鸡Myf6基因遗传多态性及其遗传效应研究

采用测序和单链构象多态(SSCP)的方法分析了Myf6基因在5个优质肉鸡纯系和3个杂交配套系中的遗传分布、遗传变异及群体杂合性等群体遗传信息, 并分析了Myf6基因对胴体性状及肉质性状的遗传效应。结果发现该基因的CDS区域非常保守, 仅在外显子1的47位处发生点突变由G→A, 由于人工选育的原因, 该基因不同基因型的分布在2个优质肉鸡纯系中偏离了Hardy-Weinberg平衡, 并且杂合度较低, 遗传一致性较高, 但在3个杂交配套系中仍都服从Hardy-Weinberg平衡, 杂合度较高, 达到了配套杂交的目的。野生型A基因可显著地提高活重、屠体重、胸肌重和腿肌重(P <0.05), 同时也会降低肉的嫩度。具体地讲, A基因对增加活重、屠体重、胸肌重和腿肌重的加性效应值分别为45.54 g, 41.03 g, 6 g和9.775 g; 对增加肌纤维直径和肌纤维密度的加性效应值分别为1.025 mm和-29.99 mm2。     

兔GHR基因单核苷酸多态性及其与屠宰性状的相关性

摘要: 采用PCR-SSCP技术和DNA测序的方法, 对比利时兔、天府黑兔、齐卡巨型兔、哈尔滨白兔以及加利福尼亚兔5个肉兔品种的生长激素受体(Growth hormone receptor, GHR)基因进行单核苷酸多态性分析。结果发现了2个单核苷酸多态位点, 分别位于外显子10的705(T→C)和810 (C→T)。通过最小二乘分析SNPs及其与屠宰性状的关系发现, 基因型AA和MM所对应的活重、全净膛、屠宰率最小二乘均值都显著低于基因型BB和NN(P<0.05)。但各基因型饲料转化率最小二乘均值差异不显著(P>0.05)。由此可以初步推断, GHR基因是影响兔体重和屠宰率等屠宰性状的主要候选基因。     

兔黑素皮质素受体4(MC4R)基因多态性及其与体重及屠体性状的关联研究

以哈尔滨白兔、天府黑兔、比利时兔、齐卡巨型兔以及加利福尼亚兔5个肉兔品种共220个个体为研究对象, 采用PCR-SSCP技术和克隆测序技术进行SNPs检测和基因型的分析。结果发现兔MC4R基因237位发生转换突变(A→G), 5个品种内的AA基因型和A等位基因频率均分别高于AG基因型和G等位基因, 而哈尔滨白兔、比利时兔以及齐卡巨型兔3个品种兔的AG基因型频率和G等位基因频率明显高于天府黑兔和加利福尼亚兔。单位点基因型与屠体性状、饲料转化率以及熟肉率的最小二乘分析表明; AG基因型与兔的体重、全净膛重以及饲料转化率有显著的关系(P<0.05), 而与熟肉率的关系不显著(P>0.05)。结果表明, MC4R基因可以作为影响和控制兔体重及屠体性状的候选基因。     

CXCR2基因多态性与奶牛乳房炎和乳品质的关联

采用PCR-SSCP技术研究了荷斯坦牛、西门塔尔牛和通江黄牛3个品种共160头个体CXCR2基因多态性与乳房炎抗性性状和对牛奶品质性状的遗传效应。结果表明: CXCR2基因有3个SNP多态位点, 分别位于序列的第685 bp、777 bp和861 bp位点, 确定了5个等位基因A、B、C、E和F。685 bp位点表现为BC和CC基因型, 777 bp位点表现为AA和AB基因型, 861 bp位点为CC和BC基因型。与奶牛乳房炎敏感性有关的基因型主要是BC、CC和FF, 可能对乳房炎有抗性的是AA、AB和EE基因型。据不同基因型对乳品质的遗传效应分析来看, AA、AB和EE基因型的乳品质性状极显著或显著优于其他基因型。     

利用微卫星标记进行凉山半细毛羊亲权鉴定的研究

经多重PCR扩增20个微卫星标记,对凉山半细毛羊进行亲权鉴定。荧光标记检测扩增产物,并用Cervus 2.0分析。结果表明：当双亲未知时,累积排除概率为0.998666 ,在父系半同胞基础上进行母子亲权鉴定,累积排除概率为0.999994,置信度为95%,最终从8个候选父亲中找出215个后裔的父亲,又从147个候选母亲中找出它们的母亲,构建了一个混合家系系谱,为进行连锁分析、QTL定位奠定了基础,并对研究绵羊群体结构、历史及多样性有重要意义。Abstract: The usefulness of multiplex polymerase chain reaction was evaluated and fluorescent detection with 20 microsatellites was used for paternity testing of Liangshan semi-fine wool sheep. The results in Cervus 2.0 indicated that the combined exclusion probability was 0.998666 when parents were both unknown. If father was known, combined exclusion probability was 0.999994, with confidence level of 95%. Finally, the biological parents of 215 individuals in offspring were found from 8 candidate fathers and 147 candidate mothers, and a mixed pedigree was constructed. It is useful for linkage analysis of sheep chromosomes and QTL location, also for the study of population structure, history, and diversity.     

MyoG基因的遗传效应分析

实验采用PCR-RFLP技术分析了不同品种猪MyoG基因3′端MspⅠ位点的多态性,应用单标记回归模型分析了不同基因型与相关性状间的关联性及不同等位基因的遗传效应。结果表明：N等位基因能极显著地增加胴体瘦肉率和眼肌面积,降低皮脂含量（P<0.01）,改善胴体产肉量和提高胴体品质;同时,不同基因型对肉质性状的遗传影响作用较大,表现为N等位基因能极显著地降低猪肉品质,使pH值、肉色和肌内脂肪含量降低,并使肌肉的系水力变差（P<0.01）。N等位基因对增加胴体瘦肉率的加性效应值和显性效应值分别为3.929%和-0.602%;对增加眼肌面积的加性效应值和显性效应值分别为2.0985 cm2和-0.5775 cm2;对皮脂率的加性效应值为-3.0245%,显性效应值为-0.4045%。N等位基因对pH1的加性效应值和显性效应值分别为-0.167和0.034;对贮藏损失的加性效应值和显性效应值分别为0.558和-0.347;对肌内脂肪含量的加性效应值和显性效应值分别为-0.963和-0.217。但MyoG基因3′端MspⅠ位点的突变对FOM肉脂仪测定的胴体等级性状的影响不显著（P>0.05）。     

中国部分猪种SLA-DQB外显子2遗传多样性

运用PCR-SSCP和克隆测序对中国部分猪种的SLA-DQB基因外显子2的多态性分析表明：有功能的DQB基因有68个新等位基因,假基因（SLA-DXB）等位基因有5个。各等位基因的数量分布极其不平衡,而且许多品种都表现出共享等位基因。9个主要等位基因中, C08广泛分布在中国猪种的6大地方类型11个品种及云南和四川野猪中,它为中国猪种特有的共享等位基因,占总数的55.10%。在单一的个体中拥有5条以上序列,说明SLA-DQB基因座在某些品种中拷贝数为3个。SLA-DQB外显子2的等位基因核苷酸和氨基酸多态变异位点分别高达81个和49个,等位基因多样度（H=0.889）以及核苷酸多样度（Pi =0.047）都很高,总体表现为β折叠区的Pi值均高于α螺旋区。综合分析表明华南型、西南型猪H和Pi均较高,高原型的藏猪最低。类群内遗传距离排序与Pi值高低排序一样,可见各地方类型中核苷酸替换的差异正比于核苷酸多样度。类群间遗传距离比较,江海型与华北型间的距离最大,而华中型和高原型间的遗传距离最小。     

家鹅线粒体tRNAthr与tRNApro序列与结构分析

本研究采用PCR和DNA测序技术测定了6个中国家鹅品种和2个欧洲鹅品种25个个体线粒体DNA tRNApro（69bp）和tRNAthr（68bp）基因的完整序列,通过对家鹅线粒体基因组的研究,首次报道了家鹅线粒体tRNApro和tRNAthr基因的结构,对鸿雁家鹅、灰雁家鹅、白额雁（Anser albifrons,序列号为AF363031）种间的tRNApro和tRNAthr基因的二级结构及序列的变异特征进行了分析,并通过家鸡（Gallus gallus domesticus,序列号为NC001323）与鸿雁家鹅间tRNApro和tRNAthr基因二级结构的比较,初步进行了鸡形目与雁形目两个目间tRNApro和tRNAthr基因二级结构及序列变异的分析。结果表明：家鹅tRNApro和tRNAthr基因均可折叠成标准的三叶草形二级结构; 2个tRNA基因三叶草结构的氨基酸臂、反密码子环在鸿雁、灰雁和白额雁种间以及鸡形目与雁形目两个目间没有发生变异,具有高度的保守性。本研究的结果将为进一步探讨家鹅线粒体DNA tRNApro和tRNAthr基因序列与结构、功能的关系奠定基础。所测定的基因序列已登录国际GenBank数据库,序列号为AY427800～AY427805和AY427812～AY427814。     

α-银环蛇毒素基因的克隆及其非融合型原核表达研究

根据文献报道α－银环蛇毒素的氨基酸序列推导出其DNA序列,设计并人工合成两两互补的14条寡核苷酸片段。经片段延伸、PCR、克隆,成功构建α-银环蛇毒素基因克隆质粒;质粒经XbaI和EcoRI双酶切回收后连接于表达载体pET28a(+)中,分别转化BL21（DE3）、BL21（DE3）Codonplus、BL21（DE3）plysS进行诱导表达,表达产物经Tris/tricine系统进行SDS-PAGE分析。结果表明：该基因已在大肠杆菌BL21（DE3）宿主菌中进行了非融合表达,其表达量占细菌总蛋白的11.98％,主要以包涵体形式存在;同时对表达条件进行了优化,其表达量可达16.28%。经Westernblot分析,在大约8kDa处出现明显的目的带,与预计蛋白分子量大小一致,说明表达产物与天然α-银环蛇毒素具有相似的免疫原性。表达产物纯化、复性后经动物毒性试验表明：表达的α-银环蛇毒素蛋白具有生物学活性,小鼠腹腔注射其LD50约为1.28μg/g。     

四川动物体内发现的钩口线虫

报道寄生于四川17种动物体内的钩口线虫12种,它们隶属于钩口科的6个属,亦记述了部份宿主的感染情况。