青藏高原5种害鼠D型肉毒素抗性相关基因VAMP1的序列分析

突触小泡相关膜蛋白1基因(VAMP1)的变异是导致鼠类对D型肉毒梭毒素灭鼠剂产生抗性的主要原因。本研究利用转录组测序的方法,分析青藏高原地区5种主要害鼠:高原鼠兔(Ochotona curzoniae)、高原鼢鼠(Eospalax baileyi)、长尾仓鼠(Cricetulus longicaudatus)、青海松田鼠(Neodon fuscus)和喜马拉雅旱獭(Marmota himalayana)的VAMP1序列信息。同时,分别采集来自5个地理种群的58只高原鼠兔和59只高原鼢鼠,对VAMP1基因第二外显子区序列进行分析。结果显示,从转录组组装文件中成功获得5种动物的VAMP1基因全序列,长度均为357 bp,共检测到46个核苷酸变异位点和4个氨基酸变异位点,但未发现与D型肉毒素抗性相关的氨基酸位点。对高原鼠兔群体和高原鼢鼠群体的VAMP1基因第二外显子序列的分析显示,高原鼠兔所有个体的序列高度保守,而在高原鼢鼠中则存在一个同义突变位点,但两物种在D型肉毒素抗性相关位点上都未监测出位点变异。该研究结果提示,D型肉毒杀鼠剂在青藏高原地区害鼠防治方面应该可以长期发挥重要作用。     

产气荚膜梭菌前噬菌体的分布特点及遗传进化分析

【目的】分析和研究产气荚膜梭菌中前噬菌体的分布情况、基因组特点及遗传进化关系。【方法】利用PHASTER (phage search tool enhanced release)软件预测产气荚膜梭菌携带的前噬菌体,基于ANI (average nucleotide identity)值对前噬菌体进行分群,利用CARD (comprehensive antibiotic research database)、Res Finder 4.1、VFDB (virulence factors database)和Bac Met(antibacterial biocide&metal resistance genes database)分析前噬菌体携带的耐药基因、毒力基因、抗菌剂/金属离子抗性基因,利用CRISPRCas Finder分析产气荚膜梭菌的CRISPR-Cas系统,利用MEGA 7.0进行前噬菌体的遗传进化关系分析。【结果】产气荚膜梭菌平均携带前噬菌体2.67条,其长度呈双峰分布,平均占基因组2.23%;前噬菌体不携带耐药基因,但携带了α毒素、唾液酶和溶血素等毒力基因以及重金属...     

食物及洞道密度对高原鼠兔冬季死亡率的影响

本研究在野外围栏条件下采用2×2 析因实验设计,通过最小存活数法分别统计冬季前后种群数量,测定附加食物及洞道密度对高原鼠兔冬季死亡率的影响,旨在检验栖息地质量对降低高原鼠兔冬季死亡率的效应。4种野外实验处理2 个重复的研究结果表明,夏季无附加食物与低密度洞道处理组高原鼠兔冬季死亡率为71% ;而附加食物和高密度洞道处理冬季死亡率仅为47% ;添加食物和低密度洞道及无附加食物和高密度洞道处理组种群死亡率分别为60% 和53% 。每一处理组雌性死亡率均显著低于雄性。夏季添加食物和增加洞道密度均能明显地降低高原鼠兔种群冬季死亡率,但无显著的交互作用。     

小反刍兽疫病毒诱导巨噬细胞产生炎症反应

[目的]探究小反刍兽疫病毒(Peste des petits ruminants virus, PPRV)感染引起的炎症反应并解析其致病机制。[方法]分离山羊肺泡巨噬细胞(PAM),利用qRT-PCR、ELISA及组织病理切片HE染色等方法分别检测PPRV感染后引起的炎性细胞因子表达、一氧化氮(NO)含量和炎性细胞侵润等现象。进一步利用转录组学测序分析PPRV感染PAM引起的差异基因、信号通路以及差异基因的表达情况。[结果]与正常山羊相比,感染PPRV的山羊其肝脏、肾脏及肺脏的部分细胞坏死并且呈现炎性细胞侵润的现象;与对照组相比,感染后的PAM细胞显著增加了NO含量(P<0.001);与未感染组相比,PPRV感染的PAM其炎性细胞因子IL-1β、TNF-α、IL-10等mRNA表达水平显著升高(P<0.05);此外,PPRV感染诱导的差异基因主要集中在炎症通路及NF-κB信号通路等。[结论]PPRV通过诱导大量炎性细胞侵润、增加炎性细胞因子表达,激活炎症信号通路从而产生炎症反应。     

粪菌移植对高原环境下SD大鼠体质量、血常规指标及肠道菌群的影响

目的 探究粪菌移植对低海拔动物的高原适应性的影响。方法 将30只雄性SD大鼠随机分为3组，每组10只，即模拟高原环境组（H组）、模拟高原环境+抗生素预处理组（HA组）及模拟高原环境+抗生素预处理+高原鼢鼠粪菌组（HAM组）。粪菌移植结束，持续饲养3周后，将所有组大鼠转移至模拟海拔6 000 m环境低压氧舱饲养30 d。测定粪菌移植对SD大鼠体质量、血常规指标及肠道菌群的影响。结果 HAM组、HA组和H组3组大鼠间平均日采食量比较差异无统计学意义（F=2.928,P>0.05）,H组大鼠平均日增重显著低于HA组、 HAM组（F=3.951, P<0.05）; HA组大鼠中性粒细胞数量较H组、HAM组分别上升7.85%和51.27%,HA组大鼠单核细胞数、单核细胞百分比显著高于H组、HAM组（F=5.131、4.325，均P<0.05）;HAM组、HA组和H组大鼠肠道菌群的优势菌门以拟杆菌门（Bacteroidetes）、厚壁菌门（Firmicutes）为主。HAM组大鼠肠道菌群的毛螺菌科（Lachnospiraceae）的相对丰度显著高于HA组、H组（F=8.545, ...