海芋凝集素cDNA的分子克隆及其性质预测

用cDNA末端快速扩增-聚合酶链式反应（RACE-PCR）方法克隆了海芋（Alocasia macrorrhiza）凝集素的全长cDNA（GenBank检索号DQ340864）,并用多种生物信息学工具对其性质进行了预测。根据来源于天南星科其他植物的凝集素和类似蛋白的保守区的DNA序列,设计了几个海芋凝集素基因aml特异引物（GSP）。用RNeasy试剂盒从海芋块茎中提取出总RNA,并以此为模板,用SMART^TM RACE cDNA扩增试剂盒提供的经特殊设计的通用引物以及不同的基因特异引物,分别获得海芋凝集素5′-和3′-RACE-PCR扩增片段。这些PCR产物经0．8％琼脂糖凝胶纯化后,分别与T克隆载体pMD 18-T相连,筛选获得阳性克隆并提取质粒,经双酶切和特异引物的PCR验证无误后,进行序列分析。从5′-和3′-RACE-PCR测序结果拼接出全长海芋凝集素cDNA序列,并用新设计自5′-RACE-PCR 5′末端的引物GSP7进行全长3′-RACE-PCR反应,获得全长海芋凝集素cDNA克隆并再次测序验证。这一新克隆的海芋凝集素cDNA的长度为1124核苷酸,分析表明它是一个编码270个氨基酸残基的蛋白质,其等电点为pH 5．7,相对分子量为29．7kD。同源性分析结果表明,海芋凝集素与其他来源于天南星科的甘露糖凝集素以及相似蛋白具有高度同源性。在海芋凝集素序列中发现了2个B型凝集素功能区域和3个甘露糖的结合位点。综合上述信息,认为这一新克隆的海芋凝集素cDNA是一个编码甘露糖识别凝集素的基因序列。     

一种新的甘露糖结合凝集素——朱顶兰凝集素基因的克隆及序列分析

运用同源克隆的方法设计简并引物,通过3′和5′RACE技术,从石蒜科植物朱顶兰(Amaryllis vittata Ait)总RNA中克隆了编码此凝集素(AVA)的全长cDNA序列。该基因全长686 bp,起始密码子位于第41～43 bp,终止密码子位于515～517bp处,开放阅读框长474 bp,编码158个氨基酸,包含信号肽序列、成熟蛋白序列和C-末端剪切序列的前体蛋白。成熟蛋白由109个氨基酸残基组成,分子量为11.9kD。成熟蛋白在氨基酸水平上与雪花莲凝集素、水仙凝集素、石蒜凝集素和君子兰凝集素分别有73.4％、85.3％、80.7％和83.5％的同源性;朱顶兰凝集素的分子模式显示其与雪花莲凝集素有极其相似的三维结构;在Blocks数据库中检索AVA蛋白氨基酸序列的结构域,发现有3个凝集素功能结构域,并具有3个典型的甘露糖专一结合位点盒(QDNY)。     

一种新的甘露糖结合凝集素--朱顶兰凝集素基因的克隆及序列分析

运用同源克隆的方法设计简并引物,通过3′和5′RACE技术,从石蒜科植物朱顶兰(Amaryllis vittata Ait)总RNA中克隆了编码此凝集素(AVA)的全长cDNA序列.该基因全长686 bp,起始密码子位于第41～43 bp,终止密码子位于515～517 bp处,开放阅读框长474 bp,编码158个氨基酸,包含信号肽序列、成熟蛋白序列和C-末端剪切序列的前体蛋白.成熟蛋白由109个氨基酸残基组成,分子量为11.9kD.成熟蛋白在氨基酸水平上与雪花莲凝集素、水仙凝集素、石蒜凝集素和君子兰凝集素分别有73.4%、85.3%、80.7%和83.5%的同源性;朱顶兰凝集素的分子模式显示其与雪花莲凝集素有极其相似的三维结构;在Blocks数据库中检索AVA蛋白氨基酸序列的结构域,发现有3个凝集素功能结构域,并具有3个典型的甘露糖专一结合位点盒(QDNY).     

香螺血清、肌肉和唾液腺凝集素凝集性能的初步研究

研究香螺(Naptunea cumingi crosse)肌肉、血清和唾液腺凝集素对7 种脊椎动物红细胞、人的4 种红细胞、4 种单细胞藻类和11 种微生物细胞的凝集性能,同时进行pH敏感性、热稳定性、糖抑制性、EDTA、金属离子以及盐浓度影响试验.结果表明,3 种凝集素对各种细胞的凝集效应存在差异,以家兔红细胞的凝集效果最佳.肌肉和血清凝集素在pH<7.0时均失活,唾液腺凝集素的热稳定性最强,温度为90 ℃仍具有活性.此外,不同的糖溶液对3 种凝集素凝集效果的影响不同,在EDTA浓度为2.00～0.25 mmol/L范围内,3 种凝集素的凝集效价均受到不同程度的抑制.在金属离子影响试验中发现,Zn2+能明显提高肌肉和血清凝集素的凝集活力,而对唾液腺凝集素有抑制的作用.当盐浓度为12～18 g/L时,可增加香螺肌肉凝集素的凝集效价,而当浓度为24～60 g/L时却会抑制肌肉凝集素的凝集活性.     

苦参凝集素的分离纯化及部分性质研究

从苦参 (SophoraflavescensAit.)根浸出液经硫酸铵分级 ,得苦参凝集素 (SFL)粗品 ,再经DEAE_Sepharose、SephadexG_1 5 0和HPLC层析 ,获得具有强凝集活性的SFL样品 ,用PAGE和SDS_PAGE检测均为单一蛋白染色带。SDS_PAGE显示SFL分子仅有一条肽链 ,SephadexG_1 0 0和SDS_PAGE测得其分子量均为 32kD。当SFL浓度为 0 .97μg/mL时能凝集兔红细胞 ,无血型专一性 ,其凝血活性可被甘露糖和果糖抑制 ,麦芽糖和葡萄糖有弱的抑制作用 ,凝集素分子含有 2 .89%的中性糖 ;当SFL量为 6 2 μg时 ,对棉花枯萎病菌 (FusariumvasinfectumAtk .)、小麦赤霉病菌(Gibberllasaubinetii (Mont.)Sacc .)和水稻稻瘟病菌 (PiriculariaoryzaeCav)菌丝体的生长发育有明显地抑制作用。用Edman法在蛋白测序仪上测出SFL的N端肽链 30个氨基酸的排列顺序为 :T/A/VDXLXFTFSDFDP NGEDLLFQGDAHVTSNN。     

波纹巴非蛤(Paphia undufata)体液和肌肉凝集素的初步研究

目的:研究波纹巴非蛤体液和肌肉凝集素对细胞的凝集性能及其理化性质,为开发新的凝集素来源提供基础材料。方法:利用10种动物及人的4种红细胞1、5种藻类细胞测定波纹巴非蛤的体液和肌肉凝集素的凝集活力,同时进行热稳定性、pH敏感性、糖抑制及金属离子影响试验。结果:体液和肌肉凝集素分别对家鸽、家兔血红细胞最为敏感,凝集效价最高,均为25。对藻类的凝集则具有某些专一性。体液凝集素有较高的温度耐受性,90℃处理10min仍能凝集兔血红细胞。肌肉凝集素对碱性环境较敏感,当pH≥8.0时,凝集活力消失。体液及肌肉凝集素在糖抑制及金属离子影响试验中也存在着差异。结论:波纹巴非蛤的体液与肌肉提取液均含凝集素,但所含凝集素类型不同。     

桑黄发酵液中凝集素SHL24的分离与生物活性研究

【背景】桑黄是一种具有很高药用价值及广泛应用前景的药用真菌,其主要有效成分为多糖。凝集素则是桑黄所含的另一类生物活性物质,具有免疫调节、抗肿瘤及抗菌等作用。【目的】从药用真菌桑黄发酵液中分离纯化凝集素SHL24,并对其生物活性进行初步探究。【方法】通过冷冻干燥、Sephadex G-50、DEAE Sephadex A-25、MPLC-MonoQ和LPLC-Sephadex G-75等方法,从药用真菌桑黄的发酵液中进行分离纯化;利用LPLC-Sephadex G-75和SDS-PAGE凝胶电泳鉴定其分子质量;检测不同pH、金属离子、糖、发酵时间、血红细胞、温度对其凝血活性的影响。【结果】从药用真菌桑黄发酵液中分离到单一蛋白条带,SDS-PAGE凝胶电泳检测其分子质量约为24 kD,与分子筛层析法分析的分子质量一致,表明该凝集素为单亚基蛋白。SHL24可以凝集供试的小鼠血红细胞和4种血型人血的血红细胞,但对不同来源的血红细胞凝集程度不同。糖抑制试验表明,SHL24不被D-甘露糖、D-麦芽糖、葡萄糖、蔗糖、树胶醛糖、D-乳糖以及L-鼠李糖所抑制。热稳定性试验和金属离子对SHL24凝血活性影响试验表明SHL24具有较好的热稳定性且其凝血活性不受Ca~(2+)、Mg~(2+)和Zn~(2+)等二价阳离子的影响。【结论】SHL24具有的稳定理化性质和生物活性,有作为蛋白质药物的潜质。     

扇叶铁线蕨凝集素的糖蛋白特性

扇叶铁线蕨叶片组织经磷酸盐缓冲液浸提,硫酸铵沉淀,再经过DEAE-Sepharose—FF和Sephadex G-100层析纯化,得到扇叶铁线蕨凝集素(AFL)。其凝集活性依赖于Ca^2 和Mn^2 ,经测定AFL,是一种分子质量为22000—22500的糖蛋白,分子中含有4．0％的中性糖,具有很高的耐热性,浓度为37．5μg ml^-1的AFL凝血活性可被甘露糖抑制,卵粘蛋白可完全抑制AFL的凝血活性。浓度为2．34μg ml^-1时引起兔血细胞凝集,并能凝集人的A、B或O型血细胞,对鳖的血细胞没有凝集作用。AFL能凝集藻类细胞、酿酒酵母细胞及经过热处理的枯草芽孢杆菌。在AFL的氨基酸组成中不含Tyr。研究结果表明,该凝集素具有糖蛋白的特性。     

天麻中一种抗真菌蛋白基因的克隆

依据天麻(GastrodiaelataBl.f.flavidaS.Chow)抗真菌蛋白GAFP_1的N端部分氨基酸序列设计简并引物,通过RACE(快速分离cDNA末端)的方法扩增得到GAFP_1全长cDNA。该cDNA包含一个编码171个氨基酸的ORF,推导的多肽序列与测得的蛋白质部分序列相同;在5′端有一个长为55bp的5′非编码区;终止密码子下游有一个141bp长的3′非编码区,其中含有两个加poly(A)信号及长度为26个腺苷酸的poly(A)。经检索发现该推导蛋白序列与火烧兰(Epipactishelloborine)和二叶兰(Listeraovata)的甘露糖结合蛋白以及雪花莲(Galanthusnivalis)中的甘露糖结合凝集素具有很高同源性。     

五步蛇毒毒中蛋白凝集素的发现及其凝集特性的研究

发现尖吻蝮蛇(Agkistrodon acutus)粗毒对动物细胞有凝集作用。顺序用DEAE—Sephadlex A-50,CM Sephadex C25柱层析,从尖吻蝮蛇毒中分离纯化出一种毒蛋白凝集素。经分子量,等电点和出血活性等实验测定确定该凝集素就是徐询等人早期分离、纯化的出血毒素Ⅲ(AaHⅢ)。这种凝集素对许多动物细胞都有凝集作用,例如脾淋巴细胞、HeLa细胞、人肾成纤维细胞和草鱼(Ctenoph argngodon idellus)。但对组细胞和血小板无作用。和植物凝集素PHA相比AaHⅢ产生细胞的凝集块体积要大些。对淋巴细胞起凝集作用的最低浓度为2.5ug/ml。能使HeLa细胞和淋巴细胞凝集在一起。如预先加肝素和溶菌酶可以抑制对淋巴细胞的凝集怍用。用溶菌酶(2mg/ml)和AaHⅢ(1mg/ml)在37℃′下保温2小时AaHⅢ的出血活性仍然存在。     

嗜水气单胞菌外膜蛋白W 基因的表达及其免疫原性分析

从患暴发性败血病的草鱼病灶处分离鉴定了嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)Wp3菌株。以其基因组DNA为模板扩增外膜蛋白W基因(OmpW),该基因全长为865 bp,开放式阅读框(ORF)为615 bp,与标准株ATCC7966的OmpW基因的同源性为99.8%。根据ORF序列设计引物扩增OmpW成熟肽编码序列并将其插入到表达载体pQE30中,转化大肠杆菌,经诱导可表达分子量为24.7 kD的带His标签的融合外膜蛋白His-W。用此融合蛋白免疫草鱼,所得草鱼血清经ELISA分析显示呈现阳性反应,说明重组蛋白能诱导产生抗体。采用实时荧光定量PCR分析草鱼头肾组织IgM基因表达水平的变化,结果显示免疫组IgM的表达量均明显高于空白组,其中低浓度免疫组(2μg/g)与空白对照组的差异显著(P<0.05),说明融合蛋白可使草鱼产生良好的免疫应答并上调抗体基因表达、产生高效抗体。保护性实验显示,不同免疫剂量均可使免疫组获得较高保护率(57%?86%)。结果显示,重组嗜水气单胞菌外膜蛋白W可作为草鱼嗜水气单胞菌基因工程亚单位疫苗。     

Purification and characterization of alpha2-macroglobulin from grass carp Ctenopharyngodon idellus: cloning a segment of the corresponding gene

The plasma protein alpha2-macroglobulin (alpha2M) was purified by gel filtration and anion-exchange chromatography from grass carp plasma. The alpha2M consists of two different subunits of molecular weight 95 kDa and 80 kDa, respectively. The characteristics of grass carp alpha2M are similar to mammalian alpha2M, in that grass carp alpha2M exists in two forms: a fast-form and a slow-form. The former is complexed with protease. The sequence of grass carp alpha2M-conserved region and a region containing the bait region was determined by sequence analysis using polymerase chain reaction (PCR). The deduced amino acid sequence of the conserved region is similar to the alpha2M sequence of common carp, however, the bait region amino acid sequence is dramatically distinct from that of common carp. This may partially explain the differential ability of alpha2M of different species to inhibit different proteases. The alpha2M was able to inhibit Aeromonas hydrophila extracellular protease (AhECPase) and thus may play a role in resistance to infection by this pathogen.     

草鱼出血病混合感染的嗜水气单胞菌的分离、鉴定与理化特性

从患出血病草鱼的肝脏病灶中分离筛选出2株致病菌。取病鱼样品组织过滤液接种CIK细胞、培养, 电镜下观察到细胞质中含有草鱼呼肠孤病毒样颗粒和包涵体, 病毒颗粒大小65 nm~ 70 nm, 包涵体0.46 μm~1.81 μm。人工回归感染实验显示分离的菌株及细胞毒悬液均能使草鱼致病死亡。对分离菌株进行细胞形态学、理化特性分析及药敏试验, 初步判定所分离的2株菌均为嗜水气单胞菌。进一步对菌株进行DNA分子鉴定, 结果显示2株菌的16S rRNA基因、促旋酶亚单位蛋白(gryB)基因均与GenBank上的嗜水     

草鱼CD81基因的克隆及功能分析

为研究白细胞表面分化抗原81(CD81)的功能, 对草鱼CD81进行了克隆, CD81全长共1376 bp, 其中5'非翻译区87 bp, 3'非翻译区581 bp, 开放阅读框为708 bp, 包括8个外显子, 7个内含子, 编码235个氨基酸。实验采用实时荧光定量PCR的方法检测了CD81在健康草鱼不同组织中的表达情况及草鱼出血病病毒(GCRV)攻毒前后的表达变化情况。结果显示草鱼CD81在所有被检测组织中均有表达, 在头肾中表达量最高。在GCRV攻毒前后草鱼鳃、脾、肝、肠及头肾5个组织中的CD81表达量均有明显变化。同时, 采用绿色荧光蛋白(GFP)来示踪CD81的亚细胞表达部位, 激光共聚焦显微镜显示, 同人类一样, 草鱼CD81定位于细胞膜上。       

Molecular cloning, characterization and expression analysis of QM gene from grass carp (Ctenopharyngodon idellus) homologous to Wilms' tumor suppressor

QM, a novel gene that was originally identified as a tumor suppressor, has been cloned from species encompassing members of higher vertebrate, plant and fungal kingdoms, but it is not well documented in fish. In present study, a gene homologous to QM was obtained from grass carp (Ctenopharyngodon idellus) head kidney and spleen cDNA library. The full-length grass carp QM (GcQM) cDNA of 759 bp contains a short 5' UTR of 22 bp, a 3' UTR of 89 bp and an open reading frame of 648 nucleotides that translates into a 215-amino acid peptide with a molecular weight of 24.5 kDa. The predicted GcQM contains a series of functional motifs that belong to the QM family signature conserved among different species. Multiple alignment analysis reveals that GcQM shares an overall identity of 62.4% approximately 97.7% with other members of QM family. The fish QM has a closest genetic relationship to chicken homologue Jif-1. The GcQM expresses constitutively in spleen, heart and brain, and significantly up-regulated by Aeromonas hydrophila and grass carp haemorrhagic virus (GCHV) in head kidney, spleen and liver. The results suggest that grass carp QM homolog is an inflammatory stress inducible gene associated with anti-bacterial and viral defense, and it plays an important role in immune defense.     

Two novel ficolin-like proteins act as pattern recognition receptors for invading pathogens in the freshwater crayfish Pacifastacus leniusculus

To isolate pathogen-associated molecular patterns (PAMPs)-binding molecules, the bacterium, Staphylococcus aureus was used as an affinity matrix to find bacteria-binding proteins in the plasma of the freshwater crayfish, Pacifastacus leniusculus. Two new bacteria-binding ficolin-like proteins (FLPs) were identified by 2-DE and MS analysis. The FLPs have a fibrinogen-related domain (FReD) in their C-terminal and a repeat region in their N-terminal regions with putative structural similarities to the collagen-like domain of vertebrate ficolins and mannose binding lectins (MBLs). Phylogenetic analysis shows that the newly isolated crayfish FLP1 and FLP2 cluster separately from other FReD-containing proteins. A tissue distribution study showed that the mRNA expression of FLP occurred mainly in the hematopoietic tissue (Hpt) and in the hepatopancreas. Recombinant FLPs exhibited agglutination activity of Gram-negative bacteria Escherichia coli and Aeromonas hydrophila in the presence of Ca(2+) . The FLPs could bind to A. hydrophila, E. coli as well as S. aureus as judged by bacteria adsorption. Moreover, the FLPs may help crayfish to clear Gram-negative bacteria, but not Gram-positive bacteria which had been injected into the hemolymph. When Gram-negative bacteria coated with FLPs were incubated with Hpt cells, a lower death rate of the cells was found compared with control treatment. Our results suggest that FLPs function as pattern recognition receptors in the immune response of crayfish.     

草鱼β-防御素1的趋化活性及免疫佐剂效应研究

为了探究草鱼防御素的免疫调节作用, 研究通过Clustal Omega多序列比对和I-TASSER二级结构预测, 发现草鱼β-防御素1(Ctenopharyngodon idella β-defensin 1, CiBD1)是一类具有两亲性的富含半胱氨酸的小分子阳离子肽, 其结构在硬骨鱼类中高度保守; 通过构建pET-32a-CiBD1原核表达载体, IPTG诱导表达后经过Ni2+亲和层析法纯化和肠激酶酶切获得CiBD1重组蛋白, 通过CFU平板法验证了CiBD1的抑菌活性, 当蛋白浓度达到200 μg/mL时, 对革兰氏阴性菌(G+)及革兰氏阳性菌(G–)都具有显著的抑制活性; 趋化实验表明CiBD1在50 ng/mL时对草鱼原代白细胞趋化活性最佳; 通过个体实验探究了CiBD1重组蛋白对嗜水气单胞菌灭活疫苗的免疫佐剂效应, 发现添加 CiBD1佐剂组死亡率显著低于单独疫苗组, 且该组IgM和MHC Ⅱ转录水平及血清中补体3(C3)和溶菌酶含量都显著高于对照组。研究表明CiBD1重组蛋白在细菌抗感染免疫中发挥着重要作用, 在水产养殖中具有一定的应用前景。     

Effect of Maillard reaction products on the growth of selected food-poisoning micro-organisms

The activity of the Maillard reaction products (MRP) prepared by heating (15 h at 90°C) a solution of 1·71 mol/l glucose and 2·05 mol/l glycine at pH values 6·0 and 8·8, against food-poisoning micro-organisms, including Staphylococcus aureus, Listeria monocytogenes, Salmonella typhimurium, Salmonella enteritidis and Aeromonas hydrophila , was investigated. High and low pH MRPs strongly inhibited A. hydrophila , whereas Staph. aureus and L. monocytogenes were slightly inhibited by the high pH MRPs only and Salmonella strains were resistant to both.