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青藏高原5种害鼠D型肉毒素抗性相关基因VAMP1的序列分析
引用本文:黄岩淦,赵芳,张同作,李生庆,李志宁,林恭华,苏建平.青藏高原5种害鼠D型肉毒素抗性相关基因VAMP1的序列分析[J].动物学杂志,2017,52(1):42-48.
作者姓名:黄岩淦  赵芳  张同作  李生庆  李志宁  林恭华  苏建平
作者单位:1. 中国科学院西北高原生物研究所 西宁810008;中国科学院大学 北京100049;2. 中国科学院西北高原生物研究所 西宁810008;青海省动物生态基因组学重点实验室 西宁810008;3. 青海省畜牧兽医科学院 西宁810016
基金项目:青海省科技支撑计划项目(2014-NS-113);青海省科技项目(2014-NS-118);* 通讯作者,E-mail: lingonghua@nwipb.cas.cn, jpsu@nwipb.ac.cn第一作者介绍 黄岩淦,女,硕士研究生;研究方向:动物生态学;E-mail: huangyangan14@163.com 100049; ③Qinghai Key Laboratory of Animal Ecological Genomics, Xining 810008; ④Qinghai Academy of Animal and Veterinary Sciences, Xining 810016
摘    要:突触小泡相关膜蛋白1基因(VAMP1)的变异是导致鼠类对D型肉毒梭毒素灭鼠剂产生抗性的主要原因。本研究利用转录组测序的方法,分析青藏高原地区5种主要害鼠:高原鼠兔(Ochotona curzoniae)、高原鼢鼠(Eospalax baileyi)、长尾仓鼠(Cricetulus longicaudatus)、青海松田鼠(Neodon fuscus)和喜马拉雅旱獭(Marmota himalayana)的VAMP1序列信息。同时,分别采集来自5个地理种群的58只高原鼠兔和59只高原鼢鼠,对VAMP1基因第二外显子区序列进行分析。结果显示,从转录组组装文件中成功获得5种动物的VAMP1基因全序列,长度均为357 bp,共检测到46个核苷酸变异位点和4个氨基酸变异位点,但未发现与D型肉毒素抗性相关的氨基酸位点。对高原鼠兔群体和高原鼢鼠群体的VAMP1基因第二外显子序列的分析显示,高原鼠兔所有个体的序列高度保守,而在高原鼢鼠中则存在一个同义突变位点,但两物种在D型肉毒素抗性相关位点上都未监测出位点变异。该研究结果提示,D型肉毒杀鼠剂在青藏高原地区害鼠防治方面应该可以长期发挥重要作用。

关 键 词:D型肉毒素  鼠害防治  突触小泡相关膜蛋白1基因(VAMP1)  序列分析
收稿时间:2016/5/12 0:00:00
修稿时间:2016/12/27 0:00:00

Variations of a Botulinum Neurotoxin Type D Resistance Related Gene VAMP1 in 5 Rodent Species Endemic to the Qinghai-Tibet Plateau
HUANG Yan-Gan,ZHAO Fang,ZHANG Tong-Zuo,LI Sheng-Qing,LI Zhi-Ning,LIN Gong-Hua,SU Jian-Ping.Variations of a Botulinum Neurotoxin Type D Resistance Related Gene VAMP1 in 5 Rodent Species Endemic to the Qinghai-Tibet Plateau[J].Chinese Journal of Zoology,2017,52(1):42-48.
Authors:HUANG Yan-Gan  ZHAO Fang  ZHANG Tong-Zuo  LI Sheng-Qing  LI Zhi-Ning  LIN Gong-Hua  SU Jian-Ping
Institution:Northwest Plateau Institute of Biology, Chinese Academy of Science,Northwest Plateau Institute of Biology, Chinese Academy of Science,Northwest Plateau Institute of Biology, Chinese Academy of Science,Qinghai Academy of Animal and Veterinary Sciences,Qinghai Academy of Animal and Veterinary Sciences,Northwest Plateau Institute of Biology, Chinese Academy of Science,Northwest Plateau Institute of Biology, Chinese Academy of Science
Abstract:
Keywords:Botulinum neurotoxins type D  Rodent control  VAMP1 gene  Sequence analysis
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