ICU耐亚胺培南鲍曼不动杆菌产金属酶检测及其耐药性分析

目的 了解重症监护病房(ICU)耐亚胺培南鲍曼不动杆菌(IRABA)的金属β-内酰胺酶(MBLs)的产生情况及其耐药特性,为临床抗感染治疗提供依据.方法 对深圳市观澜人民医院2010年1月至2012年6月ICU分离的487株鲍曼不动杆菌(ABA),用双纸片协同试验检测MBLs产生情况,用VITEK 2 compact全自动微生物分析系统检测其对18种抗生素的耐药性.结果 在487株ABA中检出IRABA 320株(65.7％);IRABA对其中7种抗生素为全耐药,对其中10种抗生素的耐药率在80％以上;比较IRABA与ISABA(亚胺培南敏感鲍曼不动杆菌)两组对常用抗生素的耐药率,除CZO、FTN、及CTT外,两组对其余抗生素的耐药率差异均有统计学意义(P＜0.01);在320株IRABA中,检出产MBLs 145株,产酶率为45.3％.结论 IRABA的检出率较高,多药耐药现象较严重,产MBLs是ABA对IPM及头孢类抗菌药物耐药的主要原因之一,应参考实验室的药敏结果,合理选用抗菌药物.     

双壳贝类线粒体基因组结构的比较

利用比较基因组学和生物信息学方法, 比较分析了已登录到GenBank中的14种海产双壳贝类和2种淡水双壳贝类的线粒体基因组的结构特征。结果发现, 双壳贝类线粒体的基因组结构、基因排列顺序均互不相同; 不同目、科和属之间线粒体基因组的大小、基因排列方式以及基因种类也存在明显的差异, 尤其是基因排列方式没有明显的规律。对16种双壳贝类的线粒体基因组全序列、编码基因序列进行系统分析, 分别得到了不同的聚类结果, 即用基因组全序列聚类时, 16种贝类的聚类结果与传统的形态学分类地位基本相同; 而将16种贝类的所有蛋白质编码基因和2个rRNA基因按照一致顺序排列起来进行聚类时, 所得的系统分类情况与这些贝类传统的形态学分类地位相差较大。     

工业应用导向的蛋白质结构与功能研究进展

在蛋白质工程、绿色生物制造以及合成生物学等研究领域中,对重要催化反应的重塑和合成路径的优化搭建,都依赖于对相关蛋白质结构与功能的深入了解。合成生物技术近年来的飞速发展对关键菌种及生物催化过程中的蛋白质的性能提出了更高要求,相关研究的关键是获得大批量、高纯度目的蛋白,并进行快速、准确的构效关系研究。中国科学院天津工业生物技术研究所建所10年来,在工业蛋白质领域进行了多年的积累,成功搭建成了蛋白质结构生物学平台;并在植物天然产物合成相关萜类合成酶、白色污染降解的聚对苯二甲酸乙二酯(polyethylene terephthalate, PET)塑料降解酶以及生物质转化利用相关酶等方面获得了一些进展,通过对这些蛋白进行结构和功能的研究,为许多研究工作提供了理论依据。蛋白质结构功能研究相关技术的不断发展,将加速合成生物学的学术和工业应用研究,推动我国生物制造领域的科技创新升级。     

盐酸右美托咪定联合乌司他丁对老年腹部手术患者术后认知功能障碍的影响分析

目的:探讨盐酸右美托咪定联合乌司他丁对老年腹部手术患者术后认知功能障碍的影响及可能机制。方法:选择2018年1月到2018年6月在我院胃肠外科、泌尿外科、肝胆外科行开腹手术的150例患者为研究对象,按照数字表随机分为右美托咪定组、乌司他丁组和联合组,每组各50例患者。比较三组患者的术后苏醒时间、有效镇痛时间、躁动例数及术后认知功能障碍(POCD)的发生情况,治疗前后血清肿瘤坏死因子α(TNF-α)、白介素6(IL-6)、血清S-100蛋白(S100β)水平、简易智能状态量表(MMSE)评分的变化及不良反应的发生情况。结果:三组患者麻醉苏醒时间比较差异无统计学意义(P0.05);联合组患者苏醒期躁动及POCD发生率明显低于右美托咪定组及乌司他丁组,有效镇痛时间明显长于右美托咪定组及乌司他丁组(P0.05);治疗后,三组患者血清TNF-α、IL-6及S100β水平均较治疗前明显改善,且联合组患者各个时点血清TNF-α、IL-6及S100β水平均明显低于右美托咪定组及乌司他丁组(P0.05)。联合组MMSE评分明显高于右美托咪定组及乌司他丁组(P0.05)。联合组不良反应总发生率为24.00%,显著低于右美托咪定组(50.00%)和乌司他丁组(48.00%)(P0.05)。结论:与单用盐酸右美托咪定和乌司他丁相比,盐酸右美托咪定联合乌司他丁可更有效预防老年腹部手术患者苏醒躁动及POCD的发生,且安全性更高,可能与其明显降低患者血清炎症因子水平有关。     

基于结构改造来源于大阪伊德氏杆菌201-F6的PET水解酶

聚对苯二甲酸乙二酯 (Polyethylene terephthalate,PET) 塑料是由对苯二甲酸 (Terephthalic acid,TPA) 和乙二醇 (Ethylene glycol,EG) 通过酯键聚合而成的高分子聚合物,具有性质稳定、不易分解等特点,目前已成为广泛使用的一种聚酯,然而大量产生的PET废弃物同时也造成严重的环境污染。2016年,一种有效降解PET的PET水解酶在大阪伊德氏杆菌201-F6中被鉴定发现 (命名为IsPETase),且多个IsPETase结构已被解析。为了设计获得PET降解效率更高的IsPETase,针对底物结合位点Ⅱc区的天冬氨酸233 (N233) 残基进行了多种突变测试,酶活性检测实验表明,用丙氨酸替代N233可以提高IsPETase的性能,尤其是结合R280A突变后,IsPETase活性增加更为显著。此外,解析了IsPETase N233A突变体的X射线晶体结构。IsPETase N233A突变体与IsPETase野生型整体结构相似,但丙氨酸取代N233后增加了底物识别位点Ⅱ末端的空间结构,推测因此增加了IsPETase的活性。这些结果为进一步基于结构改造PET水解酶提供了新的线索。     

有害甲藻Stoeckeria algicida在辽东湾的时空分布

Stoeckeria algicida为甲藻纲胸甲球藻科,有侵噬鱼类细胞杀鱼的能力,可导致鱼类成群死亡,同时也会杀死其他海洋微藻。由于该藻个体微小、形态学鉴定困难,研究较为迟缓,我国海域几乎没有该藻的研究报道。近几年,高通量测序技术的发展极大地推动了微型/微微型浮游植物的鉴定研究,为了解我国辽东湾海域是否存在Stoeckeria algicida及其分布情况,以18S rD NA V4区作为目标基因,结合高通量测序技术,专门设计了微型/微微型浮游植物鉴定引物对V4(F/R),随后对辽东湾2014年四季海水中微型和微微型浮游植物多样性进行了检测。结果发现,Stoeckeria algicida除了春季未检出外,其他季节均有检出,温度是影响该藻繁殖的主要因素。虽然Stoeckeria algicida在整个环境样品中优势度不太明显,但其夏季密度较高(最高达2.753×10~3个/L),高值区主要分布在辽东湾东西两岸,致灾风险较高,应引起有关方面足够重视。Stoeckeria algicida在我国海域首次报道,其危害后果严峻,必须加强监测监管。