人尿激酶受体cDNA的克隆及序列测定

以高转移性人肺巨细胞癌细胞系PG的总RNA为模板,用RT-PCR方法扩增人尿激酶受体(uPAR)的cDNA。将其亚克隆至pGEM-T载体后进行测序,结果表明,我们所克隆的uPAR cDNA片段与文献报道的人uPAR基因编码区cDNA序列高度同源(达99%),其中第705、746和755碱基分别由A、A和G替代了文献中的T、G和A,从而导致了第249和252位氨基酸由Gly和Glu变为Asp和Gly,我们已将此序列申请登录GenBank,登录号为AF257789。     

Annexin Ⅱ基因克隆及真核表达载体的构建

目的克隆人AnnexinⅡ全长cDNA序列,并构建其真核表达载体。方法根据Genbank中AnnexinⅡ基因的碱基序列,利用RT-PCR的方法从人肾脏组织中扩增编码AnnexinⅡ基因,将目的片段与pBS-T载体连接,利用亚克隆的方法将AnnexinⅡ的cDNA片段克隆到pcDNA3.1载体中,并进行序列测定。结果DNA测序证实该片段序列与Genbank完全一致。结论成功克隆人Annexin II全长cDNA序列,并构建出pcDNA3.1—Annexin II真核表达载体,为进一步研究其在肾脏疾病中的作用和机制奠定基础。     

汉滩病毒84FLi株L片段全长cDNA克隆的构建及鉴定

目的：克隆汉滩病毒84FLi株L片段的cDNA。方法：提取病毒总RNA,反转录为cDNA模板,用高保真的Toq酶扩增出含有L片段部分克隆的片段84L1（1-1875）、84L2（1725—3352）、84L3（2921-4961）和84L4（4727—6533）,将这4个片段分别与T载体pGEM-T-Easy连接,转化感受态大肠杆菌后获得4个克隆pGEM—L1、pGEM—L2、pGEM—L3和pGEM—L4。利用酶切连接方法获得pGEM—L12和pGEM-L34,2段产物覆盖全长的L片段,并且于2921—3352nt区域内相互重叠;再利用酶切连接的方法获得了含有L片段全序列的cDNA克隆。结果：获得6个含有L片段部分片段的克隆,进而酶切组装为含有L片段全序列的cDNA克隆。结论：应用分段克隆和逐次拼接法成功构建了84FLi株L片段全序列的cDNA克隆。     

流行性出血热病毒R22株cDNA克隆及其特异性鉴定

用家鼠型流行性出血热病毒R22株RNA,经polyA接尾,以Oligo-dT做引物,合成cDNA。用pUC18为载体转染E.coli Mc1061,建立cDNA克隆。再经菌落杂交,选择病毒特异性的5个阳性克隆制成缺口翻译探针,与病毒RNA3个片段进行反杂交,确定RNA片段的特异性。结果表明,3个克隆为中(M)片段的cDNA,另两个分别为大(L)和小(S)片段cDNA。核苷酸序列分析证明,克隆的DNA中含病毒特异的核苷酸序列。     

人肿瘤坏死因子可溶性受体Ⅰ与人IgG∶Fc的融合基因的构建及其在大肠杆菌中的表达

采用PCR方法引入编码氨基酸残基序列为GGGGSGGGGS的接头,将sTNFR1 cDNA与人IgG:Fc cDNA片段连接,构成融合基因fusion 1。将fusion 1克隆在pBSⅡ SK+载体上。测定序列后,转入pRSET-B表达载体,在大肠杆菌中表达,得到分子量 为45kDa的蛋白,超声破碎后电泳证明表达的蛋白为包涵体,经免疫蛋白印迹证实为我们构建的融合蛋白。     

α-葡萄糖苷酶基因序列分析及真核表达载体构建

目的：Aspergillus niger（CU-1）菌株α-葡萄糖苷酶基因（agdA）克隆并对其序列进行分析,构建该基因的真核表达载体。方法：设计合成的一对特异性引物,采用PCR以总DNA为模板,扩增得到DNA片段（D1）;采用RT-PCR方法扩增得到DNA片段（D2）。将DNA片段D1和D2转入大肠杆菌中并进行了序列测定,序列进行BLAST比对分析。将α-葡萄糖苷酶基因的cDNA片段与表达载体pGAPZαA连接,构建重组表达载体。结果：基因agdA大小为3 127bp,含有3个外显子和4个内含子。该基因的cDNA序列大小为2 958bp,包含完整的编码框,编码985个氨基酸。agdA基因序列与已发表的α-葡萄糖苷基因序列同源性达99%,其中有6个位置的碱基发生了变化。已成功构建重组表达载体pGAPZαA-agdA。结论：Aspergillus niger（CU-1）菌株α-葡萄糖苷酶基因序列分析及重组表达载体pGAPZαA-agdA的构建为在毕赤酵母中表达Aspergillus niger（CU-1）菌株的α-葡萄糖苷酶奠定基础。     

人呼吸道合胞病毒兰州株基因组全长cDNA克隆的构建及鉴定

目的构建用于呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)体外拯救的RSV基因组全长cDNA克隆,并进行鉴定。方法根据RSV Long株基因组序列设计并合成引物,利用RT-PCR技术分6段扩增RSV LZ01/09基因组序列并构建克隆载体;测序后,利用重叠PCR与酶切连接技术,根据基因组序列选择特异性酶切位点,引入Kpn I、Xma I和Sal I酶切位点,构建成4个亚克隆载体;将亚克隆载体的插入片段连接至经过改造且包含T7启动子、锤头状核酶、多克隆位点、丁肝核酶、T7终止子的p RSV1载体中,构建RSV基因组全长cDNA克隆;对克隆全长cDNA序列进行测定,与亲本RSV LZ01/09基因组进行同源性比对分析,并与RSV实验参比株进行系统进化树分析。结果测序结果显示,RSV LZ 01/09的基因组全长为15 204 bp,与GenBank公布的RSV基因组序列长度相当,将完整的序列提交GenBank,登录号为KY782635;酶切及测序结果显示,用于RSV全长cDNA克隆构建的基本载体p BSKS-MCS(简称p RSV1)与预期相符,RSV全长基因组cDNA克隆质粒(简称转录载体p RSV1-4F)酶切片段大小与预期一致;同源性比对结果显示,全长cDNA序列与亲本RSV LZ01/09基因组序列同源性高达99.83%;系统进化树分析结果显示,其与RSV-A亚型序列同属于一个分支。结论测序及酶切分析结果表明已成功构建RSVLZ01/09基因组全长cDNA克隆,为建立拯救RSV重组病毒的反向遗传学系统平台奠定了基础。     

血小板生成素改构体基因的克隆和序列分析

采用PCR技术,根据文献报道的鼠TPO成熟肽基因序列,设计并合成两对引物,以鼠TPO cDNA为模板,扩增获得mTPO N端153个氨基酸的478bp cDNA片段及鼠TPO全长1032bp cDNA片段,mTPO153片段与合成的碱性成纤维生长因子序列中Lys119-Lys135as的51bp肝素结合位点DNA片段连接,克隆到M13mp18及M13mp19载体中进行双向测序;同时将扩增的鼠TPO全长cDNA片段克隆到M13mp18及M13mp19载体中进行双向测序。证明获得鼠血小板生成素与肝素结合位点基因及鼠TPO全长基因,继之以pMAL-C2X为表达载体构建表达质粒,并经PCR及酶切鉴定。     

人Ⅱ型囊泡单胺转运体基因的克隆

目的 为获得人Ⅱ型囊泡单胞转运体（vesicular monomine transporter-2VMAT2)以治疗帕金森病,克隆添加Kozak序列的VMAT2cDNA,用于真核细胞表达。方法 从人胎脑中提取总RNA,逆转录成cDNA,设计一对引物用PCR方法扩增目的cDNA片段并将其重级一起pGEM-Easy-T载体中,酶切鉴定插入片段后,进行全序列测定。结果 RT-PCR扩增到1637bp的带有Kozak序列的cDNA片段。结论 克隆人VMAT2cDNA片断,可用于真核细胞表达。     

以绿荧光蛋白基因为报告基因的广宿主启动子探针载体的构建和应用

将以绿荧光蛋白基因(gfp)的 cDNA为模板,用人工合成引物经PCR扩增获得的09kbDNA片段克隆到表达载体pET11C上构建成gfp表达载体pHN115。从pHN115上切下的不含启动子,但保留了SD序列的gfp基因经克隆载体SK(+)和pIJ2925亚克隆后再克隆到广谱稳定性质粒pTR102上构建成广谱、稳定、可视的启动子探针载体pHN127。并用它从费氏中华根瘤菌HN01的总DNA中成功地钓出组成型和诱导型表达的启动子。     

一种新的兔内皮素B受体基因克隆和全序列分析

Endothelin(ET)is the most potent mammalian vasoconstrictor identified to data. As a pathogenic factor,ET is involved in the genesis of many diseases. In this study, a pair of primers was designed and synthesized according to the human ETB receptor gene (hETBR)sequence. A 394bp of DNA fragment was amplified by polymerase chain reaction(PCR) and labeled with a-32p-CTP using Random Primer-Labeling method. With this probe, rabbit lung cDNA library was screened by in situ hybridization and 11 positive clones were identified. Sequencing result showed that a complete reading frame of rabbit ETB receptor(rETBR)cDNA could be produced from three positive clones of eleven. By a series of subcloning,a recombinant plasmid including the 1326 bp of rETBR coding sequences, named pBlu Script-rETBR, was constructed. The deduced amino acid sequence indicated that the rETBR is 441 residues in length, with an expected molecular mass of approximately 49.44 kD. N-terminal 18 residues is the potential signal peptide (Score＝11.11)and therefore the molecular mass of mature rETBR is 47.65 kD with 423 amino acid residues. Analysis of the rETBR hydropathy profile indicates the presence of seven hydrophobic regions, putative transmembrane domains. Potential N-glycosylation sites are the 60th and the 118 th. The structure exhibits a significant sequence and topographical similarity with G protein-coupled receptors.     

一新种的兔内皮素B受体基因克隆和全序列分析

198 8年 ,Ｙａｎａｇｉｓａｗａ和其同事在培养的猪主动脉内皮细胞上清中分离到能对离体的猪冠状动脉产生收缩作用的多肽即内皮素 (Ｅｎｄｏｔｈｅｌｉｎ) ,简称为ＥＴ[1] 。ＥＴ不仅具有强大的缩血管作用 ,而且是体内多种细胞的促分裂剂 ,对心血管、肾脏、呼吸、消化、神经、生殖、内分泌各系统均有作用 ;更为重要的是 ,在多种疾病中 ,它又作为一种致病因子参与疾病的发生 ,具有重要的病理生理意义。ＥＴ只有与靶细胞上特异的ＥＴ受体结合 ,启动一系列细胞内信息传递系统 ,其中主要是磷酸肌醇系统 ,调节胞内钙浓度 ,才得以发挥其效应。在人…     

Isolation of a 1 195 bp 5′-Flanking Region of Rice Cytosolic Fructose-1,6-bisphosphatase and Analysis of Its Expression in Transgenic Rice

A genomic DNA fragment containing the 5′-upstream sequence and part of the open reading frame corresponding to the cytosolic fructose-1,6-bisphosphatase (cyFBPase) cDNA was isolated by Genome Walking. The 1 195 bp 5′-flanking region which started from the translation initiation ATG codon was fused to reporter gene encoding β-glucuronidase (GUS) and stably transferred to rice via particle bombardment. Strong GUS activity was detected in leaves and leaf sheaths of transgenic rice, but not in culms and roots. Histochemical localization revealed that GUS expression was exclusively restricted to mesophyll cells in transgenic rice. Our results indicate that the 1 195 bp fragment contains all the cis-elements required for directing mesophyll-specific expression pattern in rice. Key words: rice (Oryza sativa); promoter;　cytosolic fructose-1,6-bisphosphatase gene; mesophyll-specific expression     

小麦尿卟啉原Ⅲ合成酶基因克隆及序列分析

根据水稻已公布的尿卟啉原Ⅲ合成酶(UROS)基因和小麦EST的保守序列,设计特异性引物对小麦尿卟啉原Ⅲ合成酶基因的部分片段进行克隆,得到了364 bp的cDNA(命名为UROS1)。以UROS1作为种子进行电子克隆,得到一段长为1210 bp的cDNA序列,并设计特异性引物克隆到1个1077 bp cDNA序列。对该片段分析结果表明,克隆得到的小麦UROS基因包含了信号肽区和全长的成熟肽区。小麦UROS基因与水稻UROS基因的同源性为86%左右,其推导氨基酸序列与水稻和拟南芥蛋白序列同源性分别约91%和79%。动物、植物以及微生物间核酸序列的保守性较低,氨基酸序列保守性也不高,但都存在UROS保守结构域(Hem D)。进化分析显示,该酶在不同物种间的进化速度差异较大。     

草鱼瘦素受体基因片段序列的克隆及其组织表达分析

根据斑马鱼、大西洋鲑和人等物种巴知的瘦素受体基因核苷酸保守区序列设计一对简并引物,通过RT-PCR法从草鱼肝胰脏中首次克隆获得草鱼瘦素受体基因的片段序列.该片段序列长713 bp,编码237个氨基酸,氨基酸序列分析表明草鱼瘦素受体基因片段氨基酸序列与其他物种的相似性在35％ -86％之间.通过邻接法(Neighbor Joining,NJ)构建系统进化树显示,鱼类的瘦素受体独立聚成一支,草鱼与金鱼、斑马鱼聚成一支,再与日本青鳉、黑点青鳉、红鳍东方鲀和大西洋鲑聚成一支.通过实时荧光定量PCR分析草鱼瘦素受体基因的组织差异表达,结果表明,草鱼瘦素受体基因在肝胰脏、肌肉、脑、心脏、脾和肠系膜脂肪组织中均有表达,其中在脾脏组织中表达量最多,显著高于其他组织(P＜0.05),其次是心脏、脑、肌肉和肠系膜脂肪组织,在肝胰脏组织中表达量最低,且显著低于其他组织(P＜0.05).     

cDNA clones encoding bovine interphotoreceptor retinoid binding protein

We have isolated a cDNA clone (lambda IRBP-1) for bovine interphotoreceptor retinoid-binding protein (IRBP) by immunological screening of a bovine retinal lambda gt11 cDNA expression library. This clone contained a cDNA insert 325 bp in length. A 250 bp fragment of this cDNA was used to screen a bovine retina lambda gt10 cDNA library, resulting in the isolation of two larger cDNA clones containing inserts of 2.5 kb (lambda IRBP-2) and 1.5 kb (lambda IRBP-3). Restriction endonuclease mapping revealed all three clones to have an EcoR I restriction site. The 250 bp fragment of lambda IRBP-1 and the 2000 bp fragment of lambda IRBP-2 both hybridized to a single bovine retinal mRNA species approximately 8 kb in length; there was no hybridization with either chicken lens or liver RNA. The amino acid sequence of a tryptic peptide from authentic IRBP has been obtained. The deduced amino acid sequence from the cDNA nucleotide sequence is the same as this authentic peptide. This definitively establishes the identity of the cDNA clones as encoding bovine IRBP.     

鸡含锰超氧化物歧化酶cDNA克隆及序列分析

 为弄清鸡含锰超氧化物歧化酶 (manganese containingsuperoxidedismutase ,MnSOD)的cDNA序列 ,以开展动物锰营养学的深入研究 ,根据已知鸡MnSOD的N端氨基酸序列设计简并引物 ,应用 3′RACE(rapidamplificationofcDNAends)技术 ,扩增克隆了鸡心肌MnSOD 990bp的 3′cDNA片段 .再根据 3′RACE片段测序结果设计引物进行 5′RACE ,结果获取了一个与 3′RACE片段相互重叠的鸡心肌MnSOD 52 1bp的 5′RACE片段 ,并对其进行了克隆测序 .最后根据 3′RACE片段和 5′RACE片段序列信息进行拼接 ,从而获取鸡MnSODcDNA的全序列信息 .研究结果表明 :鸡MnSODcDNA全长为 110 8个核苷酸 ,其中 5′非翻译区 2 5个核苷酸 ,编码区 675个核苷酸 ,3′非翻译区 4 0 8个核苷酸 ,编码一个长 2 2 4个氨基酸残基的蛋白质前体 .其中信号肽长 2 6个氨基酸残基 ,成熟肽长 198个氨基酸残基 ,分子量为 2 2kD .与人、大鼠、线虫、果蝇等真核生物MnSOD氨基酸序列的同源性分别为82 4 %、84 .7%、62 .4 %、59.3% .     

马哈利樱桃PGIP cDNA克隆序列分析

以马哈利樱桃（Prunus mahaleb L.）为材料,通过RT－PCR获得了1045bp的目的段,经克隆测序,证实该片段包含1个完整的开放阅读框架,该阅读框架由990碱基组成,编码330个氨基酸。该序列与杏、梨、苹果的PGIP cDNA序列同源性分别达97.2%、83.4%和83.6%,可能编码的氨基酸与杏、梨、苹果的PGIP cDNA所编码的氨基酸的同源性分别达到96.7%、85.2%和85.2%。与已经克隆的PGIP DNA序列的对比分析表明,PGIP DNA序列中包含2个外显子和1个内含子,内含子全长147 ,符合TG－AG规律,2个外显子长度分别为581bp、464bp。