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【背景】枝孢菌SYC63是一株具有重寄生作用和抗菌活性的潜在生防菌株,目前尚无研究报道该菌株的全基因组序列,因此限制了其开发与利用。对该菌株进行基因组测序与分析,将进一步了解其重寄生的分子机制,为其在生物防治上的应用奠定研究基础。【目的】解析枝孢菌SYC63基因组序列信息,初步探究该菌的重寄生作用机制。【方法】利用二代高通量测序平台对枝孢菌SYC63进行全基因组测序,运用相关软件对其测序数据进行基因组组装、基因功能注释、预测次级代谢产物合成基因簇并分析重寄生相关的碳水化合物酶类基因等。【结果】基因组组装后共得到17个contigs,总长度为31 912 211 bp,GC含量为52.80%,预测到12 327个编码基因。其中,4 029、949和6 595个基因分别能在KEGG、COG和GO数据库中被注释到,同时还预测到25个次级代谢产物合成基因簇。对重寄生机制相关的碳水化合物酶类进行分析并与重寄生菌株(拟盘多毛孢菌、木霉及盾壳霉)比较,发现该菌具有较多的糖苷水解酶和糖脂酶基因,而且细胞壁降解酶类基因经锈菌孢子壁处理后在转录组测序中显著上调表达,初步分析了该菌与重寄生木霉在分子水平上的... 相似文献
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【目的】通过建立雌、雄性SD (Sprague-Dawley)大鼠模型,研究高脂饮食(high fat diet,HFD)对不同性别大鼠肠道菌群及室旁核(hypothalamic paraventricular nucleus,PVN)区小胶质细胞激活的影响。【方法】选取24只3周龄的SD大鼠,雌雄各半,随机分成雄性对照组(CM)、雌性对照组(CF),雄性高脂组(HM)、雌性高脂组(HF),共4组,每组6只。喂养至10周龄,收集大鼠新鲜粪便并提取细菌总基因组DNA,通过PCR扩增16SrDNA的V3+V4区域,进行高通量测序;采用气相色谱法分析大鼠盲肠内容物中短链脂肪酸(short chain fatty acids,SCFAs)含量;以real-time PCR技术分析PVN区小胶质细胞激活标记物CD11b和炎性细胞因子TNF-α、IL-6的m RNA相对表达水平。【结果】雌、雄高脂组分别与对照组相比,HM组大鼠肠道菌群总数及菌群多样性明显减少(P<0.05),HF组大鼠肠道菌群丰度明显减少(P<0.05)。与CM组相比,HM组大鼠盲肠中乙酸含量显著下降(P<0.0... 相似文献
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中国是荔枝(Litchi chinensis)的原产地,种植面积和产量规模均居世界第一位,以“岭南果王”著称的中国荔枝在国际鲜果市场享有极高的声誉。荔枝蒂蛀虫(Conopomorpha sinensis)在我国广泛分布于热带南亚热带地区,是荔枝的主要害虫,其幼虫蛀食荔枝果核、果蒂,会影响果实生长发育及商品果率,造成严重的经济损失。荔枝蒂蛀虫的行为隐蔽,世代重叠,难以控制。目前生产上对该虫的控制主要依靠化学防治,但长期使用化学农药容易产生污染环境、药物残留、食品安全以及虫抗药性的问题。本文结合国内外研究进展,着重从荔枝蒂蛀虫生活习性及危害发生规律、预测预报、物理防治、生物防治及生物源农药应用等方面进行综述,并对荔枝蒂蛀虫绿色防控研究方向及以农业防治为基础的综合防治方法进行展望。 相似文献
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目的:鉴定高致病性H5N1禽流感病毒感染A549肺癌细胞后,细胞蛋白质组的表达变化,并鉴定特异分子通路的改变及其涉及的关键蛋白质分子。方法:利用稳定同位素标记氨基酸技术(SILAC)标记A549细胞,得到“重标”或“轻标”的A549细胞;“重标”细胞感染高致病性F15N1禽流感病毒24h后提取细胞总蛋白,与从未感染病毒的“轻标”细胞中提取的总蛋白等量混合,酶解肽段,经正交反相色谱分离后用质谱鉴定,对数据进行定性和定量分析。结果:共鉴定到3504个蛋白质,有定量信息的蛋白质为2469个,病毒感染后表达量升高的蛋白质为72个,表达量降低的蛋白质为66个,其中包括参与多个分子调控途径如RNA剪接体、干扰素诱导通路、泛素化通路、胰岛素通路等的蛋白质。结论:建立了利用SILAC技术研究宿主细胞一病毒相互作用的方法,发现了高致病性H5N1禽流感病毒感染宿主细胞相关的关键蛋白质,为探索H5N1病毒致病的分子机理提供了理论基础。 相似文献
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目的:对保存的WJBC株波瓦生病毒进行全基因组序列测定和分析,阐明其与已报道毒株之间的关系。方法:将波瓦生病毒基因组编码区分11段进行RT-PCR扩增,扩增产物直接进行测序,非编码区采用RACE法进行扩增,扩增产物纯化并连接pGEM-Teasy载体后转化大肠杆菌DH5ct感受态细胞,挑取阳性克隆鉴定后进行测序,用DNAstar软件将测序结果拼接得到全基因组序列。下载波瓦生病毒全基因组核苷酸序列,利用MEGA5.0软件构建系统进化发生树。结果与结论:WJBC株波瓦生病毒全基因组共11839nt,编码3415个氨基酸残基,病毒基因组5’端和3’端分别有111、483nt的非编码区;进化树结果显示,WJBC株波瓦生病毒与LB株波瓦生病毒的亲缘性最高,可能为同一病毒株.. 相似文献
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目的比对实验室常用的H5N1禽流感病毒检测方法灵敏性。方法增殖H5N1病毒,蚀斑技术定量待检病毒,应用细胞接种、血凝实验、RT-PCR、Real-time RT-PCR等方法检测稀释的病毒悬液,比较检测的最低滴度。结果细胞接种、Real-time RT-PCR、RT-PCR及血凝实验能检测病毒的最低滴度为10 PFU/mL、10 PFU/mL、103 PFU/mL及3.52×105 PFU/mL。结论几种检测方法比较而言,细胞接种与Real-time RT-PCR检测灵敏性最高;血凝实验用时最短,但灵敏性低,结果需要进一步确认;RT-PCR用时较较短,检测灵敏性较高。 相似文献
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目的: 重复-Gx加速度暴露对新西兰家兔心脏结构的影响。方法: 20只新西兰家兔随机分为2组(n=10):对照组、-Gx加速度暴露组。-3.6 Gx暴露2 s,间隔5 min,每天重复20次,共30 d;对照组不受加速度作用。末次-Gx加速度暴露后,用静脉注射空气法处死动物,迅速取左心室心肌组织,常规取样并采用光学显微镜及透射电镜进行组织学观察。结果: -Gx加速度暴露组家兔心肌切片在光学显微镜下可见心肌细胞的形态及排列等与对照组无显著区别;-Gx加速度暴露组家兔心肌在透射电镜下可见,心肌纤维断裂、排列紊乱、心肌细胞水肿、核膜扩张、血管内皮基膜分离。结论: -Gx加速度暴露可造成家兔心肌细胞超微结构损伤,提示应重视长期重复-Gx加速度暴露对舰载战斗机飞行员心脏功能的影响和防护。 相似文献
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【背景】V-myb禽成髓细胞瘤病毒癌基因同源物(v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog, MYB)转录因子广泛存在于真菌中,在真菌的胁迫响应与致病性中发挥重要功能。枝孢菌(Cladosporium sp.)作为一类对锈菌有重寄生作用的真菌,具有极高的生防潜力,然而有关其MYB转录因子尚未见报道,对其MYB家族转录因子进行鉴定和表达分析,有助于理解枝孢菌在重寄生过程中发挥的作用。【目的】了解重寄生枝孢菌(Cladosporium cladosporioides) SYC63菌株中MYB转录因子家族种类数目及在重寄生过程中发挥的作用。【方法】利用生物信息学方法对其基本特性进行预测,并结合锈孢子诱导下的表达情况进行分析。【结果】枝孢菌SYC63中包含22个MYB转录因子家族基因,所有MYB转录因子均含有SANT结构域,分子量为28.26-239.05 kDa,等电点(isoelectric point, pI)为4.57-10.15,均为亲水蛋白;大多定位在细胞核,共有1R-MYB和2R-MYB两类,均含有响应病原菌的启动子结合位点... 相似文献
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植物脂氧合酶研究进展 总被引:6,自引:0,他引:6
脂氧合酶(简称LOX)是广泛分布的含有非血红素离子的双加氧酶,它是植物十八碳酸代谢途径的关键酶.该途径也称LOX途径。因为该酶作用的产物在植物的生长发育过程中以及在植物对环境胁迫反应中起着重要的作用,因此一直是人们研究的热点。目前对于植物脂氧舍酶的研究主要集中在脂氧合酶基因的表达调控、LOX途径的生化研究以及代谢产物的生理功能这几个方面。 相似文献