利用含油果实及藻类生产生物柴油

作为替代能源之一的生物柴油已日益受到欧美及亚洲一些能耗大国的重视并获得了较快的发展。仅欧洲诸炼油厂利用油菜籽、大豆及其他能源植物2006年就生产出生物柴油14亿加仑（1加仑=3．78541L,下同）,当年全球用于生物柴油的支出达17亿美元,至2020年将达到260亿美元。但亚洲与欧美在发展生物柴油方向侧重点不同。     

毛白杨COMT基因cDNA的克隆、序列与特异性表达分析

The cDNA fragment encoding caffeic acid 3-O-methyltransferase(COMT) in Chinese white poplar (Populus tomentosa Carr.) was isolated and cloned by RT-PCR technique. The size of the cDNA fragment is 1 080 bp, which almost covers the whole cDNA-encoding region. Authors’ cDNA fragment in P. tomentosa shares 98.7% homology with the reported corresponding cDNA in the P. tremuloids at nucleotide level, 99.4% homology at amino acid level, respectively. The analysis of Northern dot hybridization showed that COMT is expressed specifically in the developing secondary xylem of stem during the season of xylem differentiation, which means the linkage between the gene expression for a monolignol biosynthetic enzyme and seasonal regulation of xylem development in woody plant.     

肝癌患者体内乙型肝炎病毒基因组BCP/Pre C区基因突变多样性分析北大核心CSCD

为研究肝癌患者组织样本中HBV DNA核心启动子区(BCP区)和前C区(Pre C区)的基因突变多样性及其突变规律。收集第四军医大学附属西京医院2015年收治的192例HBV阳性的肝癌患者组织样本,PCR扩增HBV BCP/Pre C区DNA片段并进行测序分析,从测序失败的样本中随机抽取21例,采用构建单克隆文库后测序的方法进行分析。结果显示37.89%(72/190)的HBV阳性肝癌患者体内HBV病毒因呈现多种突变株混合感染的特点而导致PCR产物直接测序失败,经单克隆测序揭示,每一例失败样本的HBV DNA准种池中至少有2~11种突变株共同存在;突变株中缺失突变和插入突变的发生率高达80.95%;其它突变形式按照频率从高到低分别为A1762T/G1764A双突变90.48%,G1756C/T1803A/Δ(1 757~1 765)/Δ(1 824~1 832)四联突变80.95%,T1753C/A1762T/G1764A三联突变57.14%,A1762T/G1764A/G1896A三联突变42.86%,G1756C/Δ(1 757~1 765)双突变28.57%,T1753C/A1762T/G1764A/G1896A四联突变23.81%。由此可见,肝癌患者体内HBV病毒具有BCP/Pre C区DNA突变的多样性,这些缺失与插入突变是导致序列移码与PCR产物测序失败的直接原因。研究结果为HBV持续感染及基因突变检测、相关机制研究和个体化防治奠定了基础。     

新型氟保护漆对儿童唾液变形链球菌影响的定量分析

目的观察新型氟保护漆对儿童唾液中变形链球菌数量的影响,从微生态角度探讨其防龋效果。方法随机选取26名适龄儿童,分为有龋组和无龋组。按涂氟操作标准对两组进行多乐氟(Duraphat~~)的涂布,并收集涂氟前及涂氟后1小时、1周、2周、3周、4周、8周、12周的唾液,提取变形链球菌DNA,通过实时荧光定量PCR检测各时间节点变形链球菌的数量,并对其变化趋势进行分析。结果有龋组涂氟后变形链球菌数量与涂氟前相比呈明显下降趋势,且在第8周和12周差异有统计学意义(P_10.05);无龋组涂氟前后变形链球菌数量无明显变化(P_00.05)。结论多乐氟能显著降低有龋儿童唾液中变形链球菌数量,且抑菌效果持续时间较长,对龋易感儿童的防龋效果好,适合作为儿童防龋措施进行推广。     

幽门螺杆菌毒力基因cagA、vacA和iceA与胃十二指肠疾病的关系

目的了解长春地区就医人群中幽门螺杆菌(Helicobacterpylori,H.pylori)毒力基因分布,分析本地区H.pylori主要毒力基因型与胃十二指肠疾病关系。方法将胃黏膜标本培养分离H.pylori并运用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)对H.pylori的三种毒力基因cagA、vacA(s1a、s1b、s1c、s2、m1a、m1b、m2、i1和i2)、iceA(iceA1和iceA2)及其亚型进行检测,分析H.pylori的毒力基因型与疾病之间的关系。结果分离H.pylori 60株,标本依据病理诊断结果分为4组:消化性溃疡组(peptic ulcer disease,PUD)25株、非溃疡性消化不良组(non-ulcer dyspepsia,NUD)9株、糜烂性胃炎组(gastritis erode,GE)15株和胃癌组(gastric cancer,GC)11株。cagA基因的阳性率为90.0%,与阴性相比在疾病中的分布差异有统计学意义(x~2=8.4440,P=0.0270)。vacA基因的s1和s2亚型的阳性率分别为86.7%和13.3%。在s1阳性菌株中,s1c等位基因检出率最高为33.3%,其次s1a检出率为23.3%,而s1b在NUD和GC中检出率为0.0%。vacA基因m区m1检出率为43.3%(m1a和m1b检出率均为21.7%)和m2检出率为56.7%。vacA基因i区等位基因i1和i2的检出率分别为78.3%和21.7%,i1明显高于i2,可能是胃肠道疾病的主要毒力因子,但与疾病的类型无明显相关性。iceA1和iceA2的阳性率分别为80.0%和16.7%,iceA1/iceA2混合型的阳性率为3.3%。三种毒力基因混合型以cagA~+/vacAs1m1i1/iceA1的菌株最多,占总数的31.7%,其次为cagA~+/vacAs1m2i1/iceA1,占总数的28.3%。结论本地区H.pylori毒力因子cagA、vacA和iceA都与胃十二肠疾病的发生密切相关,但与疾病的类型无关。H.pylori毒力基因混合型cagA+/vacAs1m1i1/iceA1和cagA~+/vacAs1m2i1/iceA1是胃十二肠疾病疾病中最主要的优势基因型,其分布也与疾病的类型无密切相关性。     

基于EST-SSR标记的平欧杂种榛品种鉴定

为建立准确、高效的平欧杂种榛品种鉴定方法,本研究收集目前国内普遍引种的平欧杂种榛品种(品系)43个,选用课题组已开发的12对EST-SSR引物进行品种鉴定方法研究。结果表明:不同引物在供试样品中的PIC值为0.3800~0.7839,平均为0.5113,各引物组合经毛细管电泳均显示出了良好的扩增效果;平欧杂种榛品种(品系)间的亲缘关系较为复杂,其中薄壳红和平欧62、平欧3和平欧7、平欧30和平欧48的遗传距离最近;引物CAF-2、CAF-3、CAF-12和CAF-13组合使用,可完全区分43个平欧杂种榛品种(品系),其中引物CAF-2与CAF-13组合使用,可鉴定16个主栽品种(品系)。上述研究结果为平欧杂种榛的品种鉴定提供了便捷、有效的方法,也可为其他榛属植物研究提供参考。     

组学时代农业动物遗传育种研究的机遇与挑战

<正>高通量测序技术的飞速发展开启了生命科学领域组学时代的篇章。人类ENCODE、Roadmap、FANTOM等计划的逐步实施,进一步加深了人们对疾病产生分子机制的理解。2015年,动物基因组功能注解(Functional Annotation of Animal Genomes,FAANG)计划正式启动,其主要目标是全面而完善地注解家养动物基因组中的功能元件。该项目的启动凸显了农业动物领域相关研究的重要性,主要表现在:首先,农业动物基因组研究有利于揭示动物的进化、环境适应以及遗传选择;其次,以猪、羊     

基于组合药物网络的疾病关联性分析

组合药物在复杂疾病的治疗中形成了多靶点,多环节上的密切联系,对疾病的治疗效果也可达到单种药物治疗意想不到的效果。组合药物中各单药功能各异但联用后治疗效果更佳,说明所对应疾病之间可能存在某种关系。通过研究疾病间关联关系,可能会发现治疗某种疾病的新靶标,从而在新药的研发中取得新的进展。本文以DCDB(组合药物数据库)中的药物组合为数据源构建组合药物网络,并通过网络聚类算法得到了33个独立且内部联系紧密的药物模块。其中7组药物模块所包含的组合药物用于治疗两种或两种以上疾病,说明这些疾病之间存在一定的关联关系。对这些关系进行论证,结果表明,组合药物网络是发现疾病关联关系的一种有效手段。     

益气健脾方对Wistar鼠大肠癌模型中异常腺窝病灶的影响及其相关机制的探讨

目的:探讨益气健脾方对大肠癌模型异常腺窝病灶(ACF)的抑制效应及其相关机制。方法:50只Wistar大鼠随机分为5组:中药低剂量组(将中药溶液稀释3倍后,5 mL/kg日灌胃量)、中药中剂量组(5 mL/kg日灌胃量)、中药高剂量组(15 m L/kg日灌胃量)、模型组、正常组,每组10只大鼠,采用免疫组化法、美兰染色后镜下观察大肠组织。结果:各中药组ACF及大型ACF的数量较模型组减少(P0.05),并且中药中剂量组ACF数量减少最为明显,差异具有统计学意义(P0.05)。造模后24h、48h中药组肠腺细胞PCNA增殖指数低于模型组,差异具有统计学意义(P0.05)。造模后24 h、48 h中药组肠腺细胞凋亡指数高于模型组,差异具有统计学意义(P0.05)。中药组β-catenin异位表达均低于模型组,并且中药组β-catenin异位表达中高剂量组最高,低剂量组次之,中剂量组最低(P0.05)。中药组MMP-7的表达均低于模型组,而且各中药组中低剂量MMP-7表达最高,高剂量组次之,中剂量组最低(P0.05)。结论:益气健脾方可以明显降低Wistar大鼠ACF的发生数量,抑制大肠癌发生中Wnt信号的激活,在一定程度上减少了大肠癌的发生,起到了预防作用。