鸭肠炎病毒感染对鸭肠道黏膜组织转录组变化分析

为了探究鸭肠炎病毒感染对鸭十二指肠黏膜组织相关免疫基因的变化影响,本试验采用鸭肠炎病毒接种35日龄的健康樱桃谷鸭,将其分为3组(2个试验组和1个对照组),在感染后24 h、48 h采集十二指肠,提取总RNA进行浓度、纯度及完整性检测后构建cDNA文库,使用BGISEQ-500平台对2个实验组和对照组黏膜组织测序,筛选差异表达基因,并用GO和KEGG数据库进行分析。结果显示,2个实验组感染鸭肠炎病毒后T24和T48分别筛选出共720个差异表达基因,其中T24表达上调58个,下调163个;T48表达上调77个,表达下调422个。GO功能注释结果显示,感染后差异基因都与代谢、免疫、炎症和调控途径等密切相关。KEGG通路富集分析发现,感染T24的差异表达基因富集到神经活性配体-受体相互作用、补体和凝血级联、氮代谢、cAMP信号通路和IL-17信号转导通路;感染T48的主要差异表达基因富集到神经活性配体-受体相互作用、细胞因子-细胞因子-受体相互作用、趋化因子信号通路、造血细胞谱系和补体和凝血级联。借助BGISEQ-500平台对鸭肠炎病毒感染后十二指肠黏膜组织相关因子的变化来探究其致病机制及其他生物学通路,弥补了非模式生物转录组研究中缺乏基因信息的不足。     

陆地棉枯萎病抗性基因的等位性测定及连锁分析

1995-1996年,对我国育成的有代表性的5个抗病品种进行抗枯萎病基因的等位性测定。结果表明:在所选用的5个抗病品种中至少存在两个不同的抗病基因(暂定名为Fwl和Fw2)。连锁分析显示:Fwl与T586的8个标志性状间、Fw2与T582、T586的13个标志性状间无连锁关系。 Abstract:Allelism in vestigation of genes resistante to Fusarium wilt in cotton suggested that there were 2 genes(assigned symbols Fw1 and Fw2)in 5 cultivars used.No linkage was found between Fw1 and the marker genes in T586 and between Fw2 and those marker genes in T582 and T586.     

玉米ZmSOD基因克隆及其在干旱胁迫下的表达

为探讨超氧化物歧化酶(superoxide dismutase，SOD)基因在玉米抗逆反应中的作用，研究选用2个抗旱性有明显差别的玉米品种为试验材料，采用RT-PCR、实时荧光定量PCR(qRT-PCR)及二维凝胶电泳(2-DE)耦联的基质辅助激光解吸电离/飞行时间质谱(MALDI-TOF)法，对ZmSOD基因的序列结构及其在干旱胁迫下的表达特性进行分析。结果表明：(1)从干旱敏感品种‘登海605’(DH605)和抗旱品种‘蠡玉35’(LY35)玉米叶片中分别成功克隆出ZmSOD1和ZmSOD2基因。DH605中ZmSOD1开放阅读框(ORF)全长456 bp，编码151个氨基酸，编码的蛋白等电点为5.76，分子量为15.05 kD。LY35中ZmSOD2ORF全长459 bp，编码152个氨基酸，编码的蛋白等电点为5.65，分子量为15.11 kD；ZmSOD1和ZmSOD2是亲水性稳定蛋白，都含有Cu/Zn-SOD结构域，蛋白序列N端无信号肽及无跨膜结构域。同源性和系统进化分析表明，玉米ZmSOD和谷子Cu/Zn-SOD2的亲缘关系最近，相似性高达96.05%。(2)在干旱条件下，ZmSOD1在DH605中转录水平明显降低，LY35中ZmSOD2转录水平显著升高；2-DE耦联的质谱分析显示：ZmSOD1在DH605中表达量明显降低，LY35中ZmSOD2表达量无显著性变化，却检测到Mn-SOD蛋白表达量显著增加。(3)相关分析显示，干旱条件下，DH605叶片中ZmSOD1转录水平和其蛋白丰度及SOD酶活性呈极显著性正相关，LY35叶片中ZmSOD2转录水平与SOD酶活性呈显著性正相关。研究结果为进一步探索SOD基因在调节玉米抗性以及逆境胁迫应答过程中的作用机制提供了基础。