中国南瓜曲叶病毒ＤＮＡ Ａ的克隆及其全序列

对引起我国南瓜曲叶病的病毒分离物ＤＮＡ的克隆和序列分析表明,中国南瓜曲叶病毒ＤＮＡ Ａ由２７４１个核苷酸组成,共编码６个开放阅读框（ＯＲＦ）,其中病毒链有２个ＯＲＦ：ＡＶ１（２５６aa)和ＡＶ２（１４０aa),ＡＶ１为外壳蛋白基因;病毒链的互补链有４个ＯＲＦ,ＡＣ１（２４３aa)编码复制酶基因,ＡＣ２（134aa)编码反式激活蛋白,ＡＣ３（１３６aa)和ＡＣ４（１７２aa),该病毒属于旧世界Ｂegomoviruses,是一个粉虱传播的联体病毒。     

侵染广西罗汉果的小西葫芦黄花叶病毒的鉴定及抗血清制备

在广西临桂罗汉果花叶畸形病株上获得了一个线状病毒分离物LGL-1,寄主范围、蚜传能力测定、病毒粒子形态和细胞病理特征研究表明,它是马铃薯Y病毒科成员.采用马铃薯Y病毒科特异性简并引物做PCR扩增,并测定了分离物LGL-1的基因组3′-末端序列,序列分析表明它是小西葫芦黄花叶病毒（ZYMV）.系统进化树分析揭示,世界范围内的ZYMV分离物主要可分为3大群体,分离物LGL-1为中国特有群体Group Ⅲ成员.原核表达制备了分离物LGL-1的外壳蛋白抗血清,明确了ZYMV是引起广西罗汉果病害的主要病毒,并且比较了原核表达法和提纯病毒法制备的抗血清,在病样的间接ELISA法检测中结果的差异.     

Chinese tomato yellow leaf curl virus--a new species of geminivirus

ＧｅｍｉｎｉｖｉｒｕｓｅｓａｒｅａｇｒｏｕｐｏｆｐｌａｎｔｖｉｒｕｓｅｓｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚｅｄｂｙｔｈｅｉｒｃｉｒｃｕｌａｒｓｉｎｇｌｅｓｔｒａｎｄｅｄＤＮＡ(ｓｓＤＮＡ)ｇｅｎｏｍｅａｎｄａｕｎｉｑｕｅｇｅｍｉｎａｔｅｐａｒｔｉｃｌｅｍｏｒｐｈｏｌｏｇｙ[1].Ｇｅｍｉｎｉｖｉｒｕｓｅｓａｒｅｄｉｖｉｄｅｄｉｎｔｏｔｈｒｅｅｓｕｂｇｒｏｕｐｓｏｎｔｈｅｂａｓｉｓｏｆｇｅｎｏｍｅｏｒｇａｎｉｚａｔｉｏｎａｎｄｉｎｓｅｃｔｖｅｃｔｏｒ:ＡｌｌｓｕｂｇｒｏｕｐＩｇｅｍｉｎｉｖｉｒｕｓｅｓａｒｅｌｅａｆ…     

木尔坦棉花曲叶病毒基因重组和缺失产生DNAβ相关的新型小分子

【目的】棉花曲叶病是棉花生产上的一种重要的病毒病害,在巴基斯坦和印度等国家地区大面积流行,造成严重的经济损失。近年在中国广西南宁的棉花田间发现了棉花曲叶病害,在广西的黄秋葵中也发生了曲叶病,二者的病原均为木尔坦棉花曲叶病毒(Cotton Leaf Curl Multan Virus,CLCuMV),为了对这2个病害有更深的了解,本文对该双生病毒伴随的DNA小分子进行测序分析。【方法】分别从广西南宁地区感染CLCuMV的3棵棉花和3棵黄秋葵中提取总DNA,用CLCuMV DNAβ的特异引物进行PCR扩增,将产物分离纯化并克隆测序,进行序列比对分析。【结果】从棉花曲叶病害中分离得到了1384 nt的新型重组DNA分子,以及从黄秋葵曲叶病害中分离得到了754 nt的新型缺失型DNA分子。研究结果表明1384 nt重组分子是由CLCuMV GX1的DNA-A和DNAβ重组而成。重组分子大部分来源于CLCuMV的DNA-A,包含基因间隔区,附近的部分AV2和AC1基因,以及反向互补的部分AC3基因。其余部分来源于伴随的DNAβ,包含A-rich区域。分析拼接片段的附近序列,发现接头部分含有2-3个共同碱基,推测为重组作用发生的位点。与以前报道的在实验室中产生的CLCuMV重组分子进行比较显示,DNA-A的基因间隔区和DNAβ的A-rich区在重组过程中非常保守。另外,754 nt的重组小分子是由CLCuMV Okra1 DNAβ缺失突变产生,缺失了大部分的编码C1蛋白开放阅读框(Open Reading Frame,ORF)以及小部分的A-rich区。【结论】本研究在自然条件下分离到了来源于CLCuMV和卫星DNAβ的重组分子,以及DNAβ缺陷型分子。这2种重组小分子以前未见报道,这也是在中国发现的棉花曲叶病毒中首次发现重组分子。这种基因组变异现象在棉花曲叶病毒的进化和寄主适应过程中可能有重要的意义。     

广西黄瓜绿斑驳花叶病毒（CGMMV）黄瓜分离物的RT—PCR检测及CP基因序列分析

利用黄瓜绿斑驳花叶病毒（Cucumber Green Mottle Mosaic Virus,CGMMV）的特异性引物对来自广西一温室栽培的黄瓜病样进行RT—PCR检测,结果扩增得到了与预期大小相符的目的片段（650bp）。序列分析表明,该目的片段包含有CGMMV完整的CP基因序列、部分运动蛋白基因（MP）及3’端非编码区（3＇-UTR）序列,其中CP基因全长486bp,与已报道的CP基因序列同源性为91．2％～99．4％。经系统发育分析,明确该GX-CS分离物与日本、法国、印度等分离物属于CGMMV同一类群,并推测该分离物与广西的葫芦（GX—BG）分离物具有相同的起源关系。     

中国番茄黄化曲叶病毒——双生病毒的一个新种

用 2 0个单抗对中国番茄黄化曲叶病毒 (TYLCV CHI)和其他双生病毒进行了测定 ,在血清学水平上证实中国番茄黄化曲叶病毒与中国烟草曲叶病毒有较大的亲缘关系 ;同时报道了TYLCV CHI部分共同区、外壳蛋白N端基因和AV1基因的PCR及其克隆和序列分析 ,从分子水平上证实TYLCV CHI与世界各地的其他双生病毒不同 ,是一种新的粉虱传双生病毒     

中国南瓜曲叶病毒DNAA的克隆及其全序列

对引起我国南瓜曲叶病的病毒分离物DNA的克隆和序列分析表明,中国南瓜曲叶病毒DNA A由2741个核苷酸组成,共编码6个开放阅读框(ORF),其中病毒链有2个ORF：AV1(256aa)和AV2(140aa),AV1为外壳蛋白基因;病毒链的互补链有4个ORF,AC1(243aa)编码复制酶基因,AC2(134aa)编码反式激活蛋白,AC3(136aa)和AC4(172aa),该病毒属于旧世界Begomoviruses,是一个粉虱传播的联体病毒。