| aⅡbb3同源模拟和环形RGD药物小分子设计 |
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| 引用本文： | 罗明艳,陈梅宗,李任植.aⅡbb3同源模拟和环形RGD药物小分子设计[J].微生物学报,2008,24(2):297-301. |
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| 作者姓名： | 罗明艳 陈梅宗 李任植 |
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| 作者单位： | 南开大学物理科学学院, 天津 300071; 南开大学泰达应用物理学院, 天津 300457;南开大学物理科学学院, 天津 300071; 南开大学泰达应用物理学院, 天津 300457;南开大学物理科学学院, 天津 300071; 南开大学泰达应用物理学院, 天津 300457; 南开大学生物活性材料教育部重点实验室, 天津 300071 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助 (No. 20050055037)。 |
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| 摘 要： | 血小板表面的整合蛋白aⅡbb3对血栓的形成具有很重要的调控作用, aⅡbb3与纤维蛋白原上的RGD特征序列结合, 促进血小板凝集进而形成血栓。这样可以在理论上设计一个环形RGD小分子(RGD-c)与aⅡbb3蛋白结合, 阻断其与纤维蛋白原的结合位点, 进而阻断血栓形成。以糖蛋白avb3(pdb 代码 1jv2)作为模板, 利用modeller8v2软件进行同源模拟得到aⅡbb3三维模型。而小分子则以RGD序列为主, 两边各加一个氨基酸X、Y, X和Y之间用一个二硫键相连, 通过改变X和Y, 重复优化过程则可得到不同的小分子模型, 将其与aⅡbb3进行分子对接, 可以找出比较理想的XY组合, 对治疗血栓的药物设计具有重要的理论指导作用
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| 关 键 词： | aⅡbb3 同源模拟 对接 RGD-c MM |
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