用酵母双杂交系统研究SMAD3和SMAD4的相互作用

利用酵母双杂交试验,鉴定了细胞内信号传导蛋白SMAD3和SMAD4的相互作用。通过SMAD3和SMAD4各突变体的同源和异源相互作用的双杂交反应,确定SMAD4介导信号传递的功能区在中间连接区,SMAD3的功能区在C末端。     

组蛋白酵母双杂交诱饵载体的构建及其自激活作用检测

目的:构建组蛋白 H2A、H2B、H3、H4的酵母双杂交诱饵载体,检测其在酵母细胞中的表达和自激活活性,为应用酵母双杂交系统筛选与组蛋白相互作用的蛋白奠定基础.方法:扩增 H2A、H2B、H3、H4蛋白基编码区 cDNA序列,克隆至酵母表达载体 pGBK-T7中,再将其转化至酵母细胞 AH109中,提取酵母总蛋白,检测各种组蛋白的表达,并检测表达的组蛋白在酵母细胞中对报告基有无自激活作用.结果:将 H2A、H2B、H3、H4基的 cDNA 克隆至酵母表达载体 pGBK-T7中,其中组蛋白 H4得到正确表达,且对报告基 LacZ、HIS3、Ade 无激活作用.结论:可以利用酵母双杂交系统筛选与 H4相互作用的蛋白质.     

人PIRH2b与ARF4相互作用的初步研究

目的 利用酵母双杂交技术筛选PIRH2b的相互作用蛋白。方法 以PIRH2b为诱饵蛋白,利用酵母双杂交技术筛选人胎肝cDNA文库,用GST—pull down验证PIRH2b与ARF4在体外的相互作用,并用绿色荧光蛋白标记PIRH2b,红色荧光蛋白标记ARF4,观察两者在肝癌细胞株Hep3B中的亚细胞定位。结果利用酵母双杂交筛选到一个能与PIRH2b相互作用的蛋白ARF4,GST—pull down验证了两者在体外的相互作用,荧光标记共定位结果显示两个蛋白共定位于Hep3B细胞的核周区域。结论首次发现并证实了PIRH2b与ARF4的相互作用,PIRH2b对ARF4的功能可能有重要影响。     

SMAD3与细胞周期蛋折CyclinB的相互作用

ＳＡＭＤｓ是ＴＧＦβ家族的细胞内信号介导。为了研究ＳＭＡＤ３的信号传递过程,我们以ＳＡＭＤ３为诱饵蛋白用酵母双杂交系统筛选与ＳＡＭＤ３相互作用的蛋白,发现Ｃｙｃｌｉｎ Ｂ可以与ＳＭＡＤ３发生相互作用,并在ＣＯＳ７细胞中证实了该相互作用。提示ＴＧＦβ可能通过ＳＭＡＤｓ与细胞周期素的相互作用来调节细胞周期的变化。     

SMAD4错义突变与先天性心脏病易感性的相关性研究

SMAD4在心脏发育过程中发挥重要作用,已有研究显示,Smad4 缺陷小鼠心脏功能异常.为了进一步探究SMAD4基因错义突变与先天性心脏病(congenital heart disease,CHD)发生的相关性,本研究选取了来自中国山东汉族的417例CHD患者样本和213例健康对照样本,并靶向SMAD4的编码区进行深度...     

酵母双杂交技术筛选并回转验证在胞内与PML-C结构域相互作用的蛋白

目的 利用酵母双杂交技术在活细胞内筛选并回转验证与PML-C结构域相互作用的蛋白质.方法 通过诱饵质粒pGBKT7-PML-C,利用酵母双杂交系统从白血病细胞cDNA文库中筛选与PML-C结构域相互作用的蛋白质.结果 利用酵母双杂交技术筛选到43个能与PML-C结构域相互作用的克隆;经进一步的归类与酵母回转试验得到9个阳性克隆.结论 在细胞内PML-C结构域能与多种蛋白质有相互作用.中性粒细胞弹性蛋白酶（neutrophil elastase,NE）介导的急性早幼粒细胞白血病的发生可能与这些相互作用所致的生物学功能改变有关.     

用酵母双杂交体系确定病毒特异性蛋白与宿主蛋白的相互作用

用B型流行性感冒病毒BM2蛋白开放阅读框架片段,构建酵母双杂交体系中的"饵”载体,明确其在酵母细胞中的表达,排除自身激活作用,并用酵母双杂交法从人cDNA基因库中筛选出与BM2蛋白相互作用的蛋白.结果表明B型流感病毒BM2蛋白与宿主细胞的某一蛋白有相互作用.应用酵母双杂交体系,可以非常有效地从人cDNA基因库中确定与"饵”蛋白相互作用的蛋白基因.     

BAFF-R 胞内区与TRAF3 相结合关键分子结合域的确定

目的：研究BAFF-R 胞内区与TRAF3 相互作用的关键结合域。方法：分别钓取BAFF-R 胞内区和TRAF3 的cDNA 片段,克 隆到酵母双杂交系统中,验证两者之间的相互作用。利用缺失PCR和重叠PCR 的方法获取11 个TRAF3 的突变体,验证TRAF3 的11 个突变体和BAFF-R 胞内区的相互作用。结果：TRAF3 与BAFF-R胞内区发生相互作用时,有三个关键的分子结合域,分别 是N 端的螺旋结构382- 400 位氨基酸、中间的428－463 位氨基酸以及TRAF3 C端的543－560 位氨基酸。结论：在体内得到了 BAFF-R胞内区与TRAF3 相互作用的三个关键分子结合域,有助于展开对BAFF-R 胞内区与TRAF3 相互作用的进一步研究。     

酵母双杂交系统筛选GATA-1相互作用蛋白质及功能验证

目的 利用酵母双杂交技术从人脑cDNA文库中筛选与人GATA-1相互作用的蛋白质.方法 从人K562细胞中扩增出全长GATA1基因,设计引物将其3段截断体亚克隆入酵母表达载体pDBLeu中,转化至AH109感受态酵母中,利用酵母双杂交技术筛选人脑cDNA文库中与其相互作用的蛋白质,阳性克隆通过回转及免疫共沉淀试验进行验证,利用3xGATA荧光素酶报告基因对相互作用蛋白质进行功能验证.结果 成功构建出酵母诱饵蛋白表达质粒pDBLeu-GATA1（1）,pDBLeu-GATA1（2）,pDBLeu-GATA1（3）,筛到34个阳性克隆,用生物信息学分析及回转验证得到5个与GATA-1相互作用的候选蛋白,通过免疫共沉淀试验进一步验证,获得3个蛋白质能与GATA-1相互作用,分别是ECSIT,EFEMP1和GPS2.荧光素酶试验表明这3个蛋白质均能对GATA1的转录活性产生影响,证实它们之间的相互作用具有影响GATA1转录的功能.结论 应用酵母双杂交技术及免疫共沉淀试验,从人脑cDNA文库中成功获得3个与GATA-1相互作用并对其转录活性具有调节作用的蛋白质,为研究GATA1蛋白质的功能提供了新的线索.     

大规模酵母双杂交技术研究蛋白质相互作用的应用

简介了酵母双杂交技术原理, 总结了酵母双杂交技术大规模筛选蛋白质相互作用的基础、应用及存在的问题。因为大规模酵母双杂交技术结果有大量假阳性及假阴性问题, 因此, 有条件情况下有必要同时开展其他方法的大规模蛋白相互作用研究, 以构建规模更大可信度更高的蛋白质相互作用网络图。     

用酵母双杂交系统研究Smad3和Smad4的相互作用

Ｓｍ ａｄ３ 和 Ｓｍ ａｄ４ 是将 Ｔ Ｇ Ｆ β的信号从细胞外传递到细胞核内的重要的信号传导蛋白． Ｔ Ｇ Ｆ β与其受体结合后,激活受体的磷酸激酶,使 Ｓｍ ａｄ３ 发生磷酸化,活化的 Ｓｍ ａｄ３ 与 Ｓｍ ａｄ４ 结合,形成异源复合物,进入到核中．然后 Ｓｍ ａｄ４ 以 Ｄ Ｎ Ａ 结合蛋白的形式与特定的 Ｄ Ｎ Ａ 结合,将 Ｔ Ｇ Ｆ β的信号传到核内．激活转录,诱导背中胚层的形成,抑制细胞的分化等．经研究利用酵母双杂交试验,鉴定了 Ｓｍ ａｄ３ 和 Ｓｍ ａｄ４ 相互作用的功能区域．构建 Ｓｍ ａｄ３ 和 Ｓｍ ａｄ４ 的 Ｃ 端、 Ｎ 端和中间连接区的突变体,将这些突变体克隆到 ｐ Ｇ Ａ Ｄ４２４ 和 ｐ Ｇ Ｂ Ｔ９ 载体中,并转化到 Ｈ Ｆ７ Ｃ 酵母中．通过 Ｌｅｕ－ ／ Ｔｒｐ－ ／ Ｈｉｓ－ Ｓ Ｄ 平板上菌落的形成,和 Ｘ－ ｇａｌ显色反应鉴定转化到酵母中的两个克隆质粒的相互作用．结果显示 Ｓｍ ａｄ４ 与 Ｓｍ ａｄ３ 异源相五作用时,主要是通过 Ｓｍ ａｄ４ 的中间连接区．在同源作用时, Ｓｍ ａｄ３ 是通过 Ｃ 端,而 Ｓｍ ａｄ４ 是通过中间连接区进行的．     

Role of loop 9 on the function of neuronal nicotinic receptors

We have studied the role of loop 9 in the function of neuronal nicotinic receptors. By systematically mutating the residues in the loop we have determined that the most important amino acids determining the coupling of binding to gating are the ones closer to the transmembrane region. Single mutations at location E173 in homomeric α7 receptors destroyed their function by completely abolishing the current while preserving the expression at the membrane. In contrast, heteromeric receptor α3β4 with the same mutations retained some function. We conclude that loop 9 has a different role in the function of homomeric and heteromeric receptors.     

Mechanism for modulation of gating of connexin26-containing channels by taurine

The mechanisms of action of endogenous modulatory ligands of connexin channels are largely unknown. Previous work showed that protonated aminosulfonates (AS), notably taurine, directly and reversibly inhibit homomeric and heteromeric channels that contain Cx26, a widely distributed connexin, but not homomeric Cx32 channels. The present study investigated the molecular mechanisms of connexin channel modulation by taurine, using hemichannels and junctional channels composed of Cx26 (homomeric) and Cx26/Cx32 (heteromeric). The addition of a 28-amino acid "tag" to the carboxyl-terminal domain (CT) of Cx26 (Cx26(T)) eliminated taurine sensitivity of homomeric and heteromeric hemichannels in cells and liposomes. Cleavage of all but four residues of the tag (Cx26(Tc)) resulted in taurine-induced pore narrowing in homomeric hemichannels, and restored taurine inhibition of heteromeric hemichannels (Cx26(Tc)/Cx32). Taurine actions on junctional channels were fully consistent with those on hemichannels. Taurine-induced inhibition of Cx26/Cx32(T) and nontagged Cx26 junctional channels was blocked by extracellular HEPES, a blocker of the taurine transporter, confirming that the taurine-sensitive site of Cx26 is cytoplasmic. Nuclear magnetic resonance of peptides corresponding to Cx26 cytoplasmic domains showed that taurine binds to the cytoplasmic loop (CL) and not the CT, and that the CT and CL directly interact. ELISA showed that taurine disrupts a pH-dependent interaction between the CT and the CT-proximal half of the CL. These studies reveal that AS disrupt a pH-driven cytoplasmic interdomain interaction in Cx26-containing channels, causing closure, and that the Cx26CT has a modulatory role in Cx26 function.     

Protein-protein interactions of KChIP proteins and Kv4.2

To prove heteromeric assembly of KChIP proteins, the present study is carried out. The results of chemical crosslinking and pull down assay revealed that KChIP1, KChIP2.1, and KChIP2.2 could form homo- as well as hetero-oligomer, and this oligomerization exhibited a Ca(2+)-dependent manner. Moreover, homomeric and heteromeric assembly of KChIPs did not perturb their interaction with Kv4.2 K(+) channel, indicating that the region associated with oligomerization of KChIPs was distinct from that for binding with Kv4.2. Together with previous findings that the net effects of KChIP proteins on the molecular properties and trafficking of Kv channel were different, these observations open a fascinating possibility that the electrophysiological properties of Kv channel may be differently regulated by homomeric and heteromeric assembly of KChIPs.