应用DGGE研究微生物群落时的常见问题分析

变性梯度凝胶电泳(DGGE)是通过核酸片段对微生物群落进行研究,可以监测未培养细菌及其功能基因,被广泛地应用于微生物群落多样性和动态分析,并成为微生物分子生态学研究中的重要手段之一。文中论述了DGGE操作过程中遇到的常见问题,并提出了相应的解决方法。全面分析了样品预处理过程和PCR扩增效果对DGGE分析的影响,探讨了DGGE图谱的优化过程和图谱分析方法,并对DGGE的应用前景进行了综述。     

藏北申扎地区下石炭统永珠组下部孢子组合的特征及意义

报道藏北申扎永珠区德日昂玛—下拉剖面的永珠组孢子组合,发现孢子43属,70余种(包括未定种)。组合特征如下:1)缺乏欧美植物地理区早石炭世典型的石松类植物的小孢子Lycospora属及早石炭世晚期(维宪期)重要孢子属;2)出现较多早石炭世早期(杜内期),甚至泥盆纪晚期分子。呈现出新老化石的混合现象;3)北半球和南半球孢子的混合组合,同时也是冷、暖微古植物群混合,既有相当于中国早石炭世晚期大塘期以及西欧维宪期典型属种,又有南半球澳大利亚(包括巴西和非洲大陆)的维宪期的典型种。从孢子化石混合现象看,永珠组应为近岸浅水或滨海条件下的沉积,下伏地层的孢子化石再沉积现象说明当时有一次很大的海平面下降,在邻近地区出现了大面积的剥蚀区。说明杜内期末期—维宪期初期,申扎地区出现一次由冈瓦纳大陆冰川发育造成海平面相对下降。形成区域上不整合界面———洛工组或“巴日阿朗寨段”底部的不整合界面。混合孢子组合中的寒冷气候条件下的孢子化石的发现,印证了杨式溥、范影年和林宝玉推断的冈瓦纳冰川自早石炭世维宪期(大塘期)开始就影响到西藏申扎的推论。     

陕南早寒武世具口部的磷酸盐化Punctatus及其胚胎化石

报道陕西南部灯影组宽川铺段地层中发现的Punctatus锥体标本、保留精美软组织特征的口部标本和可能的胚胎标本。对Punctatus软组织及整体形态功能研究表明,Punctatus在分类上可能更接近于腔肠动物的水螅型,代表初具原始触手的腔肠动物早期演化类型。在上万枚与Punctatus共生的球状化石中,发现若干枚可能的原肠期胚胎及胚胎发育晚期标本,在此基础上提出PunctatusemeiensisHe,1980花冠状口部可能经历的胚胎发育序列。     

运用微生物法测定保健食品中的维生素B6

介绍运用微生物法测定保健食品中维生素B6的含量。GB／T5009．154—2003将微生物法规定为测定食品中维生素B6的国家标准方法Ⅲ。其原理为卡尔斯伯酵母菌需在有维生素B6存在的条件下才能生长,在一定条件下维生素B6的量与其生长量成正比关系。用分光光度仪在550nm波长下测定该菌的生长．与标准曲线相比较,从而得出该样品中维生素B6的含量。通过对国标方法作较详细的注解,并对有些地方作适当的修改,以期对需要开展此项工作的实验室及其人员会有较大的帮助。     

万古霉素对金黄色葡萄球菌体外抗菌活性研究

目的调查万古霉索对金黄色葡萄球菌的体外抗菌活性。方法收集温州医学院附属第一医院2005年2～7月从临床各种标本分离的金黄色葡萄球菌112株,PCR检测mecA基因确定MRSA,采用琼脂稀释法和全自动微生物分析仪检测金黄色葡萄球菌万古霉素MIC值,使用4mg／L万古霉索脑心浸液琼脂（BHIA）筛选异质性耐万古霉素金黄色葡萄球菌（hVRSA）。结果MRSA的检出率为64．3％,万古霉素的MIC大多数≤2mg／L,MIC。为2mg／L,有2株菌在4mg／L万古霉素BHIA平皿上生长,经菌群分析法证实非hVRSA。仪器法检测的万古霉素MIC值与琼脂稀释法的符合率只有35．7％,琼脂稀释法万古霉索MIC高于仪器法,仪器法检测的2株万古霉素中介耐药的菌株经琼脂稀释法和K-B法证实为敏感株。有6株对万古霉索的MIC为4mg／L,按美国NCCLS／CLSI2006年的标准被确定为万古霉素中介耐药株。结论万古霉素对金黄色葡萄球菌具有较强的体外抗菌活性,未发现耐药株,但MIC值较大。仪器法检测金黄色葡萄球菌对万古霉素的敏感性结果不可靠。按NCCLS／CLSI2006年的标准临床上能检测到对万古霉素中介耐药的金黄色葡萄球菌临床分离株。     

《微生物学实验》

《微生物学实验》由多所院校长期从事微生物教学和科研工作的青年骨干教师编写,并由权威专家主审。编写者既有农林院校(南京农业大学、东北农业大学、东北林业大学)又有综合性院校(哈尔滨师范大学)的专家、教授,因此本书内容全面,即包括了普通微生物学实验所需要的总论部分实验技术,同时又具有动物微生物学实验技术所需要的各论实验部分;书中还介绍了一些国际上的最新实验技术,明显体现了本书的优势所在。该书特点：简明扼要、实用性强,并注意突出对学生独立工作能力的训练和培养。因此,本教材既适用于高等院校生命科学、微生物学、…     

室内空气生物污染的研究进展

室内空气质量问题近年来得到了极大关注,由于室内空气的生物污染物与多种健康问题密切相关,所以有效监控室内空气生物污染对改善人们的生活环境和工作环境具有重要意义。本文对室内空气生物污染物的种类、危害、影响因素作了简要介绍,综述了污染物的多种检测方法及其最新研究进展,并对相关的研究领域进行了展望。     

一种快速提取肠道微生物总DNA的方法

采集的兔肠道内容物及其粪便样品,通过分散浸泡、震荡洗涤、分级离心、滤器过滤、DNA提取试剂盒提取纯化,可以获得纯度很高的DNA样品。经0.8%琼脂糖凝胶电泳检测和紫外分光光度计测定,样品A260/A280的比值为1.72±0.02。分别以提取的DNA样品为模板,通过设计的细菌特异引物,对其16S rDNA基因进行PCR扩增,获得了1.6 kb大小特异性很好的预期条带。这为肠道微生物群落的分子生态学研究提供了一种简便、可靠的DNA提取方法。     

微生物能源的转化效率和经济可行性研究

生物质能源在中国,尤其是农村地区是一种十分重要的能源,然而,目前和将来油气资源的缺乏不仅影响国民经济的发展,而且危及能源安全。估算了4种最具应用前景的微生物能源包括微生物柴油,生物乙醇,氢气和沼气,并讨论了经济可行性及使用前景。其诣在帮助发展将生物质转化为燃料的技术,而此项技术对中国经济的发展具有重要的意义。     

2株耐低温微生物处理污水模拟试验初报

从下水管道的污泥中分离筛选到耐冷细菌H6和耐冷酵母菌J1,采用此2菌株进行模拟污水低温(8℃)处理试验。H6和J1菌株对模拟污水COD的去除率分别为66.6%和72.2%;H6、J1菌株对有机氮去除率分别为76.9%和64.5%;H6、J1菌株对总磷去除率分别为53.9%和14.0%。说明低温微生物在低温环境的污水处理具有广阔的应用前景。