X染色体连锁智力障碍遗传机制研究进展

x染色体连锁智力障碍（X-1inked intellectual disability,XUD）是一类位于x染色体上的基因发生突变引起的先天性智力障碍,所涉及的先天性智力障碍约占所有先天性智力障碍的15％。依据除了智力障碍外是否有其他生理方面的缺陷,XLID分为两类：S-XLID（syndromic forms）和NS．XLID（non-syndromic forms）。S-XLID表现在除了智力障碍外,还在新陈代谢方面、神经特征或者其他的体征——如骨骼、颅面部上有异常或者缺陷。该文对近年来XLID的致病机制研究进展作了部分阐述。     

DNA Copy Number Aberrations in Breast Cancer by Array Comparative Genomic Hybridization

Array comparative genomic hybridization (CGH) has been popularly used for an-alyzing DNA copy number variations in diseases like cancer. In this study, we investigated 82 sporadic samples from 49 breast cancer patients using 1-Mb reso-lution bacterial artificial chromosome CGH arrays. A number of highly frequent genomic aberrations were discovered, which may act as "drivers" of tumor pro-gression. Meanwhile, the genomic profiles of four "normal" breast tissue samples taken at least 2 cm away from the primary tumor sites were also found to have some genomic aberrations that recurred with high frequency in the primary tu-mors, which may have important implications for clinical therapy. Additionally, we performed class comparison and class prediction for various clinicopathological pa-rameters, and a list of characteristic genomic aberrations associated with different clinicopathological phenotypes was compiled. Our study provides clues for further investigations of the underlying mechanisms of breast carcinogenesis.     

Sporophytic nondisjunction of the maize B chromosome at high copy numbers

It has been known for decades that the maize B chromosome undergoes nondisjunction at the second pollen mitosis.Fluorescence in-situ hybridization(FISH)was used to undertake a quantitative study of maize plants with differing numbers of B chromosomes to observe if instability increases by increasing B dosage in root tip tissue.B chromosome nondisjunction was basically absent at low copy number,but increased at higher B numbers.Thus,B nondisjunction rates are dependent on the dosage of B's in the sporophyte.Differences in nondisjunction were also documented between odd and even doses of the B.In plants that have inherited odd humbered doses of the B chromosome,B loss is nearly twice as likely as B gain in a somatic division.When comparing plants with even doses of B's to plants with odd doses of B's,plants with even numbers had a significantly higher chance to increase in number.Therefore,the B's nondisjunctive capacity,previously thought to be primarily restricted to the gametophyte,is present in sporophytic cells.     

山羊基因组与遗传变异图谱研究进展

高通量测序技术和生物信息学的发展极大的促进了山羊分子生物学研究。山羊参考基因组的不断完善以及基因组重测序技术的应用,在全基因组水平上发现了大量的遗传变异信息(SNP、Indel和CNV),丰富了山羊分子群体遗传学研究利用的分子标记。综述了山羊参考基因组组装和全基因组变异图谱的构建及其在山羊上的研究进展,以期为进一步利用分子遗传标记进行山羊的各种性状的遗传基础研究和遗传资源保护利用提供科学依据和参考。     

荧光定量PCR精确检测人胚胎干细胞线粒体DNA拷贝数方法的建立

建立一种精确定量人胚胎干细胞线粒体DNA拷贝数的方法。构建包含线粒体DNANDl和核单拷贝基β-globin基因序列的重组质粒作为标准品;收集无饲养层培养体系下人胚胎干细胞DNA样本,结合2个单独的Taqman探针实时荧光定量PCR对待测样本中线粒体NDl和核β-globin基因分别进行定量,从而对人胚胎干细胞线粒体DNA的含量进行了精确定量。结果提示,人胚胎干细胞线粒体DNA的平均拷贝数／细胞为1321±228。研究表明,该技术可对人胚胎干细胞线粒体DNA拷贝数进行准确的测定,为研究培养条件对人胚胎干细胞线粒体DNA拷贝数的影响及优化体外培养条件奠定了基础。     

具有划时代意义的韩国拷贝数变异研究

罗氏NimbleGen已与韩国疾病控制与预防中心（KCDC）和Macrogen,Inc．公司签署合作协议,将共同实施一项针对韩国人的为期8个月的高密度CNV研究。该研究分为两个阶段,包括对韩国人口的大规模CNV特征描述,并对包括糖尿病在内的复杂疾病的基因相关研究中常见的CNV进行分析。     

腈水合酶NHaseK在大肠杆菌中的功能表达

腈水合酶由α亚基和β亚基组成,活化元件对其功能表达至关重要,研究腈水合酶基因簇中各元件的表达比例对酶重组表达的影响具有重要意义。以来源于Klebsiella oxytoca KCTC 1686的腈水合酶（NHaseK）为研究对象,构建了多种表达策略,以期实现α亚基、β亚基和活化元件17k差异表达。利用pETDuet-1质粒具有双T7启动子的特点,将上述基因以八种不同的组合方式分别插入于两个启动子之后。当将三段基因同时插入于第一个启动子之后时,亚基表达量均衡,比活力为0.78 U/mg蛋白,是亚基表达量比例为5：3时的124%。在此基础上,在第二个启动子之后插入活化元件基因,活化元件表达水平提升2倍,比活提升5%,为0.82 U/mg蛋白。当将α亚基和β亚基插入于不同启动子之后时,酶活仅为对照组的10%,说明NHaseK的亚基必须同时转录才可形成成熟蛋白。进一步考察质粒拷贝数对大肠杆菌表达NHaseK的影响,确定15~20的质粒拷贝数足够实现NHaseK的功能表达。结果表明,亚基的均衡表达以及活化元件的充分表达对NHaseK的重组表达具有积极作用。     

数字PCR技术及其应用进展北大核心CSCD

数字PCR(Digital PCR,dPCR)是核酸绝对定量的新方法,该技术通过分液,将含有核酸模板的PCR反应体系分配到上万个反应器中进行PCR扩增,根据荧光信号的有或无,进行结果计数,通过泊松分布的统计处理,直接得出核酸的拷贝数。相比于实时荧光定量PCR(Quantitative PCR,qPCR),dPCR不需要建立标准曲线,应用前景更广。本文对dPCR的发展历史、原理及其应用进行了综述。     

复杂疾病全基因组关联研究进展—— 研究设计和遗传标记

实现全基因组关联研究(Genome-wide association study, GWA)在数年前还是遗传学家们的梦想, 如今它已经变成了现实。自2005年Science杂志报道了第一项有关年龄相关性(视网膜)黄斑变性全基因组关联研究研究以来, 有关与复杂疾病的全基因组关联研究如雨后春笋般层出不穷。文中介绍了近两年来全基因组关联研究在复杂疾病研究领域内的主要发现、全基因组关联研究设计原理、遗传标记的选择、比较及相关商品信息。最后介绍了人类基因组拷贝数变异的研究进展, 总结了人类全基因组关联研究所取得成就和存在的问题, 并对全基因组关联研究未来的研究重点和要解决的问题进行了展望。     

转基因水稻中外源基因的荧光原位杂交(FISH)分析

利用荧光原位杂交(FISH),在供试8个转基因水稻株系的染色体上检出了转入的外源基因barnase-ps1片段.其中两株系各检出了两个不同的信号位点,而其他株系均只检出一个信号位点.所有染色体着丝粒区都没有杂交信号.结合Southern杂交及表达分析发现,大多数株系中,整合在染色体端部区的barnase基因表现为高水平表达,而靠近着丝粒区的则表现为低水平表达,表明表达水平与转基因整合位置可能存在一定程度的相关性.表达水平与拷贝数无明显相关.本文还利用多色荧光原位杂交(Multi-color FISH)技术,进行了barnaseps1片段与报道基因pHctinG的共杂交,多数情况下,barnase-ps1片段与报道基因整合在染色体的同一位置.