明,NaCl胁迫条件下该酶活性增强.  相似文献   

9.
油菜BnMKK4全长基因的克隆及表达分析   总被引:2,自引:0,他引:2  
从‘陇油6号’油菜中克隆得到了一个新的BnMKK4基因的cDNA,全长1317bp,其中包括993bp的开放阅读框,159bp的5’非翻译区(5^1UTR),165bp的3。非翻译区(3’UTR)。与拟南芥AtMKK4有很高的同源性,因此命名为BnMKK4(GenBank登录号JF268686)。该基因编码330个氨基酸的蛋白质,分子量36.5kDa,等电点为9.01。实时荧光定量PCR结果显示该基因表达受低温胁迫和盐胁迫的诱导,表明该基因在油菜适应低温胁迫和盐胁迫的过程中发挥作用。  相似文献   

10.
硫腺苷甲硫氨酸作为甲基供体在转甲基反应中起到重要作用.为了解硫腺苷甲硫氨酸在盐地碱蓬(Suaedasalsa (L.)Pall)耐盐中的作用,我们对可能编码硫腺苷甲硫氨酸合成酶的基因(SsSAMS2)进行了分析.该基因在经400 mmol/L NaCl处理的盐地碱蓬地上部分的λ-Zap cDNA文库中克隆到,其插入片段全长1 531 bp,包含一个395个氨基酸的开放阅读框架,该基因推断的分子量约为43 kD.SsSAMS2与长春花(Catharanthus roseus)的SAMS2在氨基酸水平上的一致性为93%.Southern杂交显示,SsSAMS2在盐地碱蓬基因组中可能是两个拷贝.Northern分析显示硫腺苷甲硫氨酸合成酶基因受NaCl等胁迫的正调控.酶活性检测表明,NaCl胁迫条件下该酶活性增强.  相似文献   

11.
12.
The human heat-shock protein multigene family comprises several highly conserved proteins with structural and functional properties in common, but which vary in the extent of their inducibility in response to metabolic stress. We have isolated and characterized a novel human HSP70 cDNA, HSP70B' cDNA, and its corresponding gene sequence. HSP70B' cDNA hybrid-selected an mRNA encoding a more basic 70 kDa heat-shock protein that both the major stress-inducible HSP70 and constitutively expressed HSC70 heat-shock proteins, which in common with other heat-shock 70 kDa proteins bound ATP. The complete HSP70B' gene was sequenced and, like the major inducible HSP70 gene, is devoid of introns. The HSP70B' gene has 77% sequence similarity to the HSP70 gene and 70% similarity to HSC70 cDNA, with greatest sequence divergence towards the 3'-terminus. The HSP70B' gene represents a functional gene, as indicated by Northern-blot analysis with specific oligonucleotides, hybrid-selected translation with a specific 3' cDNA sequence and S1 nuclease protection experiments. In contrast with HSP70 mRNA, which is present at low concentrations in HeLa cells and readily induced by heat or CdCl2 treatment in both fibroblasts and HeLa cells, HSP70B' mRNA was induced only at higher temperature and showed no basal expression. The differences in patterns of induction may be due to the special features of the promoter region of the HSP70B' gene.  相似文献   

13.
糜子抗旱节水相关基因PmMYB的克隆及表达分析   总被引:7,自引:0,他引:7       下载免费PDF全文
胡银岗  林凡云  王士强  何蓓如 《遗传》2008,30(3):373-379
根据在糜子抗旱节水分子基础研究中获得的一个糜子MYB基因的EST序列, 以其序列及水稻MYB18基因的序列为基础设计引物, 扩增得到1 739 bp的全长基因组序列。序列分析表明, 其包含121 bp(347~467 bp)和93 bp(599~691 bp)的两个内含子, 3个外显子; 全长cDNA序列为1 525 bp, 其中3′非翻译区为212 bp, 5′非翻译区为41 bp, 编码区为1 272 bp, 共编码424个氨基酸, C-端存在一个丝氨酸(Ser, S)丰富区。该基因具有两个典型的MYB类转录因子基因的DNA结合区(DNA-binding domain), 分别为13~63、66~114位氨基酸, 属于典型的R2R3-MYB转录因子。对其与水稻、玉米、火炬松、拟南芥、辣椒、陆地棉、大麦及茄子等9种植物的MYB基因的R2、R3重复区的氨基酸序列多重比较, 表明R2R3重复序列在植物中具有较高的保守性; 基于氨基酸序列的编码区系统进化树分析表明, 不同植物的MYB基因遗传分化很大, 序列相似性为32%~84%, 其中糜子MYB基因与水稻的MYB18相似程度最高(84%), 与大麦和玉米的相似性分别为46%和41%。通过半定量RT-PCR对其表达模式分析表明, 该基因在水分胁迫和干旱后复水条件下上调表达, 与糜子抗旱节水紧密相关。该基因的克隆为进一步探讨利用该基因改良其他植物的抗旱节水性奠定了良好的基础。  相似文献   

14.
野生大豆P5CS基因的克隆及对盐胁迫反应   总被引:2,自引:0,他引:2  
逆境下植物大量积累脯氨酸是减轻胁迫伤害的一种自我保护机制。本研究应用同源克隆方法从NaCl处理的野生大豆中克隆获得一个脯氨酸合成酶(P5CS)基因,命名为GsP5CS。该基因核苷酸序列全长2.232 kb,含一个2148bp开放阅读框,编码715个氨基酸,包含有高等植物P5CS蛋白质的5个主要功能域,与菜豆PvP5CS1基因核苷酸序列相似性高达98.79%。Real Time PCR分析显示该基因受轻度盐胁迫诱导上调表达,根中表达高峰出现在200 mmol/L NaCl处理下,相对表达量为对照的5.83倍;叶片中表达高峰出现在300 mmol/L NaCl处理条件下,相对表达量为对照的12.78倍。并且该基因在根和叶片中的表达模式和脯氨酸含量的变化模式相同。上述结果说明,GsP5CS可能参与野生大豆脯氨酸合成。  相似文献   

15.
This study was focused on obtaining the complete gene sequence of the toxR gene in V. harveyi by using toxR-targeted PCR to amplify 5' and 3' regions flanking the 576-bp Vibrio harveyi (NBRC 15634) toxR gene fragment previously amplified using degenerate PCR. To obtain the 5' flanking sequences, a forward PCR primer (VhtoxRpv) was designed based on known sequences upstream of toxR in V. parahaemolyticus and V. vulnificus. The reverse primer (VctoxR2R) was based on the sequence of the 576-bp Vibrio harveyi toxR fragment. The resulting 750-bp amplicon was sequenced, providing the 5' sequences of the V. harveyi (NBRC 15634) toxR gene. The 3' flanking region was amplified using a primer pair toxRS1 and toxRS2 based on V. parahaemolyticus and V. vulnificus toxR and toxS, resulting in a 900-bp amplicon that contained the remaining 3' sequences of the V. harveyi NBRC 15634 toxR. This paper reports, for the first time, a complete 882-bp nucleotide sequence for toxR in Vibrio harveyi. Sequence analysis and alignment revealed that the complete toxR gene in V. harveyi shares 87% sequence similarity with toxR of V. parahaemolyticus, 84% similarity with V. fluvialis, 83% with V. vulnificus and partial sequence of V. campbellii. The phylogenetic trees revealed wider divergence in toxR compared to 16S rRNA genes, so that V. harveyi could easily be distinguished from V. campbellii and V. parahaemolyticus.  相似文献   

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We have determined the nucleotide sequence of 4508 base pairs of human genomic DNA which contain the human serine esterase gene from cytotoxic T lymphocytes (SECT) (equivalent to the 1-3E cDNA clone) and include 879 bp of 5' flanking DNA and 393 bp of 3' flanking DNA. The gene consists of five exons of 88, 148, 136, 261, and 257 nucleotides separated by four introns of 1043, 455, 205, and 643 nucleotides. The location of introns with respect to protein coding sequences in the SECT gene is identical to that of the human cathepsin G and murine granzyme B genes. Comparison of SECT gene exonic sequences to murine granzyme B-F cDNA sequences indicates similarities of 75 and 72% for granzymes B and C and 61, 59, and 61% for granzymes D, E, and F, respectively. The 5' flanking sequence of the SECT gene showed similarity only to the 5' flanking sequence of the murine granzyme B gene, indicating that these genes are homologous. Comparison of the SECT gene sequence to the human cathepsin G sequence indicated no similarity in the 5' flanking DNA although the exonic sequences show 64% sequence similarity overall and 45% sequence similarity in the respective 3' untranslated regions. These similarities suggest that the SECT and cathepsin G genes are members of the same family of serine protease genes. Evidence from high and low stringency Southern transfer analysis of human genomic DNA indicates the presence of another gene of at least 85% sequence similarity to the SECT gene.  相似文献   

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