利用微卫星标记分析中国地方鸡种的遗传多样性

中国幅员辽阔, 拥有丰富的鸡种遗传资源. 由于中国地方鸡种生产性能相对较低, 很难与国内外家禽公司育成的商业品种竞争, 现存数目较少, 有些已经濒临灭绝. 为了进一步了解中国地方鸡品种的遗传多样性状况, 本研究采集了分布于中国各地的78个地方鸡品种血样, 并利用分布于13条染色体上27个微卫星标记进行分析. 通过对2740个样本的检测分析发现, 在所有27个微卫星座位中, 等位基因数从6~51个不等, 平均值为18.74. 所检测的78个品种的杂合度(H)均在0.5以上, 所有品种的平均杂合度值为0.622, 多态信息含量(PIC)平均值为0.573. 与国外的同类研究相比, 这一结果表明中国的地方鸡品种具有更加广泛的遗传多样性. 在27个微卫星座位中, 总群内亚群的固定系数(F_ST)从0.065(LEI0166)到0.209(MCW0078)不等, 平均值为0.106. 在检测的位点中, 只有LEI0194位点在所有的群体中均偏离了Hardy-Weinberg平衡(HWE), 而其他位点基本上都处于Hardy-Weinberg平衡状态. 由于小群体中的基因漂移及非随机交配, 一些保种场保存的地方品种(如狼山鸡)的杂合度相对较低, 而保种区的品种由于保种群群体较大, 杂合度也就相对较高. 中国地方鸡品种的高杂合度与其表型多样性是一致的. 通过Nei氏遗传距离和邻接法将中国地方鸡种进行聚类, 结果表明, 中国地方鸡品种可以分为六大类, 分类结果与品种的地理分布基本一致. 通过分子生物学手段进行中国地方鸡品种的遗传多样性分析, 将对中国地方鸡品种的利用和保护提供重要的理论依据.     

鸡、鸭甲状腺激素应答基因(THRSP)的研究进展

甲状腺激素应答Spot 14(Thyroid hormone responsive spot 14, THRSP)是一个参与多种脂肪合成限速酶基因表达的转录调控因子, 在动物肝脏、乳腺和脂肪组织中高度表达。家禽中鸡和鸭THRSP基因在cDNA水平均发现THRSPα和THRSPβ两种同工型, 其中鸡THRSPα基因编码区碱基的插入/缺失影响鸡体重和腹脂性状, 与鸡的生长发育和脂肪代谢有关。文章综述了鸡THRSP基因与鸭同源基因结构特性和表达差异, 以及鸡、鸭THRSP基因多态性及其遗传效应。     

利用混合样本池法对鸡显性白羽基因PMEL17突变位点的检测

显性白羽基因座是影响鸡羽色形成的重要基因座位之一, 该基因座上的显性等位基因I 会抑制黑色素合成, 从而使携带该基因的个体全身羽毛呈现白色。目前已确认鸡显性白羽基因座编码PMEL17蛋白: 是一种黑素细胞特异性蛋白, 在黑素细胞的分化与成熟中起到重要作用, 并证明PMEL17基因的突变与显性白羽的形成有关。文章利用混合样本池建立了一种低成本、高效率, 并能在大规模群体中检测PMEL17基因突变的方法, 称为PCR产物混合样本池法。该方法的基本步骤如下: 首先, 提取个体基因组DNA, 并设计相关引物对每一个体单独进行PCR扩增; 其次, 将PCR产物等比例混合, 10个样品混在一个池中; 然后, 将PCR产物混合池样品于非变性聚丙烯酰胺凝胶上进行电泳; 最后, 待电泳结束后进行银染, 根据凝胶上所显条带判定是否存在突变体。此外, 文章还将这种方法与传统基因组DNA混合样本池法进行了比较试验, 并利用该方法对试验鸡群显性白羽基因PMEL17突变进行检测, 证实该方法具有较高准确度。     

内蒙古蒙古族人群DYS413基因座的多态性分布

为 调查DYS413(YCAⅢ) 基因座在内蒙古蒙古族人群中的分布情况,为其应用于法医学和人类遗传学研究提供依据,采集了120例内蒙古蒙古族男性无关个体静脉血,EDTA抗凝,用酚-氯仿法抽提DNA,PCR扩增DYS413基因座,6%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,1‰硝酸银(AgNO3)染色分型。 在120例内蒙古蒙古族男性人群中共检出30个不同的单倍型,其频率介于0.0007至0.01361之间,其HD(单倍型多样性)值为0.94054。表明DYS413基因座在内蒙古蒙古族人群中分布好,对法医学和人类遗传学研究具有重要价值。Abstract： In order to provide the evidence for the application of DYS413(YCAⅢ) locus in forensic medicine and population genetics by investigating its polymorphism in the Mongolians lived in the Inner Mongolia Autonomous Region, China, to collect 120 unrelated male Mongolians’ venous blood, who lived in the Inner Mongolia Autonomous Region, and the blood is anticoagulant with EDTA, then to extract DNA by using the method of phenol-chloroform and amplify the DYS413 locus with PCR. The products were separated with 6% non-denatured polyacrylamide/bisacrylamide gels(19:1) electrophoresis and stained with 1‰ nitrate of silver(AgNO3). There are total 30 different haplotypes in Mongolians, the frequencies are from 0.0007 to 0.01361, the HD(haplotype diversity) is 0.94054. It shows that DYS413 locus is high valuable in the application of forensic medicine and population genetics.     

新疆雪莲水溶性多糖的分离纯化及组成分析

为合理利用雪莲提供一定依据,对新疆天然雪莲进行多糖提取分离纯化.新疆天然雪莲经热水浸提,乙醇沉淀得粗多糖.粗多糖经Sevage法和酶法联合脱蛋白,酸性乙醇分级,得初步纯化的多糖XL1,XL2,XL3.其中XL3经DEAE-SephdexA25分离纯化得纯化多糖XL31.XL31经检测为纯多糖.气相色谱分析表明新疆天然雪莲多糖XL1,XL2,XL3和XL31均为Ara、Rha、Xyl、Gal、Glc、GalA六种单糖组成的酸性杂多糖,但单糖的摩尔比不同.     

絮凝剂BP25的化学组成及结构研究

从活性污泥里筛选到一株巨大芽孢杆菌 (Bacillusmegaterium)A2 5,它能分泌胞外絮凝剂。用乙醇沉淀及SephadexS 50 0分子筛层析得到絮凝剂纯品BP2 5。通过Bradford反应、琼脂糖凝胶电泳及硫酸 酚法测定糖 ,证明BP2 5是一类多糖类物质。应用核磁共振技术证明其不含有糖醛酸。经三甲基硅醚和甲基化的气相色谱 质谱分析 ,证明多糖BP2 5含有葡萄糖和甘露糖两种单糖 ,其摩尔比为 4∶1。其连接键型包括α 1 ,6糖苷键和α 1 ,3糖苷键。由此推导出BP2 5可能的单元结构。     

纯种与杂种鸡之间肝脏组织基因差异表达及其与肉用性状杂种优势的关系

以白洛克肉鸡 (EE)、中国丝羽乌骨鸡 (CC)、农大褐 (DD)和白来航 (AA) 4个纯种鸡为材料 ,进行 4× 4完全双列杂交 ,共得到 16种杂交组合。应用mRNA差异显示技术 (DDRT PCR)检测了 8周龄纯种和杂种鸡之间肝脏组织基因的差异表达。结果表明 ,在纯种和杂种间共有 8种 15类基因差异表达模式 ,杂种和纯种之间基因表达存在明显的差异。对各种基因差异表达模式与 10个肉用性状的杂种优势率进行相关分析发现 ,表达一致型P8(t1111)与肉用性状的杂种优势率相关不显著 (P >0 0 5) ,这说明杂种优势的形成与某些基因的差异表达有关 ;正交或反交特异表达型P4(t0 10 0、t0 0 10 )与 8周龄个体重、腿肌重、半净膛重、全净膛重相关显著 (P <0 0 5) ,与胸肌重相关极显著 (P <0 0 1) ;单亲特异表达型P1(t10 0 0、t0 0 0 1)与腹脂重相关显著 (P <0 0 5) ,与体斜长相关极显著 (P <0 0 1) ;双亲特异表达型P7(t10 0 1)与腿肌重、翅重、半净膛重、肌间脂宽的杂种优势率相关显著 (P <0 0 5) ;正交或反交单亲表达一致型P2 (t110 0、t0 0 11、t10 10、t0 10 1)与肌间脂宽的杂种优势率相关显著 (P <0 0 5) ;单亲表达一致型P5(t1110、t0 111)胫骨长的杂种优势率相关显著 (P <0 0 5)。     

链霉菌UDP-葡萄糖脱氢酸编码基因Ste6的克隆表达和性质研究

链霉菌139能够产生一种全新的胞外多糖——依博素（139A）,该多糖体内具有显著抗类风湿性关节炎活性。其生物合成基因簇（GenBank Accession Number：AYl31229）已被鉴定约31．3kb,包含22个开放阅读框（ste1—ste22）。以pET-30a为载体,克隆并在大肠杆菌BL21（DE3）中进行了ste6基因的表达,对该基因的克隆、表达与性质进行了研究。亲和层析法证实,纯化后重组蛋白具有催化UDP-葡萄糖脱氢变成UDP-葡萄糖醛酸的活性。这表明ste6编码产物是葡萄糖脱氢酶。为了证实ste6基因与依博素生物合成的关系,采用单交换基因破坏策略构建了ste6基因阻断突变株。结果初步显示ste6和依博素生物合成相关。     

鸡杂种与纯种间CIDH基因的差异表达及其与杂种优势的关系

运用银染mRNA差异显示技术进行鸡杂种优势分子遗传机理研究。在检测白洛克肉鸡(EE)和丝毛乌骨鸡(CC)纯种及其正反交杂种间的mRNA差异表达情况时,发现一个只在杂种表达的475bp的cDNA片段:CE15A15。经过反向Northern印记杂交和RT-PCR验证,发现该片段在杂种中表达增强。序列比对结果表明该片段与鸡部分cDNA序列(ID:AW198493)的相似程度高达97％,而这一序列又相似于墨西哥野鼠的细胞质异柠檬酸脱氢酶(CIDH)基因(ID:AF048831),说明CI15A15为鸡CIDH基因的部分cDNA。表型数据的统计分析表明,丝毛乌骨鸡(CC)和白洛克肉鸡(EE)正反交杂种(CE、EC)的活重和屠体性状与同期纯种相比都具有负优势,而脂肪性状则具有不同程度的正优势。由于CIDH直接参与了动物机体脂肪酸合成代谢,由此推断,该cDNA片段在鸡纯种和杂种中的差异表达可能与杂种优势形成有关。     

利用微卫星和线粒体标记分析北京鸭的起源与驯化

北京鸭是我国最著名的家鸭品种. 为分析北京鸭的起源与驯化, 本实验采集了包括北京鸭在内的6个中国地方鸭种共190只个体, 及来自辽宁省的14只野生绿头鸭(Anas platyrhynchos)血样. 利用15个微卫星标记对这6个家鸭品种的186只个体进行遗传关系分析. 并对其中88只家鸭个体及14只野鸭个体线粒体的DNA控制区(mtDNA D-loop)的部分序列进行了扩增和测序. 利用微卫星标记计算出的遗传距离(D_S)及FST分析结果表明, 北京鸭与其他中国地方鸭种的遗传分化程度较高. 聚类结果显示巢湖鸭、高邮鸭、绍兴鸭和金定鸭聚为一类, 建昌鸭、北京鸭聚为另一类. 线粒体DNA D-loop区序列分析结果表明, 虽然北京鸭群体含有所有鸭种所共有的单倍型H01, 但北京鸭的单倍型与其他家鸭仍有较大差异, 北京鸭群体具有12个独特的家鸭单倍型, 其中H02, H04, H08及H22等4个单倍型比较相近并形成单倍群A, 且H02和H22单倍型与中国绿头野鸭共有, 说明北京鸭起源于绿头鸭, 其驯化过程也基本独立于其他家鸭品种.