莱芜猪肝脏组织全长cDNA文库的构建和鉴定

目的:构建莱芜猪肝脏组织全长cDNA文库,以便研究与莱芜猪优良性状相关的基因。方法:采用改良的异硫氰酸酸胍一步法制备总RNA;利用SMART技术,以PrimeScript反转录酶逆转录合成第一链cDNA,通过LD-PCR扩增获得cDNA双链;经蛋白酶K消化和CHROMA SPIN-400柱分级分离后,收集500 bp以上的cDNA片段,并与pMD18-T载体连接,转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,建成原始文库;随机挑取单菌落,用HindⅢ和EcoRⅠ进行双酶切鉴定重组子插入片段大小。结果:经鉴定,原始文库的滴度为2.8×105 cfu/mL,重组率约为98%,插入片段大小为0.5～2 kb,平均插入片段长度大于1 kb。结论:建立的cDNA文库质量良好,可以用于目的基因的筛选。     

刺五加体细胞胚cDNA文库的构建

以2,4-D处理的刺五加体细胞胚为实验材料,提取总RNA并分离mRNA合成cDNA,连接到pAP3neo Predigested载体上.采用电穿孔法将重组质粒转化到DH10B中.经测定,原始文库滴度为2.3×106 pfu·mL-1,重组率大于95%.插入片段的长度大部分在0.5～2.0kb之间,平均长度为0.96kb,表明刺五加体细胞胚cDNA文库已构建成功.     

红果人参叶中cDNA文库的构建

以四年生红果人参叶片为材料,提取叶中总RNA合成cDNA,连接到质粒载体pDNR-LIB上。采用电穿孔法将重组质粒转化到DH5α中。经文库质量鉴定表明:原始文库滴度为1.008×106pfu·mL-1,扩增后的文库滴度为2.968×109pfu·mL-1,重组率接近100%,插入片段大小在0.5~2kb之间,平均为0.85kb,表明已成功构建了红果人参叶中cDNA文库。     

葱蝇冬滞育蛹的全长cDNA文库的构建

葱蝇Delia antiqua(Meigen)具有冬滞育的特性且与黑腹果蝇Drosophila melanogaster近缘。该研究目的在于构建葱蝇冬滞育蛹的全长cDNA文库,为进一步的冬滞育专化基因筛选、克隆、和表达分析奠定基础。利用RNAiso试剂盒提取葱蝇冬滞育蛹的总RNA,采用SMART技术合成全长cDNA,经SfiⅠ酶切消化后,将cDNA克隆到质粒载体pDNR-LIB。经鉴定,原始文库的滴度为2.4×107cfu/mL。随机挑取15个克隆,经PCR快速鉴定,插入片段大小在0.5～3kb之间,平均大小在1kb左右,重组率达100%。结果表明该研究获得高质量的葱蝇冬滞育蛹cDNA文库。     

野蚕黑卵蜂寄主识别利它素的cDNA文库构建

根据家蚕性附腺中含有的利它素能诱导野蚕黑卵蜂寄生涂有该利它素的人造卵及能用家蚕卵繁育野蚕黑卵蜂的特性 ,用化蛹 9天的家蚕雌蛹性附腺分泌部的高丰度的mRNA构建了富含利它素基因的cDNA文库。构建成的未扩增文库的滴度为 3.2 9× 10 4 pfu μL ,重组率为 90 .0 5 % ,扩增后的文库总滴度为 1.5 6× 10 7pfu μL。用PCR方法对总文库和随机挑取的噬菌斑进行扩增 ,表明λZiplox载体中已含有大小为 0 .5～ 8.0kb的cDNA插入片段 ,并在 2 .5kb、1.1kb和 0 .75kb处cDNA插入片段相对集中。所有分析结果表明 ,采用特定的发育时期和特定的组织提取的mRNA构建而成的cDNA表达文库具有较高频率的利它素基因片段和合适的滴度 ,定向插入技术并结合λZiplox噬菌体的表达功能 ,使构建的cDNA文库具有表达外源DNA的功能 ,有利于进行利它素基因的免疫筛选。     

麋鹿血液cDNA 文库的构建

为分离出MHCⅠ、Ⅱ基因,利用TRIzol 试剂从麋鹿血液组织中提取总RNA,经mRNA 纯化试剂盒纯化后,根据Stratagene 公司的cDNA 文库构建系统构建了麋鹿血液组织的cDNA 文库。初始文库滴度为1.96 ×106 pfu/ ml,总库容为1.96 ×106 个独立克隆;cDNA 插入片段平均长度约为1.0 kb;重组率为95.6 % 。文库各项指标均达标准经典cDNA 文库的基本要求。利用本实验室设计的可扩增MHCⅡ类DQA 基因第二外显子的引物检测扩增后的文库,得到了特异性非常好的目标条带,说明本文所建文库可以用于麋鹿MHC 相关基因的分离。     

人尿道(阴茎)鳞癌上皮细胞(HUS-98)cDNA文库的构建及鉴定

为了进一步分离人尿道(阴茎)鳞癌组织特异性表达基因和鳞癌特异性相关基因,采用SMART技术,构建了人尿道 (阴茎)鳞癌上皮细胞cDNA文库,从人尿道(阴茎)鳞癌上皮细胞中分离总RNA并纯化mRNA,利用经修饰的oligo(dT)引物 合成cDNA第一链,利用SMART核苷酸作为cDNA第一链在mRNA5′端延伸出去的模板,采用LD-PCR合成双链cDNA,双链 cDNA经酶切和过柱分级分离后,克隆入λTriplEx2载体后经体外包装而成cDNA文库。结果表明原始人尿道(阴茎)鳞癌上 皮cDNA文库获得1.57×107个重组子,重组率达到98%。文库扩增后,滴度达到4.0×109pfu/ml,插入cDNA平均长度为2.5kb。 构建的人尿道(阴茎)鳞癌上皮cDNA文库具有良好的质量,该cDNA文库为进一步筛选鳞癌抑癌基因及鳞癌特异性表达基因 奠定了基础。     

铁皮石斛cDNA文库的构建及分析

首次报道铁皮石斛cDNA文库的构建及其分析.以Trizol一步法从4年生的铁皮石斛叶片中提取总RNA,分离纯化mRNA,LD-PCR法反转录合成双链cDNA,以λTripEX2为载体,构建铁皮石斛cDNA文库.原始文库的滴度为4.3×105 pfu/mL,总克隆数为3.1×105,重组率为97.6%,扩增后文库总滴度为6.8×109pfu/mL,对随机挑取的噬菌斑进行PCR鉴定,结果插入片段多分布在0.5～2.0kb之间,绝大部分在1.2～1.7kb左右,文库质量鉴定结果表明,构建的铁皮石斛cDNA文库具有较好的库容量、较高的重组率以及较大的插入片段.cDNA文库的构建为铁皮石斛药用成分相关功能基因的研究奠定了基础.     

PCR介导HaNPV罹病幼虫潜伏期cDNA文库的构建

以罹病棉铃虫幼虫为材料提取总RNA ,反转录合成cDNA第一链 ,加oligo(dG)同聚尾 ,PCR扩增合成双链cDNA ,克隆到 pGEM T质粒载体中。随机筛选文库中阳性克隆 ,经酶切分析 ,cDNA插入片段大小在 0 .3～ 1.1kb之间。文库中原代重组子数为 1.66× 10 5,重组百分比为 87.8%。重组质粒的杂交分析表明 ,文库中HaNPV基因的cDNA克隆所占比例超过 50 %。     

鲑鱼泌乳素cDNA的分子克隆和序列分析

从太平洋切奴克鲑鱼的垂体制备cDNA文库。按照鲑鱼泌乳素的部分蛋白质序列所提供的信息合成寡聚脱氧核苷酸探针。用探针筛查泌乳素基因,识别出一个阳性克隆PRL-10。该克隆的硷基序列已被测出。PRL-10的总长为1.1kb,编码了含有211个氨基酸组成的泌乳素前体,其中包括了编码23个氨基酸的信号肽序列和编码188个氨基酸的成熟泌乳素序列。     

狗肝脏苯甲二氮茸结合抑制因子的cDNA克隆及序列分析

在研究狗抗吗啡活性肽ＰＰＣ过程中,发现它与牛的ＤＢＩ（ｄｉａｚｅｐａｍｂｉｎｄｉｎｇｉｎｈｉｂｉｔｏｒ）的氨基酸序列有很高的同源性,但尚未见到有关狗的ＤＢＩ的文献报道,为了更好的探讨ＰＰＣ和ＤＢＩ相互间的关系,对狗的ＤＢＩ的ｃＤＮＡ进行了克隆和序列分析。本研究利用大鼠ＤＢＩ的基因片段为探针,从狗肝脏ｃＤＮＡ文库中,筛选得到了一阳性克隆,并进行了全自动和手工测序,得到了ＤＢＩ的全长基因。根据ＥＢＭＬｂａｎｋ序列检索,发现狗的ＤＢＩ核酸序列与牛的同源性为８１％,将其核酸序列翻译成氨基酸序列,进行同源序列比较,结果显示：狗的ＤＢＩ的氨基酸序列与猪、牛、人、酵母ＤＢＩ的同源性分别为８８．５％、８７．４％、８３．９％、４６．５％。研究还发现狗的ＤＢＩ序列与抗吗啡活性肽ＰＰＣＮ端６２个氨基酸只有两个不同,Ｃ端１７个氨基酸序列完全相同。只是ＰＰＣ比ＤＢＩ中间多了２３个氨基酸。     

Molecular Cloning of the cDNA Encoding an Antifungal Protein in Gastrodia elata Bl.

Antifungal protein is the main inhibitor of fungal infection in the secondary corm of Gastrodia elata B1. was isolated and purified antifungal protein (GAFP) from the plant. Its molecular weight was about 14 kD. Polyclonal antibody against GAFP was produced. In vitro test, this antifungal protein inhibited the growth of some fungi in some crop including Gibberella zeae. cDNA was synthesized from poly (A) mRNA purified from G. elata. The cDNA was ligated into phage vector λgtll DNA and packaged in vitro and the phages were propagated on E. coli Y1090 and a λgtll expression library was constructed. A cDNA clone encoding for antifungal protein was screened out by immunoscreening of the library using the protein as a probe. The λDNA containing insert was digested by Eco RI after isolated and purified recombinants λDNA, the insert was obtained. The cDNA was 300 bp in length. The authors had isolated the cDNA clone encoding antifungal protein from G. elata.     

长臂光敏生物素标记葡萄扇叶病毒外壳蛋白基因cDNA探针的制备及其在检测上的应用

由葡萄扇叶病毒（Ｇｒａｐｅｖｉｎｅｆａｎｌｅａｆｖｉｒｕｓ,ＧＦＬＶ）导致的葡萄扇叶病在世界各地葡萄园内均有发生,是最为普遍和严重的病毒病害之一,感病葡萄可减产２０％～８０％。近年来,许多国家开展了葡萄脱毒苗木的培育和推广工作,同时进行了葡萄扇叶病毒...     

盐芥(Arabidopsis salsuginea)cDNA文库的随机测序

实验以盐生植物盐芥为材料 ,提取经盐处理的盐芥总RNA ,分离mRNA后 ,构建cDNA文库。从cDNA文库中随机挑取克隆进行测序。结果共测得 5 3个表达序列标记 (EST) ,有 37个EST( 6 9 8% )与拟南芥的基因在多肽水平上有较高同源性 ;2 1个EST( 39.6 % )的功能未知     

人白细胞介素6cDNA克隆的分离与鉴定

我们从重组的人α干扰素处理的单层HeLa细胞常规提取Poly(A)~+RNA作为逆转录合成cDNA第一链之模板,用引物-适配接头法在噬菌质粒pTz19R中构建cDNA文库。以~(32)p-标记的480bpIL-6cDNA片段作探针进行菌落原位及狭缝印迹杂交,筛选出6个阳性克隆。其中两个克隆并用限制酶切分析及DNA序列测定做进一步鉴定。结果证明,一个克隆的cDNA片段长1.3kb,含有人白介素6全长编码区;另一个的cDNA插入片段为0.9kb,缺乏信号肽及成熟IL-6N端30个残基的编码序列。     

以绵羊MHC区段BAC克隆酶切片段为探针杂交筛选绵羊混合组织cDNA文库

在已知中国美利奴羊MHC(Major histocompatibility complex)区段BAC(Bacterial artificial chromosome)克隆序列信息和预测的基因注释前提下,用位于中国美利奴羊基因组BAC文库MHC区段的6个BAC克隆酶切片段为探针,以噬菌斑原位杂交筛选法筛选中国美利奴羊混合组织cDNA文库(库库杂交),对分离到的cDNA阳性克隆进行全序列测定,并与相应的已知序列信息和基因注释的BAC克隆比对以及在NCBI Blastn数据库中序列相似性检索,旨在验证基因注释结果的准确性和对基因(序列)功能的初步分析。实验中,经过两轮杂交共筛选出27个cDNA阳性克隆(序列),并发现这些序列均可定位到相应的BAC克隆上,且25条序列处在注释基因的外显子部分;在NCBI数据库中经Blastn序列相似性检索发现,23条序列与牛基因的序列相似性最高,且与免疫功能密切相关。     

抗肿瘤单抗3H11对应抗原cDNA片段的克隆

单克隆抗体３Ｈ１１能与多种肿瘤细胞特异结合,克隆其对应抗原无疑具重要意义．用胃癌细胞ＭＧＣ８０３构建ｃＤＮＡ表达文库,通过抗体３Ｈ１１对其进行原核表达筛选,获得一株能与３Ｈ１１特异反应的阳性克隆．其ｃＤＮＡ插入片段为５５４ｂｐ．ＧｅｎＢａｎｋ不含其同源序列．将此ｃＤＮＡ片段与谷胱甘肽转移酶表达质粒ｐＧＥＸ－４Ｔ重组,Ｗｅｓｔｅｒｎｂｌｏｔ和竞争抑制实验表明,表达产物依然保持同３Ｈ１１反应的特异性．可见它是３Ｈ１１对应抗原的ｃＤＮＡ．