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ＨｏｍｏｐｙｒｉｍｉｄｉｎｅｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓｃａｎｂｉｎｄｔｏｔｈｅｍａｊｏｒｇｒｏｏｖｅｏｆｄｕｐｌｅｘＤＮＡａｔｈｏｍｏｐｕｒｉｎｅｈｏｍｏｐｙｒｉｍｉｄｉｎｅｓｅｑｕｅｎｃｅｓ,ｆｏｒｍｉｎｇａｌｏｃａｌｔｒｉｐｌｅｈｅｌｉｘ[1—3].ＴｈｅｒｅａｒｅｓｏｍｅｋｉｎｄｓｏｆｔｒｉｐｌｅｘＤＮＡ,ｕｎｉｍｏｌｅｃｕｌａｒｏｒｂｉｍｏｌｅｃｕｌａｒｏｒｔｅｒｍｏｌｅｃｕｌａｒｔｒｉｐｌｅｘｗｈｉｃｈｃｏｎｓｉｓｔｓｏｆｏｎｅｏｒｔｗｏｏｒｔｈｒｅｅｓｔｒａｎｄｓｏｆＤＮＡ,ｒｅｓｐｅ… 相似文献
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血小板表面的整合蛋白aⅡbb3对血栓的形成具有很重要的调控作用, aⅡbb3与纤维蛋白原上的RGD特征序列结合, 促进血小板凝集进而形成血栓。这样可以在理论上设计一个环形RGD小分子(RGD-c)与aⅡbb3蛋白结合, 阻断其与纤维蛋白原的结合位点, 进而阻断血栓形成。以糖蛋白avb3(pdb 代码 1jv2)作为模板, 利用modeller8v2软件进行同源模拟得到aⅡbb3三维模型。而小分子则以RGD序列为主, 两边各加一个氨基酸X、Y, X和Y之间用一个二硫键相连, 通过改变X和Y, 重复优化过程则可得到不同的小分子模型, 将其与aⅡbb3进行分子对接, 可以找出比较理想的XY组合, 对治疗血栓的药物设计具有重要的理论指导作用 相似文献
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血小板表面的整合蛋白aⅡbb3对血栓的形成具有很重要的调控作用, aⅡbb3与纤维蛋白原上的RGD特征序列结合, 促进血小板凝集进而形成血栓。这样可以在理论上设计一个环形RGD小分子(RGD-c)与aⅡbb3蛋白结合, 阻断其与纤维蛋白原的结合位点, 进而阻断血栓形成。以糖蛋白avb3(pdb 代码 1jv2)作为模板, 利用modeller8v2软件进行同源模拟得到aⅡbb3三维模型。而小分子则以RGD序列为主, 两边各加一个氨基酸X、Y, X和Y之间用一个二硫键相连, 通过改变X和Y, 重复优化过程则可得到不同的小分子模型, 将其与aⅡbb3进行分子对接, 可以找出比较理想的XY组合, 对治疗血栓的药物设计具有重要的理论指导作用 相似文献
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运用分子力学方法研究了 2 0个双分子三螺旋DNA ,其嘧啶链序列是 5′- dTTCTTTTC- L1TTTL5 -CTTTTCTT -3′,划线的 5个核苷酸组成loop环 ,L1和L5可以是任意的核苷酸 ;嘌呤链的序列是 5′- GAAAAGAA 3′和 5′- AAGAAAAG -3′ ;2条链方向相反 .对 2 0个不同loop序列双分子三螺旋DNA稳定性的研究结果表明 ,5′- loop三螺旋比相应的 3′- loop三螺旋更稳定 ,嘌呤比嘧啶与相邻碱基的堆积作用大 .2 0个三螺旋DNA的相对稳定性主要是由loop环上L1和L5碱基组成不同决定的 相似文献
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