厌氧产氢颗粒污泥蛋白质组分析样品的高效制备方法

【背景】厌氧产氢颗粒污泥比絮状产氢污泥具有更高的生物量、沉降性与反应效率,对颗粒污泥进行蛋白质组学研究,有助于揭示其代谢调控的分子机制,从而对厌氧代谢过程进行优化调控。目前关于产氢颗粒污泥蛋白质组分析样品制备方法的研究尚未见文献报道。革兰氏阳性菌Ethanoligenens harbinense YUAN-3是自凝集产氢发酵细菌,在间歇和连续流培养中可形成自聚集的厌氧颗粒,由于其全基因组信息清楚,可作为模式研究材料对制备方法进行评估。【目的】针对厌氧产氢颗粒污泥的蛋白质组学研究,比较不同蛋白质提取方法进行优化。【方法】分别利用液氮研磨、超声破碎、匀浆破碎对产氢颗粒污泥破碎,比较这3种方法对总蛋白提取量的影响;通过双向电泳比较三氯乙酸(Trichloroacetic acid,TCA)-丙酮沉淀法与苯酚抽提法对总蛋白提取效果的影响;对总蛋白样品分别进行同位素标记相对和绝对定量标记(Isobarictagsforrelativeandabsolutequantification,i TRAQ)、串联质谱标签(Tandemmasstag,TMT)标记以及质谱鉴定。【结果】液氮研磨、超声破碎、匀浆破碎3种破碎方法下总蛋白的提取量分别是对照样品的2.0、3.9与5.2倍。与TCA-丙酮沉淀法相比,苯酚抽提法总蛋白样品在双向电泳图谱上的蛋白质点明显增多,分布均匀,同时其在碱性蛋白端与小分子量蛋白端的蛋白质点也明显增多。质谱分析发现,iTRAQ标记样品与TMT标记样品中分别鉴定到1797个与1644个蛋白,在分子量、等电点、亚细胞定位的各个分布范围内,这些蛋白良好地覆盖了E.harbinenseYUAN-3中各个类型的蛋白。【结论】匀浆破碎与苯酚抽提法联用的总蛋白制备方法更适用于厌氧产氢颗粒污泥,该方法有利于后续的蛋白质双向电泳和定量蛋白质组质谱分析,可作为产氢颗粒污泥以及革兰氏阳性菌总蛋白制备的方法参考。     

斯氏按蚊中Toll受体参与抵抗微生物感染和调控肠道菌群稳态

【目的】Toll信号通路是昆虫天然免疫系统的重要组分,其中Toll受体在激活昆虫病原菌侵染免疫应答方面发挥了关键作用。本研究旨在探究斯氏按蚊Anopheles stephensi Toll受体基因在抵抗微生物侵染和维持肠道菌群稳态过程中的功能。【方法】根据冈比亚按蚊Anopheles gambiae Toll受体家族的蛋白氨基酸序列,通过序列同源比对鉴定斯氏按蚊中相应的Toll受体基因;运用荧光定量PCR检测Toll受体基因在未感染病原菌的斯氏按蚊脂肪体中的相对表达量,以及在真菌球孢白僵菌Beauveria bassiana和革兰氏阴性细菌胡萝卜软腐欧文氏菌Erwinia carotovora subsp. carotovora侵染斯氏按蚊过程中的表达变化;最后,在斯氏按蚊雌成蚊胸部显微注射AsToll1A和AsToll5A的双链RNA进行RNA干扰后,检测RNAi处理的斯氏按蚊受真菌侵染后的存活率、肠道细菌含量变化以及抗菌肽基因表达变化。【结果】在斯氏按蚊中共鉴定到8个Toll受体基因,即AsToll1A, AsToll5A, AsToll6, AsToll7, AsToll8, AsToll9, AsToll10和AsToll11。通过荧光定量PCR检测发现,未感染病原菌的斯氏按蚊雌成蚊脂肪体中AsToll5A表达量最高,AsToll1A表达量次之,其余Toll受体基因表达量极低。在球孢白僵菌和胡萝卜软腐欧文氏菌侵染过程中,与对照(注射PBS)比较,AsToll1A和AsToll5A在斯氏按蚊中的表达量显著升高,其余Toll受体基因表达变化不显著或降低。RNA干扰结果表明,AsToll1A或AsToll5A的表达受到抑制后,斯氏按蚊对球孢白僵菌的抵抗能力显著降低,肠道细菌总量与对照(dsGFP)比较显著增多。而且,抑制AsToll1A后抗菌肽基因DEF1和GAM1的表达受到显著抑制;抑制AsToll5A后仅有GAM1表达量下调。【结论】斯氏按蚊Toll受体在结构和功能上具有高度的保守性,其中AsToll1A和AsToll5A能响应病原真菌和革兰氏阴性细菌侵染并且影响肠道菌稳态。     

Sigma B因子活性的调节及其在几种革兰氏阳性食源性致病菌中的作用

Sigma B(-B)是许多革兰氏阳性菌对环境胁迫产生应答反应的主要调控因子.不仅在芽孢形成中具有重要作用,而且-B也直接或间接地调控包括蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus)、单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes)和金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)在内的一些革兰氏阳性食源性致病菌毒力及毒力相关基因的表达.本文结合作者在国内外的相关工作,综述了-B活性的调节方式及其在上述革兰氏阳性食源性致病菌中相关作用的最新研究进展,为深入研究革兰氏阳性食源性致病菌的致病机理、预防和治疗细菌感染提供新的思路和理论依据.     

鲑点石斑鱼皮肤抗菌活性蛋白的纯化及抗菌活性(英文）

近年来在多种生物体中都发现有抗菌活性蛋白和多肽。由于其具有生物化学多样性,抗病毒、微生物、真菌、原生动物、肿瘤,促进伤口愈合等生物学活性,而引起研究者的极大兴趣。抗菌活性蛋白和多肽在动物的先天免疫中具有重要作用,它们直接作用于细菌,并将其杀死。鲑点石斑鱼(Epinephelusfario)是中国南方水产养殖中重要的海水鱼。近年来,由于细菌和病毒引发的病害造成鲑点石斑鱼大量死亡,但其抗菌活性蛋白及多肽目前还未见报道。本研究发现鲑点石斑鱼皮肤具有抗菌活性成分,鲑点石斑鱼皮肤匀浆物经胰蛋白酶水解后抗菌活性丧失,说明该活性是由蛋白质引起的。经离子交换层析及凝胶过滤层析,从鲑点石斑鱼皮肤中分离纯化到抗菌活性蛋白(Efap)。SDS-PAGE显示,Efap为单链蛋白,分子量约41kD。该成分能同时抑制革兰氏阳性菌,如金黄色葡萄球菌、滕黄微球菌、枯草牙胞杆菌和革兰氏阴性菌,如溶藻弧菌、副溶血弧菌、河流弧菌、多杀性巴氏杆菌、嗜水气单胞菌、大肠杆菌和铜绿假单胞菌。革兰氏阴性菌中,溶藻弧菌、副溶血弧菌、河流弧菌和多杀性巴氏杆菌对Efap较敏感,MIC<20mol/L,其他3种菌敏感性较差,MIC>20mol/L。另外,Efap显示出较强的抗金黄色葡萄球菌的活性,MIC为5—10mol/L。Efap的广谱抗菌性,说明其在鲑点石斑鱼免疫防御中具有一定的作用。     

碱性纤维素酶革兰氏阴性菌株筛选及酶学性质研究

用CMC平板筛选方法,从造纸厂碱性淤泥中获得透明圈直径大于30mm的产碱性纤维素酶革兰氏阴性菌H8005。液体摇瓶培养产生碱性CMC酶活力高达4．2IU／mL。酶学性质初步研究显示,H8005产生的CMC酶反应的pH值以8．0左右为适;在碱性条件下具有较高的酶活和一定的稳定性;反应温度以55℃左右为宜;且具有较好的温度稳定性。Mn^2＋与Fe^3＋对酶反应有促进作用,Cu^2＋和Pb^2＋对酶反应有抑制作用。该菌产生的纤维素酶在棉织品的水洗整理及洗涤剂工业中具有非常良好的应用前景。     

产超广谱β-内酰胺酶阳性菌检测及其耐药性分析

目的 了解新乡市中心医院近年来产超广谱β-内酰胺酶（ESBLs）阳性菌的种类、分布及对11种常用抗菌药物的耐药情况,为控制其扩散、暴发流行和指导临床治疗提供科学依据。方法 对该院2003年1月～2004年1月从临床各类标本中分离的革兰阴性菌用双纸片协同法筛选产超广谱β-内酰胺酶阳性菌株,采用K-B纸片扩散法比较亚胺培南等11常用抗菌药物对产ESBLs耐药菌体外抗菌作用。结果 产ESBLs耐药株占全部革兰阴性菌的22.82%,克雷伯菌属、肠杆菌属、埃希菌属、假单胞菌属和沙雷菌属ESBLs的流行较严重,检出率分别为31.22%、29.02%、27.23%、25.19%和23.08%,在11种常用抗菌药物中,亚胺堵南的体外抗菌活性最好,敏感率为100%。结论 革兰阴性菌中,ESBLs阳性菌的发生率较高,同时ESBLs阳性菌有较高的耐药性。实验室应注重ES-BLs的检测和报告,指导临床合理应用抗生索,有效地控制ESBLs菌株在医院内的传播和流行。     

产科感染革兰阴性菌株产超β-内酰胺酶检测及耐药性分析

目的 了解引起产科感染革兰阴性杆菌产超β-内酰胺酶（ESBLs）及耐药情况。方法采用ESBLs确认试验检测ESBLs,头孢西丁三维试验检测AmpC和K-B进行药敏试验。结果 革兰阴性杆菌ESBLs、AmpC酶总检出率分别为32．0％、33．6％,单产ESBLs、单产AmpC、同产ESBLs＋高产AmpC酶和ESBLs＋诱导AmpC酶菌株依次占11．9％、13．5％、14．1％和6．03％．总分离株对亚胺培南、头孢哌酮-他唑巴坦的耐药率分别为5．28％、6．54％,其次为头孢吡肟,为25．0％。单产酶株较非产酶株,双产酶株较单产酶株具有较高的耐药率。结论 产酶是产科感染革兰阴性菌株多重耐药的主要原因之一,亚胺培南和头孢哌酮-他唑巴坦、头孢吡肟（FEP）对其具有良好的抗菌活性。     

从滑桃树种壳中分离到具抗细菌活性的新木脂素(英文)

Five neolignans including four new ones were obtained from the seed endotheliums of Trewia nudiflora L. Their structures were determined to be 9‘-methyl americanol A(1), 9‘-methyl isoamericanol A(2), 9‘-ethyl americanol A(3), 9‘-butyl americanol A(4), and americanin (5). Two acetylated products 3,4-diacetyl americanin (5a) and 3,4,9-triacetyl americanin (5b) had been prepared from compound 5. All of these compounds were investigated on antibacterial assays when carbenicillin sodium, streptomycin sulfate and rifampicin were used as positive controls. Compounds 4 and 5 exhibited antibacterial activities against gram-positive bacterium Staphylococcus aureus and gram-negative bacterium Mycobacterium tuberculosis at the minimum inhibitory concentrations (MIC) of 50μg/mL and 100μg/mE respectively, but 5a and 5b did not exhibit antibacterial activity at 200μg/disk.     

8508例阴道分泌物革兰氏染色镜检结果分析

目的探讨女性阴道分泌物中滴虫、霉菌及线索细胞数量与女性年龄状况、阴道分泌物洁净度及阴道炎症状况的关系。方法将2015年6月~2016年7月我院收治的8508例妇科病患者的阴道分泌物进行常规检查和革兰氏染色镜检其滴虫、霉菌及线索细胞的情况。结果 8508例标本中,检出滴虫731例,霉菌1681例,线索细胞596例。其中滴虫、霉菌、线索细胞在育龄期女性中检出率较高,阴道清洁度在Ⅲ°和Ⅳ°的检出率明显较高;滴虫在WBC3+、WBC4+时检出率较高,霉菌在WBC2+、WBC3+时检出率较高,线索细胞在WBC10/HP时检出率较高。结论阴道分泌物中滴虫、霉菌及线索细胞检出率与女性年龄状况、阴道洁净度情况及阴道炎症状况有关。     

革兰氏阳性菌细胞外囊泡的研究现状

细胞外囊泡(EVs),也称为膜小泡,是真核细胞和细菌分泌的囊泡状小体.它通过携带蛋白质、DNA、RNA和各种代谢物进行细胞间物质的交流传递.根据内容物的不同发挥不同的生理功能,如传递营养物质、参与免疫反应、治疗癌症等.目前大多数研究专注于真核细胞和革兰氏阴性菌囊泡的探索,而对革兰氏阳性菌中分泌的囊泡研究较少.这篇综述总...