~(125)Ⅱ标记病毒DNA探针制备方法的研究

本文报道以油桐尺蠖核型多角体病毒(BsNPV)DNA、单纯疤疹病毒(HSV)DNA、λDNA为材料,用国产~(125)I-碘化钠制备探针。探讨了离子强度,pH值、反应温度及时间诸因素对以三氯化铊为氧化剂核酸标记的影响。在pH值为4.8—4.9,离子强度(以Na~ 计)为0.1mol/L、反应温度为70℃、时间为30分钟条件下,可获得高比活性的产物。~(125)I的掺入率在10—30％之间,探针的比活性可超过10~6cpm/μgDNA。点杂交结果显示,探针最低可检测出1Pg同源DNA,探针的特异性强,存放于-20％冰箱的探针在两个月内最低检测量没有明显变化。     

提取SOD的关键之一是控制离子强度

从动物血中提取SOD时,磷酸盐缓冲液的离子强度大小是分离成功与否的关键因素。pH 7.4的磷酸盐缓冲液的离子强度低于6.000时,SOD不能从DEAE-纤维素柱上洗脱下来。故磷酸盐缓冲液的梯度洗脱浓度应为0.0025mol/L～0.25mol/L。并介绍了计算离子强度的公式。     

植物病毒检测芯片的杂交条件优化

利用芯片点样仪将5种侵染马铃薯的病毒/类病毒(苜蓿花叶病毒、黄瓜花叶病毒、黄瓜花叶病毒-卫星病毒、马铃薯病毒Y、马铃薯块茎纺锤状类病毒)的保守区寡核苷酸(Oligonucleotide,oligo)探针和PCR探针点样于玻片,并以植物18S rRNA作为内参照制成基因芯片。研究探针浓度、杂交时间、杂交温度以及点样液对芯片杂交的影响,并验证优化后病毒检测芯片的特异性。结果表明,寡核苷酸探针浓度介于5-20 ?mol/L之间对杂交信号强度影响不大,PCR探针浓度与杂交信号强度间呈线性关系;在45℃杂交4 h时,芯片的杂交信号最强,且该条件下进行杂交对两种探针芯片的影响趋势一致;点样液中以DMSO的杂交效果最好。经过整体条件优化后的两种探针芯片在杂交检测上具有较高的特异性,适于检测植物病毒。     

cDNA微阵列制作的优化

为了优化筛检cDNA微阵列中靶基因的最适长度、浓度及点样溶液的种类,设计持家基因betaactin和GAPDHRT PCR3对引物,产物长度在189～1078bp之间,以乙肝病毒DNA片段为阴性对照,扩增纯化后分别溶于3×SSC、50%DMSO及0.5mol/L碳酸盐缓冲液(pH=9.0)中,调整浓度分别为0.5μg/μL、1.0μg/μL和1.5μg/μL,比较上述不同条件的杂交结果。结果表明,杂交具有较好的特异性,阴性对照(乙肝病毒)和空白对照(点样溶液)均未见杂交信号;3种长度的同一靶基因杂交信号强度无明显差别(betaactinP=0.378;GAPDHP=0.866);3种点样溶液中以50%DMSO杂交信号最好,较强且均匀一致(P=0.0001),其余2种差异不显著(P=0.142);3种浓度靶基因杂交信号差异不显著(P=0.648),浓度高者信号略强。短片段靶基因(200bp左右)可获得与长片段靶基因(1000bp以上)一样较好的杂交信号,点样溶液以50%DMSO效果最好,靶基因浓度为0.5μg/μL时即可得到较好的杂交结果。     

产气荚膜梭菌实时荧光PCR方法的建立

目的:利用荧光定量PCR技术,建立快速敏感特异的检测产气荚膜梭菌的方法。方法:以产气荚膜梭菌基因为靶序列设计引物和探针,以自产气荚膜梭菌菌株中提取的DNA为模板,优化引物和探针的浓度比,同时验证方法的特异性、敏感性。结果:建立的反应体系在上游引物浓度为0.45μmol/L、下游引物浓度为0.15μmol/L、探针浓度为0.3μmol/L时,具有良好的特异性和敏感性,与创伤弧菌等12种相关细菌均无交叉反应;对纯菌检测的灵敏度低于10 CFU/反应体系。结论:建立的实时荧光PCR方法特异、灵敏、快速,能对战时气性坏疽做出快速准确的报告,实现对这种战时高发疾病的安全、快速和定量检测。     

双加氧酶α亚基保守序列克隆及探针制备

制备地高辛标记的环羟基化双加氧酶的α亚基保守序列探针。利用PCR法成功地克隆了环羟基化双加氧酶的α亚基保守序列310 bp片段,并对其进行测序。利用PCR法制备地高辛标记探针,对新标记的探针进行检测,结果显示其标记效率在0.1 pg/μL;敏感性检测表明,对同源DNA的检出限量为100 pg;对提取的副溶血性孤菌质粒DNA、短小芽胞杆菌总DNA杂交均呈阴性,说明该探针具有较强的特异性。     

尼氟灭酸对γ-氨基丁酸激活DRG神经元电流的作用

目的:观察尼氟灭酸(NFA)对大鼠背根神经节(DRG)神经元γ-氨基丁酸(GABA)激活电流的调制作用。方法:在新鲜分离的大鼠DRG神经元,应用全细胞膜片钳技术记录NFA和GABA激活电流。结果:部分DRG神经元(21/48,43.75%)外加NFA(0.1～100μmol/L)能引起浓度依赖性的外向电流,而大多数DRG神经元(150/159,94.32%)外加GABA(0.1～100μmol/L)则引起明显的浓度依赖性的内相电流。NFA-(100μmol/L)和GABA-(100μmol/L)激活电流的幅值分别是(0.27±0.06)nA(n=12)和(1.29±0.72)nA(n=53)。然而,预使用NFA(0.1～100μmol/L)能明显的抑制GABAA受体介导的内向电流。NFA的这一抑制作用也具有明显的浓度依赖性。但NFA没有改变GABA激活内向电流的EC50(大约30μmol/L)和翻转电位(大约-10mV)(P>0.05)。结论:预加NFA对GABA激活电流的峰值有明显的浓度依赖性的抑制作用。     

基于表面等离子共振扫描成像的DNA芯片的研究

基于表面等离子共振(surface plasmon resonance,SPR)技术的检测方法是一种灵敏度极高的光学检测方法,用于基因芯片的检测时具有高灵敏、免标记、无污染等优点,是一种很有发展潜力的芯片检测方法。将酵母Y5基因的特异性片段5′端修饰巯基后作为探针,利用单分子层自组装法把探针固定在金膜表面,应用列扫描表面等离子共振成像检测系统研究和分析DNA芯片上探针点阵的杂交信息,从而建立一套基于列扫描表面等离子共振检测系统的DNA芯片的制备和检测分析技术。实验结果表明:37℃条件下探针的最佳固定时间为5～7h,杂交特异性良好,杂交的最佳时间为5～30min。探针浓度低于0.5μmol/L时,杂交效率高而且SPR信号变化明显,探针浓度达到20μmol/L时SPR响应达到最大。     

酶法拆分制备(R)-苯基缩水甘油醚及缓冲体系对产物光学纯度的影响

新筛选出一株能选择性水解外消旋苯基缩水甘油醚(GPE)的菌株Bacillus megateriumZJUZQ-001,研究了其动力学拆分苯基缩水甘油醚条件,包括时间、温度、缓冲液类型和离子强度的影响。相比其他体系,硼酸缓冲液(100 mmol/L,pH 8.2)e.e._s值可以从91.2%提高到99.5%,E值从25.0提高到46.8,底物浓度从60 mmol/L增加到90 mmol/L。     

在非光合条件下外源蔗糖能促进蚕豆的气孔开放

蚕豆植株经暗饥饿处理40h后,取其下表皮,再用超声波“原位分离”下表皮上的保卫细胞对,然后在无菌、非光合条件下,用外源蔗糖处理蚕豆下表皮上的保卫细胞对,考察其对气孔开放的效应。结果发现,在1d的无菌培养过程中,蔗糖显著促进了气孔的开放。100mmol/L的蔗糖在10mmol/L的MES-NaOH/KOH(pH6.1)缓冲液中,开度分别增加2.0/2.6μm;在1μmol/L的气孔开放促进剂fusicoccin(FC)的存在下,100mmol/L的蔗糖在MES-NaOH/KOH(pH6.1)缓冲液中分别增加开度5.0/5.5μm。不同浓度（5～200mmol/L）的蔗糖处理结果表明气孔开度的增加与蔗糖浓度呈一定的正相关,浓度为100mmol/L的蔗糖处理表现出最大促进作用。同时还初步观察到,蔗糖可维持保卫细胞存活率和叶绿体的完整性。     

静息细胞转化生产3-羟基丙酸的条件优化

本文研究了静息细胞生物转化生产3-羟基丙酸的反应体系。考察了以甘油为底物,利用静息细胞转化生产3一羟基丙酸的相关因素,确定了最佳的转化条件：细胞浓度20g／L,甘油浓度20g／L,辅酶VB12浓度10mg／L,NAD＋浓度0．15mmol／L,温度35℃,反应体系为0．05mol／LpH7．0Tris—HCl缓冲液。在上述条件下反应6h后,3-羟基丙酸的产量达到为3．17g／L,底物转化率为28．33％。由上述结果可知,采用静息细胞转化法为3-HP的生物合成提供了一种可能的方法。     

荧光定量PCR检测人巨细胞病毒的方法学建立

目的建立人巨细胞病毒（HCMV）的TaqMan MGB探针荧光定量PCR（FQ—PCR）检测方法。方法选取HCMV MIE exon4为PCR扩增靶序列,经TA克隆构建重组质粒作为定量标准品,经FQ—PCR反应条件的优化及方法学评价,再将其应用于临床检测。结果FQ—PCR最适循环参数为：95℃ 5 min;95℃ 20 s,60℃ 60 s（40 cycles）,20μl最适反应体系为：2．0mmol／L Mg^2＋、0．5μmol／L引物、1．5μmol／L探针、200μmol／L dNTP、2110×buffer、1．0 U Taq酶、2．0μl DNA模板。检测批内CV（变异系数）值为1．32％,批间CV值为1．96％;特异性较好;线性范围为10^2-10^8copies／μl。结论成功地建立了检测HCMV的FQ—PCR法,完全适用于临床检测。     

两种DNA探针杂交检测结核分支杆菌方法的研究

为改进结核杆菌DNA探针的特异性与实用性,研制了以生物素标记的两种对结核分支杆菌特异的DNA探针:一个5’端标记的20bp的寡核苷酸探针和一个采用PCR方法合成的188bp长链探针。两种探针分别与结核分支杆菌的全染色体DNA,以及基因组上IS6110序列的一段317bp的PCR扩增产物进行斑点杂交,以碱性磷酸酶(AP)催化的染色反应检测,测试了两个探针的敏感性和特异性。系统地比较研究了两种探针杂交检测条件:探针的浓度选择,杂交温度与洗膜温度的选择,以及杂交与洗膜温度对检测的敏感性与特异性的影响。寡核苷酸探针和188bp探针杂交检测纯化结核分支杆菌基因组DNA的敏感性分别为100ng与6ng,杂交检测PCR产物的敏感性分别是400pg与50pg。两探针的最佳杂交浓度均为40～160ng/ml,最佳杂交温度分别是42℃与68℃,最佳洗膜温度分别是60℃与60～68℃之间。两种探针均仅与结核分支杆菌及BCG有杂交信号,而与其它受试分支杆菌及非分支杆菌杂交结果都呈阴性。它们的特异性都很强,但188bp探针的敏感性约是寡核苷酸探针的7～16倍,而且188bp探针检测本底较低,是检测结核分支杆菌的较佳选择     

Optimization of lab scale methanol production by <Emphasis Type="Italic">Methylosinus trichosporium</Emphasis> OB3b

Methylosinus trichosporium OB3b is a methanotrophic bacterium containing particulate methane monooxygenase (MMO), which catalyzes the hydroxylation of methane to methanol. The methanol is further oxidized to formaldehyde by methanol dehydrogenase (MDH). We developed a novel compulsory circulation diffusion system for cell cultivation. A methane/air mixture (1:1, v/v) was prepared in a tightly sealed gas reservoir and pumped into a nitrate mineral salt culture medium under optimal conditions (5 μM CuSO₄, pH 7.0, 30°C). Cells were harvested, washed, and resuspended (0.6 mg dry cells/mL) in a 500 mL flask in 100 mL of 10 mM phosphate buffer (pH 7.0) containing 100 mM NaCl and 1 mM EDTA as MDH inhibitors, and 20 mM sodium formate. A single 12 h batch reaction at 25°C yielded a final concentration of 13.2 mM methanol. The use of a repeated batch mode, in which the accumulated methanol was removed after each of three 8 h cycles over a 24 h period, showed a productivity of 2.17 μmol methanol/h/mg dry cell wt. Finally, a lab-scale reaction performed using a 3 L cylindrical reactor with a working volume of 1 L produced 13.7 mM methanol after 16 h. Our results identify a simple process for improving the productivity of biologically derived methanol and, therefore the utility of methane as an energy source.     

新型柱前衍生试剂分析草甘膦的高效液相色谱研究

以2,5-二甲氧基苯磺酰氯(DMOSC)为柱前衍生化试剂,建立了柱前衍生草甘膦的紫外检测反相高效液相色谱法,并优化了衍生化条件,得最佳条件:衍生温度35℃,时间15 min,pH 10.0,草甘膦与DMOSC的摩尔比为1∶6。HPLC分析条件:采用Kromasil C18柱,流速1.0 mL/min,柱温30℃,检测波长220 nm,流动相为甲醇-乙腈-磷酸盐缓冲溶液(0.02 mol/L、pH 5.5),三者的体积比为15∶5∶80。结果表明:草甘膦质量浓度在5~100μg/mL范围内线性关系良好,相关系数为0.996 2,检测限为0.067μg/mL。实验表明该方法反应条件温和,灵敏度高,衍生产物稳定。     

光照强度、温度、pH、盐度对小球藻（Chlorella）光合作用的影响

利用测定净光合放氧速率的方法研究了光照强度、温度、pH、盐度对小球藻（Chlorella sp.XQ-200419）和海洋小球藻（Chlorella marina NJ-016）光合作用的影响。小球藻（Chlorella sp.XQ-200419）的适宜光照强度范围为100～〉1600μmo·lm-2·s-1,光饱和点在500μmo·lm-2·s-1附近;适宜温度范围为25～42.5℃,最适温度为37.5℃;适宜pH值范围为6.5～9.0,最适pH值为7.0;对盐度的适应范围较广,在0～0.6mol/L范围内,随着盐度的升高,净光合放氧速率有下降趋势。海洋小球藻（Chlorella marina NJ-016）的适宜光照强度范围为400～〉1600μmol·m-2·s-1,光饱和点在1400μmo·lm-2.s-1附近;适宜温度范围为25～42.5℃,最适温度为37.5℃;适宜pH值范围为5.0～9.0,最适pH值为8.0;对盐度有很好的适应性,在0～0.6mol/L范围内,随着盐度升高,净光合放氧速率明显上升。小球藻和海洋小球藻的净光合放氧速率随光照强度、温度、pH值和盐度变化的规律,表明了两种小球藻的基本生理生态学特性：能适应较强的光照强度、较高的温度、中性偏碱的环境和较高的盐度。研究结果有助于小球藻培养条件的优化。两种小球藻对光照强度、温度、pH值和盐度变化的反应也有所不同：与小球藻（Chlorella sp.XQ-200419）相比,海洋小球藻（Chlorella marina NJ-016）对光照强度有更好的适应性,对pH值变化有更宽的适应范围,适当提高盐度对其光合作用有明显的促进作用。这表明海洋小球藻（Chlorella marina NJ-016）在快速生长繁殖方面具有更大的潜力,这一研究结果为筛选适合于大量培养的优良藻种提供了依据。     

环境因子对小球藻(Chlorella sp.XQ-20044)光合作用的影响

小球藻(Chlorella sp.XQ-20044)是一株具有应用潜力的产油微藻,本文利用测定净光合放氧速率的方法研究了光照强度、温度、pH值和盐度对其光合作用的影响。研究结果表明:小球藻适宜的光照强度为500~1200μmol·m-2·s-1,光补偿点约30μmol·m-2·s-1,光饱和点在600μmol·m-2·s-1附近;光合作用适宜的温度范围为30~42.5℃,最适温度为40℃;适宜的pH值范围7.0~10.0,最适pH值为8.0;适宜盐度范围0.1~0.3 mol/L,最适盐度为0.2 mol/L。从光合作用特性来看,小球藻能适应较强的光照强度、较高的温度、偏碱性和较高的盐度环境,其中可耐受较高盐度的特性,有助于预防敌害生物的污染,对于实现规模培养,特别是利用开放系统进行规模培养较为有利。     

Spectrofluorimetric determination of 5-hydroxytryptamine using chlorosulphonylthenoyltrifluoroacetone-europium probe.

A new spectrofluorimetric method was developed for the determination of trace amounts of 5-hydroxytryptamine (5-HT). Using chlorosulphonylthenoyltrifluoroacetone (CTTA)-europium (Eu(3+)) ion as a fluorescent probe in a buffer solution at pH 11.0, 5-HT can remarkably enhance the fluorescence intensity of the CTTA-Eu(3+) complex at lambda = 612 nm; the enhanced fluorescence intensity of Eu(3+) is proportional to the concentration of 5-HT. Optimum conditions for the determination of 5-HT were also investigated. The linear range and detection limit for the determination of 5-HT were 1.0 x 10(-7)-1.2 x 10(-5) mol/L and 8.5 x 10(-8) mol/L, respectively. This method is simple, practical and relatively free of interference from coexisting substances, and can be applied to assess 5-HT in urine samples.