Maspin在卵巢癌中作用机制的体外研究

目的:检测卵巢癌细胞中Maspin对细胞增殖能力、VEGF和乙酰肝素酶Heparanase(HPA)表达的影响。方法:构建Maspin真核表达质粒,体外转染卵巢癌SKOV3细胞,磺基罗丹明B法((sulforhodamine B,SRB)检测转染后细胞增殖能力变化,细胞免疫化学及半定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测VEGF和HPA的表达。结果:成功构建Maspin真核表达质粒并转染于卵巢癌细胞SKOV3后,证实转染目的基因的SKOV3-Maspin细胞中Maspin表达明显增强;转染Maspin cDNA的SKOV3细胞的体外增殖能力明显弱于转染空载体组和未转染组,而后两者之间差异无显著性;转染Maspin cDNA的SKOV3细胞中VEGF的表达明显弱于转染空载体组和未转染组,而后两者之间差异无显著性;但是HPA的表达无明显改变。结论:Maspin可能通过下调VEGF的表达抑制卵巢癌血管生成。HPA表达与卵巢癌的恶性生物学行为密切相关,但与Maspin无明显相关性。     

矩阵设计检测金针菇转化子外源DNA插入位点

插入位点分析对于金针菇功能基因组学的研究极为重要,分析方法常用反向PCR、热不对称交错PCR、Tail-PCR、染色体步移等,存在操作复杂、消耗时间长、特异性较差、效率低等缺点。近年来开始应用基因组重测序的方法,对转化子逐一测序与分析,工作量较大、费用较高。本研究应用矩阵设计,把多个转化子的DNA混合构成样品池,重测序后分析插入位点,M个样品池的测序数据可分析M×(M+1)/2个转化子的插入位点。应用矩阵设计构建6个样品池检测21个转化子,获得21个插入位点,表明这种方法可行、适合大样本分析,如突变体库。     

金针菇交配型B第三个亚位点的发现与遗传

本研究在分析金针菇减数分裂重组热点时发现B交配型位点可能存在第三个亚位点,为此对同核菌株‘6-3’和‘6-21’的B交配型位点进行全基因组注释,获得8对同源信息素受体基因（pheromone receptor gene,pr）和3对同源信息素前体基因（pheromone precursor gene,pp）,组成了2个结构完整、相距326kb的亚位点α和β;‘6-21’菌株还发现1个‘6-3’菌株不具有的pr,组成第3个亚位点γ,它与亚位点α和β没有连锁。‘6-3’和‘6-21’配对形成异核体后出菇,分离获得142个单孢菌株,其B交配型有8种基因型,通过亲和性试验得到证实,同时还验证了第3个亚位点γ具有与α、β相同的功能。     

金针菇细胞色素c过氧化物酶基因（ffccp）及其在菌柄伸长的差异表达初步分析

细胞色素c过氧化物酶（cytochrome C peroxidase,CcP）是细胞内H₂O₂的主要降解酶,参与真菌的氧化应答过程。本研究基于基因组数据获得一个金针菇细胞色素c过氧化物酶编码基因,命名为ffccp。该基因全长1 913bp,包含一个1 098bp的完整开放阅读框,编码365个氨基酸。生物信息学分析结果显示,该基因编码的蛋白质（FfCcP）无跨膜结构和信号肽,不形成二硫键结构,亚细胞定位于线粒体上,具备血红素结合蛋白的保守位点。序列比对和进化分析结果显示,金针菇与糙皮侧耳Pleurotus ostreatus等大型真菌的CcP序列高度相似（相似度均超过70%）,属于CcP家族蛋白。RT-qPCR的检测结果显示,氧化胁迫和损伤胁迫均能诱导ffccp基因上调表达,但两种胁迫对ffccp表达的调控机制可能并不相同。进一步检测ffccp在子实体发育过程中的差异表达情况,发现ffccp在伸长期菌柄出现显著上调表达,且表达量与菌柄伸长速度的相关性达到0.998,为极强正相关。推测ffccp的上调表达可能有利于菌柄的伸长。     

子宫肌瘤组织中HMGI-C基因的表达与肌瘤大小之间关系

目的 探讨了HMGI-C基因的表达与子宫肌瘤瘤体大小之间的关系.方法 120例子宫肌瘤标本及临近的正常子宫肌层标本来源于81名子宫肌瘤患者经子宫全切除术和子宫次全切除术的标本.通过RT-PCR和免疫组织化学方法分别检测子宫肌瘤和正常子宫肌层的HMGI-C基因蛋白的表达含量,并将其分为Ⅰ组:HMGI-C表达阳性的子宫肌瘤组,Ⅱ组:HMGI-C表达阴性的子宫肌瘤组,Ⅲ组:正常子宫肌层组.结果 所有子宫肌瘤标本的直径范围在1.0～17.6cm.平均直径为7.5±0.24cm.有HMGI-C基因表达的子宫肌瘤标本的平均直径(12.1±2.9cm)明显大于无HMGI-C基因表达的子宫肌瘤标本的平均直径(6.9±3.0cm)(P=0.003).根据全部标本的平均直径将子宫肌瘤标本分为直径＞7.5cm的子宫肌瘤标本组和直径≤7.5cm的子宫肌瘤标本组,前者的HMGI-C基因的阳性表达比率也明显高于后者(P＜0.001).结论 本实验提示HMGI-C基因在子宫肌瘤组织中的表达与肌瘤瘤体大小有明显的相关性,HMGI-C基因可能促进子宫肌瘤细胞的生长.     

调控葡萄酒石酸生物合成VvbHLH79基因克隆及表达分析

【目的】葡萄是典型的酒石酸积累型果实,酒石酸不仅影响葡萄果实的味道,还决定葡萄酒的色泽、口感、微生物稳定性和陈酿潜力,但调控酒石酸生物合成的转录因子及机制尚不明确。【方法】bHLH转录因子参与调控植物的生长发育、次生代谢和抗逆性等多种生物学过程,课题组前期筛选到1条与酒石酸生物合成相关的bHLH转录因子。研究以酿酒葡萄‘琼瑶浆’、‘马瑟兰’为试验材料,采用PCR方法从中克隆到与酒石酸含量相关的VvbHLH79转录因子,对其进行生物信息学和亚细胞定位分析;利用HPLC和qRT-PCR技术测定葡萄果实在不同发育时期的酒石酸含量和VvbHLH79的表达量;并构建植物表达载体,使用农杆菌介导的果梗侵染法瞬时转化葡萄幼果果实之后检测VvbHLH79的表达量和酒石酸含量,以明确VvbHLH79基因在葡萄果实中对酒石酸含量的作用,为进一步探究VvbHLH79在调控葡萄酒石酸生物合成的分子机制奠定基础。【结果】结果表明：（1）通过RNA-seq测序筛选获得1个葡萄VvbHLH79基因,该基因CDS序列全长831 bp,编码277个氨基酸,相对分子量为66.22kD,理论等电点为5.15,属于无信号肽和跨膜结构的不稳定亲水性蛋白;氨基酸序列第147-232位含有bHLH-SF保守结构域,属于bHLH转录因子家族;亚细胞定位在细胞核。（2）同源序列比对和系统进化树结果显示,葡萄VvbHLH79编码蛋白与河岸葡萄中的bHLH89编码的蛋白（登录号：XP_034699340.1）序列一致性最高,达到99.64%。（3）qRT-PCR分析表明,VvbHLH79随着‘琼瑶浆’果实的发育,相对表达量在降低,从座果期到成熟期降低了67.25%左右;HPLC测定结果显示,酒石酸的积累主要在葡萄果实转色之前,转色之后酒石酸含量就快速下降。（4）VvbHLH79在低酒石酸葡萄果实中瞬时过表达后使酒石酸含量显著升高,而将VvbHLH79在高酒石酸葡萄果实中沉默后酒石酸含量显著下降,证实了VvbHLH79基因正向调控酒石酸含量。【结论】研究推测,VvbHLH79转录因子可能在葡萄酒石酸生物合成通路中发挥作用。