脑网络：从脑结构到脑功能

人脑是自然界中最复杂的系统之一,不同的功能区域相互作用、互相协调,共同构成一个网络来发挥其功能。人脑是一个复杂的网络,具有高效的“小世界”拓扑属性。本文从脑结构到脑功能方面介绍了从不同模态影像学数据构造脑网络的主要进展,并探讨不同的脑疾病患者脑网络拓扑结构是否发生了异常,以及这些异常特征能否用来进行疾病分类,最后对本领域未来的研究做了简单的展望。     

利用cvTree方法构建及分析tRNA序列的亲缘关系进化网络

本文利用cvTree和复杂网络理论相结合的方法,构建了3 420条tRNA序列亲缘关系进化网络.计算了相关网络的平均度、平均聚类系数和平均最短路径随进化距离Dis变化的关系.同时还分析和讨论了tRNA序列之间的亲缘关系及其进化机制,观察到一个与其它方法不同的结果:随着亲缘距离Dis的增加,网络的度分布先是从power-law分布转变为Gussian分布,然后又从Gussian分布转变为反power-law分布.本研究结果说明由cvTree方法和复杂网络理论相结合的方法研究tRNA基因序列的进化的结果也许更加符合其进化历程.     

蛋白质氨基酸网络研究进展

氨基酸网络是运用复杂网络工具对蛋白质结构-功能关系研究的新方法。本文回顾了氨基酸网络中常用网络参量的计算方法,如:度分布,聚集系数,平均最短路径等。结合本研究小组的工作,介绍了常用的网络构建和分析方法,并总结了氨基酸网络在蛋白质折叠以及蛋白质分子对接问题中的应用。最后,分析了氨基酸网络研究目前存在的主要问题,并对未来的工作进行了展望。     

耐热DNA连接酶介导的TLCR技术在简化DNA重组实验中的应用

传统的DNA重组方法Type Ⅱ型限制酶技术受到片段纯化的限制,无法做到复杂混合体系中DNA片段的特异性连接。为解决这个问题,本研究将耐热连接酶链式反应(Thermostable ligase chain reaction, TLCR)引入DNA片段的连接与捕获。该技术利用耐热型DNA连接酶的特性,在热循环反应中配合针对目的片段末端序列设计的单链寡核苷酸连接模板--Helper,实现目的片段的特异性连接和产物数量的指数性增长。两个质粒构建实验被用于验证TLCR技术的可行性和应用效果。首先利用TLCR技术从一个未经纯化的含有7种不同大小片段的混杂体系中特异性地将一段1.5 kb的片段捕获进载体,随机抽取的克隆样品经检验准确率达到80%,验证TLCR技术在复杂混合体系中特异性连接DNA片段的可行性和准确性。在另一个质粒构建实验中,TLCR技术从λ噬菌体基因组Hind消化物中将两段总长达27 kb的片段按顺序捕获进载体,随机抽取的克隆样品经检验同样达到了80%的准确率。结果表明,TLCR技术能够简化DNA重组实验的操作,并且适用于多片段和大片段的连接,可以为生物学研究提供便利。     

复杂疾病基因鉴定的计算生物学方法

过去20多年复杂疾病易感基因鉴定的主要方法是连锁分析和关联研究。因为连锁分析确定的数量性状位点通常很宽, 加之对区域内大部分基因的功能以及基因功能和疾病之间联系的认识十分有限, 所以从数量性状位点到基因的识别是一个挑战。近年来发展了一些利用公共数据库的信息预测疾病易感基因的计算生物学方法。文章简要介绍了DGP、GeneSeeker、Prioritizer、PROSPECTR and SUSPECTS及Endeavor 5种计算生物学方法的基本原理, 以2型糖尿病/肥胖和骨质疏松症易感基因的预测为例说明它们的应用方法, 并讨论了这些方法的局限及应用前景。     

从QTL到QTG的路还有多远?

植物大多数重要的经济性状都是数量性状, 人们对许多植物进行了数量性状基因座(QTL)的研究, 并取得了长足的发展。文章详尽地分析了数量性状表型与基因型的复杂关系, 介绍了当前QTL研究领域里的几种精细作图策略。讨论了当前挖掘控制目标性状QTL基因的研究过程中存在的困难和问题, 提出几个有待发展的研究方向, 并展望了该领域的发展前景。因目前的QTL仍然是一个相当大的染色体区段, 往往含有多个候选基因。文章就怎样从QTL粗放位点研究进一步发展到数量性状基因(quantitative trait gene, QTG)水平上的变异, 再从QTG到相应于基因内多态性的数量性状核苷酸(quantitative trait nucleotides, QTN), 提出了一些见解。来迎接后基因组时代数量遗传领域的挑战。     

矿泉水对健康影响的定性循证研究

目的：检索国内外相关文献，综合分析矿泉水与健康的关系。方法：在PubMed、Embase、Medline、Cochrane、中国生物医学文献服务系统、万方数据知识服务平台和中国知网等7个数据库检索自1998年1月-2019年6月国内外公开发表的中英文相关研究文献，纳入以人为研究对象的实验性研究，排除重复、不完整、无法获得全文、非饮用用途的文献等，语种限定为中文和英文。结果：共检索到符合条件文献483篇，按照纳排标准纳入7篇进行分析。饮用特定类型的矿泉水可以在一定程度上改善糖尿病、消化不良、心血管疾病、肾结石患者的健康情况：如富含碳酸氢盐与镁的矿泉水可能改善患者血糖指标，降低糖尿病风险；富含碳酸氢盐、钙、镁的矿泉水可降低消化不良症状的发生频率与剧烈程度，促进胃排空；富含碳酸氢盐、钙、镁、硫的矿泉水可以降低心血管疾病患者的血压、血清总胆固醇、低密度脂蛋白等生物标志物的浓度；如富含碳酸氢盐的矿泉水可升高肾结石患者的尿液pH、尿柠檬酸盐与尿镁的浓度，预防肾结石的发生。结论：饮用特定类型的矿泉水可以一定程度上改善某些疾病患者的健康状况，但是矿泉水与健康之间的关系尚需更加权威的证据加以支持。     

输尿管软镜与超微通道经皮肾镜碎石术治疗直径<2cm肾结石的对照分析研究

摘要 目的：对比分析输尿管软镜碎石术与超微通道经皮肾镜碎石术治疗直径<2 cm的肾结石的临床应用效果。方法：选取2017年7月～2019年11月间直径<2 cm肾结石患者200例作为研究对象,随机选择其中的100例患者采用输尿管软镜钬激光碎石术进行治疗(FURS组),另外的100例患者采用超微通道经皮肾镜钬激光碎石术进行治疗(UMP组),比较观察两组患者的手术相关指标,其中包括手术时间、术中出血量、清石率,以及患者术后下床活动时间、术后住院天数等指标的差异,同时记录两组患者术后并发症的情况。结果：两组手术均成功完成,未出现严重出血及邻近器官损伤等并发症,在清石率方面,两组均有较高水平,无统计学差异（98% vs 97%,P＞0.05）;在手术并发症发生率方面,差异无统计学意义 (7% vs 8%,P＞0.05);术中血红蛋白下降水平FURS组少于UMP组（6.82±2.27 vs 16.75±4.92,P＜0.01）;FURS组较UMP组术后下床活动时间（7.53±2.24 vs 15.46±2.61,P＜0.01）以及住院天数（3.46±1.69 vs 6.15±1.27,P<0.01）更少,差异有统计学意义。结论：输尿管软镜钬激光碎石术与微通道经皮肾镜钬激光碎石术都可以成为直径<2 cm肾结石的有效治疗方法,但输尿管软镜钬激光碎石术的患者术中出血少,住院时间短,更为安全,疗效确切,更加具有微创优势,值得优先考虑。     

名刊封面

科学家确定防御白血病关键基因 美国科学家近日发现一种控制干细胞快速产生和分化的基因,这一发现有望导致对于白血病和其他血癌的新型疗法。这一名为JunB的基因位于调控造血干细胞（HSCs）增殖和分化的分子与环境信号复杂网络的中央。     

瑞士EMS第四代碎石清石系统治疗复杂性肾结石(附52例报告)

目的:探讨经皮肾镜下应用瑞士EMS第四代碎石清石系统治疗治疗复杂性肾结石的临床效果和操作体会.方法:总结分析我院应用经皮肾镜取石术(PCNL),结合瑞士EMS第四代碎石清石系统治疗治疗复杂性肾结石52例的临床资料.结果:47例均成功行一期取石术,2例需二期PCNL清石,3例需ESWL.手术时间74±26分钟,失血量0.61±0.59 g/L,残石率14.4%±9.3%.3例术后大出血,术中未见严重并发症.结论:瑞士EMS第四代碎石清石系统整合气压弹道碎石与超声碎石技术,处理复杂肾结石安全高效.