| 利用cvTree方法构建及分析tRNA序列的亲缘关系进化网络 |
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| 引用本文： | 毛源泽,韦芳萍,王俊美,刘强.利用cvTree方法构建及分析tRNA序列的亲缘关系进化网络[J].基因组学与应用生物学,2011,30(4). |
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| 作者姓名： | 毛源泽 韦芳萍 王俊美 刘强 |
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| 作者单位： | 广西大学物理科学与工程技术学院,南宁,530004 |
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| 基金项目： | 广西自然科学基金项目，国家重点基础研究发展计划项目，国家自然科学基金资助项目，广西研究生计划创新项目 |
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| 摘 要： | 本文利用cvTree和复杂网络理论相结合的方法,构建了3 420条tRNA序列亲缘关系进化网络.计算了相关网络的平均度、平均聚类系数和平均最短路径随进化距离Dis变化的关系.同时还分析和讨论了tRNA序列之间的亲缘关系及其进化机制,观察到一个与其它方法不同的结果:随着亲缘距离Dis的增加,网络的度分布先是从power-law分布转变为Gussian分布,然后又从Gussian分布转变为反power-law分布.本研究结果说明由cvTree方法和复杂网络理论相结合的方法研究tRNA基因序列的进化的结果也许更加符合其进化历程.
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| 关 键 词： | tRNA序列 cvTree方法 复杂网络 |
Construction and Analysis of the Kinship Evolutionary Network of tRNA Sequences by cvTree Method |
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| Mao Yuanze,Wei Fangping,Wang Junmei,Liu Qiang.Construction and Analysis of the Kinship Evolutionary Network of tRNA Sequences by cvTree Method[J].Genomics and Applied Biology,2011,30(4). |
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| Authors: | Mao Yuanze Wei Fangping Wang Junmei Liu Qiang |
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