紫茉莉抗病毒蛋白（Mirabilis antiviral protein，MAP）的空间结构和与底物相互作用的模拟研究

首先应用同源构筑方法建立了低序列同源性的紫茉莉抗病毒蛋白（ＭｉｒａｂｉｌｉｓａｎｔｉｖｉｒａｌＰｒｏｔｅｉｎ,ＭＡＰ）的空间结构,然后对此粗结构进行了分子动力学优化。最后通过对ＭＡＰ,ＴＣＳ与其底物类似物的相互作用,了解ＲＩＰ特异糖苷酶活性的机制。结果表明模拟结构是合理的。ＲＩＰ特异糖苷酶活性主要是由于酶的活性口袋与底物的特殊构象相互匹配。     

天花粉蛋白与底物类似物GAGA相互作用的计算机图象模拟

以天花粉蛋白（ＴＣＳ）晶体结构模型作为ＲＩＰｓ的代表,ＲＮＡ四核苷酸ＧＡＧＡ作为底物类似物,用计算机图象模拟建立了ＴＣＳ和ＧＡＧＡ相互作用的模型。利用这一模型解释了ＲＩＰｓ的Ｎ－糖苷酶活性的作用机制。这一模型对专一性识别也能解释,且与一些生化实验结果相符;对某些实变体的活性改变也能有相应的解释．