基于各向异性网络模型研究δ阿片受体的动力学与关键残基

目的 阿片受体是一种G蛋白偶联受体(GPCR),主要通过变构转导胞外区内源性配体结合信号,使其与胞内区效应蛋白偶联来介导镇痛反应。δ阿片受体(DOP)除了与疼痛控制有关外,还与情绪控制有关,是一个很有吸引力的治疗靶点。本文旨在分析DOP的结构动力学和变构效应。方法 首先利用各向异性网络模型(anisotropic network model,ANM)对DOP进行建模,通过慢运动模式和快运动模式残基涨落探索DOP的结构动力学与功能的关系。然后,结合微扰响应扫描(perturbation-response scanning,PRS)对DOP中与变构通信相关的关键残基进行识别。结果 慢运动模式可以很好地识别DOP的结构以及功能性钠离子结合位点,快运动模式可以识别出对蛋白质结构稳定起重要作用的关键残基。残基运动相关性分析发现胞外/胞内的跨膜螺旋与环状区域之间存在正相关性,这些区域相互作用促进DOP与配体的结合。PRS分析中敏感性高和效应性高的关键残基在DOP的变构通信中发挥重要作用。结论 这项工作有助于加强对δ阿片受体变构通讯机制的理解,并为药物设计提供有价值的信息。     

组培条件下不同番茄品种及砧木自交系幼苗期硝酸盐耐性的比较

采用组培的方法,对15个番茄普通栽培品种的幼苗进行系列浓度Ca(NO₃)₂胁迫处理,10 d后调查不同品种单株幼苗的生长情况和盐害程度。结果表明,15个供试品种幼苗期硝酸盐耐性存在显著差异。上海903、苏红2003、阳光906、大禹中蔬4号、三星L402、番茄大红、中蔬4号、宝大903、霞粉、毛粉 802为硝酸盐敏感品种;早丰番茄、江蔬14号、宝粉和三星906为中等耐硝酸盐品种;日本大粉皇后为耐硝酸盐品种。同时对7个番茄砧木自交系（TR-1、TR-2、TR-3、TR-4、TR-5、TR-7、TR-8）进行了幼苗期高浓度Ca(NO₃)₂的耐盐分析。结果表明,砧木自交系的平均侧根数均显著高于同浓度下供试的普通番茄栽培品种,盐胁迫指数均显著低于普通栽培品种,具有较强的耐盐性;其中TR-8耐盐性最强。     

黑麦草(Lolium perenne L.)内生真菌的检测、分离及鉴定*

从多年生黑麦草(LoliumperenneL.)5个品种———SR4000、Pinnacle、Topgun、CalypsoⅡ、Justus中分离出61个菌株。次培养后,所得形态稳定的菌株可分为4个形态群,依据其形态特征及APPCR的结果,确定其中的57个分离菌株为Neotyphodiumlolii。     

数字乳房X片图像的预处理算法研究

介绍了一种数字乳房X片图像的预处理算法。利用时域处理和形态学处理相结合的方法,对数字乳房X片图像进行预处理,去除无用背景像素点,有效减少后期增强、分割处理的数据量。     

应用合成生物学构建蓝细菌细胞工厂的研究进展

蓝细菌是一类能进行放氧光合作用的原核微生物,具有生长速度快、光合效率高、易于基因遗传操作等特点。它们能够将捕获的光能和二氧化碳转化为生物能源分子,在解决当前社会面临的能源紧缺和环境污染等问题上有着重要的理论和应用研究价值。近年来,随着合成生物学的迅猛发展,构建以蓝细菌为底盘的“人工细胞工厂”用于合成各类生物能源和精细化学产品取得了令人瞩目的成绩。重点介绍了应用合成生物学构建蓝细菌细胞合成工厂的研究进展,并对“光合自养型细胞工厂”面临的两大问题——产物毒性问题以及细胞内氧化胁迫问题进行了重点讨论。     

中国狼不同地理种群遗传多样性及系统进化分析

为了解中国狼不同地理种群遗传多样性及系统发育情况,从中国境内狼的主要分布区青海、新疆、内蒙古和吉林4个地区采集样品,用分子生物学技术手段成功地获得44个个体线粒体DNA控制区第一高变区(HVRⅠ)序列和40个线粒体Cyt b部分序列。线粒体控制区HVRⅠ共检测到51个变异位点,位点变异率为8.76%;线粒体Cyt b部分序列发现31个变异位点,位点变异率为5.33%,未见插入及缺失现象,变异类型全部为碱基置换。共定义了16个线粒体HVRⅠ单倍型,其中吉林与内蒙种群存在共享单倍型,估计这两地间种群亲缘关系较近。4个地理种群中新疆种群拥有较高的遗传多样性(0.94)。中国狼种群总体平均核苷酸多态性为2.27%,与世界其他国家地区相比,中国狼种群拥有相对较高的遗传多样性。通过线粒体HVRⅠ单倍型构建的系统进化树可以看出,中国狼在进化上分为2大支,其中位于青藏高原的青海种群独立为一支,推测其可能长期作为独立种群进化。基于青海种群与新疆,内蒙种群的线粒体Cyt b遗传距离,推测中国狼2个世系可能在更新世冰川时期青藏高原受地质作用急速隆起后出现分歧,分歧时间大约在1.1 MY前。     

地佐辛对妇科恶性肿瘤患者术后镇痛疗效及免疫功能的影响

目的:探究地佐辛在妇科恶性肿瘤术后镇痛中的疗效及对其围手术期免疫功能的影响,为临床手术用药提供依据。方法:选择2012年7月~2015年9月期间我院行妇科恶性肿瘤手术患者87例为研究对象,采用随机数字法将其分为地佐辛组(45例)和对照组(42例),地佐辛组患者给予全身麻醉联合地佐辛治疗,对照组患者给予全身麻醉联合芬太尼治疗,记录并分析两组患者术中、术后VAS疼痛评分、Ramsay镇静评分及免疫指标。结果:两组患者术后各时间点的VAS评分均分均小于4分,地佐辛组患者在T3时刻VAS评分显著低于对照组(P0.05);与T1时刻比较,T2、T4时刻地佐辛组患者CD3~+、CD4~+、CD4~+/CD8~+及NK细胞水平均显著降低(P0.05),T2时刻地佐辛组患者CD8~+水平显著升高(P0.05);对照组T2时刻CD3~+、CD4~+、CD4~+/CD8~+及NK细胞水平,T4时刻CD3~+、NK细胞水平,T5时刻NK细胞水平均出现明显降低(P0.05);地佐辛组患者T5时刻CD3~+、CD4~+、CD4~+/CD8~+及NK细胞水平均显著高于对照组(P0.05)。结论:地佐辛治疗妇科肿瘤患者术后镇痛效果较好、安全性高,与芬太尼比较,其对机体的免疫抑制作用轻,更利于患者疾病的控制与康复,值得在临床应用推广。     

水稻条斑病菌gacA基因的克隆及功能初析

根据黄单胞菌gacA基因的同源性设计简并引物,采用PCR方法从水稻条斑病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzicola,Xooc)中克隆了gacA同源基因,命名为gacA_Xooc。序列比较显示,该基因在黄单胞菌中是相对保守的。通过同源重组的方法,构建了gacA_Xooc的插入突变株。对0.1% Tryptone的趋化应答能力检测发现,gacA突变株的趋化能力明显降低,证明gacA与Xooc的趋化性相关。     

医院与社区获得性感染大肠埃希菌耐消毒剂基因比较分析

目的 比较在本地区医院感染与社区获得性大肠埃希菌中耐消毒剂基因的流行情况.方法 收集从临床标本中分离出的大肠埃希菌112株,根据感染途径不同,将其分为医院与社区获得性两组,用PCR方法检测耐消毒剂基因qacE△1,并进行组间检出率比较.结果 本地区医院与社区获得性感染大肠埃希菌耐消毒剂基因的携带率分别为58.1％(43/74)和23.7％ (9/38),组间比较差异有统计学意义(P ＜0.05);74株医院获得性大肠埃希菌中,产ESBL率为71.6％(53/74),38株社区获得性大肠埃希菌中,产ESBL率为39.5％ (15/38).医院与社区获得性产ESBL大肠埃希菌耐消毒剂基因qacE△1检出率分别为64.2％(34/53)与6.7％(1/15),组间比较差异亦有统计学意义(P＜0.01).结论 医院获得性感染大肠埃希菌耐消毒剂基因的携带率高于社区获得性大肠埃希菌,产ESBL阳性菌株的携带率显著高于产ESBL阴性菌株,这可能是由于医院环境中消毒剂选择压力和/或携带耐消毒剂基因的菌株在医院内水平传播速度较快的结果.     

不同取样强度下古田山木本植物幼苗组成 及其分布格局比较

幼苗阶段是森林群落更新的瓶颈, 研究木本植物幼苗组成和分布格局对正确认识森林群落构建以及多样性维持机制具有十分重要的意义。以往基于幼苗阶段的研究取样强度较小, 主要涉及常见种, 缺乏对稀有种的有效监测。我们对古田山24 ha森林样地幼苗监测网络进行了扩建, 在已有507个1 m × 1 m幼苗监测样方的基础上, 增设了285个5 m × 5 m幼苗样方, 对样方内所有高度≥ 10 cm且胸径< 1 cm的木本植物幼苗按大样地监测标准进行了定位、挂牌、鉴定和测量。本研究利用2012年5 m × 5 m幼苗监测样方的首次调查数据, 比较了24 ha大样地中不同取样强度下幼苗和非幼苗(胸径≥ 1 cm的木本植物)个体在物种组成、多样性分布格局以及生境偏好等方面的差异。结果表明: (1) 285个5 m × 5 m幼苗监测样方共计有木本植物幼苗138种20,581株, Shannon-Wiener多样性指数以及经多度校正的物种丰富度指数均显著高于1 m × 1 m幼苗监测样方以及24 ha大样地的非幼苗个体, 该结果与基于Rarefaction方法计算的物种数期望值结果一致; 与1 m × 1 m幼苗监测样方结果相比, 5 m × 5 m幼苗监测样方内物种数-取样面积曲线趋于饱和。(2) 5 m × 5 m幼苗监测样方幼苗与24 ha大样地非幼苗个体物种多度呈异速增长关系, 表明植物在幼苗阶段受到负密度制约效应的影响, 死亡率相对较高。(3)取样强度和胸径阈值的选取对群落稀有种的界定有重要影响, 朱砂根(Ardisia crenata)、山鸡椒(Litsea cubeba)、美丽胡枝子(Lespedeza thunbergii subsp. formosa)等物种在24 ha样地水平被认为是稀有种, 但是在5 m × 5 m幼苗样方却属于常见种。(4)指示种分析结果表明, 基于不同取样强度的幼苗生境指示种与基于大样地非幼苗个体的分析结果存在较大差异。在5 m × 5 m幼苗样方中, 13个物种与单一生境类型显著相关, 其中仅有3个物种与1 m × 1 m幼苗样方指示种相同, 与24 ha大样地非幼苗相比, 仅有2个共有指示种。总之, 不同取样强度可显著影响幼苗物种多样性格局的分析结果, 通过样方扩建对林下幼苗进行系统监测, 可进一步加深对群落生物多样性维持机制的认识。