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相似文献
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1.
苍术(Atractylodeslancea(Thunb.)DC.)种内遗传多样性分析   总被引:6,自引:0,他引:6  
分析了苍术5种等位酶12个倍点25个等位基因的分化特征。结果表明:群体内多态位点比例平均为0.61,每们位点的平均杂合率为0.26,每个位点发现的平均等位基因数为1.78。  相似文献   

2.
马尾松天然群体同工酶遗传变异   总被引:15,自引:0,他引:15  
黄启强  王莲辉 《遗传学报》1995,22(2):142-151
6个马尾松天然群体同工酶分析结果表明:马尾松群体具有较丰富的遗传变异,其多态位点百分率(P)=76.2%;等位基因平均数(Na)=2.39;有效等位基因平均数(Ne)=1.62,平均杂合率(He)=0.273。但群体间遗传分化极小,基因分化系数(G_(ST))=0.0172,遗传距离(D)=0.011±0.005。总遗传变异中,约2%来自群体间,而约98%的遗传变异存在于群体内的个体,并且其变异又主要来源于1/3的基因位点。马尾松群体近似于随机交配群体,绝大多数位点处于平衡状况,但也有约1/3的位点并非随机交配,存在不同程度的近交。  相似文献   

3.
毛乌素沙地根茎灌木羊柴的遗传多样性和克隆结构   总被引:17,自引:0,他引:17  
采用淀粉凝胶电泳技术对毛乌素沙地根茎灌木羊柴(HedysarumlaeveMaxim.)8个群体的遗传多样性和克隆结构进行了初步研究。利用10个酶系统15个等位酶位点的检测表明,羊柴群体具有较高的遗传变异水平,多态位点百分率P=37.0,等位基因平均数A=1.48,平均期望杂合度He=0.101;但8个群体间的分化很小(Fst=0.067);固定沙丘群体和半固定沙丘群体在等位酶水平上的变异性无显著差异。通过7个多态位点的研究表明,羊柴群体中的克隆多样性很高(D=0.9156),但不同克隆在规模上相差很大。同时,群体间的克隆分化较大,广布基因型仅占3.2%。克隆空间结构的分析表明,羊柴的基株分布为游击型构型,克隆之间的镶嵌明显。  相似文献   

4.
采用等位酶电泳 技术测定了四川省凉山彝族自治州南部金阳、雷波和米易3县的苦荞麦「Fagopyrum tataricum(L.)Gaertn.」8个栽培居群的遗传多样性和分化,结合农业生物学性状进行了分析。苦荞麦居群的遗传多样性水平较高,每个位点的等位基因平均数为1.8,多态位点比率为46.6%,平均实际杂合度和预期杂合度分别为0.187和0.218,FST值为0.22,居群间存在较明显的遗传分化,  相似文献   

5.
虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)5个群体的遗传多样性   总被引:21,自引:0,他引:21  
虾夷扇贝为20世纪80年代初从日本引入我国并逐渐开展养殖的双壳贝类,目前已在我国北方地区大面积养殖。实验采用微卫星分子遗传标记技术对大连獐子岛底播增殖放流群体(CC)、黄海北部海区采集的野生群体(HQ)、日本青森养殖群体(JX)、俄罗斯远东日本海沿岸养殖群体(RX)及大连大长山岛养殖上壳白化群体(ZB)等5个虾夷扇贝群体的遗传多样性进行研究。其中HQ群体为本课题组2005年在黄海北部采集的野生群体,本研究筛选出一个该群体的特异性遗传标记。用8个微卫星位点进行扩增,共获得45个等位基因,每个位点的等位基因数处于3—9之间,大小为100—340bp,平均有效等位基因数为3.1535,基因型数为3—21个,PIC(PolymorphismInformationContent)值处于0.0322-0.5944之间。5个群体的平均观测杂合度分别为0.3292、0.3048、0.3167、0.2708、0.3042,平均期望杂合度分别为0.4595、0.4002、0.3838、0.3620、0.3885,群体间的多态性差异不显著。根据群体间遗传相似性系数、遗传距离及UPGMA聚类分析发现,CC和HQ群体亲缘关系最近,JX和RX群体的亲缘关系较近,ZB群体与JX和RX群体的亲缘关系较近。通过Hardy—Weinberg平衡及F-检验发现,5个群体都不同程度的偏离平衡,表明各群体基因频率和基因型频率的稳定性较低,且5个群体均处于不同程度的杂合子缺失状态,群体间的遗传分化程度较高,但遗传变异主要来自群体内的个体间。  相似文献   

6.
巴马小型猪群体遗传结构的随机扩增多态DNA分析   总被引:6,自引:4,他引:2  
目的分析巴马小型猪的群体遗传结构。方法应用经过筛选的 31条引物对巴马小型猪个体基因组DNA进行RAPD扩增,利用从internet网上下载的软件RAPD istance Package ver-sion1.04软件对实验结果进行分析,计算不同个体间的相似系数。结果经RAPD反应,共扩增出275条带,其中多态性带85条,多态性带频率在0~66.7%之间,平均为27.7%。不同个体猪拥有的RAPD条带具有差异,但拥有相同条带个体猪比率较高。该群体猪的相似系数(F)为0.928(0.78~0.97),平均等位基因频率(q)为0.732,最低平均杂合率(H)为0.286。结论巴马小型猪个体具有较好的遗传一致性和遗传稳定性。  相似文献   

7.
苍术DNA分离及RAPD遗传多样性分析   总被引:10,自引:1,他引:9  
用新鲜的或-75℃保存的苍术〔Atractylodeslancea(Thunb.)DC.〕叶片提取DNA,产量分别为40ng/mg鲜重和10ng/mg鲜重左右,分离出的DNA的OD260/OD280值均大于19,可用于RAPD试验。用8种引物对苍术4个居群的DNA进行扩增,单个10碱基的引物扩增出的RAPD标记在1~15之间,多态位点百分率南苍术为4750%,北苍术为4540%,遗传相似度值南苍术为085,北苍术为087。结果表明,南苍术的遗传多样性略高于北苍术。  相似文献   

8.
李俊清 《生态学报》1996,16(2):128-134
本文利用凝胶电泳法研究亮叶水青冈(Faguslucida)种内遗传多样性。所测定的酶系统包括:过氧化物酶(PX1和PX2)、磷酸葡萄糖脱氢酶(PGD)、谷氨酸草酰乙酸转氨酶(GOT1和GOT2)、异柠檬酸脱氢酶(IDH)、甲基荼醌还原酶(MNR)、葡萄糖磷酸变位酶(PGM1和PGM2),苹果酸脱氨酶(MDH2)、酸性磷酸酶(ACP)和磷酸果糖升构酶(PGI)9种酶系统11个基因位点。测定和分析了亮叶水青冈2地理种群的等位基因频率,固定指致,基因多祥性和遗传距离,为进一步研究水青冈的遗传变异和种内种间关系提供了科学依据。  相似文献   

9.
板栗群体的遗传多样性及人工选择的影响   总被引:26,自引:0,他引:26  
利用水平板淀粉凝胶电泳技术对板栗9个群体11个种同工酶系统的12个酶位点进行分析,结果表明板栗(Castaneamolisina)为多态性物种,遗传变异水平较高,其多态位百分率为71.3%,每个位点的等位基因平均数为2.27,平均期望杂合值为0.346;总的基因多样性中,89.3%发生于群体内,各群体之间的遗传距离为0.010~0.177;对各等位基因频率进行PCA分析,筛选出较合适的基因标记位点及构建了板栗遗传结构的空间变异模式。在综合前人研究的基础上,初步探讨了人工选择对板栗遗传多样性的影响,初步推测出西南为板栗遗传多样性中心  相似文献   

10.
龙脑香科植物望天树的居群遗传结构及分化   总被引:12,自引:0,他引:12  
李巧明  许再富 《云南植物研究》2001,23(3):313-320,T001
运用“水平切片淀粉凝胶是泳等分析”方法,对国家一级珍稀濒危保护植物望天树(Parashorea chinensis)进行了遗传多样性和居群分化的研究,通过对分布于滇南,滇东南和桂西南的9个天然居群(中国科学院西双版纳热带植物园引种载培的2个人工居群作为对照),11个酶系统16个等位酶位点的研究表明,望天树群体内遗传变异水平极低,多态位点比率P为6.25%-12.50%(平均为6.82%),等位基因平均数A为1.06-1.13(平均为1.07),平均期望杂合度He为0.032-0.054(平均为0.035),平均观测杂合度Ho为0.063,所有居群Pgm-1位点的基因型均为杂合体,其余位点的基因型均为纯合体,居群间存在低水平的遗传分化,GST值为0.030,结果表明不同于其它热带植物的报道,望天树群体的遗传结构单一,一方面反映了群体内存在大量的内繁育(无融合生殖,近交),另一方面也说明了在进化过程中该种曾经历了严重的瓶颈效应,遗传变异大量丧失。  相似文献   

11.
天然红松林等位酶研究   总被引:8,自引:2,他引:6  
利用红松种子的单倍体胚乳,采用水平切片淀粉凝胶电泳技术,对采自三个地区的天然红松林的材料进行了10种酶系统的等位酶实验,共获得了18个等位基因位点,对这18个位点等位基因的统计分析表明:红松种群的多态位点百分数为P=77.78%,等位基因平均数为A=2.0,预期杂合度为He=0.1648。红松种群间遗传分化程度在松属于较低水平。在红松18个等位基因位点的变异中,绝大部分变异94.2%来自种群内部,  相似文献   

12.
应用RAPD分子标记对濒危灌木长叶红砂(Reaumuria trigyna)种群遗传多样性进行了分析.应用18条随机引物对长叶红砂5个种群的95个个体进行扩增,检测到118个位点,其中多态位点105个.结果表明:长叶红砂种群的多态位点比率(P)为88.98%,显示出长叶红砂种群存在较高的遗传多样性.Shannon多样性指数(0.4966)、Nei基因多样性指数(0.3303)和基因分化系数(Gst=0.1425)的分析结果显示,长叶红砂种群遗传变异大多存在于种群内,种群间的遗传分化占14.25%.聚类分析表明,长叶红砂种群遗传距离与地理距离之间无直接相关关系.遗传多样性水平与物种特性和所处不同群落有关,濒危植物并不一定表现为遗传变异水平的降低.  相似文献   

13.
异色瓢虫不同地理种群的ISSR种群多样性分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
异色瓢虫Harmonia axyridis(Pallas)在亚洲地区是一种重要的捕食性天敌昆虫,但是当引入到欧美后,对当地的物种产生了威胁.本文用ISSR技术对两个中国本地种群和一个引入美国的种群进行了种群多样性以及种群分化的分析.8条ISSR引物共扩增出105条带,其中多态性条带比率为96.19%.Nei's多样性指数、Shannon信息指数、多态性条带比率,在中国种群与美国种群中均非常接近,种群分化不明显(G_(st)=0.042).AMOVA分析显示种群多样性主要来源于种群内部,种群问的基因流非常强(N_m=5.537).基于Nei's多样性构建的聚类结果显示ISSR是一种快速有效的研究异色瓢虫种群多样性关系的技术.  相似文献   

14.
中国落叶松-杨栅锈菌遗传多样性研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
采用SSR分子标记技术对采自全国19个地区、不同年份的落叶松-杨栅锈菌Melampsora larici-populina(简称MLP)36个单孢子堆菌系的遗传多样性和种群遗传结构进行了研究。用5对SSR多态性引物共检测到62个观察等位基因(Na),有效等位基因数(Ne)为5.42–9.82,平均有效等位基因数为7.05。供试MLP样本在5个SSR位点上的多态性信息量(PIC)变化范围为0.64–0.89,平均值0.79。平均观察杂合度(Ho)、平均期望杂合度(He)分别为0.36和0.86,不同位点的S  相似文献   

15.
Korshikov II  Pirko NN  Pirko YV 《Genetika》2005,41(3):356-365
Using electrophoretic analysis of 11 enzyme systems, we studied the genetic structure and differentiation of eight natural populations of silver fir Abies alba Mill. in the Ukrainian Carpathians. Of 24 isozyme loci identified, 66.8% proved to be polymorphic. The mean numbers of alleles and genotypes per locus in the populations were respectively 3.1 and 4.5. Each A. alba tree was on average heterozygous at 15.9% of genes. In six populations, the genotypic distribution for all of the loci examined corresponded to Hardy-Weinberg proportions. The populations studied had low levels of subdivision (F(ST) = 0.018; GST = 0.019) and differentiation. Nei's genetic distances between the A. alba populations in the region ranged from 0.002 to 0.009, being on average 0.006.  相似文献   

16.
Wang JL  Zhao NX  Gao YB  Lin F  Ren AZ  Ruan WB  Chen L 《Genetika》2006,42(5):587-594
Random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis was used to characterize the genetic diversity and population genetic structure of Stipa krylovii populations in Inner Mongolia steppe of North China. Thirteen 10 bp oligonucleotide primers, which generated 237 RAPD bands, were used to analyze 90 plants of five populations from three regions, meadow steppe, typical steppe and desert steppe, from the east to the west. The genetic diversity of Stipa krylovii that was revealed by observed number of alleles (na), expected number of alleles (ne), Nei's diversity index (h), Shannon's diversity index (H), amplificated loci, polymorphic loci and the percentage of polymorphic loci (PPB) increased from the east to the west. The Pearson's correlation analysis between genetic diversity parameters and ecological parameters indicated that the genetic diversity of Stipa krylovii was associated with precipitation and cumulative temperature variations along the longitude (humidity were calculated by precipitation and cumulative temperature). Dendrogram based on Jaccard's genetic distance showed that the individuals from the same population formed a single sub-group. Although most variation (56.85%) was within populations, there was high genetic differentiation among populations of Stipa krylovii, high differentiation within and between regions by AMOVA analysis. Either Nei's unbiased genetic distance (G(ST)) or gene flow (Nm) among pairwise populations was not correlated with geographical distance by Mantel's test (P > 0.05), suggesting that there was no consistency with the isolation by distance model in these populations. Natural selection may have played a role in affecting the genetic diversity and population structure, but habitat destruction and degradation in northern grassland in China may be the main factor responsible for high genetic differentiation among populations, within and among regions.  相似文献   

17.
Forest musk deer (Moschus berezovskii) are rare as a result of poaching for musk and habitat loss. Some captive populations of forest musk deer have been established for decades in China. However, little genetic information is available for conservation management. In this paper, genetic variations, population structures, and the genetic bottleneck hypothesis were examined using 11 microsatellite loci from captive populations in Miyalo, Jinfeng and Maerkang in Sichuan Province, China. Estimates of genetic variability revealed substantial genetic variation in the three populations. A total of 142 different alleles were observed in 121 forest musk deer and the effective number of alleles per locus varied from 6.76 to 12.95. The average values of observed heterozygosity, expected heterozygosity, and Nei's expected heterozygosity were 0.552, 0.899 and 0.894 respectively. The overall significant (P < 0.001) deficit of heterozygotes because of inbreeding within breeds amounted to 34.5%. The mean FST (P < 0.001) showed that approximately 90.2% of the genetic variation was within populations and 9.8% was across populations. The UPGMA diagram, based on Nei's unbiased genetic distance, indicated that the three populations were differentiated into two different groups and it agreed with their origin and history. Bottleneck tests indicated that all three populations have undergone a population bottleneck, suggesting a small effective population size. Acknowledging that the genetic structure of populations has crucial conservation implications, the present genetic information should be taken into account in management plans for the conservation of captive forest musk deer.  相似文献   

18.
用ISSR分子标记对内蒙古地区刺叶柄棘豆(Oxytorpis aciphylla Ledeb.) 5个地理种群进行了种群遗传多样性分析。结果表明:刺叶柄棘豆种群具有较高的遗传多样性,11个ISSR引物扩增出215条带,总的多态位点百分率为98.14%,Shannon多样性指数I=0.2108,Nei基因多样性指数 H=0.341 6,种内总基因多样性(Ht) 为0.2108,种群内基因多样性(Hs)为0.160 4, 大部分遗传变异(76.11%)的遗传变异存在于种群内, 23.89%的遗传变异存在于种群间。遗传分化系数(Gst)为0.238 9,基因流(Nm)为1.592 9。5个居群间已有遗传分化趋势,遗传漂变不会引起遗传分化。UPGMA遗传距离聚类结果表明, 5个地理种群中,植被类型为荒漠草原的4个种群之间遗传距离较近,与1个荒漠种群距离较远。  相似文献   

19.
云南金钱槭形态变异与遗传变异的相关性研究   总被引:14,自引:1,他引:13  
对我国特有珍稀濒危保护植物云南金钱槭的形态变异水平、遗传变异模式以及两者之间的相关性进行了研究。形态学性状分析结果表明 :各居群形态性状变异系数的平均值从大到小排列为 :文山居群 (WSh)、屏边居群 (PB)、黑龙潭居群 (HL T)、蒙自居群 (MZ) ;文山居群与屏边、黑龙潭、蒙自居群间已产生显著或极显著水平的形态差异 ,而后三者间的差异未达显著水平。RAPD分析检测到 10 3个位点 ,其中多态位点 84个 ,云南金钱槭物种水平的多态位点比率为 81.5 5 % ,与其它珍稀濒危植物相比该种的遗传多样性水平不低。 AMOVA和 N ei基因多样性指数分析显示 ,尽管大部分遗传变异仍存在于居群内 (分别为5 7.86 %、5 7.33% ) ,但居群间的遗传变异已达较高水平 (分别为 4 2 .14 %、4 2 .6 7% )。相关分析结果显示 ,云南金钱槭的形态变异与海拔、土壤有机质等生态因子有着显著或极显著水平的相关性 ,但与遗传变异的相关性未达显著水平 ,说明云南金钱槭的形态变异虽然具有一定的遗传基础 ,但可塑性及环境压力对形态变异的产生作用更大一些。基于形态性状和 RAPD数据的聚类分析则进一步说明 ,云南金钱槭的形态变异受到环境因子的强烈影响而与遗传背景的关系不显著  相似文献   

20.
大别山山核桃种群遗传多样性研究   总被引:5,自引:1,他引:4       下载免费PDF全文
为了更有效地保护和合理开发大别山山核桃(Carya dabieshanensis)资源,该文利用RAPD分子标记技术,对3个天然大别山山核桃种群的90个单株的遗传多样性、种群内和种群间的遗传变异进行了研究,结果表明:20对10 bp随机引物共检测到238条谱带,其中多态带为162条,占68.1%。遗传多样性分析结果显示: Shannon多样性指数为0.476 1,58.18%的变异分布于群体内,而种群间变异占了41.82%;Nei指数群体总基因多样度为0.314 5,群体内平均基因多样度(HS)为0.186 5,群体间的基因多样度(HST)为0.128 0,群体Nei基因分化系数(GST)为0.406 7,说明40.67%的变异存在于种群间,群体内的变异占了总变异的59.33%,与Shannon多样性指数相比基本一致,均表明种群内有较丰富的遗传变异,这为优良品种选育提供广阔前景;种群间的基因流(Nm)为0.730 6,证明种群间遗传交换较小,这与环境适应性和高山阻隔有一定的关系。  相似文献   

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