一种基于Z-Curve映射下DNA序列信噪比的快速算法研究

DNA序列信号频谱3-周期特性被认为是用来区分编码区和非编码区的一个重要特征.针对信噪比计算量大的问题,给出基于Z-Curve映射下快速计算信噪比的方法,该方法有效避开计算离散傅立叶变换(DFT),从序列本身直接得到信噪比.实验结果表明,快速算法计算效率是DFT方法的百倍之上,极大减小基因的信噪比计算时间.     

利用Ecopath模型评价鲢鳙放养对千岛湖生态系统的影响

“保水渔业”是中国控制"水华"暴发等生态灾变的措施之一，其结果存在较大的不确定性。在浙江省的新安江水库（千岛湖），"保水渔业"的实施带来了水质改善和渔业增产的双重效果。但在生态系统自组织层面，这种人工干预手段引起的生态系统结构化效应的研究，尚未真正展开。基于2008-2010年千岛湖的生态和渔业资源调查数据，应用EwE （V6.6）构建了2010年千岛湖生态系统的Ecopath模型，并将其与2004和2016年的模型进行对照，分析了千岛湖生态系统在鲢、鳙鱼放养下的变化。千岛湖生态系统在3个年份均为4个整合营养级，营养能流分布成典型的金字塔型，且营养流总量中流向碎屑的占比很大，营养级Ⅰ、Ⅱ的能量被利用得不够充分；除鲢、鳙鱼外大部分鱼类的生物量逐渐下降，浮游植物和碎屑的生物量增多；系统的初级生产力和规模得到了一定提升，但总体的能量转换效率有所降低。在一些和系统成熟度、复原力和稳定性密切相关的参数方面，总初级生产量/总呼吸量增加，Finn氏循环指数和Finn氏平均路径长度逐渐降低，3个年份的连接指数（CI）分别为0.223、0.219、0.263，系统杂食指数（SOI）分别为0.087、0.102和0.131。研究分析表明，长期的鲢、鳙鱼放养使千岛湖的食物网结构发生了较大的变动，生态系统的营养交互关系不够复杂，成熟度和稳定性有所下降。千岛湖作为一个由水库发展而来的淡水水体，食物网关系本身就较为简单。因此，未来需要避免过多的人为干扰，并基于生态学原理更系统地进行修复工作。     

ω-3 多不饱和脂肪酸对母婴健康结局影响的研究进展

综述了国内外研究中ω-3 PUFAs补充与妊娠期间母婴健康结局的关系以及目前推荐摄入的国家的现状和推荐后所带来的健康效益，为我国妇女在妊娠期间是否需要补充剂ω-3 PUFAs以及其推荐摄入量提供科学依据。     

国内简讯

天冠集团与清华大学等部门联合攻关的发酵法生产1，3-丙二醇技术，在刚刚通过教育部组织的成果鉴定后，又成功进行了500t／a工业性试验，为微生物法发酵生产1，3-丙二醇的工业化提供了经济可行的工艺路线。据悉，天冠集团正在筹建千吨级的1，3-丙二醇生产线。     

MCF—7细胞在亚多层中细胞膜极性的变化

Sub-multilayer of MCF-7 cell, an established human breast carcinoma cell line, was achieved by culturing the cells on millipore filters for a long time. The superficial layer cells maintained their membrane polarity features as MCF-7 cells in monolayers did. MAM-6, a human milk fat globule membrane antigen, was polarized distributed in apical domain of 97.5% superficial layer cells revealed by immunoperoxidase cytochemistry. Whereas, among the low layer cells, which had no free surface (apical domain) toward the culture medium and did not show morphological polarity features, only 12.9% expressed surface MAM-6 with weak immunoperoxidase staining and random distribution. But the immunostaining for detecting cytoplasmic MAM-6 in low layer cells was stronger than that in superficial layer cells, indicating that the vectorial delivery and insert of MAM-6 carrying glycoprotein to the plasma membrane seemed to be stopped or declined and became undirectional in the later situation. The study demonstrates that an asymmetric spatial environment, which is composed of a liquid phase space and a solid phase space, is crucial for the establishment of epithelial membrane polarity of MCF-7 cells.     

CD3AK细胞的免疫生物学特征及作用分析

目前的临床应用已表明CD3AK细胞用于部分肿瘤术后清除残余肿瘤细胞、经由局部动脉、胸腹腔给药治疗等措施,对加强疾病的控制、延缓复发、延长生存期均有肯定的作用。本文主要针对CD3AK细胞的制备、过继免疫治疗及免疫学特征与作用进行分析。     

严重急性呼吸综合征冠状病毒2膜蛋白对宿主细胞pre-mRNA 3"UTR加工的影响

目的 研究严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）膜蛋白对宿主细胞mRNA前体（pre-mRNA）3"非翻译区（UTR）加工的影响。方法 本研究以人肺上皮细胞系A549为模型，利用瞬时转染在细胞内过表达SARS-CoV-2膜蛋白；利用RNA-Seq测序技术及生物信息学分析方法，系统性描绘宿主细胞选择性多聚腺苷酸化（alternative polyadenylation，APA）事件；Metascape数据库对发生显著APA变化的基因进行功能富集分析；RT-qPCR验证靶基因3"UTR长度变化；蛋白质免疫印迹（Western blot）检测目的蛋白表达水平。结果 SARS-CoV-2膜蛋白外源表达后宿主细胞内共813个基因发生显著APA变化。GO和KEGG分析显示，差异APA基因广泛参与有丝分裂细胞周期、调节细胞应激等生物过程，涉及病毒感染和蛋白质加工等。从中进一步筛选出AKT1基因，在IGV软件中显示3"UTR延长；RT-qPCR验证AKT1基因的3"UTR长度变化趋势；Western blot结果显示AKT1蛋白磷酸化水平增加。结论 SARS-CoV-2膜蛋白潜在影响宿主pre-mRNA的3"UTR加工，其中参与多种病毒性生物过程的AKT1基因 3"UTR延长，且其编码的蛋白质功能在细胞内被激活。