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霍乱弧菌和副溶血弧菌分离株的gyrB基因系统发育分析 总被引:1,自引:0,他引:1
依据gyrB基因部分编码序列构建系统发育树以分类和鉴别霍乱弧菌和副溶血弧菌,并探讨其种系发生关系。扩增并测序13株霍乱弧菌、8株副溶血弧菌、2株嗜水气单胞菌及1株类志贺邻单胞菌的gyrB基因(编码DNA促旋酶B亚单位)序列,并采用距离法与最大似然法构建系统发育树。两种方法所构建的树结构完全一致,霍乱弧菌、副溶血弧菌、嗜水气单胞菌及类志贺邻单胞菌各自形成一个独立的簇。其中,霍乱肠毒素基因(ctxA)阳性的霍乱弧菌(8株O139群与2株O1群ElTor型)聚类成一分枝;3株副溶血弧菌临床株(1株2002年流行株,2株2004年分离株)与1日本菌株及2001年1株自环境分离的毒力株聚类。系统发育分析靶分子gyrB基因可以良好区分上述4种常见病原菌。产毒O139群霍乱弧菌与产毒O1群ElTor型霍乱弧菌关系密切。副溶血弧菌环境毒力株与本地区临床主要流行株在系统发育关系上较为接近,可能是潜在的致病菌。 相似文献
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目的 了解常山县儿童青少年交通伤害发生状况,为制定预防干预措施提供依据.方法 根据《全国伤害监测方案》,在常山县人民医院、招贤中心卫生院、辉埠卫生院建立医院急诊伤害监测系统,以首次在监测医院就诊的各类伤害病例作为监测对象,采用哨点监测方式,以年度为单位持续进行医院伤害监测.结果 常山县2004-2010年监测医院共报告交通伤害病人14 122例,其中儿童青少年交通伤害1 937例,占13.72%;以5~14岁在校学生为多,占14.71%;交通伤害中男、女之比为1.66:1;伤害发生原因机动车车祸比非机动车车祸多.伤害发生场所以公路/街道为主,占94.11%;伤害发生时活动以驾乘交通工具和休闲活动为多,分别占52.30%和32.32%.结论 5~14岁在校学生为伤害预防干预的重点.应有针对性地开展预防干预措施,减少伤害的发生. 相似文献
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2010年浙江省部分地区急性出血性 结膜炎暴发疫情病原学研究 总被引:1,自引:0,他引:1
为查明引起2010年浙江省急性出血性结膜炎(AHC)暴发疫情的病因,并对病原进行分子溯源。本研究采用荧光RT-PCR方法直接从患者眼拭子样本中检测肠道病毒(EV)和柯萨奇病毒A24变异株(CA24v)核酸;用Hep-2细胞分离病毒,对阳性分离物提取病毒核酸后进行VP1全基因和3C蛋白酶区(3C)扩增和测序,同源性与进化分析。结果13份眼拭子样本中EV和CA24v核酸均阳性8份,分离到CA24v6株。选取4株病毒测序,获得VP1全长均为915个核苷酸(nt),3C区全长495nt,VP1和3C区均没有nt插入和缺失。2010年浙江4株CA24v分离株之间在3C区和VP1区核苷酸和氨基酸(aa)高度同源,2010年浙江CA24v分离株与原型株EH24/70在3C区的nt和aa同源性分别为85.2%~85.8%和96.2%~96.7%,与2002~2008年浙江、云南和广东CA24v株的同源性分别为93.4%~96.2%和96.7%~99.3%;浙江2010年CA24v株在3C区进化树的GⅣ基因亚型C4分枝上(GⅣ-C4),在VP1基因进化树的人类肠道病毒C组(EV-C)CA24v分枝上。研究表明引起2010年浙江省急性出血性结膜炎暴发流行的病原为CA24v,GⅣ基因亚型,与引起2002~2008年浙江AHC流行的CA24v株(GⅣ)具有密切的亲缘关系,推测CA24v病毒自2002年以来一直在本地低强度循环,2010年又导致了浙江AHC的暴发。 相似文献
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本文初步研究了湖州市非细菌性急性胃肠炎暴发中检出的诺如病毒的分子生物学特征。收集湖州市2008年和2009年2起非细菌性急性胃肠炎暴发疫情中采集的患者粪便标本,采用荧光定量RT-PCR方法对其进行诺如病毒核酸检测,并对核酸阳性标本进行RNA多聚酶部分区域的RT-PCR扩增。选取阳性扩增产物进行纯化及序列测定,结合诺如病毒GI、GII各基因型参考株进行核苷酸序列遗传进化分析。结果2起疫情均同时检出了GI和GII型诺如病毒。随后对其中4份RNA多聚酶区扩增阳性的标本进行测序及序列分析,结果发现2008年检出的2株GI型诺如病毒均为GI/2基因型;而2009年检出的1株GI型诺如病毒为GI/3基因型,另一株GII型诺如病毒则与近些年欧洲和亚洲相继出现的遗传组GII的新基因型GIIb的各代表株同源性最高,为GIIb基因型。这说明湖州地区流行的诺如病毒存在很高的遗传多样性,并且不同时间流行的基因型也存在一定差异。这也是国内首次在急性病毒性胃肠炎暴发中检出诺如病毒GIIb变异株。 相似文献
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目的:探讨时间序列ARIMA模型在时间序列资料分析中的应用,建立咳嗽症状监测数据的预测模型.方法:采用条件最小二乘方法估计模型参数.通过对数转换及差分方法使原始序列平稳,按照残差不相关原则、简洁原则确定模型结构,依据AIC和SBC准则确定模型阶数,最终建立起ARIMA预测模型.结果:ARIMA(1,1,1)模型拟合效果较好,方差估计值为0.7361,AIC=95.6092,SBC=98.8310,对模型进行白噪声残差检验,提示残差为白噪声.结论:症状监测这种具有时间序列特点的资料可以用ARIMA模型来进行拟合估计.本文中预测结果可信区间比较宽,可能是因为时间序列比较短,还未能考虑到季节趋势.另外,所用监测数据是在中小学生在校发生症状的人数,故在节假日会出现缺失值,样本量和时间长度均有限,可能影响模型估计的准确性,本研究的结论还有待于将来资料积累后进行修正和深化. 相似文献
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荧光定量RT-PCR技术快速检测SARS病毒核酸 总被引:2,自引:0,他引:2
建立以特异性荧光探针为特点的TaqMan荧光定量RT-PCR方法用于检测严重急性呼吸道综合症病毒(severe acute respiratory syndrome -associate coronavirus,SARS-CoV)核酸.筛选针对SARS病毒基因保守区域设计的引物与TaqMan探针,并对荧光定量RT-PCR反应体系与反应条件进行优化,验证本方法的特异性、敏感度与重复性. 实验结果表明本方法对SARS病毒核酸的检测具有高度特异性,与甲1型、甲3型、乙型流感病毒、禽流感病毒H5N1、麻疹及其他呼吸道病毒均无交叉反应;检测灵敏度达0.1TCID50;从病毒核酸提取至检测完成仅需3h左右,且操作简便,重复性好.本研究建立的TaqMan荧光定量RT-PCR方法特异、敏感、快速,适合于临床实验室进行SARS病毒的早期快速检测. 相似文献
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雌蚊翅振音及其在蚊虫防治中的应用 总被引:1,自引:0,他引:1
蚊虫飞翔时 ,翅上下拍打会形成连续的翅振音。雌蚊翅振音频率会随蚊种、蚊体长和日龄及环境温度而变化 ,一般在 3 0 0~ 5 0 0Hz之间。同种个体间翅振音频率变化较小 ,常在平均频率± 5 0Hz范围内。雄蚊只对基本频率的雌蚊翅振音起反应 ,雌蚊翅振音的偶然变化不会降低其对雄蚊的引诱力。雄蚊对雌蚊翅振音具有敏感反应的主要原因是其听觉器官对雌蚊翅振音形成了良好的适应性。因此 ,许多蚊虫研究者希望利用雌蚊翅振音来防治蚊虫。因该方法对环境安全 ,在今后蚊虫防治中其重要性将会日益显现。 相似文献