12个物种miR-302基因簇的生物信息学分析

很多microRNA (miRNA)基因在基因组上聚集排列形成miRNA基因簇.miRNA基因簇在进化上较为保守,有其特殊的生物学意义.miR-302基因簇在胚胎干细胞中特异表达,对胚胎干细胞的自我更新和多潜能维持有重要的作用.本文采用miRBase数据库查询和BLAST同源搜索方法共搜寻并分析了12个物种的miR-302基因簇.生物信息学分析表明,这些物种miR-302基因簇均位于LARP7蛋白基因的内含子区,但转录方向与LARP7基因转录方向相反.序列相似性分析显示,同一物种miR-302簇成员间以及不同物种相应miR-302簇成员间相似性均较高.进化分析表明,基因复制可能是miR-302基因簇进化的主要驱动力.     

抗菌肽及抗菌肽转基因植物研究进展

抗菌肽是一类小分子多肽,在生物体内分布广泛,具有广谱的抗菌性,是生物体内天然防御系统的一部分。主要介绍了抗菌肽的性质,类型,作用机制及抗菌肽转基因植物的研究进展。     

U83 Box C/D snoRNA构建果蝇科系统发生树

利用已报道的黑腹果蝇U83基因搜索果蝇基因数据库,鉴定了10种新的果蝇科U83同源基因,它们均位于相应物种核蛋白基因rpl3的内含子中。以冈比亚按蚊为外类群,对11种果蝇的U83核苷酸序列作进化关系分析,用邻接法重建了系统发生树,结果与传统方法构建的系统发生树相比,能反映果蝇科的大致进化关系,但还存在部分差别。为增加序列信息,把序列长度拓展至整个U83所在的内含子,同法构建系统发生树,结果与传统系统发生树几乎完全一致。该研究是用boxC/D snoRNA基因序列构建系统发生树的首次尝试,实验结果证明U83可以很好地用于构建果蝇科内各物种的种系发生树。     

泰和乌骨鸡肌肉氨基酸营养价值的研究

泰和乌骨鸡肌肉含有18种氨基酸,总量为20.63%,其中8种人体必须氨基酸总量为8.30%,4种鲜味氨基酸总量为8.96%。必须氨基酸在总氨基酸中所占的百分比高于WHO/FAO模式,必须氨基酸的构成比例基本符合WHO/FAO标准     

一种具有应用价值的基因工程表达系统

基因工程技术的目的是使外源基因在受体细胞内按人们期望的方式进行表达,表达系统是基因工程的关键。原核生物表达系统已为人们所深入了解并被广泛应用。真核生物表达系统一度发展缓慢,随着人们对真核生物如酿酒酵母Ｕ山ｃｃｈａｒｏａｐｃｅｓｃｅｒｅｖ０。ｅ）遗传表达机制的深入了解以及实验手段的不断提高,其基因工程表达系统也建立起来了。但是,人们发现酿酒酵母作为一种基因工程表达系统存在一些局限性川,因为酿酒酵母是以发酵为主的酵母,在采用常规的通气发酵条件下其所能达到的生长速度和密度并不高。所以表达外源基因很难达…     

濒危植物华东黄杉种群遗传多样性ISSR分析

采用ISSR分子标记技术分析了5个华东黄杉居群的遗传多样性水平和居群遗传结构。用10个引物对5个居群共76个样品进行扩增,共得到76条清晰的扩增带,其中69个位点为多态性位点。在物种水平上,多态性百分率（PPB）为90.79%,Nei’s基因多样性指数（H）为0.3361,Shannon’s信息多样性指数（I）为0.4974。在居群水平上,多态性位点百分率在56.58%～85.53%之间,Nei’s基因多样性指数为0.2084～0.2675,Shannon’s信息多样性指数为0.2695～0.4076。物种和居群遗传多样性水平都较高,居群间产生了一定的遗传分化（Gst=0.2366,Φst=26.88%）。由UPGMA聚类分析可知,在5个居群中,湖南阳明山两支与浙江临安先聚为一支,再与安徽休宁聚为一支,最后与江西三清山聚合。鉴于华东黄杉生境的特殊性和人为大量的砍伐,华东黄杉的数量逐渐减少,建议在华东黄杉分布区建立自然保护区,对其生存空间进行长期、有效的保护。     

产棕榈油酸酵母菌的分离和鉴定

1992年分离到一株高产棕榈油酸的酵母菌。该菌株产油脂量为菌体干重的32.06％,棕榈油酸占油脂总量的52.14％,经初步鉴定认为是一株酿酒酵母Saccharomyces cerevisiae。     

miR-34基因家族的分子进化

根据miRNA基因在进化中高度保守的特点，利用生物信息学方法在目前已测序的动物物种中搜寻参与哺乳动物早期发育调控的mir-34基因的同源序列，在33个不同的动物物种中获得了miR-34基因的54条同源序列，其中18条为新发现的序列。表明miR-34是高度保守的，广泛存在于后生动物中。目前发现的mir-34基因80％位于基因间隔区，少数位于蛋白编码基因的内含子区和3′UTR上。不同动物中，mir-34基因成熟序列的同源性为68%，前体序列为38.89%。在无脊椎动物中只有一个mir-34，而在几乎所有的脊椎动物中都有mir-34a，mir-34b，mir-34c, 形成miR-34基因家族。系统进化分析表明,脊椎动物中miR-34基因家族是通过基因的串联和局部重复形成的，这个过程中伴随着个别碱基的变异。     

红曲霉DNA提取及其RAPD-PCR反应体系的建立

采用改进的氯化苄法对红曲霉DNA进行提取纯化,探讨了提取液中EDTA的浓度以及其他因素对提取结果的影响。同时,以该法提取的DNA为模板,采用正交实验优化RAPD分析最佳反应条件。结果表明,当提取液中EDTA浓度为125mmol/l时,所得的红曲霉DNA的质量和数量均较理想,每克红曲霉菌丝体（湿重）能提取到50μg的DNA,分子量约为25kb,以此DNA为模板进行PCR扩增,其最佳反应体系为：Mg^2 2.0mmol/l,dNTPs 0.15mmol/l,Taq 0.05U/μl,模板DNA 1.2ng/μl,随机引物0.36μmol/l,Tris-HCl 10mmol/l pH9.0,KCl 50mmol/l,Nonidet P40 0.1%。另外,通过对比RAN酶消化前后的模板扩增结果证明了本实验酶的消化的必要性,对比了不同预变性时间处理模板对RAPD－PCR扩增的影响,发现不经过预变性的模板扩增结果最理想。